exam 1 Flashcards
pk eskon dit que le lien P possède un caractère partiel de liaison double?
psk le N ou le O peuvent faire un lien double partiel, et donc lui donner un caractère planaire en cis ou en trans.
microfilaments se retrouvent ou?
dans le cytoplasme, sous forme de polymère d’actine pour microfilaments et polymère de tubuline pour microtubules
dans une isomérie cis ou trans, c quoi qui est du meme coté ou qui est opposé.?
le carbone alpha et sa chaine latérale
le lien peptidique a un caractère cmt?
a un caractère partiel de liaison double. c le fait que les électrons doubles qui crée le caractère partiel.
Planaire, partiel psk ton N a des élections libres et donc mtn, ca forme un double lien et ton double lien O forme un électron libre. c ca qui ft en sorte que tu px etre trans ou cis
quel est l’exception ou c pas le groupement carboxyle du carbone alpha qui fait un lien P mais bien le groupement carbonyle de la chaine lat
glutation (acide glutamique + cystéine ). c pas le carbone alpha qui est impliqué, c le carbone gamma.
a.a font des repliements locaux pour former des motifs protéiques
structures secondaires
quels sont les angles permis pour les hélices alpha
la combinaison d’angles phi et psi doit etre entre -50 et -60 degrés
les polypeptides différents ou identiques forment les sous-unités d’une protéines. qu’est-ce qu’un protomère
associations de sous-unités qui se répètent
pk esk les hélices alpha sont right handed
psk ca diminue l’encombrement stérique
quels sont les 2 a.a qui déstabilisent les structures alpha
- glycine psk elle a pas de chaine latérale,c jst un Hydrogène, donc les angles ont pas de contraintes, c trop flexible, ils tournent comme ils veulent et on avait dit que les angles phi doivent etre -50 et -60
- proline psk1, elle a de fortes contraintes a cause de ses angles phi et psy, qui l’empechent detre dans le range de -50 à -60, du coup elle peut pas tourner comme elle veut
et 2, quand elle fait un lien P, elle perd le H de son groupement amine (NH), du coup elle peut pas fr de pont H
vrai ou faux, les zinc fingers sont très présents dans les facteurs de transduction
faux, sont très présent dans les facteurs à transcription, donc ce sont des protéines qui peuvent se lier à l’ADN et à l’ARN
fibroids de la soie a des feuillets beta cmt
antiparallèles. C DES FEUILLETS ANTIPARALLÈLE QUI SONT EXTENSIBLE D’UN COTÉ ET QUI SONT INEXTENSIBLES DE L’AUTRE
quels sont les structures secondaires répétitives, régulière
helice alpha er feuillet plissé beta. correspondent à environ 50% d’une protéine globulaire
quels sont les structures secondaires non-répétitives, irrégulière
solénoïdes (coil) ou les boucles, qui permettent de relier les structures secondaire régulières entre elles. c lautre 50% de la protéine globulaire
le repliement pour se rendre à la structure tertiaire dépend de quoi?
- liaison H
- pont électrostatiques
- pont disulfure
- effet hydrophobe
décris tonneau alpha beta
8 hélices alpha et 8 feuillets plissé beta, ou les feuillets sont PARALLÈLES et sont reliés ensemble par de hélices
nomme les 2 domaines quon retire pyruvate kinase
- domaine de liaison à l’ATP ; beta psk ton freree court trop énergétique et c le premier Domain
- domaine de liaison au susbtrat (ye au centre)
- domaine régulateur de l’activité
principale force de stabilisation des protéines
domaine hydrophobe, psk la protéine va vrm se replier sur elle et va etre + stable psk les parties hydrophobes vont etre a linterieur
vrai ou faux, les chaperonnes moléculaires qui s’assurent du bon repliement des protéines ne sont pas ATP dépendante.
faux, elles le sont.
