Cours 9 Flashcards
Qu’à découvert Felix d’Hérelle?
Les bactériophages
Qui a découvert la péniciline?
Fleming
Quels sont les 2 types de résistances aux antibiotiques?
La résistance intrinsèque est une caractéristique naturelle de certaines bactéries, les rendant naturellement moins sensibles à certains antibiotiques. Plusieurs mécanismes contribuent à cette résistance intrinsèque:
● Perméabilité aux médicaments: Certaines bactéries possèdent une membrane externe imperméable à certains antibiotiques, empêchant ces derniers d’atteindre leur cible à l’intérieur de la cellule.
● Efflux: Les bactéries peuvent utiliser des pompes d’efflux pour expulser activement les antibiotiques hors de la cellule, réduisant ainsi leur concentration intracellulaire et leur efficacité.
● Dégradation: Certaines bactéries produisent des enzymes capables de dégrader les antibiotiques, les rendant inactifs.
● Augmentation des mutations génomiques: Certaines bactéries présentent un taux de mutation élevé, ce qui peut conduire à l’apparition de mutations conférant une résistance aux antibiotiques.
La résistance acquise survient lorsqu’une bactérie initialement sensible à un antibiotique développe une résistance au fil du temps. Cette acquisition de résistance est le plus souvent due au transfert horizontal de gènes de résistance provenant d’autres espèces bactériennes. Les principaux mécanismes de résistance acquise sont:
● Modification des cibles: Des mutations au niveau du site cible de l’antibiotique peuvent empêcher la liaison de l’antibiotique et son action.
● Inactivation des médicaments: Les bactéries peuvent produire des enzymes qui modifient chimiquement les antibiotiques, les rendant inactifs.
● Efflux: Comme pour la résistance intrinsèque, les pompes d’efflux peuvent également être acquises par les bactéries, leur permettant d’expulser les antibiotiques.
Qu’est-ce que le résistome?
Le résistome représente l’ensemble des gènes de résistance aux antibiotiques présents dans un environnement donné, que ce soit chez les bactéries pathogènes ou non pathogènes.
Les gènes de résistance présents dans l’environnement peuvent être transférés aux bactéries pathogènes, notamment par transfert horizontal de gènes.
Quelle est la différence entre phage virulent et phage tempéré?
Phage virulent: Un phage virulent, comme le phage T4, a un cycle de vie exclusivement lytique. Cela signifie qu’après avoir infecté une bactérie, il se réplique rapidement, produit de nouveaux virions (particules virales) et provoque la LYSE de la cellule hôte.
Phage tempéré: Un phage tempéré, en revanche, peut établir une association stable avec son hôte, un état appelé lysogénie. Pendant cette phase de latence, l’ADN du phage, appelé prophage, se réplique en synchronisation avec le chromosome bactérien, soit sous forme d’épisome (ex: phage P1), soit en s’intégrant directement dans le chromosome bactérien (ex: phage λ)
Décrit le flux de carbone dans l’océan, en mettant l’accent sur le rôle de la matière organique et des virus.
POM (matière organique particulaire) les niveaux
trophiques des bactéries aux protozoaires, au
zooplancton, aux poissons et aux organismes de plus
grande taille.
La MOD (matière organique dissoute) est le plus
grand réservoir de carbone dans l’océan, qui n’est
disponible que pour les bactéries.
Shunt viral: Les virus marins jouent un rôle crucial dans le recyclage du carbone dissous. En infectant et en lysant les bactéries, les virus libèrent le carbone organique stocké dans les cellules bactériennes sous forme de MOD. Ce processus, appelé shunt viral, empêche le carbone de remonter la chaîne alimentaire traditionnelle et le rend à nouveau disponible pour les bactéries.
Ou se trouve le plus de particules virales? 87%
Sédiments
Pourquoi est-ce difficile de classer les PHAGES?
Contrairement à d’autres organismes, il n’existe aucun gène ou protéine universellement présent dans tous les génomes de phage. Cela rend impossible la construction d’un arbre phylogénétique englobant l’ensemble des phages, comme on peut le faire pour les bactéries ou les eucaryotes, en utilisant un gène marqueur commun, comme l’ARNr 16S pour les bactéries.
Les phages présentent une grande diversité morphologique, observable par microscopie électronique. Cependant, cette diversité morphologique ne reflète pas l’énorme diversité génétique des phages
Qu’est-ce que le clustering?
Le ‘clustering’ est une méthode de classification des phages basée sur la similarité de leurs génomes. Les phages présentant un haut degré de similarité génomique sont regroupés en clusters.
50% famille
70% genre
95% espèce
Explique le concept de moisaicisme
La phylogénie, l’étude des relations évolutives entre les organismes, est complexifiée chez les phages par le phénomène de mosaïcisme génomique.
Le mosaïcisme se traduit par une rupture de synténie, c’est-à-dire que l’ordre des gènes sur le génome du phage n’est pas conservé par rapport à un ancêtre commun. Ce phénomène est causé par l’acquisition de gènes provenant de phages phylogénétiquement éloignés.
Les virus ont une origine polyphylétique. Qu’est-ce que cela signifie?
Les virus auraient une origine polyphylétique, c’est-à-dire qu’ils auraient émergé à plusieurs reprises au cours de l’évolution, à partir de différents ancêtres cellulaires. Cette hypothèse est en CONTRASTE avec l’origine monophylétique des eucaryotes, qui partagent tous un ancêtre commun unique.
Explique la théorie kill the winner pour la diversité bactérienne causée par les phages
Cette hypothèse repose sur l’idée que les phages ciblent préférentiellement les bactéries les plus abondantes et les plus actives métaboliquement, c’est-à-dire les “gagnants” de la compétition pour les ressources. En éliminant sélectivement ces bactéries dominantes, les phages créent un espace pour que d’autres espèces bactériennes, moins compétitives en leur absence, puissent se développer.
Explique l’hypothèse de la reine rouge
Selon l’hypothèse de la Reine Rouge, l’interaction antagoniste entre phages et bactéries conduit à :
Variation Continue: Les bactéries développent constamment de nouveaux mécanismes de résistance pour échapper à l’infection par les phages. En parallèle, les phages s’adaptent en permanence pour contourner ces résistances
QU’est-ce que le blocage de l’adsorption par le bactéries?
Le blocage de l’adsorption est un mécanisme clé de la résistance bactérienne contre l’infection par les phages.
Si le phage ne peut pas s’adsorber, il ne peut pas injecter son matériel génétique dans la bactérie et l’infection est avortée.
Pourquoi Plusieurs Ilots de Défense chez les bactéries ?
- Pour se défendre contre une grande variété de phages
- Parce que les phages s’adaptent vite à la résistance
bactérienne
