Cycle cellulaire et instabilité génomique partie 2 Flashcards
Vrai ou Faux:
Chez les humains, seulement 1% du génome code pour des gènes
Vrai
Vrai ou Faux:
Les cancers évoluent
Vrai
Vrai ou Faux:
Certains complexe peuvent être à la fois gatekeeper et caretaker
Vrai comme MRE11-RAD50-NSB1
Quelle est cette définition?
Ne régulent pas la prolifération cellulaire directement mais agissent en prévenant l’instabilité génomique. Ils interviennent dans les fonctions de réparation de l’ADN
Les caretakers
Donner un exemple de gatekeepers et un exemple de caretakers
Gatekeepers: p53, pRB
Caretakers: RAD51
En quel année le 1e mécanisme de réparation a été découvert?
Fin 1940
Expliquer l’erreur d’expérimentation de Kelner
Essai de génération de mutants chez
Streptomyces griseus par les UV; mais difficulté de
reproductibilité. Pétri: sur le dessus plus de viabilité
que les pétris dessous: exposition à la lumière visible
La photolyase est activé par la lumière, ce qui stimule la survie des mutations
Vrai ou Faux:
La GRAVITÉ des lésions que l’ADN subit est liée
au fait que cette molécule est UNIQUE au sein d’une cellule
et au CARACTÈRE TRANSMISSIBLE de ces atteintes
Vrai
Vrai ou Faux:
Les mécanismes qui existent pour déceler et corriger les lésions de l’ADN sont infaillibles
Faux
Ils sont non infaillibles
Que cause le MMS?
le MMS cause une alkylation sur les azotes des purines
Vrai ou Faux:
Le benzo[a]pyrène est oxydé dans les cellules et ils peut se fixé par la suite à la guanine
Vrai!
C’est un agent présent dans la cigarette
Les hydroxides (OH) causent des cassures _________ dans l’ADN
A. Simple brin
B. Double brin
A. Simple brin
Vrai ou Faux:
Les ROSs attaquent et brise la structure d’ADN
Vrai
G + ROS = 8-O-G engendre un changement _________ qui est la mutation la commune associée au cancer)
A. GC-TA
B. TA-GC
C. GC-TC
A. GC-TA
Quel test permet d’établir le pouvoir mutagène de composés?
A. Le test de bactéries
B. Le test de Amie
C. Le test de Ames
D. Le test de Anne
C. Le test de Ames
Quels sont les thérapies qui sont basées sur la réparation de l’ADN? (2)
La chimiothérapie et la radiothérapie
La chimiothérapie va cibler quelle type de cellule?
Les cellules qui prolifèrent vite! (autant les cancéreuses que celles saines)
Quel est le caractère important de tous les cancers?
A. Les cellules cancéreuses sont indestructibles
B. Les cellules cancéreuses sont en divsion continue
C. Les cellules cancéreuses peuvent être bénines
B. Les cellules cancéreuses sont en divsion continue
Quelle est la première drogue chimiothérapeutique utilisée chez l’humain?
Les agents alkylants (Nitrogen mustard)
À quoi correspond ces caractéristiques?
- Endommage l’ADN dans toutes les phases du cycle
cellulaire
- La cytotoxicité vient du fait que les brins de l’ADN sont
«soudés »
- Problème de réplication … si la cellule est dans cette
phase !
Les agents alklants !!!! (nitrogen mustard)
Vrai ou Faux:
Les drogues (agents alkylants) causent des dommages à l’ADN, mais il n’y a pas d’effet secondaire malgré tout
Faux
Les drogues (agents alkylants) causent des dommages à l’ADN donc elles peuvent créer des mutations secondaires
Vrai ou Faux:
Les agents alkylants (nitrogen mustard) font les ponts inter-brins lorsqu’ils s’insérent dans l’ADN
Vrai
Pourquoi les antimétabolites sont utilisés comme type de drogue en chimiothérapie?
Parce que la plupart sont des analogues de nucléosides qui vont interférer avec la synthèse de l’ADN
RÉPONSE DE MES NOTES PERSO
nucléoside modifié
La drogue va s’intercaler dans l’adn lors de la replication, et la polymérase va etre bloquer ou elle va avoir de la diffuculté a continuer son élongation donc les cellules restent en phase S
Quelles sont les deux voies de la radiothérapie? Expliquer chaque voie
Voie directe: on ionise le squelette de l’ADN et cela cause des dommages à l’ADN
Voie indirecte: On brise les molécules d’eau en OH- et en H+. Le OH- est le radical hydroxyde, qui va se déposé sur l’ADN et causé des cassures simple brin sur l’ADN (Cause des cassures simple brin sur deux brins adjacents)
Vrai ou Faux:
Les chimiothérapies et les radiothérapies peuvent engendrer des cancers secondaires
vrai
Quel est le principe majeur derrière la chimiothérapie et la radiothérapie?
