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MCB2979-Bactériologie générale 1 > Cours 5 : plasmides > Flashcards

Cours 5 : plasmides Flashcards

1
Q

Vrai ou faux. Toutes les bactéries peuvent initier des pili de conjugaison.

A

Faux. Seulement celles possédant le plasmide à cet effet peuvent le faire

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Q

Quelles sont les 4 étapes de la conjugaison?

A
  1. Le donneur entre en contact avec le receveur par un pilus de conjugaison
  2. Le pilus se retire et forme une pore. Les cellules entrent en contact direct.
  3. Un des deux brins du plasmide est transféré dans le receveur
  4. Le donneur reconstitue le plasmide en synthétisant le brin complémentaire. Même chose pour le receveur, qui a maintenant le même plasmide et devient F+
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3
Q

Certains plasmides sont dit “autotransférables”. Qu’est-ce que cela veut dire?

A

Le plasmide contient toute l’info nécessaire pour le transfert de l’ADN (il est capable de faire des pili et transférer l’ADN)

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4
Q

Si un plasmide n’est pas autotransférable, il est dit “mobilisable”. Qu’est ce que cela veut dire?

A

Le plasmide a besoin des fonctions de transfert d’un plasmide autotransférable.

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5
Q

Les gènes tra agissent-ils en cis ou en trans?

A

En trans.

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6
Q

Pourquoi doit-il y avoir une régulation de la conjugaison?

A

Car les cellules ne doivent pas toujours exprimer leurs pili (éviter que certains bactériophages puissent s’y lier)

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7
Q

Dans le plasmide F, quel rôle est joué par la protéine TraJ?

A

C’est un activateur transcriptionnel de l’opéron tra.

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8
Q

Par quoi est régulé traJ dans la régulation de la conjugaison?

A

Par un ARN antisens finP et une protéine FinO.

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9
Q

Quel est le rôle de finO dans la régulation de la conjugaison?

A

Il stabilise l’interaction Arn-Adn et protège l’ARN finP contre la dégradation.

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10
Q

Quelle est la fonction des gènes traABCEFGHKLQUVW?

A

Biosynthèse et assemblage du pili

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11
Q

Quelle est la fonction des gènes traST?

A

Exclusion d’entrée

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12
Q

Quelle est la fonction de traI?

A

initiation du transfert, nickage spécifique à l’OriT, et ADN hélicase.

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13
Q

Quelle est la fonction des gènes traJ et finOP?

A

Régulation du transfert.

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14
Q

Les gènes tra codifient des protéines qui contituent deux composantes. Quel est le rôle de la composante DTR?

A

Transfert et Réplication de l’ADN

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15
Q

Les gènes tra codifient des protéines qui contituent deux composantes. Quel est le rôle de la composante MPF?

A

Génération du pilus.

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16
Q

Dans la composante MPF, on retrouve des protéines de couplages. Quel est leur rôle?

A

Ils mettent en communication les composantes MPF et DTR, pour synchroniser le transfert et la formation du pili.

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17
Q

On peut diviser le processus de conjugaison en 2 étapes. Quelles sont-elles?

A

1) Formation des matings pairs

2) transfert et réplication de l’ADN à cercle roulant

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18
Q

Quelle cellule est le transconjugant? La bactérie donneuse ou la bactérie receveuse?

A

La bactérie receveuse.

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19
Q

Vrai ou faux. Une cellule bactérienne ne peut produire qu’un seul pili.

A

Faux. Il peut y avoir plusieurs pili par cellule.

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20
Q

Pourquoi y a-t-il un raccourcissement des pili après contact des cellules bactériennes lors du processus de conjugaison?

A

Pour amener les cellules ensembles”mating pair formation”

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21
Q

Chez les bactéries Gram-, quelle est le signal pour le début du transfert de gènes?

A

Le contact entre la protéine terminale d’un pilus et un récepteur sur la membrane externe du receveur (LPS)

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22
Q

Combien y a-t-il de promoteur pour tous les gènes de tra?

A

Un seul promoteur

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23
Q

Vrai ou faux. Le complexe Tra qui forme un porte est un système de sécrétion de type II

A

Faux, c’est un système de sécrétion de type IV

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24
Q

Vrai ou faux. Les plasmides mobilisables sont incapables de produire un tube de sécrétion de type IV seuls.

A

Vrai. Ils ont absolument besoin de l’aide des plasmides autotransférables.

