Eucaryotes : mycètes Flashcards
Quelles sont les caractéristiques essentielles des eucaryotes?
- Évolution divergente des procaryotes
- donc plus près des organismes complexes, multicellulaires
- certains ont des comportements multicellulaires, ou vont s’associer ensemble - Noyaux et compartiments cellulaires
- p.ex appareil de Golgi, réticulum endoplasmique, mitochondries - Deux grands groupes
- 1 mycètes (regroupent notamment les champignons)
- 2 protistes (protozoaires et micro-algues)
Décrire les caractéristiques des mycètes.
On retrouve les champignons, moisissures et levures.
- Quantité
- Plus de 100 000 espèces, mais potentiellement plus de 1.5 millions
- alors on n’a qu’un petit aperçu des mycètes - Taille
- macroscopiques et microscopiques
- macroscopiques: absence de photosynthèse, c’est la différence avec les algues et plantes
- micro: absence de locomotion, présence de paroi cellulaire et absorption des éléments nutritifs (osmotrophie, solubilisation des nutriments avant d’ingérer) sont les différence avec les protozoaires - Chimiohétérotrophes
- utilisent matière organique comme source de carbone et d’énergie
- sont majoritement saprophytes: dégradent cadavres de d’autres organismes - Environnements
- majoritairement dans le sol
- exceptions: moisissures aquatiques
- rôles dans le cycle de la matière: décomposition, dégradation - Effets indésirables
- dégradation des produits finis/manufacturés (bois d’oeuvre, textiles, aliments)
- p.ex plexiglas de la station spatiale russe MIR, a été dissous
- pathogènes des plantes (>5000) et quelques dizaines sont pathogènes chez animaux et humains
Quels sont des exemples d’utilisations des mycètes?
- Fermentation
- pain, bière, vin
- ex. saccharomyces cerevisiae - Production d’antibiotiques
- pénicilline produite par Penicillium notatum - Affinage des fromages
- production d’arômes, de saveurs
- roquefort (Penicillium roqueforti) et camembert (Penicillium camemberti) - Aliments
- miso, tempeh, sufu, sauce soya, café, chocolat
Décrire la morphologie des mycètes.
- Majorité sont pluricellulaires
- Structure de base: hyphes
- longues cellules filamenteuses ramifiées
- diamètre entre 5-10 microns et longueur variable - Présence de paroi cellulaire
- plusieurs polysaccharides selon le genre de mycète: hémicellulose, chitine
- mycètes inférieurs/imparfaits (dont on n’a pas encore identifié de stade de reproduction sexuée) ont des parois cellulaires faites de cellulose (glucose) - Intérieur de la paroi
- membrane cytoplasmique
- protoplasme (cytoplasme), réticulum endoplasmique, appareil de Golgi, noyau, organites comme mitochondries - Hyphes
- croissance de façon apicale (c’est la pointe qui croît)
- deux grands types:- 1 hyphe ceonocytique (non cloisonné)
- 2 hyphe cloisonné uninucléé ou multinucléé
- les septums (cloisons) ont des pores: échanges intercellulaires
- Mycélia
- un ensemble d’hyphes = un mycélium (des mycélia)
- 2 types de mycélia:- 1 végétatif = envahir territoire pour puiser nutriments et les échanger à la grandeur de l’organisme
- 2 reproductif = impliqués dans reproduction, production d’exospores (fonction de dispersion de l’organisme)
- ensemble de mycélia, les aériens et les reproductifs = thalle
- Dimensions
- couvrent souvent jusqu’à 35m
- le plus grand organisme vivant est un mycète qui fait 9km2, de 2400 ans, qui fait 605 tonnes - Parfois unicellulaires
- notamment les levures
- petite taille, mais tout de même supérieure à procaryotes en général
- reproduction par bourgeonnement
- diamètre 1-5 microns
- levures dimorphiques: transition d’unicellulaire à pluricellulaire (plupart sont pathogènes)
Donner deux exemples de levures dimorphiques.