les résidus cystéine sont nécessaires pk
à la formation et/ou à la stabilisation de la structure 3D de certaines protéines
quels sont les conditions ou les protéines peuvent etre dénaturés
- si temp est trop élevé
- si conditions inadéquates de pH
- si concentration salines
ca dénaturent les protéines, donc ca les déplie et ca les rend sous leur forme inactive, mais ce sont des modifications généralement réversibles
la créatine kinase est une enzyme impliqué dans quoi?
dans la génération de molécules énergétiques pour les muscles ou d’autre tissus.
lorsque un tissu se brise, il ya relâche de créatine kinase dans le liquide extracellulaire et dans les sang. donc si on fait un prélèvement sanguin, on pourra savoir quel type de tissu a été endommagé (psk CK MM c muscles squelettique, CK MB c musique cardiaque et créatinine kinase BB c tube digestif et structures cérébrale)
que veut-on dire par maladie associées à des défauts de conformation d’une protéine (structure quaternaire!)
tas des dépôts amyloïdes de protéines mal repliées, qui ne sont pas éliminés. ce qui se passe c que ces dépôts forme des feuillets plissés beta et s’empilent, donc les protéasomes ca devient presque impossible pour eux de les détruirre, et ca mène a la mort des cellules éventuellement.
on retrouve ca chez plusieurs maladies neurodégénératives comme parkinson, truc de prion, Alzheimer, etc.
que veut-on dire par maladie associées à des défauts de structure d’une protéine (structure quaternaire!)
simple exemple de l’anémie falciforme : dans l’hémoglobine, au lieu d’un acide glutamique en position 6, t’as une valine, ce qui nique tt ton Hbs psk la il va etre déformé et comme il va etre déformé, il pourra pas bien circuler et va etre détruit. moins d’éryhtrhocyte = anémie!
que veut-on dire par complémentaire moléculaire dans les protéines (structure quaternaire!)
les protéines forment des structures qui interagissent avec d’autre protéines bien spécifiques. ces interactions sont maintenus grace à des interactions non-covalentes. ex: antigène qui se lie à un site spécifique d’un anticoprs
acéthylation et méthylation ont lieu sur quel a.a?
lysine et arginine
vrai ou faux. la polymérisation dépend de l’hydrolyse de l’ATP en ADP
vrai, psk quand ATP est hydrolysé en ADP, il libère de l’énergie et un groupement phosphate, et cette énergie peut etre utilisé pour faire polymérisation
beta tubuline structure
2 feuillets plissé beta (BE-TA)+ 12 helice alpha (YA 12 LETTRES DANS LA BETA TUBULINE). check limage de lina sur le cours 2
médicament qui va déstabiliser les interactions entre protofilaments
colchicine
vrai ou faux, les filaments intermédiaires ont un role dans la motilité
faux, pas de role, mais sont still connectés aux filaments d’actife et de microtubules
vrai ou faux, les filaments intermédiaires requiert des nucléotides
faux, ils ont pas bsn de GTP/ATP
structure de filaments intermédiaires
ce sont des dimères d’hélices alpha, formée de 7 résidus d’a.a. dans ces 7 résidus-la, les A.A 1 et 4 de chaque résidu sont non-polaires et s’attirent entre eux
dimère empilé =
formation d’une double hélice (coiled coil)
structure de la Mb
protéine qui a 8 hélice alpha reliés ensemble par des boucles et possède 1 groupement hème
Mb peut lier quoi?
le o2 au muscle.
peut aussi lier le co psk l’affinité de l’hème pour le CO est 250x celle du muscle. donc elle donne un O au muscle et reprend plusieurs co
vrai ou faux. pour la myoglobine ; t’as bsn de bcp de o2 pour atteindre une saturation maximale de la Mb
faux, la saturation augmente à de faibles concentrations de o2, donc tas vrm pas bcp de bcp de o2 pour etre saturé au max
graphique de la myoglobine
hyperbole
1 hb peut transporter cmb de o2 en meme temps?
