Cours 6 Flashcards

1
Q

Quelles sont les deux familles de recombinases?

A

Les séries-recombinases et les tyrosines recombinases

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Q

Quel enzyme favorise la recombinaison entre deux molécules distinctes?

A

Intégrases

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3
Q

Quels enzymes favorisent la recombinaison entre régions de la même molécule d’ADN?

A

Les résolvases et les invertases

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4
Q

Quelle est la distance entre les coupures d’une tyrosine recombinase?

A

6-8 pb

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5
Q

Vrai ou faux. La sérine recombinase clive un seul brin lors de la réaction de recombinaison.

A

Faux. Elle clive les deux brins.

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6
Q

Qu’est ce qu’un shufflon?

A

c’est un système de recombinaison qui permet à un plasmide de produire différents types de pili de conjugaison, permettant de faire la conjugaison avec d’autres types de bactéries.

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7
Q

Quel est le nom du plasmide contenant un shufflon?

A

Le plasmide R64.

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8
Q

En ce qui concerne la région G du phage mu, quel est le nom de l’invertase responsable pour le changement par recombinaison?

A

Invertase Gin

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9
Q

Le fimbriae de type I d’E.coli est codé par quel gène?

A

fimA

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10
Q

Qu’est ce qui contrôle l’expression du gène fimA?

A

FimBE, qui sont en fait des tyrosines recombinases.

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11
Q

Où se trouve le promoteur du gène fimA?

A

Dans une région d’ADN inversible de 314 p.b.

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12
Q

Vrai ou faux. Fim E fait une inversion dans un seul sens, et favorise le sens ON.

A

Faux. Il favorise le sens OFF, mais il est vrai qu’il fait une inversion dans un seul sens.

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13
Q

Vrai ou faux. FimB fait une inversion dans les deux sens, et donc favorise on ou off.

A

vrai.

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14
Q

À quel moment se produit l’inversion du promoteur de fimA?

A

Durant l’infection

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15
Q

Qu’arrive-t-il si le promoteur de fimA subit une inversion?

A

Le promoteur n’agit plus, et donc pas de production de fimA, et donc pas de production de fimbriae chez la bactérie.

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16
Q

Comment s’est faite la découverte des transposons chez les bactéries?

A

Grâce aux études de résistances aux antibiotiques avec des plasmides transférables.

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17
Q

Vrai ou faux. L’intégration des transposons se fait de manière aléatoire.

A

Vrai.

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18
Q

Vrai ou faux. Les transposons sont possèdent une recombinaison dépendante du système RecA

A

Faux. Ils en sont indépendants.

19
Q

Les gènes A et B sont côtes à côtes, et possèdent chacun leur propre promoteur. S’il y a une mutation par transposition dans le gène A, empêchant ainsi sa transcription, le gène B pourra-t-il tout de même être transcrit?

A

Oui, car les deux sont sous le contrôle de deux promoteurs différents.

20
Q

Quels sont les deux types de transposons?

A

les éléments IS et les transposons composés

21
Q

Quelle condition doit être remplie par les IR de deux séquences d’insertion pour permettre à la transposase de les exciser ensemble?

A

Ils doivent être identiques.

22
Q

Le transposon Tn3 et le phage mu utilisent quel mécanisme de réplication, et en quoi consiste-t-il?

A

Mécanisme de transposition réplicative. On peut retrouver le transposon à la fois au site originaire et au site cible.

23
Q

Les transposons Tn5 et Tn10 utilisent quel mécanisme de transposition, et en quoi consiste-t-il?

A

Le mécanisme cut and paste. Cela veut dire que le transposon est excisé d’un site originaire, et se déplace vers un site différent.

24
Q

Par quoi se distinguent les rétrotransposons des transposons?

A

Par leur intermédiaire à ARN (et non ADN)

25
Q

Qu’est ce que des ICE?

A

Ce sont des transposons transférés par conjugaison.

26
Q

Qu’est ce que des intégrons?

A

Des éléments géniques mobiles qui contiennent cassettes d’expressions.

27
Q

Les ICE possèdent-ils une origine de réplication?

A

Non

28
Q

Les ICE possèdent-ils une origine de transfert?

A

Oui.

29
Q

De quelle manière s’intègrent et s’excisent les ICE du chromosome?

A

Par recombinaison site-spécifique.

30
Q

Les ICE peuvent-ils survivre sous forme circulaire en dehors du chromosome?

A

Non, car ils n’ont pas d’OriT, et donc doivent être dans le chromosome pour pouvoir se répliquer et aller dans d’autres espèces bactériennes.

31
Q

Lors de la conjugaison des ICE, ces derniers sont sous quelle forme?

A

Circulaire.

32
Q

À quoi servent les gènes set dans les ICE?

A

La régulation

33
Q

À quoi servent les gènes int et xis dans les ICE?

A

À l’intégration et excision par recombinaison spécifique.

34
Q

À quoi servent les gènes Tra dans un ICE?

A

À la conjugaison par pili de type IV, donc synthèse de ce type de pili.

35
Q

Par quoi est induite la régulation dans les éléments ICE?

A

Par une réponse SOS, par des antibiotiques ou par le stress.

36
Q

Quelle est la structure de base d’un intégron?

A

Un gène intl (intégrase) suivi par une séquence de recombinaison attl. Entre les deux, il y a au moins un promoteur.

37
Q

Où peut-on retrouver les intégrons?

A

Dans le chromosome, dans les plasmides et souvent dans les transposons.

38
Q

Comment l’intégron recrute-t-il des gènes de résistance?

A

Par recombinaison attl-attc

39
Q

Les cassettes possèdent-elles des promoteurs?

A

Non.

40
Q

Dans les cassettes, quelle est la cible de l’intégrase?

A

Un site attc

41
Q

Il y a très peu de conservation entre les séquence attc. Par contre, à certains endroits, c’est conservé. Quelles sont ces régions?

A

Aux extrémités ICS et CS.

42
Q

Vrai ou faux. ICS n’est pas complémentaire à la séquence CS de la cassette circulaire.

A

FAUX. c’est toujours complémentaire!

43
Q

L’excision d’une cassette se fait par quel type de recombinaison?

A

attC x attC

44
Q

Les intégrations des cassettes se font par quel type de recombinaison?

A

attI x attC