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Sherbrook MicroBio > Examen mi-session > Flashcards

Examen mi-session Flashcards

1
Q

Quels sont les différents interactions avec un objet que la lumière peu avoir ?

A
  • Réflexion : l’onde rebondit sur la surface, donne la couleur aux objets
  • Absorption : énergie de la lumière gardée par l’objet, lumière émise de nouveau
  • Transmission : passage de la lumière à travers des objets
  • Diffraction : déviation ou courbure des rayons lumineux lors de leur passage à travers une ouverture de petite taille
  • Réfraction: Changement d’angle de la lumière en fonction de la densité de la matière qu’elle traverse
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Q

Nomme les solutions des problème en microscopie pour la diffraction et la réfraction

A

Diffraction: les lentilles créent un tel effet, le grossissement maximal associé à une lentille est de 100X
Réfraction: Utilisation de l’huile à immersion qui possède le même indice de réfraction que le verre

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Q

Qu’est-ce que la résolution ?

A

-Capacité d’une lentille à présenter les objets distinctement sans chevauchement
- Liée à la longueur d’onde de la lumière

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4
Q

Nomme les trois types de microscopes

A

-Microscopes optiques: utilisent ;’énergie du spectre lumineux et des lentilles (fond clair, fond noir, contraste de phase)
- Microscope électronique : utilisent un faisceau d’électrons et des électroaimants (à balayages, à transmission)
- Microscopes à sondes : utilisent le principe du braille à l’aide d’une sonde et d’un signal électrique

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Q

Qu’est-ce que la microscopie à fond clair ?

A

-Échantillon plus foncé sur fond brillant
- Observation de spécimens frais et contrastés ou morts colorés (dénombrement)
- Grossissement maximal

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6
Q

Qu’est-ce que la microscopie à fond noir ?

A
  • Observation de microorganismes vivants : invisible en fond clair, impossible à colorer
  • Condenseur modifié avec disque opaque
  • Plis faible grossissement
  • Spécimen brillant sur fond noir
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7
Q

Qu’est-ce que la microscopie à contraste de phase ?

A
  • Observation des structures internes d’organismes vivants (fixés non colorés)
  • Augmente le contraste entre strcutures d’épaisseurs variables (rayons diffractés et retardés par le spécimen)
  • Spécimens avec régions brillantes à noir en passant par le gris
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8
Q

Qu’est-ce que le fluorochrome

A

Substance naturellement fluorescente ou colorant fluorescent. Absorbe l’énergie lumineuse et la réémet en lumière visible

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9
Q

Qu’est-ce que le filtre d’excitation

A

Il retient la lumière visible et laisse passer les rayons UVs qui exciteront les fluorochromes sur les spécimen à observer

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10
Q

Qu’est-ce qu’un filtre d’émission

A

Il retient les rayons UVs et laisse passer la lumiètr visible émise par le fluorochrome

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11
Q

Qu’est-ce que l’immunofluorescence

A

Utilisation d’anticorps associés à des fluorochromes

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12
Q

Qu’est-ce que ;a Microscopie confocale

A

Construction d’images tridimensionnelles
Utilisation de fluorochromes
Un laser balai l’échantillon couche par couche

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13
Q

Qu’est-ce que la microscopie électronique ?

A

Idéal pour visualiser des spécimens de moins de 0.2 um (structures bactériennes internes, virus)
Spécimens non vivants seulement
Pas de source lumineuses ; faisceaux d’électrons (échantillon détruit ensuite
Pas de lentilles de verre

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14
Q

Qu’est que la microscopie électronique à transmission

A
  • Observation d’échantillons très minces
    -Électrons passent à travers le spécimen puis atteignent le détecteur
    -Possibilité d’énorme grossissement
    -
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15
Q

Qu’est-ce que la microscopie électronique à balayage

A
  • Fonctionne différemment du TEm ; images tridimensionnelles des surfaces
  • Électrons du spécimens sont renvoyés ver un capteur
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16
Q

La différence entre un montage frais (liquide) et un montage fixe (séché et coloré)

A

Frais: technique simple et goutte suspendue
Fixe: séchage à l’Air, fixation à chaud et coloration

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17
Q

Nomme les différents types de colorations

A

-Simple : Colorant basiques, morphologie, taille et arrangement comme la coloration bleu de méthylène
- Différentielle : Plusieurs colorants , caractéristiques distinctives d’un microorganismes comme la coloration de Gram
- Négative : Le fond de la lame est coloré, le spécimen peut être coloré ou non selon les observations à faire ex: coloration de la capsule

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18
Q

Qu’est-ce que le catabolisme ?

