F6 proteinsortering

Question 1

invaginering av membran

Answer 1

Membran dras in i cellen vilket skapar mer membran (veckat) och mer membranyta.

Question 2

sorteringssignal

Answer 2

specifika aminosyrasekvenser som säger var protein ska transporteras

Question 3

transport in/ut i kärnan

Answer 3

• sker i kärnporkomplexet
  -> små molekyler/proteiner kan ta sig in/ut genom små hål som finns här

Question 4

transport in i kärnan

Answer 4

• protein binder till “nuclear import receptors” när de känner igen “nuclear localization signal” (=pos. aminosyror)
  -> drar in proteinet i kärnan

receptorn ut ur kärnan igen:
- Ran-GTP binder till receptorn+protein vilket leder till konformationsändring
- på väg ut möter dem Ran-GAP som gör Ran-GTP till Ran-GDP
=> receptorn släpper proteinet och Ran-GDP samt receptor ut ur kärnan

Question 5

transport ut ur kärnan

Answer 5

• “nuclear export receptor” kommer binda till Ran-GTP och proteinet som ska ut.
• de tre ut ur kärnan tillsammans
• på väg ut: möter Ran-GEF som byter ut Ran-GTP till Ran-GDP
  => konformationsändring och receptorn+Ran-GDP släpper proteinet
• åker tillbaka in i kärnan

Question 6

reglering av transport in/ut ur kärnan

Answer 6

• protein i cytosol som ska in kan vara fosforylerad eller bunden till inhibitor
  => NLS (nuclear localization signal) maskerad

Question 7

ko-translationell translokation

Answer 7

proteiner som ska till ER translateras och transporteras samtidigt

Question 8

process för ko-translationell translokation

Answer 8

• signal recognition particle (SRP) känner igen signalsekvens om att protein ska till ER
  => binder till signalsekvens och till ribosom och lägger sig som lock för att stoppa translation
• åker runt tills SRP receptor stöts på
• SRP receptor binder till translokonkanal och resten binder till SRP receptor
• resten binds till translokonkanal och SRP receptor släpper
  => proteinet translateras genom kanalen

Question 9

start-transfer sekvens

Answer 9

• kan agera som signal som drar till sig SRP receptor
• öppnar translokonkanal
  => translation sker genom kanal in i ER
• kan vara intern eller sitta i ändar, kan finnas flera

Question 10

stop-transfer sekvens

Answer 10

• stoppar translokonkanal
  => protein fortsätter translateras in i cytosol
• kan vara intern eller sitta i ändar, kan finnas flera

Question 11

glycolysering

Answer 11

= socker sitter på aminosyra
- t.ex. glukos, manos
- sker under translation i translokonkanal
- finns ett motiv (sekvens) som oligosaccharyl transferas känner igen
=> socker sätts på

Question 12

N-länkad glycolysering

Answer 12

vanligast. Socker kopplas till kväve (N) på asparagin (N)

Question 13

Calnexin som chaperon, tävling

Answer 13

• oveckat protein: två glukos av tre klipps bort
  -> en glukos kvar= > binder till calnexin som håller i proteinet och ger det möjlighet att veckas rätt själv
• glucosidase bryter bindning mellan glukos och calnexin
  Antingen: protein rätt veckat => ut ur ER
  Eller: felveckat
• mannosidase vinner => protein tillbaka till calnexin, försöka igen
• glucosyl transferas vinner, socker bryts ned => protein in i proteasom och bryts ner

Question 14

vesikulär transport

Answer 14

Transport från ER till Golgi.
Vesiklar knoppas av med protein i och transporteras till Golgi där de smälts samman (= fusion)

Question 15

process vesikulär transport

Answer 15

• proteinhöljen (coat proteins) sätts på där det ska knoppas av, återanvänds
• receptorer i membran känner igen och binder till protein som ska transporteras
  -många vesiklar bildas, coat proteins faller av när de är bildade
  => smälter samman till vesicular tubular clusters
• motorproteiner drar clusters via “motorvägar”

Question 16

retrograd transport

Answer 16

Det försvinner mycket membran med vesikulär transport så membran och protein transporteras tillbaka.
- protein med KDEL-sekvens känns igen och transporteras tillbaka till ER
- vissa protein råkar följa med, deras KDEL-sekvens gör att de transporteras tillbaka