4 hème = 4 o2 en meme temps
HBE et HBF sont des hémoglobines qu’on qualifierait d’embryonnaire. pk?
psk HBE est seulement la de la 1ere semaine de vie in utero jusqua 3 mois de gestation, puis elle est remplacé par HbF qui la remplace jusqua 6 mois post-natal,
après ca t’as HBA qui remplace la HBF, après 6 mois post-natal mais elle apparait dès la naissance
vrai ou faux. HBE et HBF ont une affinité plus basse pour le o que HBA
faux, elles doivent avoir une meilleure affinité que HBA is on veut que le bebe pogne tout le sang quil a de bsn
pk dit-on que le BGP diminue l’affinité de l’Hb pour O2
psk il se met au milieu et stabilise l’Hb la conformation T de l’Hb. en stabilisant la conformation T, qui est la conformation desoxyhémoglobine, le 2-3BPG diminue l’affinité de l’Hb pour le O2
pk dit-on que HBF a une meilleure affinité pour le po2 que HBA
psk cest les sous-unités beta, qui ont des cavités chargé + qui attirent le 2-3BPG. comme HBF (a2gamma2) na pas de sous-unité beta, il ne lie pas le 2-3-BPG et donc a une meilleure affinité pour le O2.
c important psk c comme ca que transfert maternel de o2 via le placenta se ft mieux
pk dit-on que o2 et 2-3BPG s’excluent mutuellement?
psk si po2 augmente comme par exemple dans les poumons, le 2-3-BPG est déplacé et l’affinité pour le o2 augmente
les lipides peuvent former des polymères
faux,
roles des lipides
- protecteur (isolants thermique, coussinet)
2.structural (pour les membranes plasmiques) - énergétiques (on peut stocker les AG et ils peuvent etre réutilisé comme énergie)
- role dynamique
- role lors de la signalisation intracellulaire
un lipide est toujours bipolaire
faux, il peut aussi etre apolaire (neutre)
acide gras formule chimique
COO- + chaine d’hydrocarbure linéaire (entre 8 à 80C en nb pair), donc c des molécules ampiphiles
les AG insaturés ont un nombre maximal de double liaison C=C. quel est ce nombre?
maximum de 6 C=C. LES DOUBLES LINES NE COMMENCENT QU’AU 6E CARBONE
les AG avec plus que 24C sont le + retrouvé ou?
cires des plantes, insectes et bactéries
les AG polyinsaturés ( 2 ou + C=C) ont leur premiere C=C entre quel carbones? peut-on retrouver 2 C=C à la suite l’un de l’autre
le premier C=C est entre le C9 et le C10, et le reste des C=C sont apres le C10.
non, on peut pas retrouver peut-on retrouver 2 C=C à la suite l’un de l’autre
la majorité des C=C dans un AG polyinsaturés sont retrouvés en quelle configuration
cis
vrai ou faux, dans un AG, c’est le dernier carbone qui porte le COOH
faux, c le carbone c1
comment eskon nome la série dans un AG
en partant du dernier carbone, et la des que tu vois ta doublie liaison, tu prend le Carbone ou commence ta double liaison et cv etre ca ton w
ex : w3. tu commence du dernier carbone, tu vois que ta double liaison commence au 3e carbone a partir de la fin, c ton w3
quel type d’AG saturés sont retrouvé dans les graines
les AG à chaine longue aussi, mais qui ont entrer 20 à 24 C
Quel type d’AG saturés sont retrouvé dans les huiles, graisses animales et végétales
les AG à chaine moyenne, qui ont entre 12-20C
acide linoléique série
acide linolénique série
w6 (c le premier mais sa série est la plus long)
w3
proviennent des graines
quels sont les AG quon retrouve le plus souvent en cis
insaturés courbés ( cmt te rappeler : pense au is pour insaturés et c pour courbés (C(COURBÉ)IS(INSATURÉ)
les AG en conformation trans sont habituellement quoi?