A

Réactions qui produisent de l’énergie via la dégradation des molécules complexes

(exergoniques)

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19
Q

Qu’est-ce que l’anabolisme ?

A

Réactions qui requièrent de l’énergie afin de synthétiser des molécules complexes
(endergoniques)

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20
Q

Quel est la différence entre phototrophe et chimiotrophe

A
  • Photo : source d’énergie par la lumière
    -Chimio : source d’énergie par composé chimiques
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21
Q

Quel est la différence entre autotrophe et hétérotrophes

A
  • Auto: Source de carbone par le CO2 atmosphérique
  • Hétéro : source de carbone composés organiques
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22
Q

Quel est la différence entre phototrophes et hétérotrophes

A

Proto: Auto producteur de sa nourriture
Hétéro : consommateur nutritionnels

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23
Q

Nomme des voies métaboliques

A

Glycolyse, fermentation éthanolique, respiration aérobie, photosyntèse…

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24
Q

Qu’est-ce qu’une enzyme..
(Fonctions)

A

-Protéines qui augmentent la vitesse des réactions biochimiques
- Elles diminuent l’énergie d’activation nécessaire aux réactions. Sans les enzymes, les cellules ne seraient pas viables .

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25
Q

Quelles sont les structures d’une enzymes ?

A

-Apoenzyme (protéine inactive)
-Coenzyme et ou cofacteur
- Holoenzyme = enzyme active

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26
Q

Nomme les étapes de la réaction enzymatique

A

1-Interactions substrat et site actif
2- Formation du complexe intermédiaire enzyme-substrat
3-Transformation des substrats
4-Détachement des produits
5-Enzyme demeure intacte et prête à recommencer

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27
Q

Quels sont les lieux de catalyse ?

A

-Enzyme intracellulaire (endoenzymes)
-Enzymes extracellulaires (exoenzymes)

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28
Q

Quels sont les variables de l’environnement qui rend les enzymes vulnérables ?

A

-Température
-pH
-Concentration de substrat
-Inhibiteurs

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29
Q

Quels sont les régulations d’enzymes lors de la synthèse des enzymes ?

A
  • Utilisation d’activateur ou d’inhibiteur de transcription
  • Pas toutes les enzymes produites en permanence
    -Arrangement des gènes en opérons
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30
Q

Quels sont les régulation enzymatiques lors de l’activité enzymatique ?

A

-Inhibition compétitive
-Inhibition non compétitive

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31
Q

Qu’est-ce que la rétro-inhibition ?

A
  • Produit final de la voie inhibe une enzyme précédente (inhibition non compétitive )
  • Bonne méthode conservation énergétique
  • On ne veut pas gaspiller les ressources
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32
Q

Quelle est la différence entre les enzymes constitutives et enzymes inductibles ?

A
  • Consti : transcrites et traduites en permanence , associées aux processus vitaux
  • Induct: transcrites et traduites au besoin (conservation de l’énergie), régulation prétranscriptionnelle (signaux moléculaires internes ou externes )
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33
Q

Qu’est-ce qu’un Opéron ?

A

gène adjacent dont l’expression est régulée simultanément par les mêmes gènes régulateurs

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34
Q

Qu’est-ce que lacl

A

Protéine régulatrice constitutive qui se lie à l’opérateur

35
Q

Qu’est-ce que p sur un brin d’ADN

A

promoteur; lieu de liaison de l’ARN polymérase

36
Q

Qu’est-ce que o dans l’opéron

A

opérateur; lieu de liaison du répresseur lacl

37
Q

Qu’est-ce que lacz

A

Bêta-Galactosidase ; transforme le lactose en glucose et galactose

38
Q

Qu’est-ce que lacY

A

Perméase; transporte le lactose à travers la membrane cytoplasmique

39
Q

Qu’est-ce que lacA

A

Transacétylase; transforme les galactosides

40
Q

Comment se mesure la croissance microbienne ?

A

Se mesure en termes de nombres de cellules

41
Q

La croissance microbienne implique quoi ?

