fermentai Flashcards
kas yra negrįžtamas slopinimas?
kai inhibitorius jungiasi su fermentu stipriais kovalentiniais ryšiais
kokie yra negrįžtami inhibitoriai?
specifiški, nesijungia su visais baltymais
negrįžtamo slopinimo būdai
negrįžtamas kovalentinis,pereinamosios būsenos analogai,savižudybės inaktyvikliai
negrįžtamo slopinimo pvz
penicilinas,aspirinas,dizopropilfluorfosfatas
apibūdink pereinamosios būsenos struktūrinius analogus
labai specifiški tam tikram fermentui nes panašūs į pereinamąją būseną,pvz penicilinas.slopinamas bakterijų fermentas glikopeptido transpeptidazė,sudanrantis skersinius ryšius sienelėje tarp D AR
Ką daro penicilinas?
slopina skersinių ryšių susidarymą,todėl ląstelė žūsta dėl osmosinio slėgio,nes pažeidžiama sienelė
apibūdink savižudybės inaktyviklius
dažniausiai panašūs į substratus. pvz:5-fluoruracilas
kas yra 5-fluoruracilas
tai timidilato sintazės savižudybės inaktyviklis,stabdo dnr sintezę
kas yra grįžtamasis slopinimas?
kai inhibitoriai jungiasi su fermentais nekovalentiniais ryšiais(sumažėjus inhibitoriaus konc.,fermento aktyvumas atsistato)
vmax ir km konkurentiniame slopinime
vmax nekinta,km didėja
kaip keičiasi vmax ir km nekonkurentiniame slopinime?
vmax sumažėja,km nekinta. taip yra nes slopiklis jungiasi kitoje fermento vietoje nei substratas,tačiau slopiklis sąlygoja fermento konformacinius pokyčius,todėl mažėja fermento aktyvumas
kaip veikia alosterinė reguliacija?
alosteriniai veiksniai(ef ektoriai) jungiasi prie fermento nekovalentiniais ryšiais,alosteriniai fermentai turi kitą reguliuojamą vietą nei aktyvusis centras
ką daro neigiami(alosteriniai slopikliai)
mažina fermento aktyvumą
ką daro teigiami(alosteriniai inaktyvikliai)
didina fermento aktyvumą
kas yra homotrofiniai efektoriai?
alosterinių reakcijų efektoriai gali būti ir substratai
kas yra heterotrofiniai efektoriai?
jų struktūra skiriasi nuo substrato
alosterinių fermentų ypatumai
sigmoidinė prisotinimo kreivė, nuo 2 ir daugiau subvienetų,oligomeriai baltymai,turi 2būsenas:R-aktyvi,palanki substratui prisijungti; T-neaktyvi.būdinga koperatyvumas
kaip dar vadinamas grįžtamasis kovalentinis modifikavimas?
fosforilinimu
kokios grupės fosforilinamos?
ser,thre,tyr OH grupės
kodėl fosfato grupės buvimas keičia fermento konformacija?
fosfato grupė turi neigiamą krūvį
kodėl fosfato grupės buvimas keičia fermento konformacija?
fosfato grupė turi neigiamą krūvį
kokias 2 konformacijas turi fermentas?
fosforilintą ir nefosforilintą,iš kurių viena būna aktyvi
kas fermentą forforilina, o kas defosforilina?
fosforilina baltymų kinazės,priklausomos nuo atp. Defosforilina-fosfoproteinų fosfatazės.
kaip sąveika su baltymais aktyvina fermentą?
prisijungus 4 kalcio jonams,kalmodulinas jungiasi su baltymu-taikiniu ir jį aktyvina