F3 replikation

Question 1

protein

Answer 1

polymer av aminosyror som har en N-terminal (start) och en C-terminal (slut)

Question 2

proteiner veckas

Answer 2

aminosyror hamnar bredvid varandra vilket gör att svaga vätebindningar och elektrostatiska interaktioner skapas. Detta gör att ett ämne kan binda till proteinet.

Question 3

celldelning

Answer 3

4 faser:
- G1
- S = genom kopieras
- G2
- M = cellen delar sig

Question 4

DNA templat

Answer 4

Den strand som ska kopieras

Question 5

S (celldelning)

Answer 5

Templat finns och nukleotider finns överallt i cellkärnan. T.ex. en G i templat och så kommer en lös C = fastnar där tillräckligt länge för att enzym ska katalysera bindning mellan dem

Question 6

helikas

Answer 6

protein som öppnar upp DNA-dubbelsträng via ATP-driven reaktion
ATP -> ADP => konformationsändring => slagborr genom bindningar

Question 7

ORI

Answer 7

origin of replication. Startpunkt för replikation => gör att helikas startar.
Finns ung. 30 000 ORI i mänskligt genom

Question 8

topoisomeras l

Answer 8

Öppning av dubbelhelix kan leda till knutar. Ti l kan bryta bindningar och då släppa spänningen så strängar kan rotera utan knutar. När spänningen är släppt gör den spontant att det binds ihop igen

Question 9

topoisomeras ll

Answer 9

Kan byta plats på DNA-strängar som trasslats ihop. Bryter bindningar genom ATP-hydrolys, kan sedan binda ihop igen

Question 10

single-stranded bindning protein

Answer 10

binder till enkelsträngad DNA så att den inte basparar med sig själv

Question 11

clamp loader och sliding clamp

Answer 11

clamp loader binder till sliding clamp vilket laddar molekylen. Sliding clamp binder i sin tur till DNA polymeras och håller den i rätt position

Question 12

DNA polymeras

Answer 12

katalyserar DNA-syntes
En basparning i taget
Ungefär 1000 baser/sekund

Behöver: enkelsträng att kopiera, dubbelsträng att bygga på

Question 13

replikationsgaffel

Answer 13

där DNA-dubbelsträngen delas

Question 14

leading strand templat

Answer 14

enkelt för DNApoly att läsa av (5’ till 3’)

Question 15

lagging strand templat

Answer 15

svårt för DNApoly att läsa av då denna är antiparallell och det behövs därför göras baklänges => görs i fragment

Question 16

proofreading / editing

Answer 16

när DNApoly rättar till fel
= klipper bort felaktig bas och sätter dit rätt bas

Question 17

2 active sites för DNApoly

Answer 17

1. P=polymerisering. Enzymet katalyserar bindning mellan baspar här.
2. E=editing. Om fel bas försöks bindas skapas inget baspar och strängen “hänger löst”. DNApoly stannar då av tills strängen kommit in i E där felaktig nukleotid klipps bort.

Question 18

DNAprimas/primas/RNAprimas

Answer 18

Använder RNA-nukleotider som binder till början av lagging strand, alltså bildar den början till dubbelsträngen som DNApoly sedan bygger på.
“Placeras” på nytt hela tiden när DNA-dubbelsträngen delas för att DNApoly då ska kunna göra från den “nya början”.

Question 19

DNA ligas

Answer 19

Binder ihop fragmenten på lagging strand. ATP används för att katalysera detta.

Question 20

MutS och MutL

Answer 20

Om felaktig basparning så kommer sliding clamp “fastna”. MutS känner igen detta, drar till sig MutL och tillsammans rör de sig mot där det är fel. Där klipper MutL bort inkorrekt del.

Question 21

centromer

Answer 21

där 2 kromosomer sitter ihop

Question 22

telomerer

Answer 22

“Ihoprullad” ände av DNA så att det inte ska uppfattas som t.ex. virus

Question 23

telomeras

Answer 23

“Rullar upp” ände av DNA-sträng genom att sätta dit repeterande baser. Görs endast i vissa celler.

Question 24

När stannar celldelning?

Answer 24

Telomererna förkortas vid varje celldelning, när de inte längre kan förkortas stannar celldelningen