F3 replikation Flashcards
protein
polymer av aminosyror som har en N-terminal (start) och en C-terminal (slut)
proteiner veckas
aminosyror hamnar bredvid varandra vilket gör att svaga vätebindningar och elektrostatiska interaktioner skapas. Detta gör att ett ämne kan binda till proteinet.
celldelning
4 faser:
- G1
- S = genom kopieras
- G2
- M = cellen delar sig
DNA templat
Den strand som ska kopieras
S (celldelning)
Templat finns och nukleotider finns överallt i cellkärnan. T.ex. en G i templat och så kommer en lös C = fastnar där tillräckligt länge för att enzym ska katalysera bindning mellan dem
helikas
protein som öppnar upp DNA-dubbelsträng via ATP-driven reaktion
ATP -> ADP => konformationsändring => slagborr genom bindningar
ORI
origin of replication. Startpunkt för replikation => gör att helikas startar.
Finns ung. 30 000 ORI i mänskligt genom
topoisomeras l
Öppning av dubbelhelix kan leda till knutar. Ti l kan bryta bindningar och då släppa spänningen så strängar kan rotera utan knutar. När spänningen är släppt gör den spontant att det binds ihop igen
topoisomeras ll
Kan byta plats på DNA-strängar som trasslats ihop. Bryter bindningar genom ATP-hydrolys, kan sedan binda ihop igen
single-stranded bindning protein
binder till enkelsträngad DNA så att den inte basparar med sig själv
clamp loader och sliding clamp
clamp loader binder till sliding clamp vilket laddar molekylen. Sliding clamp binder i sin tur till DNA polymeras och håller den i rätt position
DNA polymeras
katalyserar DNA-syntes
En basparning i taget
Ungefär 1000 baser/sekund
Behöver: enkelsträng att kopiera, dubbelsträng att bygga på
replikationsgaffel
där DNA-dubbelsträngen delas
leading strand templat
enkelt för DNApoly att läsa av (5’ till 3’)
lagging strand templat
svårt för DNApoly att läsa av då denna är antiparallell och det behövs därför göras baklänges => görs i fragment
proofreading / editing
när DNApoly rättar till fel
= klipper bort felaktig bas och sätter dit rätt bas
2 active sites för DNApoly
- P=polymerisering. Enzymet katalyserar bindning mellan baspar här.
- E=editing. Om fel bas försöks bindas skapas inget baspar och strängen “hänger löst”. DNApoly stannar då av tills strängen kommit in i E där felaktig nukleotid klipps bort.
DNAprimas/primas/RNAprimas
Använder RNA-nukleotider som binder till början av lagging strand, alltså bildar den början till dubbelsträngen som DNApoly sedan bygger på.
“Placeras” på nytt hela tiden när DNA-dubbelsträngen delas för att DNApoly då ska kunna göra från den “nya början”.
DNA ligas
Binder ihop fragmenten på lagging strand. ATP används för att katalysera detta.
MutS och MutL
Om felaktig basparning så kommer sliding clamp “fastna”. MutS känner igen detta, drar till sig MutL och tillsammans rör de sig mot där det är fel. Där klipper MutL bort inkorrekt del.
centromer
där 2 kromosomer sitter ihop
telomerer
“Ihoprullad” ände av DNA så att det inte ska uppfattas som t.ex. virus
telomeras
“Rullar upp” ände av DNA-sträng genom att sätta dit repeterande baser. Görs endast i vissa celler.
När stannar celldelning?
Telomererna förkortas vid varje celldelning, när de inte längre kan förkortas stannar celldelningen
