Cours 7 : Les bactériophages Flashcards
Vrai ou faux. Tous les phages possèdent leur matériel génétique sous la forme linéaire?
Faux. Il peut être linéaire ou circulaire.
Si l’on observe une plage de lyse claire sur une gélose, observe-t-on l’action des phages tempérés ou des phages virulents?
Des phages virulents.
Quelles sont les 5 étapes pour l’attachement du phage T4?
1. Arrivée 2, Fixation 3. Contraction 4. Pénétration/percement 5. Injection de l'ADN
Vrai ou faux. L’interaction entre le fibre de la queue du phage T4 et le LPS de la surface bactérienne est très élevée.
Faux. Elle est faible.
Vrai ou faux. L’interaction entre les fibres courtes du phage T4 et les structure de surface de la membrane externe d’une bactérie est très forte et irréversible.
Vrai.
Vrai ou faux. La queue du phage T4 pénètre la membrane plasmique de la bactérie.
Faux. Il pénètre la membrane externe et le cytosquelette, mais pas la membrane plasmique.
Quelle protéine aide l’entrée de l’ADN phagique T4 à travers la membrane plasmique?
La protéine pilote.
Sous quelle forme est l'ADN du phage T4? a) linéaire b) circulaire et c)monocaténaire d)bicaténaire
a) linéaire
et
d) monocaténaire
Sous quelle forme se trouve l'ADN du phage M13? a)linéaire b)circulaire et c)monocaténaire d)bicaténaire
b) circulaire
et
c) monocaténaire
Comment l’ADN du phage M13 est-il introduit dans les bactéries?
Via un pilus F.
Vrai ou faux. Le phage M13 tue toujours les cellules bactériennes qu’elle infecte?
Faux. Les nouvelles particules de phages sont assemblées et libérées sans que la cellule ne soit tuée. Le phage M13 ralentit davantage la croissance des bactéries.
Sous quelle forme se trouve l'ADN du phage phiX174? a)linéaire b)circulaire et c)monocaténaire d)bicaténaire
b) circulaire
et
c) monocaténaire
Comment répliquer l’extrémité du génome linéaire du phage T7?
Avec des séquences répétées aux extrémités
Comment répliquer l’extrémité du génome linéaire du phage phi-29?
Avec une protéine terminale
À quoi sert la protéine terminale lors de la réplication de l’ADN linéaire du phage phi-29?
Elle sert d’amorce pour une nouvelle ronde de réplication.
Grâce à quel enzyme peut se faire la réplication de l’ADN linéaire du phage phi-29?
ADN polymérase phagique.
À quelle extrémité de l’ADN linéaire du phage phi-29 se trouve la protéine terminale?
À l’extrémité 5’.
Vrai ou faux. L’ADN du phage T4 est redondant aux extrémités.
Vrai.
Quels sont les deux stades de la réplication de l’ADN du phage T4?
Stade 1 : réplication à des origines spécifiques
Stade 2: Déplacement des brins d’ADN par la recombinaison
Vrai ou faux. Le phage T4 ne voit jamais son génome grandir en taille durant le processus d’infection.
Faux. Après l’infection, la tête du phage contient 103% de la taille d’un génome.
Qu’utilise le phage T4 pour former des concatènes?
La recombinaison.
Comment la réplication du phage lambda se fait-elle? (par quel mécanismes?)
Thêta et à cercle roulante.
Quelle protéines sont présentes dans le phage lambda pour initier la réplication de type thêta?
Protéines O et P.
Quelles protéines sont présentes dans le phage lambda pour initier la réplication à cercle roulant?
Protéine Gam et une endonucléase phagique.
Quel classe d’ARN doit être transcrite pour la biosynthèse des composants structurales du phage T7?
a) classe I
b) classe II
c) classe III
c) classe III
Quelle classe d’ARN doit être transcrite pour utiliser l’ARN polymérase d’E.coli dans la production de gènes précoces?
a) classe I
b) classe II
c) classe III
a) classe I
Quelle classe d’ARN doit être transcrite pour utiliser l’ARN polymérase de T7 pour fabriquer le gènes impliqués dans le métabolisme de l’ADN?
a) classe I
b) classe II
c) classe III
b) classe II
Expliquez la phase d’absorption du phage lambda à la surface de la bactérie. Quelles protéines phagiques et bactériennes sont impliquées?
