Cours 6: Génétique bactérienne Flashcards
Quels sont les 2 formes d’échanges d’information génétique chez les bactéries?
Transferts verticals: entre un parents et son descendant
transferts horizontals: entre 2 organismes distincts
Quelles sont les 3 types d’échanges bactériens?
1) transformation
2) conjugaison
3) transduction
Qu’est-ce que Griffith a fait en gros? Les sont les 3 principes de son expérience
Il étudie le transfert de la virulence bactérienne de la bactérie pathogène Strepto. pneumoniae;
1) types morphologiques des pneumocoques (S et R)
2) transformation des pneumocoques de forme R en forme S
3) agent transformant de l’ADN
Dans l’expérience de griffith, quelles pneumocoques étaient les virulentes? Qu’est-ce qui différencie les 2 types S et R
La forme S, qui a une capsule de polysaccharide… virulente!
La forme R n’a pas de capsule donc ne sont pas virulents et sont smoov
Qu’est-ce qu’il se passe dans l’expérience de griffin en fait?
- il inocule un rat avec la type cell smooth: le rat meurt
- il inocule un autre avec la pneumo rough donc sanc capsule: le rat survit
- il tue la S, mais sa capsule reste. Il inocule le rat avec la capsule: il survit
- il inocule le rat avec la capsule (smooth morte) + rough vivante = le rat est mort
APRÈS ISOLEMENT DU PATHO: both smooth and rough are alive… = TRANSFORMATION :)
Vrai ou faux, ce sont les protéine et les lipides qui sont les agent transformants de l’ADN dans la pneumocoque de griffin?
FAUX c’est l’ADN!
Qu’est-ce que la transformation bactérienne?
C’est le processus par lequel l’ADN retrouvé dans l’environement est absorbé par une bactérie. Il se retrouve là de façon artificielle ou accidentelle.
Que sont des transformants?
La cellule (bactérie) qui absorbe l’ADN libre, se recombinant à son chromosome.
La transformation bactérienne se base sur la ________ bactérienne.
Qui est l’aptitude que les bactéries ont d’________ les fragments libres et les _________ à leur génome.
Compétence.
absorber
incorporer
Quels sont les facteurs de compétence bactérienne au niveau cellulaire?
récepteurs
Nucléases
protéines se liant à l’ADN simple brin
Quels sont les paramètre pouvant influencer la compétence?
- espèce bactérienne
- milieu de croissance
- phase de croissance
- changement rapide de t*
V ou F? gram + et - are both competent?
TRUE!
Quels sont les 3 étapes de la transformation bactérienne?
a) Adsorption de l’ADN (récepteur)
b) Entrée de l’ADN (simple brin)
c) Recombinaison homologue (dans la cell, dans un plasmide)
d) Bactérie transformée (transformant ou recombinant)
Qu’est-ce qui empêcherait à la bactérie de ne pas intégrer l’ADN?
Si l’ADN n’est pas similaire au plasmide.
est-ce qu’un l’intégration d’un plasmide est possible sans recombinaison?
yeeees
In vitro, comment pourrions nous causer un transfert par l’Ecoli, qui ne le ferait jamais in-vivo?
Traitement par chlorure de calcium et un choc thermique.
l’entrée est alors forcée par la Déstabilisation par un choc électrique
Que stipule l’expérience de Lederberg et Tatum?
Ils ont pris 2 souches avec des capacités de synthèses opposées.
Les ont étalées sur des milieux minimaux pendant 4 a 5h, puis les 2 ensemble (3 géloses).
Dans les géloses avec 1 seule espèce, rien n’a poussé. Dans les géloses avec le mélange, 10 colonies ont poussées.
CONCLU: les souches mixtes se sont recombinées
Quelles sont les 3 caractéristiques essentielles de la conjugaison bactérienne?
1) contact physique entre les bacté
2) présence d’un facteur de fertilité dans les bactéries donneuses
3) transfert linéaire de l’ADN (plasmide) de la bactérie donneuse dans la bactérie receveuse)
Par quelle structure cellulaire se fait la conjugaison bactérienne?
Pili sexuel
Quelles sont les 3 types de donneurs génétiques chez les bactéries?
