Cours 6 - Fin Intra Flashcards

1
Q
La gestion du heat sock chez B.subtilis, il utilise:
A) Facteur sS
B) Facteur sE
C) Facteur sH
D) Facteur sigma normal
E) Répresseur HrcA
F) Protéine Ef-tu
A

D) Facteur sigma normal

E) Répresseur HrcA

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Q

Avec quoi intéragit HrcA?

A

opéracteur CIRCE, réprim les gènes à basse température

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3
Q

Que fait Groel (heat shock de b.subtilis?

A

Relie la protéine HrcA, lorsque la température augmente, groel replie d’autres protéines, hrca n’est pas repliée donc expression du heat shock

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4
Q

Comment se gère le heat shock chez les gram+?
A) Quel facteur s?
B) Quel est l’ihnibiteur?
C) Par quoi passe la voie de signalisation

A

A) sB
B) anti-sigma (intéragit avec la polymérase)
C) Phosphorelai par des serine-thréonines kinases

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5
Q

Gestion du heat shock chez les gram+:

Quelles sont les protéines périplasmiques? Que sont-elle (type de protéines)?

A

Famille Rsb: RA, RB, RC, RD

Sérine-thréonine kinases

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6
Q

Gestion du heat shock chez les gram+:

Comment fonctionnent les protéines périplasmiques?

A

Détecte un manque d’énergie (pénurie de carbone), un stress environnemental (heat shock, pH)
- Phorphoryle RsbS -> phosphoryle ou déphospho des protéines régulatrices -> relachement anti-sigmaB (rsbW) ->inhibition

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7
Q

Que font les sRNA en cis (3)?

A

Inhibent la traduction (se lient avec TIR)
Terminaison de la transcription
Réplication des plamides

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8
Q

Que font les srna en trans (2), avec des exemples?

A
  1. Inhibent la traduction: MicF -> ompF

2. Stimulent la traduction (défait des structures secondaires): DsrA -> rpoS

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9
Q

Les sRNA, peuvent t’ils réguler plus d’un gène cible?

A

En trans oui, comme drsa avec hns et rpos

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10
Q

Ou trouve t on la protéine Hfq?

A

Trouvée dans la réplicase du phage Qb (réplication arn génomique)

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11
Q

Que fait les sRNA de la famille CsrB?

A

Intéragit avec plusieurs protéines CrsA pour l’empêcher d’intéragir avec l’arn cible.

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12
Q

Que fait CsrA?

A
  • entreposage du glycogène

- Stabilise une structure secondaire qui emprinne le TIR

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13
Q

À quoi ressemble l’arn 6S?

A

un complexe ouvert d’adn

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14
Q

À quoi la membrane bactérienne est elle sensible (4-5)?

A
Changement osmotique
Agents nuisibles:
- toxines hydrophobes
- heat shock
- changement de pH
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15
Q

Avec quoi la bactérie peut réguler la pression osmotiques (3)?

A

K+
Proline
Glycine bactérienne

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16
Q

Les porines:
A) combien de sous-unités
B) Hélice a ou feuillets B
C) Canaux laissent passer … ?

A

A) 3 sous-unités
B) Feuillet beta
C) Molécules hydrophobes

17
Q

Quelles sont les deux porines principales et leur différence principale?

A

OmpC: laisse passer des petites molécules
OmpF: molécules plus grosses

18
Q

Quel porine va être favoriser dans un milieu aqueux et dans l’intestion?

A

Milieu aqueux: OmpF

Intestins: OmpC (ne laissent pas passer les sels biliaires ->toxiques

19
Q

Qu’est ce qui peut altérer le ratio OmpC/OmpF (6)?

A
Température
pH
Stress oxydatif
Solvants organiques
Atb
Toxines
20
Q

Vrai ou Faux. Les gènes ompc et f sont sous le contrôle d’un stimulon

A

Faux, sous le contrôle d’un régulon

21
Q

Que font les gènes ompF et ompB?

A

ompF: gènes de structure
ompB: gènes de envz et ompR

22
Q

Dans le système à deux composantes, que sont envz et ompR?

A

EnvZ: senseur membranaire
OmpR: régulateur transcriptionnel

23
Q

Que signifie un augmentation de ompR-P et une diminution?

A

Augmentation: transcription de ompC activé
Diminution: ompF

24
Q

Quand MicF est utile?

A

Lorsque la bactérie doit s’adapter rapidement à un changement de milieu, ex: aqueux vers intestin, sesor de changement de pH et température

25
MicF: A) S'associe avec? B) Pour agir sur ? C) Afin d'inhibier ?
A) Hfq B) TIR de l'arnm de ompf C) la traduction
26
Quels sont les activateurs de MicF?
SoxS: stress oxydatif MarA: Acides faibles et antibiotiques Rob: peptides antimicrobiens OmpR-P: ya know
27
Qui inhibe la traduction de ompC
MicC + Hfq
28
``` Dans le système à deux composantes CpxA-CpxR, A) Répondent à quoi? B) Que fait CpxA? C) CpxR? D) Affectent le ration Omp/ompf? ```
A) Stress de l'enveloppe B) Senseur membranaire C) Régulateur transcriptionnel D) Oui, via l'augmentation de ompR-P
29
Comment fonctionnent le système à deux composantes CpxA-CpxR?
CpxA s'autophosphoryle, lorsqu'il détecte des pili/curli qui s'accumulent (pas de transport du aux dommage de la membrane externe) -> CpxR-P code pour des chaperonnes et des protéases qui replient et dégradent les pili/curli, et inhibe les protéines qui les fabriquent.
30
``` Le facteur sE: A) ou agit il? B) Comment peut il être activé? Anti-sE C) ou est il placé? D) Quels sont ses domaines? E) Que fait-il ```
``` A) espace periplasmique B) Par l'inactivation de l'anti-sE C) Membrane interne D) Périplasmique et cytoplasmique E) Inactive et séquestre facteur sE ```
31
Qui dégrade RseA et qu'arrive t il?
- Dégradé par DegS (dom périplasmique) et YaeL (domaine transmenbranaire) - Relâche le facteur sE
32
Associez au bon terme: A) CpxA-CpxR B) EnVZ-OmpR C) DegS 1) Active sE 2) accumulation de protéines endommagées ou mal localisée 3) défaut d'assemblage des protéines
A - 3 B - 2 C - 1
33
Quel rôle a le fer?
Catlyseur des centres actifs Détection des niveaux d'O (FNR) Transport d'O (hème)
34
Quels sont les 3 systèmes de gestion du fer?
1. Système Fur 2. sRNA RyhB 3. Enzyme acotinase du cycle des tricarboxyliques
35
Quels sont les domaines du système Fur?
helix-turn-helix (nterm) dimérisation (cterm) intraction avec effecteur F2+
36
Qu'arrive t-il lorsque le fer est en excès?
- corépresseur agit avec l'apo-réprsseur fur, changement de conformation qui lui permet d'intéragir avec la boite fur -> bloque l'accès à la polymérase -> réprime la transcription des régulons - activation de la protéine ferritine d'entrposage du fer et autre protéines avec du fer - Fur réprime synthèse de RhyB, donc augmentation de l'expression des gènes qui répondent au Fe2+