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25
Q

qu’est ce qui est nécessaire pour la mobilisation?

A

Une séquence OriT et des protéines de mobilisatiion (gènes mob).

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26
Q

Quel est le rôle des gènes mob?

A

Cliver le plasmide mobilisable à l’OriT?

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27
Q

Lorsqu’on veut faire une conjugaison tri-parentales, avec 3 cellules : 1 autotransférable, 1 mobilisable, et une cellule receveuse. Si on veut transférer le plasmide mobilisable présent dans la souche II à la souche III, comment se fait ce processus?

A

Le plasmide autotransférable transfère dans la cellule avec le plasmide mobilisable. Lorsque les deux plasmides sont combinés, le plasmide mobilisable peut utiliser les propriétés du plasmide autotransférable pour transférer dans la cellule receveuse III.

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28
Q

qu’est ce qu’un souche Hfr?

A

C’est un plasmide F intégré dans le chromosome de la cellule par recombinaison homologue.

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29
Q

Vrai ou faux. Lors du transfert du plasmide F dans une souche Hfr, le chromosome entier est souvent transféré?

A

Faux. C’est très rare.

30
Q

L’intégration d’un plasmide F dans un chromosome peut se faire par :

A
  1. Recombinaison homologue entre les éléments IS

2. Il y a plusieurs éléments IS trouvés sur le plasmide F et sur le chromosome bactérien d’E.coli

31
Q

Lors d’une conjugaison Hfr, quels sont les premiers gènes à être transférés?

A

Les gènes près de l’OriT.

32
Q

Les séquences IS sont utilisées de deux manières dans le chromosome et le plasmide. Quelles sont ces deux manières?

A

Intégration dans le chromosome du plasmide, et excision du plasmide.

33
Q

Vrai ou faux. L’intégration d’un plasmide dans un chromosome est réversible.

A

Vrai. Le plasmide peut subir une excision.

34
Q

Qu’est ce qu’un plasmide F’?

A

C’est un plasmide F possédant des séquences chromosomiques de l’hôte.

35
Q

À quel moment se forme un plasmide F’?

A

Lorsqu’un plasmide F intégré s’excise de manière aberrante du chromosome bactérien. Il apporte avec lui une partie du chromosome bactérien.

36
Q

Lorsqu’un plasmide F’ est transféré, que deviens la cellule receveuse?

A

Elle deviens F+, car l’entièreté du chromosome est transféré.

37
Q

Lorsqu’une cellule receveuse reçoit un plasmide Hfr, que deviens-elle?

A

Elle reste F-, car le plasmide ne se transfère jamais en entièreté.

38
Q

Est-il possible pour une bactérie de transférer de l’ADN à des cellules eucaryotes?

A

Oui! Par exemple, lors qu’une interaction entre les bactéries et les plantes.

39
Q

Agrobactérium tumefaciens est-elle une bacterie Gram+ ou Gram-?

A

Gram négative.

40
Q

Agrobactérium tumefaciens cause une maladie particulière chez certaines plantes. Quelle est celle maladie?

A

La galle du collet.

41
Q

Quelles sont les 4 étapes de l’infection d’agrobacterium tumefaciens?

A
  1. Attachement
  2. Ancrage
  3. Transfert d’ADN
  4. Formation des tumeurs.
42
Q

Vrai ou faux. Le plasmide Ti d’Agrobacterium tumefaciens est intégré dans le noyau de la plante infectée?

A

Vrai.

43
Q

Quel est le rôle des gènes noc et acc dans le plasmide Ti (tumor inducing)?

A

Ils codent des enzymes nécessaires au catabolisme des opines.

44
Q

Lorsqu’une plante se blesse, quelle est la période d’infection propice à Agrobacterium tumefaciens?

A

jusqu’à 30h après la blessure.

45
Q

Que libèrent les plantes blessées dans l’environnement, et quel est l’effet?

A

Elles libèrent des composés phénolés comme l’acétylsyringone, un produit qui induit les gènes de virulence (vir) chez Agrobacterium.

46
Q

Quels sont les sites d’attachement d’Agrobacterium lors de la phase d’attachement de l’infection?

A

LPS et les produits des gènes chvAB,exoC et pscA

47
Q

Chez la plante, quel est le récepteur utilisé par Agrobacterium pour s’attacher à la plante?

A

L’acide polygalacturonique.

48
Q

Quelle est la période d’adhérance lors de l’infection par Agrobacterium?

