Extraction d'ADN Flashcards

1
Q

Quelles sont les propriétées physico-chimiques de l’ADN utilisable pour leur purification

A

-polymères dont la taille varie avec le nombre de nucléotides
- composés d’une forte charge négative
- adoptent une structure en double brins

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2
Q

Nommer 2 facteurs qui rendent l’ADN très soluble dans l’eau

A

-Molécule très chargée
-Possède peu de groupes hydrophobes

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3
Q

Quelle est la méthode la plus populaire de précipiter les protéine

A

Précipitation à l’éthanol ou au isopropanole

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4
Q

Expliquer un protocole typique pour précipiter un échantillon d’ADN

A
  • l’ajout de 2.5 volumes d’éthanol et 0.25M d’acétate de sodium
    à une solution contenant de l’ADN
  • la solution est ensuite mise à -20°C pendant au moins 30 minutes
    et l’ADN est récupéré par centrifugation à 10,000 rpm pendant 10
    minutes à 4°C dans une microcentrifugeuse
  • une certaine quantité de sels sera aussi précipité avec l’ADN. Des lavages
    subséquents avec de 70% l’éthanol permettra de les enlever
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5
Q

Expliquer la méthode de partition de phase et quelle solution est utilisé dans cette méthode

A

La méthode à partition de phase consiste à utiliser du phénol pour séparer des protéines de l’ADN. Les protéines seront contenus dans la phase phénolique (moins soluble) et l’ADN plus sera dans la phase aqueuse (plus soluble)

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6
Q

Quel gel d’élèctrophorèse est utilisé pour la séparation de l’ADN

A

Gel d’agarose

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7
Q

Pourquoi est ce que le gel de polyacrylamide ne marchera pas pour une élèctrophorèse d’ADN

A

L’ADN est beaucoup trop long et ne peut passée par les pores de poryacrylamide.

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8
Q

Nommer les 3 cycles du PCR

A

1)Dénaturation de l’ADN
2) Hybridation des amorces
3)Polymérisation de l’ADN

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9
Q

De quoi dépend la température d’hybrydation des amorces. (2)

A

1) De leur longueur en nucléotides
2) Nombre de nucléotides C et G

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9
Q

De quoi dépend la température d’hybrydation des amorces. (2)

A

1) De leur longueur en nucléotides
2) Nombre de nucléotides C et G

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10
Q

Vrai ou Faux?

Il est possible d’utiliser une élèctrophorèse avec un gel polycacrylamide pour de l’ADN de quelques centaines de nucléotides ou moins

A

Vrai

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11
Q

La séparation de l’ADN dans une élèctrophorèse dépend de leur

A

Masse moléculaire
Plus lourd se déplace moins loin
Plus vite se déplace plus loin

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12
Q

Nommer un colorant utilisé pour visualiser les bandes d’ADN après une élèctrophorèse

A

Bromure d’éthidium

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13
Q

Quelle type d’échangeurs (anionique ou cationique) devrait être utiliser pour un chromatographie par échange d’ions pour une échantillon d’ADN

A

Échangeur anionique

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14
Q

Quel est le rôle de la chromatographie par gel filtration pour un échantillon d’ADN

A

Déssaller les oglionucléotides

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15
Q

La densité de flottaison de l’ADN dépend de quoi

A

Sa composition en base

16
Q

Quel type de centrifugation peut être utiliser pour purifier l’ADN

A

Par gradients de densité au Chlorure de Césium