Cours 10 : Métabolismes alternatifs Flashcards
Lors de la respiration aérobiques, quels sont les cofacteurs d’oxydoréduction réduits lors des réactions cataboliques?
Le NADH+H+ et le FADH2
Le NADH+H+ est chargé en électrons via quelles voies cataboliques?
Et le FADH2?
NADH+H+ : Glycolyse, voie ED, cycle de Krebs et béta-oxydation
FADH2: Cycle de krebs et voie de la béta-oxydation
Quelles sont les 3 différentes majeures entre les procaryotes et les eucaryotes pour la respiration aérobique?
1) Les eucaryotes ont un système de navette pour transporter les électrons du cytosol aux mitochondries; absence de ce système chez les procaryotes.
2) La composition de la chaîne de transport d’électrons varie chez les espèces bactériennes; les eucaryotes ont tous le modèle classique de la chaîne de transport
3) Uniquement chez les bactéries, la CTE peut être bifurquée et comprendre différents éléments selon la concentration en oxygène.
Chez les eucaryotes, dans quel compartiment cellulaire s’effectue la glycolyse?
Et le cycle de Krebs?
Glycolyse : Dans le cytosol
Krebs : Mitochondrie
Comment la CTE varie-t-elle selon les espèces bactériennes au niveau du système de transport d’électrons entre le complexe I et III ou II et III?
Il y a habituellement utilisation d’ubiquinone, mais il y a possibilité d’autres quinones.
Comment la CTE varie-t-elle selon les espèces bactériennes au niveau du système III?
Dans le modèle classique : cytochrome bc1, mais il y a un haut niveau de variabilité entre les espèces.
Vrai ou faux. Selon les espèces bactériennes, le système de transport entre les complexes III et IV reste stable dans la CTE.
Faux. Habituellement, le cytochrome c est utilisé, mais il y a également possibilité d’autres cytochromes selon l’espèce.
Comment le système IV de la CTE varie-t-il selon les espèces bactériennes?
La cytochrome oxydase varie par la nature variable selon le cytochrome.
Dans la CTE aérobique d’E.coli, de quoi est constitué le complexe III?
Du cytochrome b556 ou b558 en alternance selon la concentration d’oxygène.
Que retrouve-t-on dans la CTE d’E.coli au lieu du cytochrome c?
Les cytochromes o,a ou d selon la concentration en oxygène.
Chez E.coli, au moment où la CTE biffurque selon la concentration d’oxygène, si la concentration en oxygène est haute, quels cytochrome seront utilisés?
Le cytochrome b 556, puis le cytochrome o.
Pourquoi le cytochrome b558 est plus efficace en basse concentration d’oxygène?
Car il a une forte affinité pour l’oxygène.
Quel est le meilleur accepteur d’électrons possible pour la CTE?
L’oxygène moléculaire.
Au niveau de la respiration anaérobique, quel est l’accepteur terminal d’électron?
Autre chose que l’oxygène moléculaire/accepteurs alternatifs d’électrons
En anaérobiose, les gènes responsable de la CTE aérobique sont-ils produits?
Non… sauf le complexe I et l’ubiquinone qui restent présents en faibles quantités.
Dans la CTE anaérobique, le FADH2 et le NADH+H+ sont-ils utilisés comme donneurs d’électrons?
Pas le FADH2! Mais le NADH+H+ l’est un peu, mais faiblement.
Vrai ou faux. La compostion de la chaîne de transport anaérobique est relativement stable.
Faux. Elle est hautement variable selon la disponibilité des donneurs et receveurs d’électrons.
Quel est le principal donneur d’électrons pour la respiration anaérobique?
Le formate
Quels sont les 4 donneurs possibles dans la respiration anaérobique chez E.coli?
Formate, NADH+H+, glycérol-3P et lactate
Vrai ou faux. La même enzyme déshydrogénase membranaire est utilisée pour l’utilisation de chaque donneur d’électrons.
Faux! Une enzyme déshydrogénase spécifique est requise pour l’utilisation de chaque donneur d’électrons.
Comment est produit le formate en conditions anaérobiques?
L’enzyme pyruvate formate lyase est produite et scinde le pyruvate en deux en ajoutant la coA par son élément souffre à l’acétyl, réaction n’implquant pas de rédox ni de source d’énergie chimique. Cela produit une molécule d’acétyl coA et du formate.
Où est situé le site actif de la formate déshydrogénase?
Quelle conséquence cela a-t-il?
Du côté extracytoplasmique de la membrane externe.
Cela fait en sorte que le formate produit dans le cytoplasme doit être exporté au travers de la membrane interne bactérienne par un transporteur de type symport.
Comment se nomme le transporteur chez E.coli exportant le formate?
FocA.
En présence d’oxygène, les bactéries anaérobies facultatives vont-elles opter davantage pour un système aérobie ou anaérobie? Pourquoi?
Quelles couples de donneurs d’électrons/déshydrogénases seront alors utilisés?
Aérobie, pour un rendement maximal en terme de gradient de protons et production d’ATP.
NADH+H+/NADH+H+ déshydrogénase et FADH2/succinate déshydrogénase.
Pourquoi les couples glycerol3P/glycérol3P déshydrogénase et lactate/lactate déshydrogénase ne sont utilisés qu’en conditions de carence en formate et NADH+H+?
Car ils ne contribuent pas au gradient de protons.
Quelle est la principale quinone utilisée pour la respiration anaérobique?
Quelle est l’exception?
La ménaquinone.
L’exception est lors de l’utilisation du NADH+H+ comme donneur d’électrons, qui implique l’ubiquinone comme pour la chaîne de transport d’électrons anaérobique.
Chez E.coli, quels sont les accepteurs terminaux d’électron pour la respiration anaérobique?
Le nitrate, le nitrite, le TMAO, le DMSO et le fumarate.
Par quoi est effectué le transport des électrons des quinols à l’accepteurs terminal d’électron pour la respiration anaérobique?
Par une réductase membranaire spécifique à l’accepteur d’électrons.
De quoi dépend la nature de la réductase membranaire dans la respiration anaérobique?
De la disponibilité des accepteurs d’électrons selon les conditions environnementales de croissance.
