Cours 6 Flashcards
Quelles sont les deux familles de recombinases?
Les séries-recombinases et les tyrosines recombinases
Quel enzyme favorise la recombinaison entre deux molécules distinctes?
Intégrases
Quels enzymes favorisent la recombinaison entre régions de la même molécule d’ADN?
Les résolvases et les invertases
Quelle est la distance entre les coupures d’une tyrosine recombinase?
6-8 pb
Vrai ou faux. La sérine recombinase clive un seul brin lors de la réaction de recombinaison.
Faux. Elle clive les deux brins.
Qu’est ce qu’un shufflon?
c’est un système de recombinaison qui permet à un plasmide de produire différents types de pili de conjugaison, permettant de faire la conjugaison avec d’autres types de bactéries.
Quel est le nom du plasmide contenant un shufflon?
Le plasmide R64.
En ce qui concerne la région G du phage mu, quel est le nom de l’invertase responsable pour le changement par recombinaison?
Invertase Gin
Le fimbriae de type I d’E.coli est codé par quel gène?
fimA
Qu’est ce qui contrôle l’expression du gène fimA?
FimBE, qui sont en fait des tyrosines recombinases.
Où se trouve le promoteur du gène fimA?
Dans une région d’ADN inversible de 314 p.b.
Vrai ou faux. Fim E fait une inversion dans un seul sens, et favorise le sens ON.
Faux. Il favorise le sens OFF, mais il est vrai qu’il fait une inversion dans un seul sens.
Vrai ou faux. FimB fait une inversion dans les deux sens, et donc favorise on ou off.
vrai.
À quel moment se produit l’inversion du promoteur de fimA?
Durant l’infection
Qu’arrive-t-il si le promoteur de fimA subit une inversion?
Le promoteur n’agit plus, et donc pas de production de fimA, et donc pas de production de fimbriae chez la bactérie.
Comment s’est faite la découverte des transposons chez les bactéries?
Grâce aux études de résistances aux antibiotiques avec des plasmides transférables.
Vrai ou faux. L’intégration des transposons se fait de manière aléatoire.
Vrai.
Vrai ou faux. Les transposons sont possèdent une recombinaison dépendante du système RecA
Faux. Ils en sont indépendants.
Les gènes A et B sont côtes à côtes, et possèdent chacun leur propre promoteur. S’il y a une mutation par transposition dans le gène A, empêchant ainsi sa transcription, le gène B pourra-t-il tout de même être transcrit?
Oui, car les deux sont sous le contrôle de deux promoteurs différents.
Quels sont les deux types de transposons?
les éléments IS et les transposons composés
Quelle condition doit être remplie par les IR de deux séquences d’insertion pour permettre à la transposase de les exciser ensemble?
Ils doivent être identiques.
Le transposon Tn3 et le phage mu utilisent quel mécanisme de réplication, et en quoi consiste-t-il?
Mécanisme de transposition réplicative. On peut retrouver le transposon à la fois au site originaire et au site cible.
Les transposons Tn5 et Tn10 utilisent quel mécanisme de transposition, et en quoi consiste-t-il?
Le mécanisme cut and paste. Cela veut dire que le transposon est excisé d’un site originaire, et se déplace vers un site différent.
Par quoi se distinguent les rétrotransposons des transposons?
Par leur intermédiaire à ARN (et non ADN)
Qu’est ce que des ICE?
Ce sont des transposons transférés par conjugaison.
Qu’est ce que des intégrons?
Des éléments géniques mobiles qui contiennent cassettes d’expressions.
Les ICE possèdent-ils une origine de réplication?
Non
Les ICE possèdent-ils une origine de transfert?
Oui.
De quelle manière s’intègrent et s’excisent les ICE du chromosome?
Par recombinaison site-spécifique.
Les ICE peuvent-ils survivre sous forme circulaire en dehors du chromosome?
Non, car ils n’ont pas d’OriT, et donc doivent être dans le chromosome pour pouvoir se répliquer et aller dans d’autres espèces bactériennes.
Lors de la conjugaison des ICE, ces derniers sont sous quelle forme?
Circulaire.
À quoi servent les gènes set dans les ICE?
La régulation
À quoi servent les gènes int et xis dans les ICE?
À l’intégration et excision par recombinaison spécifique.
À quoi servent les gènes Tra dans un ICE?
À la conjugaison par pili de type IV, donc synthèse de ce type de pili.
Par quoi est induite la régulation dans les éléments ICE?
Par une réponse SOS, par des antibiotiques ou par le stress.
Quelle est la structure de base d’un intégron?
Un gène intl (intégrase) suivi par une séquence de recombinaison attl. Entre les deux, il y a au moins un promoteur.
Où peut-on retrouver les intégrons?
Dans le chromosome, dans les plasmides et souvent dans les transposons.
Comment l’intégron recrute-t-il des gènes de résistance?
Par recombinaison attl-attc
Les cassettes possèdent-elles des promoteurs?
Non.
Dans les cassettes, quelle est la cible de l’intégrase?
Un site attc
Il y a très peu de conservation entre les séquence attc. Par contre, à certains endroits, c’est conservé. Quelles sont ces régions?
Aux extrémités ICS et CS.
Vrai ou faux. ICS n’est pas complémentaire à la séquence CS de la cassette circulaire.
FAUX. c’est toujours complémentaire!
L’excision d’une cassette se fait par quel type de recombinaison?
attC x attC
Les intégrations des cassettes se font par quel type de recombinaison?
attI x attC
