diversité génétique et diagnostics moléculaires

Question 1

quele mutation/variant génétique protège naturellement 10% des européens contre le SIDA/VIH

Answer 1

del32 du CCR5 ( récepteur cellulaire du virus)

Question 2

quelle est la famille d’isoformes métabolisant le plus de médicaments?

Answer 2

CYP

Question 3

Les genes codant les CYP sont monomorphes?

Answer 3

faux, poly morphes

Question 4

déficience en TMPT fait quoi?

Answer 4

accumulation de la 6-thioguanine: toxique pour la moelle osseuse
toxicité hématopoiétique (surtout sur les neutropénies)
aplasie medullaire

Question 5

cest quoi que TPMT fait?

Answer 5

dégrade la 6 mercaptopurine

Question 6

TPMT a une hérédité monogénique

Answer 6

vrai

Question 7

le gène TPMT est sur quel chromosome?

Answer 7

6

Question 8

le gène TPMT est monomorphe6

Answer 8

faux, polymorphe

Question 9

quels médicaments sont utilisés dans la voie de la TPMT ?

Answer 9

azathioprine (ou 6-mercaptopurine sinon)

Question 10

effet azathioprine

Answer 10

guerir cancers enfants

Question 11

mode d’action de la TPMT

Answer 11

ajouter un radical méthyl (S-méthylation) à ses substrat (enzyme de conjugaison) à l’azathioprine, la 6-mercaptopurine et la thioguanine pour les inactiver

Question 12

pourquoi l’azathioprine guérit le cancer?

Answer 12

car la thioguanine est une analogue de base purique et pyrimidiques de l’ADN : incorporation à l’ADN

TGTP inhibe Rac1

les 2 : apoptose cellulaire

Question 13

si déficience en TMPT, kosser quon fait?

Answer 13

diminue dose de 30-70% si déficience intermédiaire (hétérozygote)
si aucune activité (2 allèles) : méthotrexate

Question 14

action du méthotrexate :

Answer 14

inhibe la dihydrofolate réductase (DHFR)
inhibe voie des folates
folate indispensabe à synthèse purines et thymidines
pas de synthèse ADN : apoptose

Question 15

quels sont les dinucléotides les plus fréquents dans les mutations ?

Answer 15

CG en TG

Question 16

qu’implique la digestion pcr

Answer 16

enzyme de restriction pour trouer une mutation qui crée ou abolit un site de restriction : si il y a coupe : site de restriction ok si pas de coupe: site de restriction muté

Question 17

qu’implique l’allèle specific primer extension ?

Answer 17

ajouter des amorces spécifiques à certaines allèles pendant la PCR : les amorces qui connectent au bon nucléotides sont extendue et sinon, pas d’amplification

Question 18

qu’utilise le séquençage d’adn?

Answer 18

des ddNTPs fluorescents/marqués

Question 19

différence dNTP et ddNTP :

Answer 19

pas de oh (juste H) au carbone 3 du ribose

Question 20

2 techniques de PCR en temps réel?

Answer 20

sybr green et taqman

Question 21

comment la technique sybr green fonctionne :

Answer 21

technique de fluorescence qui suit l’amplification pcr avec le fluorescent marquant uniquement l’ADN double brin
plus tas de fluorescence plus tas de double brin à la fin d’1 cycle

Question 22

comment marche la pcr temps réel

Answer 22

pcr en temps réel regarde à quelle vitesse (cmb de cycle) l’échantillon fait la moitié de sa fluorescence maximale.
moins t’as besoin de cycle, plus tu as d’ADN de départ

Question 23

Ct =

Answer 23

nombre de cycles

Question 24

comment marche la technique taqman:

Answer 24

3 amorces dont 2 normales et 1 amorce taqman qui possède un reporter et un quencher. quand ils sont cote à cote : pas de fluorescence mais lorsque polymérase polymérise la section où il y a l’amorce, le quencher s’éloigne du reporter et ce derner fait de la fluorescence : 1 fluorescent par double brin synthètisé

Question 25

qu’utilise la MLPA:

Answer 25

2 sondes oligonucléotides s’hybride côte à côte et puis ajout ligase pour sceller les 2 sous-unités
si le trou est gros : plus d’ADN: insertion/ajout
si le trou est petit : délétion

Question 26

2 techniques de séquencage à haut débit :

Answer 26

454 et illumina

Question 27

différences illumina et 454:

Answer 27

illumina plus rapide
illumina sur biopuce / plaque de verre
454 sur billes
illumina amplifié en pont/clusters
illumin moins cher, plus petits fragments
illumina : pcr et séquencage sur plaque et 454 : pcr sur billes et séquancage avec bille et puits

Question 28

applications du séquencage à haut débit:

Answer 28

séquençage de l’exome

analyse adn foetal circulant