La protéine J phagique s’attache à la protéine LamB d’E.coli. Attachement spécifique de la protéine J à une structure spécifique à la surface bactérienne.
Quelle protéine bactérienne de la membrane interne aide l’entrée dans la membrane de l’ADN phagique de lambda?
La protéine PtsM.
Pourquoi l’ADN phagique de lambda a-t-il tendance à se circulariser une fois dans le cytoplasme de la bactérie?
Pour éviter d’être dégradé par des endonucléases.
Quel mode de réplication est associé à un cycle lytique chez le phage lambda?
Circulation à cercle roulant.
Sous quelle forme se trouve le génome lambda lorsqu’il est encapsulé dans les phages?
Sous forme linéaire.
Sous quelle forme se trouve le génome de lambda lorsqu’il se trouve dans le cytoplasme de la bactérie?
Sous forme circulaire.
Vrai ou faux. La majorité des cellules infectées par le phage lambda entrent dans un cycle lysogénique.
Faux. >90% entrent dans un cycle lytique.
Pour déterminer si lambda entre dans un cycle lytique ou lysogénique, il y a compétition entre deux répresseurs. Quels sont-ils?
cI et Cro
Si le répresseur cI gagne sur le répresseur Cro, le phage lambda entre-t-il dans le cycle lytique ou lysogénique?
Cycle lysogénique
Si le répresseur Cro gagne sur le répresseur cI, le phage lambda entre-t-il dans le cycle lytique ou lysogénique?
Cycle lytique.
Vrai ou faux. Les facteurs environnementaux influencent CII.
Vrai,
À des hautes concentrations de CI, cI est-il activé ou inhibé?
inhibé.
Vrai ou faux. Cro inhibe le promoteur de cI.
Vrai.
À partir de quel gène est synthétisé Cro?
et cI?
Cro : PL
cI: PR
Vrai ou faux. Si CII est inactivé, le cycle lytique arrête.
Faux. Il commence. C’est la synthèse de CI qui est inhibée.
Pour commencer la synthèse, Cro doit se fixer sur quels sites?
OL et OR
S’il y a une carence de nutriments, est-ce le cycle lytique ou lysogénique qui est favorisé?
Lysogénique.
Dans le cycle du phage mu, si ner s’attache à l’opérateur O, qu’est ce qui se passe?
La synthèse de c est réprimée, et la cellule entre dans un cycle lytique.
Dans le cycle du phage mu, si c s’attache à l’opérateur O, qu’est ce qui se passe?
PnerAB est bloqué, et la cellule deviens lysogène.
Quel type de transposition est utilisé dans l’intégration et la réplication du génome du phage mu?
Transposition réplicative.
Que détermine l’orientation de la région G chez le phage mu?
L’infection de différentes espèces bactériennes.
La région G chez le phage mu code pour quelles protéines?
Les protéines de la queue, responsables pour l’attachement du phage à la LPS bactérienne.
L’inversion de la région G chez le phage mu est catalysée par l’action de quelle protéine? Dans quelle catégorie se trouve cette protéine?
Sous l’action de la protéine Gin, qui est une série recombinase.
Qu’est ce que la transduction?
Transfert d’ADN chromosomique par les particules phagiques.
Comment appelle-t-on le type de transduction où n’importe quel région chromosomique peut être transférée?
Transduction généralisée.
Quelle est la première étape d’infection?
L’adsorption.
Quels sont les 3 systèmes de prévention de l’adsorption?
- Blocage des récepteurs phagiques
- Production d’une matrice extracellulaire
- Production des inhibiteurs compétitifs.
Vrai ou faux. Les bactéries sont capables de produire des protéines capable de cacher ou masquer les récepteurs phagiques.
Vrai.
Quelle protéine d’E.coli bloque le récepteur de ferrichrome FhuA, site d’attachement pour certains phages comme T1, T5 et phi80?
Protéine Llp (lipoprotéine)
Quelle protéine d’E.coli est la cible de certains phages de types T?
