DIVERSITà GENOMICA Flashcards
DEFINIZONE,
genomi di due individui differiscono maggiormente a livello strutturale che a livello del singolo nucleotide,
- 4 24 mb di differenza dovute a varianti del numero di copie
- Circa 2,5 mb di differenze dovute a polimorfismi del singolo nucleotide
- Inserzioni o delezioni di corte sequenze
- Polimorfismi di lunghezza di unità ripetute come i microsatelliti ed i minisatelliti
DEFINIZIONE MUTAZIONE
varianti che hanno una frequenza superiore all’1%
UTILITA’ VARIAZIONI GENETICHE
malgrado una variazione genetica possa distruggere un organismo se avviene una posizione vitale del dna la sopravvivenza delle specie nel lungo periodo ha bisogno di cambiamenti nel dna per adattarsi a nuove situazioni ambientali
MUTAZIONI, TIPI
- Somatiche cioè avvenire in qualunque cellula somatica, tumori, mosaicismi,
- Costituzionali, in tutte le cellule dell’organismo tra cui le cellule germinali ed ereditabili
MUTAZIONI, TIPI IN BASE ALL’INSORGENZA
- Spontanee, frequenza bassa, in condizioni normali, possono avvenire durante la duplicazione, la ricombinazione e la segregazione,
- Indotte, frequenza maggiore, da agenti mutageni, come radiazioni, sostanze tossiche
MUTAZIONI , CLASSIFICAZIONI IN BASE AGLI EFFETTI
- Neutre, nessun effetto fenotipico
- Positive, effetto fenotipico vantaggioso, adattamento all’ambiente
- Negative, effetto fenotipico svantaggioso, patologico
MUTAZIONI IN BASE ALL’ENTITA’ DELL’ALTERAZIONI
- Mutazioni puntiformi sostituzione di singola base
- Delezioni duplicazioni di esoni o dell’interno gene
COSA AVVIENE SE INTERESSANO SITI DI SPLICING SI PUO’ AVERE
- L’eliminazione di un esone dal mrna ,
- Eliminazione di una parte dell’esone dal mrna
- L’inclusione di un introne o di una parte di introne nell’mrna
- Possono anche essere regioni UTR, enhancer
CLASSIFICAZIONE DELLE VARIANTI IN GENETICA MEDICA, 5 CLASSI,
- Benigne
- Probabilmente benigne
- Di incerto significato
- Probabilmente patogenetiche
- Patogenetiche
MALATTIE GENETICHE, TIPI
- Cromosomiche genomiche per variazioni numeriche o strutturali
- Geniche del DNA nucleare o mitocondriale, variazioni nella sequenza nucleotidica del gene da mutazione puntiforme da delezione/ duplicazione/inserzione intragenica o da meccanismi atipici quali da imprinting da espansione di triplette
- Multifattoriali determinata dall’azione contemporanea di fattori genetici, generalmente molteplici e di fattori ambientali
MOSAICISMO
DEFINIZIONI
- Quando una mutazione si verifica dopo il concenpimento vale a dire come evento post zigotico, si stabiliscono due popolazioni cellulari differenti, una normale ed una mutata,
- Quanto più precocemente avviene la mutazione, maggiore sarà il numero di cellule in cui è presente.
- DEFINIZIONE MOSAICISMO, condizione in cui in un individuo o in un tessuto sono presenti delle linee cellulari geneticamente diverse per una mutazione o una non disgiunzione di un singolo zigote.
Quando coesistono due popolazioni nello stesso individuo si parla di mosaicismo
TIPI DI MOSAICISMO
- Germinale, se è presente nelle cellule germinali, può essere trasmesso alla prole
- Somatico, può essere privo di conseguenze, se interessa geni che controllano la proliferazione cellulare possono essere responsabili dell’insorgenza dei tumori
ANOMALIE, TIPI
- Anomalie di numero
- Anomalie di struttura,