des graisses, donc des AG solides à température ambiante. pense à un bloc de beurre
vrai ou faux. le point de fusion diminue avec la longueur
faux, its illogic, + c long + tas bsn denergie pr le detruire
vrai ou faux. le pt de fusion augmente avec les configurations cis
faux, il diminue
vrai ou faux. les AG cis sont plus dangereux que les AG saturés
faux, ce sont les AG insaturés Trans qui sont plus dangereux que les AG saturés (trans deja tas des doubles liaisons en trans, donc t plus solide a cause de tes double liaison) que les AG saturés trans
vrai ou faux. les AG sont souvent libre dans la cellule
faux, sont souvent stocké sous forme de triglycérides (très grosse source d’énergie sous forme de gouttelette lipidique)
vrai ou faux, les savons sont des sels de stéroïdes
Faux, ce sont des sels d’AG (dinguerieeee jvien de capter pk ca nettoie tes mains de la graisse)
ou est ce quon retoruve l’acide linoléique et l’acide linolénique
- linoléique dans les huiles végétales
- linolénique dans les huiles de poisson
les icosanoides sont des dérivées de quoi? qui subissent quels types de réactions (nommes les enzymes)
d’arachidonate (20;4). donc acide arachidonique subit des rx d’oxydation et de cyclooxygénation, grace aux COX 1 ET COX 2, et la ca forme des cycles à 5C
les icosanoides deviennent quoi, suite à des rx de cycclooxygénation ?
- prostaglandines
-thromboxanes
-leucotriènes
possèdent tous des cycles à 5 C
nommes les icosanoides qui sont des vasoconstricteur
PGE2, PGF2 ET TXA2
pk esk ya une contradiction de l’aspirine pour les asmathiques?
psk aspirine a pour but d’inhiber cox 1 et cox2, quand t’inhibe ca, tu laisses bcp d’acide arachidonique dispo. donc ca fait plus de leucotriènes et les leucotriènes créent de la bronchoconstriction et donc peuvent causer des difficultés inflammatoires
lipides simples, présenté sous forme estérifiée par condensation de 1 AG + 1 alcool.
cires. sont vrm cutes c les plus petites et c les premieres dans ta liste, donc c pr ca que c les lipides simples
si l’alcool rattaché à la chaine est un glycérol, on aura quel type de cire?
glycéride
esters non polaires d’alcools monohydroxyliques à très longues chaines et d’Acide gras à longue chaine
céride
principaux constituants des cires animales, végétales et bactériennes
cires ; 1 ester d’AG avec un 1 alcool à chaine longue
vrai ou faux. les cérides sont des molécules solides à température ambiante
vrai, pense à la cire d’abeille (cire animale) !
fais un lien entre la formule chimique des cérides et leur température de fusion
comme la formule chimique des cérides c’est souvent 1 ester d’AG avec un alcool à chaine longue. . + la chaine est longue, + il faudra une température élevée pour la briser, donc c pour ca que la température de fusion est élevée
dans un céride, la chaine la chaine carbonée longue de l’alcool est souvent insaturé ou saturé?
SATURÉE
AG inertes chimiques
cérides, qui font partie des cires
AG qui composent les graisses et les huiles
triacylglycérols
quelles sont les lipides qui servent d’impérméablisants pour les plumes, les cuticules et la pellicule de fruits
cérides
AG hydrolysé par des lipases
tryacyglcérol ou triglycérides
AG dégradés sous forme de sels d’AG en présence de base fortes
triacylglycérol ou triglycérides
lipides qui servent de réserve énergétique a long terme chez la plupart des eucaryotes
triacylglycérols ou triglycérides
lipides servant d’isolants thermiques dans le tissus adipeux
triacylglycérols
AG insolubles en milieux aqueux, forment des émulsions instables
triacylglycérols
vrai ou faux. les glycérophospholipides sont 2 AG estérifiés en position 2 et 3 du glycérol-3-phosphate
faux. ce sont ont 2 AG estérifiés en position 1 et 2 du glycérol-3-phosphate
lipide qui stock de l’énergie sous forme de composé acyl gras, utilisé slm dans des conditions extrêmes (ex : jeune prolongé )
glycérophospholipides
