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BIO 1101 > Final - Chapitre 9 - Régulation eucaryote > Flashcards

Final - Chapitre 9 - Régulation eucaryote Flashcards

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1
Q

la transcription peut être régulée à tous les niveaux… l’étape la plus sensible est

A

l’initiation de la transcription

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Q

comme chez les procaryotes, les protéines régulatrices sont des … et des …. de la transcription

A

répresseurs et activateurs

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3
Q

v ou f, les séquences régulatrices sont homogènes chez l’homme

A

faux, certaines proches, certaines loin

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Q

v ou f, les actions des protéines régulatrices ne sont pas complexifiées par des caractéristiques additionnelles des cellules et des gènes eucaryotes

A

faux, sont complexifiées

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Q

v ou f, chez les eucaryotes, les sites de liaison des régulateurs de transcription ne sont pas nécessairement distribués de manière homogène sur le promoteur

A

vrai

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6
Q

décris enhancer

A

séquence d’ADN qui fixe des facteurs régulateurs de transcription, a pour conséquence d’augmenter la transcription de gènes situés en aval ou en amont. Les enhancers peuvent agir à une grande distance des gènes

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7
Q

décris isolateur

A

élément spécifique d’ADN contrôlant l’activation des activateurs. Situé entre un enhancer et un promoteur, un isolateur inhibe l’activation du gène induite par l’activateur

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8
Q

lors de l’analyse du promoteur de Flowering Locus T, l’analyse par délétion ou ajout de séquences régulatrices permet quoi

A

de mieux comprendre les fonctions des promoteurs et de les délimiter

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9
Q

afin de pouvoir étudier les séquences régulatrices, on utilise les gènes rapporteurs… c’est quoi

A

gènes qui codent les protéines dont la présence se mesure facilement - remplacement de la région codante par une enzyme (compose lumière, composé coloré, détectable par les Ac)

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10
Q

v ou f, le gène rapporté doit être familier au génome de l’organisme modifié

A

faux, doit être étranger

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11
Q

si on ajoute une étiquette à une protéine, qu’est-ce qu’on observe

A

la protéine de fusion

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12
Q

les activateurs et les répresseurs sont modulaires, composés d’un…

A

domaine liant l’ADN et d’un domaine d’activation ou d’inhibition

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13
Q

qu’est-ce que Gal4

A

active la transcription des enzymes nécessaire au métabolisme du galactose chez la levure

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14
Q

que se passe-t-il si on lie seulement le premier 1/3 N-terminal de Gal4?

A

La protéine produite lie normalement l’ADN, mais n’active pas la transcription

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15
Q

à quoi sert le domaine de liaison à l’ADN dans les protéines régulatrices

A

cibler la région activatrice de la protéine sur le promoteur

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16
Q

les eucaryotes ont différents domaines capables de reconnaitre l’ADN, la majorité est formée …

A

d’hélice qui s’insère dans le sillon majeur (comme hélice-coude-hélice bactérienne)

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17
Q

homéodomaine

A

constitué de plusieurs hélices : une reconnait la séquence d’ADN dans le sillon majeur et les autres servent au bon positionnement sur la charpente

forme souvent des hétérodimère

En fonction du contexte cellulaire et des protéines partenaires, les homéoprotéines peuvent agir comme des activateurs ou des répresseurs de la transcription. Lorsqu’elles se lient à l’ADN, elles influencent l’activité des ARN polymérases et d’autres protéines impliquées dans la transcription.

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18
Q

le doigt de zinc

A

utilise un atome de zinc pour stabiliser l’hélice alpha qui s’insère dans le sillon majeur de l’ADN

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19
Q

concernant le doigt de zin, il fait des liaisons avec quels aa

A

cystéine et histidine - modifie la structure 3D de la protéine régulatrice

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20
Q

v ou f, une protéine régulatrice peut contenir plusieurs doigts de zinc les unes à la suite des autres… allongeant d’autant la séquence d’ADN reconnue

A

vrai

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21
Q

v ou f, il y aucun autre motif que le doigt de zinc qui utilise le zinc

A

faux, d’autres motifs utilisent le zinc, mais toujours pour stabiliser leur structure

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22
Q

l’agrafe à leucine

A

formée de 2 longues hélices alpha qui s’insèrent dans deux sillons majeurs voisins (un demi-tour entre eux)

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23
Q

comment est induite la dimérisation dans l’agrafe à leucine

A

dimérisation est induite par une autre région au sein de ces mêmes hélices : dans cette région, elles forment des courts tronçons bispiralés au sein desquels les deux hélices restent associées par des interactions hydrophobes entre des résidus leucine (ou autres résidus hydrophobes) espacés de façon appropriée