A
  • Augmentation en taille
  • Duplication de son contenu cellulaire
  • Division cellulaire
  • Répétition du cycle encore et encore
42
Q

Quel est le principal moyen de reproduction chez les bactéries

A
  • Par fission binaire
43
Q

Quelles sont les étapes de la fission binaire ?

A
  • Bactérie produit plus de composantes cellulaires
  • Réplication de l’ADN (2 copies)
  • Constriction centrale et septum
  • Division = 2 bactéries identiques
44
Q

Qu’est-ce que le Bourgeonnement ?

A

-Mode de reproduction microbienne
- Excroissance qui grossit puis se sépare
- Surtout levures

45
Q

Qu’est-ce que la Fragmentation ?

A
  • Mode de reproduction microbienne
  • Chez cyanobactéries (long filament, division simultsnée)
46
Q

Qu’est-ce que l’Exospores

A

-Mode de reproduction microbienne
- Actinomycètes filamenteuses

47
Q

Qu’est-ce que le temps de génération ?

A

temps pour effectuer un cycle de vie ; une divisom

48
Q

Quels sont les deux type de représentation graphique pour la croissance ?

A
  • Échelle logarithmique
  • Courbe de croissance bactérienne
49
Q

Quels sont les caractéristiques de la courbe de croissance bactérienne ?

A
  • Augmentation de la population (nombre) et de la biomasse (quantité)
  • Bactéries dans un milieu de culture sans ajout ou retrait
  • Divisée en quatre phases :
    -> Latence
    -> Croissance exponentielle
    -> Stationnaire
    -> Déclin
50
Q

Les caractéristiques de la phase de latence

A
  • Période d’adaptation de l’inoculum
  • Population ne double pas, mais la biomasse augmente (activité métabolique intense)
    -Influencée par la composition du milieu, quantité d’inoculum de départ et les bactéries elles-mêmes
  • Commence éventuellement à se diviser à un taux constant ; fin de la phase de latence
51
Q

Les caractéristiques de la phase de croissance exponentielle

A
  • Les bactéries adaptées se divisent à un taux constant (temps de génération maximal)
  • Population uniforme, bactéries métaboliquement très actives
52
Q

Les caractéristiques de la phase stationnaire

A
  • Épuisement d’un élément essentiel, accumulation de déchets métaboliques ou changement conditions
    -La reproduction et la mortalité cellulaires sont équivalentes
    -Production de molécules signales en réponse à une densité critiques
  • Amorce de processus cellulaires importants
53
Q

Les caractéristiques de la phase de déclin ?

A
  • Haut taux de mortalité.
  • La mortalité est plus grande que la
    reproduction.
  • Lorsque la plupart des bactéries sont
    mortes certaines bactéries survivent
    (en utilisant les ressources provenant
    des cadavres).
  • Relâchement des endospores
54
Q

Quels sont les Variations que peuvent avoir les courbes de croissance

A
  • Les courbes de croissance diffèrent selon
    l’espèce bactérienne en croissance.
  • Chaque phase varie même pour les
    souches d’une même espèce.
  • La composition du milieu ou des
    conditions de culture font également varier
    la courbe de croissance
55
Q

Qu’est-ce que le Dénombrement direct de cellules

A
  • Dénombrement des cellules
    vivantes et mortes dans un
    volume connu en microscopie.
  • Chambre de Petroff-Hausser
56
Q

Quels sont les deux types Mesure quantitative de la croissance

A
  • Mesure directe:
  • Dénombrement de cellules
  • Dénombrement de colonies
  • Filtration (peu)
  • Dilution en série (beaucoup)
  • Nombre le plus probable
  • Mesure indirecte:
  • Turbidimétrie (densité cellulaire)
  • Activité métabolique
  • Biomasse sèche
57
Q

Qu’est-ce que le Dénombrement de colonies

A
  • Unités formatrices de colonie (UFC)
  • Décompte des bactéries viables
    (UFC/mL), sous-estimation du nombre
    réel
  • Comptage final sur une boîte de Pétri
    avec entre 30 et 300 colonies
58
Q

Qu’est-ce que Dilutions préalables

A
  • Dilution en série
  • Étape obligatoire pour échantillons concentrés
59
Q

Qu’est-ce que Filtration préalable

A
  • Filtration sur membrane (peu bactérie, volume connu)
60
Q

Qu’est-ce que Méthode du nombre le plus probable (MPN)

