Extra info Flashcards
Wat zijn broad range PCRs?
Hierbij worden primers gebruikt die sequenties hebben die gericht zijn om heel breed op de aanwezigheid van DNA van micro-organismen te kunnen testen
Erg aspecifiek doordat in verschillende MO grote delen overlappende en sterk gelijkende sequenties voorkomen
wat houdt rt-PCR in?
Real time PCR
mbv specifieke probes wordt de vorming van de PCR producten tijdens de PCR gemonitord
TaqMan probes = hydrolyse probes meest gebruikt
Er wordt een fluorescent signaal gevormd dat evenredig is aan het aantal gevormde PCR producten
–> Signaal wordt gemeten door apparaat
Wanneer is een RT-PCR positief?
Als het fluorescente signaal boven de achtergrondruis uitkomt
= ct-waarde
Wat is de ct-waarde?
De cycle threshold of crossing point waarde
= het moment waarop het fluorescente signaal boven de achtergrondruis uitkomt bij RT-PCR
Omgekeerd evenredig met de hoeveelheid target die in de PCR gebruikt is
Als er veel target aanwezig is in het sample, zullen er minder amplificatie cycli nodig zijn om een detecteerbaar signaal te genereren
Iedere cyclus verschil staat daarbij voor een factor 2 verschil (ongeveer) in hoeveelheid target aangezien tijdens de PCR in iedere cyclus het aantal target moleculen verdubbeld zal worden
Bij welke virussen treden relatief makkelijk mutaties op en door welk achterliggend mechanisme wordt dit veroorzaakt?
Mutaties in het genoom van een virus ontstaan tijdens de replicatie at random. RNA virussen (zoals retrovirussen) hebben door het ontbreken van proof-reading een grotere mutatie frequentie dan DNA virussen (zoals herpesvirussen)
Leg in maximaal 40 woorden uit wat U=U betekent.
U=U betekent dat als er bij een patiënt met HIV onder adequate behandeling geen virus in het bloed aantoonbaar is, deze patiënt het virus niet kan overdragen aan zijn (sexuele) partner(s).
Leg in maximaal 40 woorden uit wat U=U betekent voor de individuele patiënt.
Voor het individu houdt dit in dat patiënt met zijn/haar partner onbeschermd sexueel contact kan hebben en dat een stel(M/V) op natuurlijke wijze zwanger kan worden (onafhankelijk van de HIV status van de partner)
Wat is het belangrijkste verschijnsel waardoor kinderen met MIS-C kritisch ziek kunnen worden?
hypotensie en risico op shock door achteruitgang ventrikelfunctie
Wanneer moet je denken aan MIS-C?
Bij persisterende koorts zonder duidelijke focus
Benoem twee cruciale verschillen in de pathogenese van deze twee coronavirussen ten opzichte van SARS-CoV-2 - het virus dat de huidige pandemie veroorzaakt - die een inzet van vaccins bij SARS en MERS niet noodzakelijk maakte?
- MERS repliceert in de lagere luchtweg en SARS2 in de bovenste luchtweg waardoor er geen efficiënte verspreiding van MERS-CoV optrad
2.SARS veroorzaakt eerst klinische verschijnselen en virus piekt dan later waardoor isolatie van patiënten werkt. SARS2 virus replicatie piekt voor
klinische verschijnselen en isolatie van positieve individuen niet effectief is
Wat zijn de functies van de anafylatoxinen?
- Degranulatie van mestcellen, granulocyten, macrofagen: uitstoot van vasoactieve stoffen (zoals histamine) uit mestcellen en basofielen
–> ontstekingsreactie - Contractie glad spierweefsel
- Endotheel: verhoogde vasculaire permeabiliteit
- Chemotaxis van fagocyten –> aantrekking naar bepaalde plek in weefsel
- Activatie fagocyten voor productie van ROS + cytokinen en verhoogde expressie FcR en complement receptoren
welke cytokines zorgen voor de differentiatie van de T-helpercellen?
Th1: IFN-y en IL-12
Th2: IL-4
Th17: TGF-b en IL-6
Tfh: IL-6 en IL-21
Treg: TGF-b
Welke cytokines worden geproduceerd door welke Thelpercellen?
Th1: IFN-y, TNF-a, IL-2
Th2: IL-4. IL-5, IL-13
Th17: IL-17. IL-22, TNF-a
Tfh: IL-21 en IL-17
Treg: IL-10 en TGF-b
Geef voor elk van de volgend virussen aan of dit een verwekker van een zoönose kan zijn.
hepatitis C virus
hepatitis E virus
West Nile virus
Herpes B virus
hepatitis C virus: nee
hepatitis E virus: ja
West Nile virus: ja
Herpes B virus: ja
wat is de functie van catalase?
Afbraak van H2O2
Hoe groot is een virus ongeveer?
60 nm
Welke gramkleuring hebben enterokokken?
Gram positief
Welke componenten zijn aanwezig in een hepatitis B vaccin?
Aluminium hydroxyde
HBsAg eiwit
Pre-S1 en pre-S2 eiwit
Wat toon je aan met een western Blot?
Eiwitten
noem drie manieren om, bij de behandeling van een virusinfectie, antivirale resistentie te voorkomen / tegen te gaan
- Gebruik de juiste dosering en de juiste behandelduur van het geneesmiddel.
- Gebruik een antiviraal geneesmiddel met een hoge genetische barrière tegen resistentie.
- Gebruik een combinatie van antivirale geneesmiddelen zodat de genetische barrière tegen resistentie van het regime hoger wordt.