- Candida albicans
- présents dans microbiote humain (urogénital et buccal)
- 50% des gens le portent, chez fumeurs: 90%
- quand il est présent dans l’environnement (forme non-pathogène): unicellulaire
- quand invasion dans un hôte (pathogène): pluricellulaire (quand il forme des hyphes) - Ustilago maydis
- dans l’environnement: pluricellulaire
- dans un hôte: unicellulaire (pour une meilleure dispersion, par le système vasculaire de la plante)
Les conditions environnementales dictent le changement d’une forme à l’autre pour soit se propager dans le sol ou causer une infection.
Quels sont les types de reproduction chez les mycètes?
- Asexuée/végétative/somatique
- la plus fréquente
- but: propager l’espèce, augmenter le nombre de cellules de l’organisme dans l’environnement, donc production de cellules filles
- 4 mécanismes: fission binaire, bourgeonnement (le plus fréquent chez les levures), fragmentation d’hyphes (hyphes brisés et emportés par microcourants et organismes à proximité) et formation de spores asexués (libérés dans l’environnement pour répartir l’espèce dans celui-ci)
- pas de “brassage” de gènes
- spores asexuées = conçues aérodynamiquement pour être en suspension dans l’air, 10% de celles-ci sédimentent en 24h (tombent sur le sol) et elles survivent mieux aux stress que mycélia (température, sécheresse, etc.)
- organes de fructification (qui produisent spores asexués) = leurs caractéristiques sont utilisées pour identification et classification des mycètes - Sexuée
- beaucoup plus rare
- fusion de 2 noyaux de 2 organismes distincts, mais sexuellement compatibles
- but: accéler évolution de l’organisme, produire une fille au bagage génétique différent
- modalités complexes: cycle haploïde/diploïdes, les étapes de ce cycle utilisées dans classification/identification des mycètes
Décrire la physiologie des mycètes.
- Xérophiles
-[eau] faible
0environnements à concentrations de sucres/hydrates de carbone très élevées, donc pas beaucoup d’eau libre, p.ex mélasses, nectars
-milieux dans lesquels les bactéries peinent à survivre - Mésophiles
- 22 à 30 degrés
- certaines capables de croître à 0, certaines à 37
- certaines dans tas de compost à 62 - Milieux acides
- plus que bactéries
DONC leurs conditions optimales sont difficiles pour les bactéries. Alors on utilise cela quand on crée des milieux sélectifs, p.ex: Sabouraux ou Rose Bengal (pH 5.6 et antibiotiques qui inhibent procaryotes)
- Majorité sont aérobies
- quelques unes sont anaérobies falcultives
- quelques anaérobies strictes (retrouvées dans rumen des ruminents) - Sources de carbone
- variées
- doivent être toujours d’origine organique (sont organotrophes, hétérotrophes) - Croissance plus lente in vitro que bactéries
- c’est pourquoi on utilise antibios dans milieux sélectifs, pour ne pas que ces derniers prennent le dessus sur le milieu de culture
Comment fonctionne la classification des mycètes?
Classification polyphasée (mélange de caractéristiques phénotypiques et analyses phylogénétiques), donc:
- Caractéristiques spores asexués/sexuées
- forme, pigmentation - Organes de fructification
- Étapes des cycles vitaux
- reproduction sexuée/asexuée
- étapes du cycle haploïde/diploïdes - Morphologie des cellules et mycélia
- Fungi imperfecti (champignons imparfaits)
- absence de cycle sexué: en fait, on n’a pas encore trouvé les stimuli environnementaux qui déclenchent leur reproduction sexuée - Phylogénie
- caractéristiques phylogénétiques
Expliquer des exemples d’associations symbiotiques de mycètes avec d’autres organismes.