F+
Hfr
F’
Qu’est-ce qui caractérise les bactéries F+, et qu’arrive lorsqu’elles donnent à un F- (receveur)?
où se trouve le facteur de fertilité?
FACTEUR DE FERTILITÉ SUR PLASMIDE
Les F- deviennent F+, enherit le plasmide (donneuses)
Qu’est-ce qui caractérise les bactéries Hfr, et qu’arrive lorsqu’elles donnent à un F- (receveur)?
où se trouve le facteur de fertilité?
HAUTE FRÉQUENCE DE RECOMBINANTS, FACTEUR DE FERTILITÉ DANS LE CHROMOSOME À DES SITES SPÉCIFIQUES
Les F- enherit le gène dans son chromosome (recombinants bactériens), sans devenir F+
Qu’est-ce qui caractérise les bactéries F’, et qu’arrive lorsqu’elles donnent à un F- (receveur)?
où se trouve le facteur de fertilité?
ISSUS D’UNE ERREUR D’EXCISION D’UN HFR ET D’ADN CHROMOSOMIQUE,
FACTEUR DE FERTILITÉ SUR LE PLASMIDE
Les F- devient F+ enherit le plasmide avec un bout de chromosome. Les 2 bactéries finissent F’
Qu’est-ce que le transfert linéaire?
Lorsque la bactérie donneuse transfert son adn de façon linéaire à partir d’un point spécifique appelé l’origine de transfert.
Le plasmide F est une petite molécule d’ADN bicaténaire circulaire de 95-100 kpb,
extra ou intrachomosomique appellée (_______).
Celui-ci est _______ et _______
épisome
autoréplicable
autotransférable
Quels sont les deux états dans lequel le plasmide F est susceptibles de se répliquer… par quel type de cellule donneuse?
Hfr: intégré au chromosome de la cellule hôte
F+: libre dans le cytoplasme (plasmide F)
Définit moi les types de plasmides suivants:
1) Plasmide F
2) Plasmide R
3) Plasmide Col
4) Plasmide de virulence
5) Production d’antibiotique
6) Plasmide métabolique
1) Facteur de fertilité
2) Résistance aux antibiotiques et autres inhibiteurs
3) Production et résistance aux bactériocines (colicine)
4) Enterotoxines, invasion, antigènes,…
5) ex: streptomycine
6) dégradation de substances inhabituelles,…
Vrai ou faux: tous les plasmides peuvent être transférables?
NAUR
La conjugation bactérienne consiste en un transfert _____ et _____ du
chromosome bactérien (Hfr) ou du plasmide F de la cellule donneuse à la cellule receveuse (F-) à l’aide d’un contact _____ entre les cellules (contact initié par le _____ )
direct
unidirectionnel
direct
pili sexuel
Comment peut-on utiliser la conjugaison pour cartographier un chromosome bactérien? (méthode)
De quel croisement de bactéries (F) est-il question
- croisement Hfr x F-
- inhibition du croisement à plusieurs moments différents pour les échantillons
- étalement sur milieux sélectifs = évaluation de l’arrivée des marqueurs génétiques donc de leur place dans le chromosome
dans un graphique montrant la fréquence d’arrivée de présence du gène par rapport au temps affiche des courbes toutes plus basses que la dernière.
Laquelle illustre le gène le plus proche du pili/point d’origine?
La plus haute! à cause de sa fréquence durant toute la durée des autres
Que sont les bactériophages et quelles sont les 2 types présents?
Quel type de parasite sont-ils?
Virus de bactéries constitué d’un capside protéique. Ils contiennent une molécule d’ADN ou ARN (mono/bicartenaire) intra ou extracell. Ils sont parasites intracell obligatoire.
a) phages virulants
b) phages tempérés
Par quoi sont caractérisés les phages virulents? Leur cycle?
CYCLE LYTHIQUE
Lisent toutes bactéries qu’ils infectent
Par quoi sont caractérisés les phages tempérés? Leur cycle?
CYCLE LYTHIQUE ou LYSOGÉNIQUES
Lisent toutes bactéries qu’ils infectent (lytique) ou demeurent à l’état latent dans une bactérie hôte (lysogéniques).
