Cours 5 Flashcards
Qu’est-ce qu’une communauté microbienne ?
Une communauté microbienne est l’ensemble des micro-organismes, de différentes espèces, qui coexistent dans un environnement spécifique (niche écologique).
Quelle est la différence entre une communauté et une population microbienne ?
Une communauté microbienne est composée de plusieurs espèces, tandis qu’une population microbienne est un groupe d’individus appartenant à la même espèce, définie dans le temps et l’espace.
Pourquoi les communautés et populations microbiennes sont-elles considérées comme dynamiques ?
Les communautés et populations microbiennes sont dynamiques car leur composition et leur abondance peuvent fluctuer en fonction des conditions environnementales, des interactions entre espèces et de l’évolution des populations.
Quelles sont les deux grandes catégories d’interactions microbiennes ?
Les deux grandes catégories d’interactions microbiennes sont les interactions conflictuelles (compétition, amensalisme, prédation, parasitisme) et les interactions bénéfiques (commensalisme, pro-coopération, mutualisme).
En quoi la compétition est-elle la règle dans le monde microbien ?
La compétition est la règle dans le monde microbien car les micro-organismes d’un même biotope utilisent souvent les mêmes voies métaboliques pour exploiter les ressources disponibles. Un apport de nutriments spécifiques favorise les micro-organismes capables de les métaboliser, modifiant ainsi la composition de la communauté.
Expliquez la différence entre la compétition et l’amensalisme.
La compétition implique que deux organismes utilisent la même ressource, impactant négativement la croissance des deux partenaires. L’amensalisme est une interaction où un organisme produit une substance toxique qui nuit à un autre organisme, sans bénéfice direct pour le producteur.
Citez deux exemples de bactéries prédatrices et décrivez leur mode d’action.
Vampirococcus s’attache à la surface des bactéries pourpres photosynthétiques Chromatium minus et aspire leur cytoplasme pour se multiplier. Bdellovibrio bacteriovorus, une deltaproteobactérie mobile, pénètre dans le périplasme de bactéries Gram-négatives et s’y multiplie, conduisant à la lyse de la cellule hôte.
Quelle est la différence entre la prédation et le parasitisme chez les bactéries ?
La prédation implique l’élimination immédiate de la proie, tandis que le parasitisme est une interaction durable où le parasite exploite son hôte pour sa survie et sa reproduction, sans nécessairement le tuer.
Décrivez le commensalisme en utilisant l’exemple des E. coli intestinales.
Dans le commensalisme, un seul partenaire bénéficie de l’interaction. Par exemple, les E. coli aérobies facultatives de l’intestin consomment l’oxygène, créant un environnement anaérobie favorable à la croissance des bactéries anaérobies strictes comme Bacteroïdes, sans en retirer de bénéfice direct.
En quoi la pro-coopération est-elle une relation facultative ? Donnez un exemple.
La pro-coopération est une interaction bénéfique facultative, ce qui signifie que les deux partenaires peuvent survivre indépendamment l’un de l’autre, mais collaborent pour obtenir un avantage dans certaines conditions. Par exemple, Nitrosomonas oxyde l’ammonium en nitrite, nécessaire à la croissance de Nitrobacter. En retour, Nitrobacter détoxifie l’environnement en consommant les nitrites toxiques pour Nitrosomonas.
Quelle est la particularité du mutualisme par rapport aux autres interactions bénéfiques ? Illustrez avec un exemple.
Le mutualisme est une interaction bénéfique obligatoire, les deux partenaires dépendant l’un de l’autre pour leur survie. Par exemple, le champignon Rhizopus infecte le riz grâce aux facteurs de colonisation produits par la bactérie Burkholderia endofungorum qu’il héberge. En retour, Burkholderia produit des toxines (rhizoxines et rhizonines) nécessaires à l’infection.
Définissez l’adaptation et l’adaptabilité en biologie.
L’adaptation est l’ensemble des caractéristiques morphologiques et physiologiques qui permettent à un organisme de survivre et se reproduire dans un environnement donné. L’adaptabilité est la capacité d’un organisme à s’adapter à de nouvelles conditions environnementales.
Qu’est-ce que le Quorum Sensing et quel est son rôle dans les communautés bactériennes ?
Le Quorum Sensing est un système de communication bactérienne basé sur la densité cellulaire. Il joue un rôle crucial dans la virulence, la colonisation de l’hôte, la formation de biofilms, la défense contre les compétiteurs et l’adaptation aux changements environnementaux.
Expliquez la différence entre les auto-inducteurs AHL et PAI.
Les AHL (acyl-homoserine lactones) sont des AI non spécifiques reconnus par plusieurs espèces bactériennes, permettant une communication inter-espèce. Les PAI (peptides auto-inducteurs) sont des AI spécifiques reconnus par un seul récepteur, assurant une communication intra-espèce précise.
Comment le système Quorum Sensing peut-il être une cible pour de nouvelles molécules anti-virulence ? Quelles molécules sont impliquées?
En bloquant la communication via le Quorum Sensing, on peut empêcher les bactéries pathogènes d’exprimer leur virulence. Des stratégies prometteuses consistent à utiliser des molécules mimant les AI pour perturber la communication ou des molécules bloquant les récepteurs des AI.