A
  • Estimation du nombre de bactéries basée sur des dilutions:
  • Croissance liquide
  • Milieu sélectif ou différentiel
  • Ajout tube de Durham possible
  • Méthode statistique
61
Q

Nomme des Estimation par méthode indirecte

A
  • Turbidimétrie (densité optique):
  • Spectrophotomètre
  • Biomasse sèche:
  • Centrifugation ou filtration puis pesée
  • Mesure de l’activité métabolique
62
Q

Qu’est-ce que Les biofilms

A
  • En nature, les colonies clonales sont rarement
    présentes
  • Biofilms:
  • Microorganismes fixés, mais en contact avec l’eau
  • Couche visqueuses (matrice)
  • Une ou plusieurs espèces
  • Formes diverses
  • Communautés microbiennes coordonnées:
  • Signalisation chimique (quorum sensing)
63
Q

Quels sont les avantages des
Biofilms

A
  • Avantages
  • Réserves de nutriments
  • Protection de l’environnement:
  • Dessication
  • Antibiotiques
  • Prédation
  • Transfert matériel génétique
64
Q

Formation d’un biofilm

A
  • Microorganismes planctoniques dans milieu aqueux
  • Adhérence de certains microorganismes sur une surface
  • Fimbriae
  • Multiplication et production d’une matrice visqueuse
  • Production d’auto-inducteurs pour la communication et le recrutement
  • Épaississement du biofilm, création de canaux et répartitions des tâches
  • Fragmentation ou détachement; retour à l’état planctonique
65
Q

Mesurer la croissance en biofilm

A

Coloration au violet cristallisé

66
Q

Observer un biofilm

A
  • Microscopie (permettant d’observer la structure en 3D):
  • Électronique à balayage
  • Confocal
67
Q

Facteurs de croissance

A
  • Conditions optimales pour la croissance microbienne
  • Facteurs physiques (conditions de l’environnement):
  • Température
  • pH
  • Pression osmotique et barométrique
  • Lumière
  • Facteurs chimiques (éléments dans l’environnement):
  • Carbone et hydrogène
  • Azote, phosphore et soufre
  • Oligoéléments
  • Facteurs de croissance
  • Dioxygène
68
Q

Pourquoi la température affecte la croissance ?

A

Température optimale de croissance; permet le temps de génération le plus court:
* Température minimale
* Température maximale

  • Psychrophiles (0-15-25°C)
  • Psychrotrophes (0 à 35°C)
  • Mésophiles (Top 25-40°C)
  • Bactéries pathogènes:
  • Thermophiles (Top 50-60°C)
  • Hyperthermophiles (Top min 80°C)
69
Q

Pourquoi la pression osmotique affecte la croissance

A
  • Plasmolyse en milieu hypertonique freine la croissance:
  • Méthode de conservation
  • Halophiles extrêmes:
  • Halophiles stricts (besoin du sel)
  • Halophiles facultatifs (tolèrent bien le sel)
  • Considération pour les milieux de culture solides
  • Agar 1.5%
70
Q

Pourquoi la Pression barométrique affecte la croissance

A
  • Piézophiles
  • Fonds marins ou sous-sol profond
  • Extrêmement difficile d’obtenir des spécimens
    puis de les faire croître en laboratoire.
  • Microorganismes largement inconnus
71
Q

En quoi la Lumière affecte la croissance

A
  • Essentielle à la croissance des bactéries photosynthétiques
72
Q

En quoi Facteurs chimiques affecte croissance

A
  • Les facteurs chimiques réfèrent principalement à la composition des milieux
    de culture utilisés en laboratoire.
  • Besoins très diversifiés entre les bactéries
  • Les besoins d’un microorganisme reflètent son bagage génétique (enzymes)
  • Certaines bactéries demeurent incultivables sur des milieux de culture
    artificiels, elles requièrent des cellules vivantes.
  • Ces capacités métaboliques peuvent être utilisées en identification
    bactérienne (caractères biochimiques).
73
Q

Comment les organismes vont chercher leur carbone et hydrogène

A
  • Source de carbone:
  • Inorganique : CO2
  • Organique : glucides, protéines et lipides
  • Hydrogène:
  • Élément essentiel, mais non limitant
  • H2O et molécules organiques
74
Q

