Électrophorèse des protéines Flashcards
Qu’est-ce que l’électrophorèse?
Migration de molécules possédant une charge nette sous l’effet d’un champ électrique
L’anode est de quelle couleur? Chargé + ou -? Fait migrer quelles molécules?
Rouge. +. Les anions
La cathode est de quelle couleur? Chargé + ou -? Fait migrer quelles molécules?
Noir. -. Les cations
Quelles sont les 2 types d’électrophorèse?
- Conditions dénaturantes (SDS-PAGE)
- Conditions non-dénaturantes (PAGE)
Dans l’équation de la vitesse de déplacement (v), que signifie le “E”, le “q” et le “f”?
E : force du champ électrique
q : charge nette de la molécule
f : coefficient de friction
De quoi dépend le coefficient de friction?
- Masse (taille) de la molécule
- Forme de la molécule
- Viscosité du milieu
Qu’est-ce qui permet de stabiliser la migration?
- Électrophorèse en surface
- Électrophorèse interne
Quelle est le support le plus employé pour séparer les acides nucléiques?
L’agarose
Pourquoi le support doit être électriquement neutre?
Pour ne pas altérer la migration des molécules
Pourquoi il ne faut pas utiliser l’agarose naturelle?
Contient des groupements sulfates qui sont chargés négativement à pH neutre
Quelle est le support le plus employé pour séparer des protéines?
PAGE
Quelle est la meilleure orientation pout un gel qui est sensible à l’oxygène?
Vertical (PAGE), car l’oxygène inhibe la polymérisation
Les chambre sont de quelle orientation pour un gel d’agarose et pour un PAGE?
Agarose : Horizontal
PAGE : Vertical
Quelles sont les 2 radicaux libres pour la réaction de polymérisation ?
Persulfate d’ammonium
TEMED
Vrai ou Faux? L’acrylamide polymérisé est neurologique?
Non, il est neurologique seulement sous forme de poudre
Un gros % dans le gel est pour quelle type de molécules? Un petit?
Gros (15-20%) : Grosses molécules, car moins poreux
Petit (4-5%) : Petites molécules
Qu’est-ce que le SDS?
Détergent qui aide à dénaturer les protéines et qui se lie aux protéines en brisant les liens non-covalents
Comment agit le SDS?
Il donne aux protéines une charge nette indépendante de leur composition en acides aminés, ce qui permet de les séparer selon leur taille
Nommer des applications du SDS-PAGE
- Analyser pureté d’un échantillon protéique
- Déterminer la masse moléculaire d’une protéine
- Démontrer l’activité d’une protéase
- Déterminer si une enzyme possède des sous-unités et leur taille
- Permet de découper les bandes pour une analyse par MS
- Première étape pour un western blot
Quelle est l’agent réducteur pour briser les ponts disulfures entre 2 cystéines?
Le B-mercaptoéthanol
Comment sont dénaturé les protéines?
Par la chaleur (100)
Le SDS-PAGE est une système continu ou discontinu?
Discontinu, car 2 gels un par dessus l’autre. (pH différents)
Lequel migre plus vite, la glycine ou une protéine?
Glycine
À quoi sert le gel de concentration?
Permet aux protéines d’arriver en même temps au gel de séparation et donc aux protéines de même taille de migrer en une zone étroite. La séparation selon leur taille est optimal, car chaque bande est mieux séparées des autres