A

2h après l’attachement de la bactérie au récepteur de la plante.

49
Q

En général, que se produit-il lors de la phase d’adhérance de l’infection d’Agrobacterium?

A

Il y a synthèse de cellulose par la bactérie. Les produits des gènes chvAB et pscA sont impliqués dans ce processus, et transportent les sucres et les polysaccharides. Au bout du compte, il y a formation d’un réseau de fibres qui entourent les bactéries et les fixent à la plante.

50
Q

Quelle est la région du plasmide Ti transférée à la plante lors de l’infection par Agrobacterium? Que contient cette région?

A

ADN-T. Cette région contient des gènes pour la production des opines, qui seront exprimés dans la plantes, et pour la production des facteurs de croissance pour former des tumeurs.

51
Q

Quel est l’avantage pour Agrobacterium d’infecter une plante?

A

La bactérie obtient de cette manière une source immortalisée de nourriture.

52
Q

Le segment d’ADN-T est transféré à la plante sous quelle forme?

A

Sous forme linéaire.

53
Q

Vrai ou faux. L’intégration de l’ADN-T dans le génome de la plante se fait par recombinaison homologue.

A

FAUX. L’intégration est aléatoire.

54
Q

Qui suis-je? Hormone végétale qui induit la croissance de la tumeur dans les tiges, lors du transfert d’ADN-T lors de l’infection d’Agrobacterium.

A

Cytokinines.

55
Q

Les gènes de virulence Vir du plasmide Ti sont-ils transférés à la plante? Quel est leur rôle?

A

Non! C’est seulement l’ADN-T. Les gènes de virulence codent pour des protéines impliquées dans la production et le transfert de l’ADN-T.

56
Q

Quelle est la fonction de la protéine virA produite par le gène vir?

A

C’est le récepteur des signaux libérés par les plantes blessées (acetosyringone). Si il est activé, la protéine s’autophosphoryle et active virG.

57
Q

Quelle protéine, une fois activée par virA, contrôle la transcription de l’opéron vir?

A

virG.

58
Q

Quelle est la fonction de la protéine virB?

A

C’est une protéine membranaire. Elle participe activement à la formation du pore de conjugaison.

59
Q

Quelle est la fonction de la protéine virC?

A

Cette protéine possède une fonction hélicase.

60
Q

Quelle est la fonction de la protéine virD?

A

C’est une endonucléase (relaxase), qui guide l’ADN-T dans le noyau de la cellule végétale.

61
Q

Quelle est le rôle de la protéine virE?

A

C’est une protéine ssb, qui stabilise le simple brin d’ADN-T transféré.

62
Q

Sur quelles protéines vir sont retrouvées les signaux NLS ?

A

VirD2 et VirE2

63
Q

Vrai ou faux. Il ne peut y avoir qu’un seul système sécrétoire de type IV par cellule pour le transfert de l’ADN-T?

A

Faux. Il peut y en avoir plusieurs.

64
Q

Quel sont les 4 éléments essentiels pour une recombinaison homologue?

A
  1. Homologie : séquences identiques ou très similaires
  2. Appariment entre 2 ADN bicaténaires complémentaires
  3. Enzymes de recombinaison
  4. Formation d’un hétéroduplex entre 2 molécules d’ADN
65
Q

Nommez 4 rôle de la recombinaison

A
  1. réparation de l’ADN
  2. Création de diversité
  3. Ségrégation des chromosomes et plasmides
  4. réarrangement d’ADN.
66
Q

Il existe 3 types de recombinaison. Quels sont-ils?

A
  1. La recombinaison homologue
  2. La recombinaison site-spécifique
  3. La transposition.
67
Q

Lors de la résolution des jonctions de Holliday, quel est le rôle de la protéine RuvB?

A

Elle possède une activité ATPase, et utilise l’énergie pour déplacer l’ADN (migration des branches)

68
Q

Quelle protéine permet de faire un clivage et ainsi résoudre la jonction de Holliday?

A

La protéine RuvC.

69
Q

Quel est le rôle de la protéine RuvA dans la résolution des jonctions de Holliday?

A

Elle se lie aux jonctions et garde la structure plate.

70
Q

Quel est le rôle de l’enzyme RecBCP chez E.Coli?

A

Il modifie les extrémités libres de façon qu’elle soient convenables pour la réparation par recombinaison. Donc, il permet de réparer les cassures bicaténaires.

MCB2979-Bactériologie générale 1 (12 decks)

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