F4 transkription

Question 1

transkription

Answer 1

RNA skapas av DNA

Question 2

skillnad mellan RNA och DNA

Answer 2

RNA har ribos som socker, U istället för T
DNA har deoxyribos som socker, har T

Question 3

3 delar av transkription

Answer 3

1. initiering
2. elongering
3. terminering

Question 4

promotorregion hos eukaryoter

Answer 4

CAAT-box vid -75 (finns ibland).
TATA-box (Hogness box) vid -25.
CAAT-box….TATA-box….start av RNA

Question 5

RNA polymeras ll

Answer 5

utför transkriptionen. Har helikas-egenskaper => kan dela på DNA-dubbelsträng

Question 6

initiering

Answer 6

RNA poly sitter på DNA till den hittar TATA-boxen. Den sitter på båda strängarna, vilken gen som kopieras beror alltså på vilken sträng som RNA poly sitter på.

Question 7

generella transkriptionsfaktorer

Answer 7

fungerar som delta-faktor hos prokaryoter -> känner igen TATA-boxen och hjälper då RNA poly att hitta/positioneras rätt

Question 8

elongeringsfaktorer

Answer 8

proteiner som hjälper RNA poly binda och aktiveras. En faktor fosforylerar aminosyror i proteinet
=> ändring i proteinet
=> transkriptionsfaktorer släpper
=>RNA poly aktiverat

Question 9

specifika transkriptionsfaktorer

Answer 9

• kan vara aktivatorer eller repressorer
• binder längre ifrån gener
• t.ex. om de saknas i könskromosomer blir det en kvinna, finns de aktiveras gener i Y-kromosomen
• t.ex. acetylas och deacetylas (histonacetylering)

Question 10

transkriptionskomplex

Answer 10

• specifika tf binder till DNA och till mediator
• mediator binder även till generella tf, RNA poly och proteiner som modifierar histoner så att RNA poly kan komma åt allt
  -> mediator håller ihop allt

Question 11

terminering i E. coli

Answer 11

• stöter på termineringssekvens = terminator
• bildas en knut => RNA poly släpper RNA-strängen

Question 12

histonacetylering

Answer 12

• kromatin = DNA lindat runt histoner
• start av histoner fladdrar löst => kan modifieras så RNA poly kommer åt DNA
• DNA hårt lindat runt pga negativt laddat runt positivt laddade histoner
• aminosyror blir oladdade så kan DNA kommas åt
  -> detta görs av acetylas
  -> deacetylas gör tvärtom

Question 13

lac-operonet i E. coli

Answer 13

• repressor binder i promotorregion så RNA poly inte kan kopiera => beta-galaktosidas (=bryter ned laktos) kan ej bildas
• om laktos binder till repressor blir den inaktiv => beta-galaktosidas kan bildas som då bryter ned laktos
  => finns ingen laktos bildas inte heller beta-galaktosidas

Question 14

mRNA modifiering

Answer 14

• 5’-end capping: G-P-P-P sätts på
• 3’-end poly A addition: AAA… sätts på
• intron removal (splicing)
  => görs så cellen kan urskilja mRNA

Question 15

alternativ splicing

Answer 15

= olika varianter av protein kan skapas av samma gen
- hoppar över olika exoner, splicar bort vissa
-> t.ex. ta bort nr. 2, behåll 1,3,4…)
- exoner kan inte förflyttas, bara tas bort