Comment les organismes vont chercher Azote, phosphore et soufre

A
  • Azote
  • Synthèse protéique, ADN et ARN
  • Sources: protéines et acides aminés, nitrates et ammonium
  • Autre: Fixation d’azote atmosphérique (libre ou symbiose)
  • Phosphore
  • Synthèse phospholipides, ADN, ARN et ATP
  • Sources: phosphates
  • Soufre
  • Synthèse protéique et vitamines
  • Sources: sulfates ou acide aminés soufré
75
Q

Qu’est-ce que les Oligoéléments

A
  • Éléments minéraux nécessaires en petites quantités
  • Fer, cuivre, zinc, etc.
  • Ajoutés ou présents « par défaut » dans l’eau du robinet
76
Q

La différence entre Aérobie stricts, Anaérobie stricts et
Anaérobie obligatoire et
Anaérobie facultatifs

A
  • Aérobie stricts: besoin d’oxygène pour croître
  • Anaérobie stricts: oxygène toxique/mortel; bactéries tuées en présence
    d’oxygène
  • Anaérobie obligatoire: bactérie devient métaboliquement inactive
  • Anaérobie facultatifs: préfèrent l’oxygène, mais capables de fonctionner sans
    oxygène (fermentation ou respiration anaérobie)
77
Q

Nomme des Milieux et cultures anaérobies

A
  • Présence d’oxygène toxique:
  • Milieu réducteur (milieu avec thioglycolate de sodium)
  • Jarres anaérobie (plats de Pétri ou tubes)
  • Chambre anaérobie étanche:
  • Entrée matériel via sas
  • Remplie de gaz inertes
78
Q

Qu’est-ce qu’un milieu de culture ?

A
  • Préparations nutritives stériles servant à la croissance
    des microorganismes en laboratoire.
  • Liquide (bouillon), solide (gélose) ou semi-solide (gélose)
  • Utilisation d’agar-agar en concentration variable (1 à 1.8%)
  • Contenus dans des éprouvettes ou des plats/boîtes de Pétri
  • Inoculum: microorganismes introduits dans/sur un
    milieu de culture pour leur croissance.
  • Culture: microorganismes qui se développent et se
    multiplient dans/sur un milieu de culture.
79
Q

Qu’est-ce qu’un Milieux synthétiques (définis)

A
  • Milieu dont la composition chimique est connue
    avec exactitude
    qualitativement et quantitativement.
  • Plus pour bactéries autotrophes (métaboliquement
    autonomes)
80
Q

Qu’est-ce qu’un Milieux complexes (empiriques)

A
  • Milieu dont la composition chimique exacte reste inconnue, mais dont les
    ingrédients et leurs quantités sont connus.
  • Ex.: sang, infusion de cœur-cerveau, extrait de levure, etc.
  • Principalement pour les bactéries hétérotrophes
81
Q

Qu’est-ce qu’un Milieux sélectifs

A
  • Milieux de culture qui stimulent la croissance ou la prédominance de bactéries
    recherchées et/ou inhibent la croissance demicroorganismes compétiteurs
  • Agents de sélections généraux:
  • Inhibent Gram positif
  • Sels biliaires
  • Violet cristallisé
  • Vert brillant
  • Agents sélections spécifiques:
  • Antibiotiques
82
Q

Qu’est-ce que des Milieux différentiels

A
  • Milieux avec des ingrédients qui facilitent la distinction entre les
    colonies observées pour identifier celles d’intérêt.
  • Changement de couleur de la colonie ou du milieu autour de la colonie
  • Agents différentiels: sang, indicateurs pH, lactose, etc.
  • Colonie: amas visible de cellules microbiennes issues de la même
    cellule mère
  • Gélose sang: détermination des types d’hémolyse
  • Alpha = destruction de l’hémoglobine (pigment verdâtre)
  • Bêta = lyse complète des globules rouges (halo clair)
  • Gamma = pas d’hémolyse
83
Q

Nomme des milieux sélectifs et différentiels

A
  • Gélose mannitol sel (Staphylococcus aureus):
  • 7.5% NaCl
  • Mannitol
  • Indicateur de pH
  • Gélose MacConkey:
  • Violet cristallisé
  • Sels biliaires
  • Lactose
  • Rouge neutre (indicateur pH)
84
Q

Qu’est-ce qu’un Milieu d’enrichissement

A

Augmenter la proportion des microorganismes voulus parmi une population nombreuse et complexe.:
* Ex. décomposeurs de phénol, bactéries fixatrices d’azote, etc.
* Microorganismes viables mais non cultivables (VBNC)

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