Que sont les prophages?
La forme latente du génome viral qui réside dans l’hôte, sans le détruire.
Ex: Prophage de Lambda E. coli
Comment s’ingtègre un prophage au chromosome… prend l’exemple du lambda dans le chromosome de E.coli.
par recombinaison dans un site spécifique du chromosome de la bactérie.
Que sont des Bactéries lysogènes?
Bactéries possédant et transmettant à leur descendance le
pouvoir de produire des phages en absence d’infection
(elles possèdent l’ADN du phage) Ex.: E. coli (lambda), E. coli (P1)
Comment fonctionne le cycle lytique des bactériophages?
1) attachement du phage
2) entrée de l’ADN du phage, et dégradation de l’ADN de l’hôte.
3) synthèse du génome et protéines viraux
4) assemblage des génomes et prots en phages
5) relâchement des phages à l’extérieur de la cell: lyse de la cellule :(
Pourquoi on peut remarquer des trous dans les colonies sur géloses lorsque des phages sont introduits?
Puisqu’ils se reproduisent et détruisent les cellules avoisinantes
Comment pourrait ton remarquer l’action des phages dans une culture bactérienne en suspension?
La densité cellulaire diminue
Qu’est-ce que la transduction bactérienne?
Transfert génétique au cours duquel un ou plusieurs gènes bactriens sont transmis d’une bactérie donneuse à une receveuse par l’intermédiaire d’un bactériophage transducteur (vecteur).
Le bactériophage transporte le chromosome bactérien de la bact donneuse à la receveuse.
Quels sont les 2 types de transduction?
généralisée
spécialisée
Qu’est-ce qui définit la transduction généralisée?
phages tempérés ou virulents transportent un exogénote bactérien qui correspond à n’imorte quel fragment du chromosome de la bact donneuse
Quelles sont les étapes de la cinétique de transduction généralisée?
1) Transfert de marqueurs génétiques de la donn à la recev par un vecteur phagique
2) recombination de ces marqueurs au génome de la bact recev
Quelle est la cinétique de la transduction?
1) infection phagique des bactéries donneuses - le phage dégrade l’ADN de la cellule
2) Erreur lors de l’assemblage des phages (encapsidation), un rare phage va encapside l’ADN de la cellule bactérienne.
3) lyse de la bactérie infectée, les phages transducteurs (adn de bactérie) et normaux sont libérés
4) Infection de bactéries réceptrices par les phages normaux et transducteurs. La cellule se faisant infecter par le phage tranducteur ne lyse pas la cellule, mais bien recombine son adn
Les phages transducteurs ne contiennent pas d’ADN viral, vrai ou faux?
VRAI!
Qu’est-ce que la transduction spécialisée?
lorsqu’un phage tempéré a inséré dans son génome un fragment d’ADN de bactérie donneuse qu’il a sélectionné. Ce, de manière stable.
ex: lambda, e.coli
Quelle est la cinétique de la transduction spécialisée?
1) libération du prophage du chromosome de la bactérie sauvage lysogène donneuse
2) erreur d’excision du prophage et le prophage est mtn hybride avec une partie d’ARN bactérie ajoutée à son ADN phagique
3) Phage mature et fais la lyse de la cell pour s’en sortir.
4) phage normal/transducteur infecte une bactérie recev qui ne peut pas synthétiser le gène qu’ils porte (ex: lactose)
5) recombinaison homologue de l’ADN (de la bact donn) transduit au génome de la bactérie receveuse (elle peut mtn synthétiser le gène donnée par le phage)
Comment on appelle une bactérie infectée par un phage transducteur (incapable de lyser la bactérie) après intégration de l’ADN par recombinaison son le génome?
transductant
RÉPOND OUI OU NON
Transduction généralisée
1) phage a adn viral?
2) adn bactériel porte un gène spécifique?
3) lyse de la cell transductée?
naur
naur
naur
RÉPOND OUI OU NON
Transduction spé
1) phage a adn viral?
2) adn bactériel porte un gène spécifique?
3) lyse de la cell transductée?
yes
yes
yea, mais éventuellement