S’assurer que les cellules saines n’accumulent pas
de lésions génétiques (dose est très importante)
Les cellules normales devraient être capable de
supporter ces traitements, alors que les cellules
cancéreuses, à cause de leur division accélérée
devraient mourir.
Quels sont les 5 mécanismes de réparation de l’ADN?
Base excision repair (BER)
Le mismatch repair
Nucléotide excision repair (NER)
Le non-homologous end joining
La recombinaison homologue
Vrai ou faux:
Avec BER, les bases sont excisés spécifiquement grâce aux glycosylases
Vrai
Parmi les dommages suivants, lesquelles sont reconnus par le BER?
A. Déamination
B. Dépurination
C. Alkylation
D. Réaction avec un carcinogène
E. Les dimères de pyrimidine
A, B, C et D
A. Déamination
B. Dépurination
C. Alkylation
D. Réaction avec un carcinogène
Comment fonctionne la réparation par excision de bases (BER)?
On a une DNA glycosylase qui va venir cliver l’uracile
Ensuite une 5’AP endonucléase est recruté pour venir cliver dans le but de creer une extrémité OH 3’
Ensuite une dRPase + DNA polymérase sont recruté au site 3’ pour mettre la bonne base
Ensuite une DNA ligase est amené pour réparer la coupure fait au squelette
Et voila, le brin est comme neuf!
Vrai ou Faux:
PARP est un acteur clé du BER
Vrai
Comment on fait pour détecter en labo les activités du BER?
L’uracile DNA glycosylase va venir créer un site AP (Abasique) à la place du U. On va pouvoir ensuite observée le tout sur un gel dénaturant (voir le nombre de fragment et la grosseur)
Vrai ou Faux:
L’essai comet permet de détecter le niveau de cassure, mais pas de savoir si c’est des cassures simple brin ou double brin
Vrai
Méthode utilisé pour voir l’activité de BER
Que peut-il se passer si BER tourne mal?
On va avoir la substitution de base qui peuvent altérer la protéine
Associé la protéine du mécanisme de réparation par mauvais appariement (mismatch repair) avec sa fonction
Protéine: Mut S, Mut L, Mut H
A. Stabilise le complexe
B. Reconnait les mauvais appariements (insertions/délétions de plus de 4 nucléotides)
C. Lie l’ADN qui est méthylé et forme un nick dans l’ADN (jusqu’à 1 kb upstream)
A. Mut L
B. Mut S
C. Mut H
Dans la réparation par mauvais appariement:
L’excision est accomplie par la coopération de _____ (une hélicase) qui déroule l’ADN vers le mismatch et une exonucléase (______) dégrade l’ADN, suivi de la resynthèse par l’ADN polymérase III et une DNA ligase.
L’excision est accomplie par la coopération de UvrD (une hélicase) qui déroule l’ADN vers le mismatch et une exonucléase (Exo1) dégrade l’ADN, suivi de la resynthèse par l’ADN polymérase III et une DNA ligase.
Le mismatch repair est extrêment présent dans quel type de cancer?
A. prostate
B. utérus
C. colon
D. peau
C. colon
Le NER (nucléotide excision repair) est beaucoup associé à quel cancer?
A. Prostate
B. Colon
C. Peau
D. Ovaires
E. Pancréas
C. Peau
Quels sont les conséquences des dimères de pyrimidines qui sont induits par l’UV?
A. Disturbent l’hélice d’ADN (distortions)
B. Bloquent la réplication de l’ADN
C. Dégradent les polymérases
D. Bloquent la transcription
E. Sont très génotoxiques
A, B, D, E
A. Disturbent l’hélice d’ADN (distortions)
B. Bloquent la réplication de l’ADN
D. Bloquent la transcription
E. Sont très génotoxiques
Les dommages des dimères de pyrimidine induits par l’UV sont enlevés par quel mécanisme de réparation?