La protéine OmpA
Comment se nomment les enzymes phagiques qui sont capable de dégrader l’EPS?
La polysaccharide lyase ou polysaccharide hydrolase.
2 bactéries sont capables de produire de l’alginate. Quelles sont-elles?
Pseudomonas et Acetobacter.
Quels phages de Pseudomonas sont capables de produire une enzyme qui dégrade l’alginase?
Comment se nomme cet enzyme?
Phages F116, phi GH4
Alginate lyase.
Les protéines Sie sont produites par quel type de phage?
Phage tempéré (prophages)
Vrai ou faux. Le phage T4 dégrade le peptidoglycane durant l’infection
Vrai.
Quelles protéines sont produites par le phage T4 pour bloquer la translocation d’ADN des autres phages?
Imm et Sp
Comment se nomme l’enzyme qui modifie l’ADN de l’hôte contre l’action de l’enzyme de restriction dans les système R/M?
Enzyme de modification (méthylase)
Le phage T4 peut modifier son génome par la production de quelle molécule dans le système R/M?
hydroxyméthylcytosine (HMC)
Dans le système CRISPR-CAS, à quoi sert la partie ARN?
À la reconnaissance
Dans le système CRISPER-CAS, à quoi sert la partie protéine?
Au clivage
Vrai ou faux. Le système Abi tue les cellules infectées.
Vrai
Quel système Abi est trouvé chez E.coli?
Système Rex
Quel type de bactérie contient plusieurs systèmes Abi?
Les bactéries lactiques
Dans le système Abi chez E.coli, quelle molécule Rex est associée avec les membranes? RexA ou RexB?
RexB
Combien de Rex A sont nécessaires pour activer 1 RexB dans le système Abi chez E.coli?
2 RexA sont nécessaires.
Vrai ou faux. Les introns, rétrons et intéines dérangent le produit de la séquence codante dans laquelle ils sont insérées.
Faux. Il ne le dérangent pas.
Vrai ou faux. Les introns peuvent faire des réactions d’autoépissage en absence de protéines.
Vrai
Les introns de groupe I sont retrouvés chez les phages de quelles bactéries?
E.coli et B.subtilis
La motilité des introns de groupe I est catalysée par quelle enzyme?
homing endonucléases
Chez quels organismes/structures sont retrouvés les introns de groupe II?
eubactéries, archaebactéries,, mitochondries et chloroplastes
Dans quel type de réaction sont impliqués les introns de groupe II?
Dans les réactions d’épissage in vivo.
Le domaine IV des introns de groupe II peut coder pour quoi?
Un ORF
L’ORF dans les introns de groupe II est impliqué dans quoi?
La mobilité
L’ORF possède 3 domaines, qui codent tous pour un enzyme.
Quels sont ces domaines, et quelle est leur fonction?
RT : Transcriptase
inverse Zn : endonucléase
X : maturase
Quelle type de réactions permet l’insertion à des sites aléatoires des introns de groupe II?
Retrotransposition.
Dans les deux types de réactions de mobilité des introns de groupe II, quelle est la plus fréquente?
Le retrohoming.
Comment est synthétisée la partie ADN des rétrons?
Par réaction de la transcriptase inverse, codée par le rétron.
Les rétrons ont été originalement trouvées chez quelle espèces bactérienne?
Myxococcus
Vrai ou faux. Les rétrons ne sont pas trouvés chez E.Coli
Faux
Pour quoi codent les rétrons, et quelle molécule est formée?
ARN, ADN et transcriptase inverse.
La molécule formée se nomme msDNA
Chez quel organisme a-t-on découvert les intéines?
On peut les trouver aussi chez quelle espèce?
Découvert chez les levures, mais présente également chez les eubactéries.
Vrai ou faux. Les extéines sont identiques entres-elles.
Faux. Elles ne possèdent aucune similarité.
Vrai ou faux. Plusieurs régions sont conservées chez les intéines.
Vrai
Quelles régions sont conservées chez les intéines? (3)
- Partie C-terminale : His-Asn
- Séquence des homing endonucléase trouvés chez les introns du groupe I
- Les intéines peuvent catalyser leur mobilité comme les introns