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24
Q

v ou f, les agrafes à leucine peuvent former des homo ou hétérodimères

A

v

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25
Q

hélice boucle hélice

A

ressemble à l’agrafe à leucine, mais elle est formée par 4 hélices alpha qui sont reliées via une région relâchée (boucle)

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26
Q

comment se fait l’association entre les deux sous-unité de l’hélice boucle hélice

A

régions riches en leucines présentes sur les deux hélices (celle qui lie l’ADN et la plus petite)

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27
Q

comment définir les domaines activateurs

A

sur la base de leur contenu en aa

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28
Q

comment est-ce que les domaines activateurs peuvent recruter la polymérase

A

à travers le complexe médiateur ou des facteurs généraux de la transcription

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29
Q

but pour les domaines activateur de recruter des facteurs modificateurs des histones

A

altérer la chromatine pour permettre l’accès à des sites de liaison spécifique sur l’ADN

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30
Q

v ou f, les activateurs agissent souvent directement sur l’ARNpol

A

faux, rarement

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31
Q

3 façons des répresseur d’agir

A
  1. interférer avec les activateurs : compétition
  2. interagir avec le complexe d’initiation (à travers le complexe médiateur) et inhibter la transcription
  3. compacter la chromatine et rendre les gènes inaccessibles (complexes remodelants)
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32
Q

que cause la méthylation (transcription)

A

répression : queue méthylée recrute des protéines responsables de la formation d’hétérochromatine

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33
Q

que cause l’acétylation ou la phosphorylation de la charge +

A

l’ADN peut être déroulé plus facilement

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34
Q

la méthylation se fait généralement sur quelles bases

A

C ou A

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35
Q

lors de la division cellulaire, les groupements méthyles sont maintenus et leur présence active la méthylation du brin complémentaire v ou f

A

vrai

36
Q

v ou f, les histones formant les nucléosomes ne peuvent pas être modifiés de manière post-trad

A

faux, peuvent

37
Q

acétylation des histones se fait par…

A

histone acétyl transférase (recruté par des activateurs sur des régions précises de l’ADN)

38
Q

l’addition d’un groupement acétyle peut créer un site de liaison pour des protéines contenant des…

A

bromodomaines

39
Q

qu’est-ce qu’un bromodomaine

A

motif de 4 hélices alpha capable de s’attacher sur des histones acétylées

40
Q

une des sous-unité de ce facteur général de transcription contient un bromodomaine - peut se lier plus facilement à un promoteur sur un nucléosome acétylé

A

TFIID

41
Q

comment sont recrutés les facteurs remodeleurs de la chromatine

A

facteurs de transcription
queues N-terminales (des histones)

42
Q

v ou f les complexes remodeleurs de la chromatines ont besoin d’ATP

A

v, énergie utilisée pour permettre une redistribution des liens entre l’ADN et les histones

43
Q

par quoi sont tenus les nucléosomes (liens)

A

liens H

44
Q

v ou f , les nucléosomes peuvent être transférés vers un autre brin

A

vrai

45
Q

comment est-ce que l’ADN peut être légèrement déroulé

A

par glissement

46
Q

certains gènes sont maintenus silencieux par méthyloation de l’ADN de quelle région

A

promotrice

47
Q

v ou f l’ADN des régions euchromatiques est souvent méthylé

A

faux, l’ADN des régions hétérochromatiques

48
Q

v ou f, les séquences méthylées ne sont pas reconnues par des protéines spécifiques

A

faux, elles le sont

49
Q

les séquences méthylées sont reconnues par des protéines spécifiques qui recrutent quoi qui rendent la région impossible à transcrire

A

des histones méthylases et des histones désacétylases

50
Q

v ou f, un même facteur peut agir sur plusieurs gènes et la plupart des gènes eucaryotes sont sous le contrôle de multiples éléments

A

v

51
Q

plusieurs gènes sont sous le contrôle d’un même facteur. En absence du glucose, les opérons Lac et Gal sont activés par CAP

A

contrôle combinatoire

52
Q

deux conditions sont nécessaires pour obtenir la pleine expression des opérons Lac (présence lactose et absence glucose) ou Gal (présence galactose et absence glucose)

A

intégration du signal

53
Q

contrôle de l’expression génique : le développement des 4 parties de la fleur est la présence coordonnées de..