Le NER (il reconnait les distortions de l’ADN)
Associé les rôles des protéines dans le NER avec la protéine
Protéine: XPC-R23, TFIIH, XPA, RPA, XPG, ERCC1/XPF, pol delta/epsilon
A. Excision du dommage, synthèse de l’ADN et réparation du dommage
B. Ouverture de l’ADN et localisation de l’ADN muté
C. Localise la distortion dans l’ADN et ouvre partiellement l’ADN
D. Incision
E. Maintient de la structure ouverte de l’ADN
F. Stabilisation de l’ADNsb
A. pol delta/epsilon
B. TFIIH
C. XPC-R23
D. XPG et ERCC1/XPF
E. XPA
F. RPA
Quels sont les deux types de reconnaissance de lésion dans le mécanisme NER?
GNER et TCNER
GNER reconnait les distortion et va ensuite recruté les protéines nécessaires pour réparer le dommage
TCNER est dans le cas où c’est l’ARN polymérase II qui est bloquée au niveau de la distortion. Elle va donc recruter des protéines qui vont reconnaitre la lésion et enclencher la voie commune pour enlever la mutation
La réparation est plus rapide dans le cas de TCNER
Quelles sont les maladies qui sont associées au GNER ou TCNER? (2)
Dire le défaut de réparation est causée par un GNER ou un TCNER défectueux
Xeroderma pigmentosum (XP)
GNER et TCNER
Le Cockayne Syndrome (CS)
TCNER
Quel maladie donne une prédisposition au cancer de la peau 2000 fois plus élevé?
Quelle maladie occasionne des problème de croissance?
Ces maladies là sont dû à un défaut dans quel mécanisme de réparation de l’ADN?
Quel maladie donne une prédisposition au cancer de la peau 2000 fois plus élevé? Xeroderma pigmentosum (XP)
Quelle maladie occasionne des problème de croissance? Cockayne Syndrome (CS)
Ces maladies là sont dû à un défaut dans quel mécanisme de réparation de l’ADN? NER
Les causes suivantes sont tous des causes de cassures double-brin. Associé la cause avec la catégorie lui correspondant soit:
Dommage exogènes, dommages endogènes ou dommages spécialisés
A. Radicaux libres, Bris de fourches de réplications
B. Méiose, Recombinaison V(D)J, Class switching
C. Radiations ionisantes, chimiques
A. dommages endogènes
B. Dommages spécialisés
C. Dommages exogènes
***Nouvelles sources de dommages: Chromotrypsis***
Qu’est-ce la chromotrypsis
Ce sont des mutations massives
On ne sait pas encore si c’est le résultat d’un seul évenement catastrophique ou si c’est l’accumulation de cassures graduelles ou si c’est une combinaison des deux!
Comment peut-on détecter les cassures double-brin?
Avec l’essai comet en conditions neutres
Le non-homologous end joining est favorisée durant quelle phase?
A. Phase G1
B. Phase S
C. Phase G2
D. Phase S/G2
A. Phase G1
La nucléase Artémis est retrouvé dans quel mécanisme de réparation de l’ADN? Quel est son rôle?
Dans le non-homologous end joining
Elle peut dégrader les extrémités qui sont non compatibles.
Vrai ou Faux:
La nucléase Artémis peut causer une perte d’information génétique
Vrai puisqu’elle dégradé les extrémités dans le mécanisme de non homologous end joining
Expliquer le mécanisme de non homologous end joining
- Liaison des extrémités par Ku70/80 et DNA-PKcs
- Exposition des extrémités et recrutement de XRCC4-ligaseIV-XLF
- Si les extrémités ne sont pas compatibles, on peut utilisé la nucléase Artémis pour dégradé et rendre les extrémités compatibles
Vrai ou Faux:
NHEJ est nécessaire pour assurer la stabilité génomique et la suppression de la translocation
Vrai
Vrai ou Faux:
On a l’augmentation de translocation nonreciproque dans les cellules qui sont déficientes en NHEJ
Vrai
Vrai ou Faux:
SW620 et LoVo sont deux lignées de cancer du colon qui présent peu de léthalité synthétique avec NHEJ
Vrai
Expliquer, en gros, la recombinaison homologue
On est en présence du bris de l’ADN double-brin
On va dégrader les extremité de l’ADN
Nécessite une nucléase (MRE11) qui doit etre assiter avec la nucléase (Exo1)
On crée un brin d’ADN avec une extremité 3’ protubérante
La recombinaison homologue se fait en phase S-G2 (mitose et chromatide soeur est présente donc on prendre une recombinase (rad51 avec ses cofacteurs) qui va aller chercher l’info genetique dans la chromatide soeurs intact. On peut donc copier l’info génétique pour réalinner un brin)
On va se dissocier de la chromatide soeur et on va ensuite pouvoir faire une réparation fidèle de la cassure double brin
Mre11, Rad50, Nbs1 et Xrs2 sont des protéines utilisées dans quel mécanisme de réparation de l’ADN?
