DIVERSITà GENOMICA Flashcards

1
Q

DEFINIZONE,

A

genomi di due individui differiscono maggiormente a livello strutturale che a livello del singolo nucleotide,
- 4 24 mb di differenza dovute a varianti del numero di copie
- Circa 2,5 mb di differenze dovute a polimorfismi del singolo nucleotide
- Inserzioni o delezioni di corte sequenze
- Polimorfismi di lunghezza di unità ripetute come i microsatelliti ed i minisatelliti

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2
Q

DEFINIZIONE MUTAZIONE

A

varianti che hanno una frequenza superiore all’1%

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3
Q

UTILITA’ VARIAZIONI GENETICHE

A

malgrado una variazione genetica possa distruggere un organismo se avviene una posizione vitale del dna la sopravvivenza delle specie nel lungo periodo ha bisogno di cambiamenti nel dna per adattarsi a nuove situazioni ambientali

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4
Q

MUTAZIONI, TIPI

A
  • Somatiche cioè avvenire in qualunque cellula somatica, tumori, mosaicismi,
  • Costituzionali, in tutte le cellule dell’organismo tra cui le cellule germinali ed ereditabili
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5
Q

MUTAZIONI, TIPI IN BASE ALL’INSORGENZA

A
  • Spontanee, frequenza bassa, in condizioni normali, possono avvenire durante la duplicazione, la ricombinazione e la segregazione,
  • Indotte, frequenza maggiore, da agenti mutageni, come radiazioni, sostanze tossiche
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6
Q

MUTAZIONI , CLASSIFICAZIONI IN BASE AGLI EFFETTI

A
  • Neutre, nessun effetto fenotipico
  • Positive, effetto fenotipico vantaggioso, adattamento all’ambiente
  • Negative, effetto fenotipico svantaggioso, patologico
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7
Q

MUTAZIONI IN BASE ALL’ENTITA’ DELL’ALTERAZIONI

A
  • Mutazioni puntiformi sostituzione di singola base
  • Delezioni duplicazioni di esoni o dell’interno gene
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8
Q

COSA AVVIENE SE INTERESSANO SITI DI SPLICING SI PUO’ AVERE

A
  • L’eliminazione di un esone dal mrna ,
  • Eliminazione di una parte dell’esone dal mrna
  • L’inclusione di un introne o di una parte di introne nell’mrna
  • Possono anche essere regioni UTR, enhancer
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9
Q

CLASSIFICAZIONE DELLE VARIANTI IN GENETICA MEDICA, 5 CLASSI,

A
  • Benigne
  • Probabilmente benigne
  • Di incerto significato
  • Probabilmente patogenetiche
  • Patogenetiche
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10
Q

MALATTIE GENETICHE, TIPI

A
  • Cromosomiche genomiche per variazioni numeriche o strutturali
  • Geniche del DNA nucleare o mitocondriale, variazioni nella sequenza nucleotidica del gene da mutazione puntiforme da delezione/ duplicazione/inserzione intragenica o da meccanismi atipici quali da imprinting da espansione di triplette
  • Multifattoriali determinata dall’azione contemporanea di fattori genetici, generalmente molteplici e di fattori ambientali
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11
Q

MOSAICISMO
DEFINIZIONI

A
  • Quando una mutazione si verifica dopo il concenpimento vale a dire come evento post zigotico, si stabiliscono due popolazioni cellulari differenti, una normale ed una mutata,
  • Quanto più precocemente avviene la mutazione, maggiore sarà il numero di cellule in cui è presente.
  • DEFINIZIONE MOSAICISMO, condizione in cui in un individuo o in un tessuto sono presenti delle linee cellulari geneticamente diverse per una mutazione o una non disgiunzione di un singolo zigote.
    Quando coesistono due popolazioni nello stesso individuo si parla di mosaicismo
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12
Q

TIPI DI MOSAICISMO

A
  • Germinale, se è presente nelle cellule germinali, può essere trasmesso alla prole
  • Somatico, può essere privo di conseguenze, se interessa geni che controllano la proliferazione cellulare possono essere responsabili dell’insorgenza dei tumori
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13
Q

ANOMALIE, TIPI

A
  • Anomalie di numero
  • Anomalie di struttura,
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14
Q
A
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