A

différents facteurs de transcription bien spécifiques

54
Q

des groupes de gènes peuvent être sous le contrôle d’un même élément en plus d’avoir une régulation spécifique pour chacun d’entre eux. Cette région contient des éléments activateurs, inhibiteurs et même isolateurs

A

LCR (locus control region)

55
Q

la liaison des protéines à LCR permet quoi

A

dérouler localement la chromatine pour accéder aux gènes

56
Q

locus (eucaryote)

A

emplacement physique précis et invariable sur un chromosome

57
Q

opéron (procaryote)

A

unité fonctionnelle de gènes qui opèrent sous le signal d’un même promoteur

58
Q

donne un exemple de gènes sous le contrôle de région LCR

A

globine : chaque gène n’est exprimé qu’à un moment précis du développement

59
Q

un être humain a environ cmb de types de cellules

A

200

60
Q

v ou f les 200 types de cellules de l’être humain dérivent de deux oeufs fécondés

A

faux, un seul

61
Q

le génome d’un invertébré compte 15 000-20 000 gènes, celui d’un vertébré en compte combien

A

30 000 à 40 000

62
Q

% du génome exprimé dans un type cellulaire donné

A

7-8%

63
Q

des types cellulaires différents expriment À LA FOIS deux types de gènes

A

gènes communs
gènes qui les rendent spécifiques

64
Q

v ou f, une cellule mammifère typique exprime des récepteurs pour plus d’une dizaine de molécules (signaux) dont la fonction première est de réguler l’activité de facteurs de transcription

A

faux, plus d’une centaine

65
Q

les signaux (molécules) hydrophiles sont interceptés par

A

récepteurs membranaires

66
Q

les signaux (molécules) hydrophobes sont captés par

A

récepteurs nucléaires

67
Q

RTKs

A

large groupe de récepteurs liant des facteurs de croissances ou autres petites protéines

68
Q

comment sont les récepteurs RTKs inactifs

A

monomériques

69
Q

comment activer RTK

A

liaison à molécule signal entraîne dimérisation

activation du domaine kinase

phosphorylation des résidus tyrosine

reconnaissance des récepteurs phosphorylés et activation des protéines intracell

activation de la voie de signalisatgion Ras-MAPK

70
Q

suite à l’activation de RTK, que se passe-t-il

A

SH2 domaine de GRB2 se lie à RTK activé et SH3 se lie avec la protéine sos

sos = GEF (guanine-nucléotide exchange factor) : catalyse l’échange du GDP pour une GTP, active Ras

71
Q

effet de l’activation de Ras sur la cellule

A

activation de la voie MAPK

72
Q

l’activation de MAPK par Ras s’effectue comment

A

série de phosphorylations successives, chacune activant une kinases capable à son tour de phosphoryler et activer la suivante dans la chaine

73
Q

v ou f, ce sont tous les récepteurs tyrosine-kinase qui déclenchent une cascade MAPK

A

faux

74
Q

Voie Notch-Delta

A

influence de l’expression génique des cellules voisines en produisant des protéines de signalisation extracell

75
Q

les protéines de signalisation extracell sont synthétisées dans une cellule puis elles sont… (2 options)

A

placées à la membrane plasmique
sécrétées dans la matrice extracell

76
Q

voie Notch-Delta : les molécules de signalisation qui restent à la surface de la cellule émettrice contrôlent l’expression des gènes comment

A

physiquement en contact direct. : contact cellule à cellule

77
Q

explique la voie Notch-Delta dans le développement neuronal

A

neuroblastes expriment Delta (transmembranaire)
les cellules épidermiques expriment Notch

78
Q

Qu’est-ce que Notch

A

récepteur hétérodimérique à un passage transmembranaire

79
Q

lorsque Notch est absent, il y a différencition en neurones ou en cellules de l’épiderme

A

en neurones

80
Q

lorsque Notch est absent, l’activateur de la transcription Su(H) forme une complexe avec les protéines…

A

hairless, groucho et CtBP

complexe réprime la transcription des gènes en aval qui sont des répresseurs de la différenciation neuronale

81
Q

Quand Notch est activé, il déloge quoi

A

les protéines liées à Su(H) et la transcription des gènes (répresseur des gènes neuronaux) est activée… différenciation en cellule de l’épiderne

82
Q

processus permettant à la cellule de devenir hautement spécialisée

A

différenciation cellulaire

83
Q

processus de développement des structures d’un organisme au cours de son embryogenèse

A

morphogenèse

84
Q

pourquoi la régulation de la transcription ?

A

réponse à une modification de l’environnement

processus de développement de l’organisme

85
Q

à quoi mène la liaison au ligand dans la voie de signalisation Notch-Delta

A

clivage protéolytique de la portion intracell qui passe alors à l’intérieur du noyau et régule la transcription des gènes de réponse (déloge les protéines liées à Su(H))

bloque la différenciation en neurones

promeut la différenciation en cellule de l’épiderme

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