- Lichens
- symbiose entre mycète et organisme photosynthétique unicellulaire (cyanobactérie ou algue)
- vivent dans conditions difficiles (environnements pauvres en nutriments, arides)
- rôle de l’algue/cyano = autotrophes (capturent CO2 pour produire de la matière organique) et __ (capture énergie lumineuse pour produire énergie)
- rôles des mycètes = absorption d’éléments nutritifs très efficacement (dont) qu’elles peuvent donc ensuite fournir aux algues/cytos, fournir structure physique très résistante
- quand on sépare les partenaires, ils meurent
- très peu d’excrétion, ils concentrent tout ce qui a dans l’environnement DONC très bons indicateurs de pollution (organismes sentinelles), car ils concentrent les polluants
- dangereux pour santé des organismes qui se nourrissent de lichens, quand ceux-ci ont concentré des éléments dangereux (polluants, radioactifs, etc.)
- capacité de concentrer polluants utilisée pour bioremédication: on ensemance lichens pour l’absorption éléments radioactifs et ensuite on les enfouit - Mycorhizes
- symbiose de mycètes dans le sol et racines des plantes
- analyse des racines de fossiles montre qu’ils étaient présents et ce seraient eux qui ont aidé l’implantation des plantes de l’océan vers le sol
- aujourd’hui, présents chez 80% des plantes vasculaires
- rôle de la plante: fournir hydrates de carbone pour nourrir le mycète (sucres)
- rôle des mycètes: absorber sels et minéraux pour les rendre accessibles à la plante
- “Wood Wide Web” : réseau de micorhizes dans la forêt
- expérience qui a mis en lumière le WWW: on a mis du CO2 radioactif au dessus de plants et on s’est aperçus que les plants envoisinants récoltaient jusqu’à 6% de la matière provenant de la fixation du CO2 radioactif
Quelles mycètes sont pathogènes/toxiques pour l’Homme?
- Candida albicans
- levure dimorphique
- présence normale dans microbiote (buccal et urogénital)
- mais quand arrivent débalancements hormonaux, antibiothérapie (mycètes insensibles aux antibiotiques, et bactéries éliminées, dont elles sont favorisées) ou immunosuppression: ils prennent le dessus
- causes: muguet (chez nourrissons, dans la bouche), somatites (infections dans prothèses bucales), infections urogénitales - Mycètes toxiques
- p.ex dans maisons dans lesquelles inondations/dégâts d’eau/infiltrations d’eau ont mal séché : développement de mycélia toxiques
- libèrent mycotoxines dans l’environnement qui causent des symptômes comme nausées, etc.
- p.ex. stachybotris chartarum, penicilium versicolore
- culture hydroponique de cannabis entraîne croissance de mycètes sous les murs (cachés dans structure de la maison)
Quels sont des exemples d’utilisations des mycètes?
- Production d’antibiotiques
- pénicilinne - Fermentations
- saccharymoyces cerevisiae
- saccharomyces carlsbergensis (bière) - Enzymes
- amlysases, lipases, Lactaid (produit par levures ou certains champignons), cellulases - POU (protéines d’origine unicellulaire)
- produire nourriture pour humains et animaux - Production de biocarburants
- p.ex éthanol à partir de résidus de maïs - Molécules bio-actives
- sujets de recherches
- retombées potentiellement positives (p.ex bloquer protozoaire qui cause malaria)
Décrire cryptococcous neoformans.
Levure dysmorphique.
- dans l’hôte: grande levure bourgeonnante, avec capsule de polysaccharides
- dans l’environnement: petite cellule
- cause une mycose
- infectent principalement les immunodéficients (VIH, sida, cancer, greffe d’organe récente)
- souvent dans excréments d’oiseaux
- cause: méningo-encéphalite, pneumonie
Décrire l’aspergillus flavus (production d’aflatoxines)
Mycète toxique.
- domaine de l’agriculture (grains donnés au bétail, noix, etc)
- saprophyte, dans le sol
- produisent aflatoxines cancérigènes
Décrire claviceps purpurea.
Mycète
- champignon
- affecte céréales comme seigle
- créent masses d’hyphes nommées ergots qui produisent des alcaloïdes toxiques amenant avrotement, mort, troubles du comportement (dérivé = LSD)
Décrire les pseudogymnascus destructans.
Mycète
- syndrôme du nez blanc chez chauves-souris
- psychrophiles (entre 4 et 20 degrés)
- colonies produisent un colorant brunâtre