Recombinaison homologue
Vrai ou Faux:
C’est le domaine FHA qui va reconnaitre le gH2AX dans la protéine Nbs1
Vrai
Quel est le rôle du complexe Mre11 dans la recombinaison homologue?
Il maintient les extrémités de l’ADN (le complexe est de par et d’autre de la cassure). De plus, le complexe va dégrader les extrémités
Vrai ou Faux:
Rad51 est un homologue à Rec A de E.coli
Vrai
Sans _____, on est pas capable de réparer efficacement les cassures double-brin
A. Ku70/80
B. Rad51
C. Mer11
B. Rad51
Pourquoi NHEJ est utilisé prioritairement pour réparer les cassures doubles brins chez les humains?
Chez humains bcp plus d’introns, donc moins grave si on est moins fidèle
Phase G1 longue qui n’a pas de chromatide soeur donc on peut pas aller copier (peut pas faire de recombinaison homologue)
Processus n’est pas toujours fidèle
Génome Grand (1% codant)
Cellules sont remplacées rapidement
La phase G1 est très longue
Quels sont les cofacteurs de RAD51?
BRCA1 et 2
Vrai ou Faux:
BRCA2 est muté dans le cancer du sein
Vrai
Vrai ou Faux:
BRCA1 et 2 (tout comme RAD51) inactivé chez la souris montrent une létalité embryonnaire
Vrai
Vrai ou Faux:
Lorsque BRCA2 est déficient, il est rare d’avoir des instabilité chromosomiques
Faux, il y a beaucoup de chance d’avoir des instabilité chromatiques
Quels sont les conséquence du tronquage de BRCA2 dans les cellules CAPAN-1? (3)
Pas de foyer de RAD51 après l’irradiation
Réduction de la recombinaison homologue
Pas de NLS (RAD51 est seulement présent au cytoplasme)
Vrai ou Faux:
La localisation nucléaire de RAD51 est dépendante de BRCA2
Vrai
Si BRCA2 n’est pas présent ou est muté, RAD51 ne pourra pas se rendre au noyau, il va etre pris au cytoplasme donc il ne pourra pas réparer les dommages à l’ADN)
Que se passe-t-il lorsque BRCA est absent ou muté (en rapport à Rad51)
Rad51 ne peut se rendre au noyau, il est séquestrer au cytoplasme donc il ne peut pas aller réparer le dommage à l’ADN, ce qui ultimement, cause de l’instabilité génomique
Comment on peut tuer les cellules BRCA2?
Avec les inhibiteurs de PARP
Vrai ou Faux:
Les inhibiteurs de PARP1 cause la létalité synthétique
Vrai
***pas sur du concept***
Associé la protéine/mécanisme avec les caractéristiques
- XPG
- APN1
- NHEJ
- Recombination homologue
- BRCA2
- SOD
- Ku70
- MSH2
A. Translocations
chromosomiques
B. Religation en phase G1
C. Cancer sein
D. Base excision repair
E. RAD51
F. Cancer colon
G. Cancer de la peau
H. Stress oxydatif
- G
- D
- B ou A
- C ou E
- E ou C
- H ou D
- B ou A
- F
Qu’est-ce qui décrit le non-homologous endjoining ?
A) DNA glycosylase, AP endonuclease, DNA polymerase, DNA ligase
B) Répare des dimères de pyrimidine
C) Ku répare les extrémités suivi d’une ligation
D) Les protéines trouvent le mismatch et l’éliminent
C) Ku répare les extrémités suivi d’une ligation
Les polymérases peuvent ajouter et vérifier des nucléotides – ceci est associé à quel type de réparation?
A) Réparation des cassures double-brin
B) Nucleotide excision repair
C) Le « proofreading »
D) Toutes ces réponses
D) Toutes ces réponses
À quel moment le « base excision repair » fonctionne?
A) C’est un mécanisme réparant l’ADN des gènes transcrits préférentiellement
B) C’est un mécanisme global
B) C’est un mécanisme global
