Cours 4 Flashcards

1
Q

Quelle est la définition d’une régulation globale:
A) Régulation d’un gène et d’un opéron pour répondre à un signal de stress de l’environnement
B) ensemble de gènes qui répondent à un régulateur commun
C) un seul gène qui répond à un régulateur commun
D) Régulation de plusieurs gènes et opérons pour répondre à un signal de stress de l’environnement

A

D) Régulation de plusieurs gènes et opérons pour répondre à un signal de stress de l’environnement

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2
Q

Définir régulon.

A

ensemble de gènes qui répondent à un régulateur commun (arn, protéine). Les gènes et les opérons peuvent faire partie de plus d’un régulon

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3
Q

Définir stimulon.

A

L’ensemble des régulons (qui se chevauchent) qui sont induit par un signal de l’environnement particulier

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4
Q

Qu’est ce que la croissance diauxique?

A

S’il y a une autre source comme le galactose, épuisement d’abord du glucose disponible, délai de croissance pour générer les enzymes nécessaire et puis croissance plus lente.

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5
Q

Par quel gène l’adénylate cyclase est codé?

A

cya

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6
Q

Si il y aprésence de sucre rapide, quel est le ration PEP/Pyruvate?

A

Bas

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7
Q

Quel est la suite d’action en présence de source de carbone pauvre, incluant PEP, Hrp, Pyruvate, IIAglc, Amp?

A

Pep donne son P au Hrp et avec la pyruvate kinase, fait du pyruvate
Hrp-p donne son P au IIAglc
IIAglc-P stimule d’adénylate cyclase ce qui produit du cAMP

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8
Q

Qu’est ce que l’exclusion de l’inducteur?

A

Lorsque IIAglc inhibe la perméase (ex: de lactose), pour diminuer le taux d’inducteur dans la cellule

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9
Q

De quel gène vient CAP?

A

crp

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10
Q

Que contient le régulon CAP?

A

lac, mal, gal, ara

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11
Q

CAP peut être:
A) activateur
B) répresseur

A

Les 2 :)

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12
Q

Complexe ouvert ou fermé?
A) Promoteur de classe I
B) Promoteur de classe II
C) Ara

A

A) fermé
B) ouvert
C) fermé

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13
Q

Quelles sont les deux conditions avant l’activation des opérons catabolites sensibles?

A
  1. Une meilleure source de carbone doit être absente

2. l’inducteur doit être présent

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14
Q

Dans quelle situation l’opéron lactose présente une répression maximale?

A

Présence de glucose (donc pas de CAP/cAMP)

Absence de lactose (Donc LacI lié à l’opéron)

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15
Q

Que veut dire une mutation pléiotropique?

A

Affecte plusieurs plusieurs opérons

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16
Q

Comment l’isolement au tétrazolium a été utile?

A

Pour découvrir les mutants cya et crp
Rouge -> colonie poussent (donc mutants)
Blanc -> colonies qui poussent et qui métabolisent un sucre (donc les sauvages)

17
Q

Quelles est la différence entre la régulation catabolique de B.subtilis et e.coli?

A

E.coli utilise le système Cap-cAmp, mécanisme activateur.

Tandis que B.sub n’utilise pas cAmp mais un mécanisme de répression par ccpA

18
Q

Concernant le mécanisme de répression de B. sub, que se passe t il lorsque le milieu est riche en glucose?

A

Augmentation du FBP -> augmentation des Hpr phosporylées (grâce à Hpr kinase) -> Hpr-S-P + ccpA se fixe sur le site cre

19
Q

Quelles sont les 2 composantes des systèmes à 2 composantes?

A
  1. senseur localisé dans la membrane (activité histidine kinase)
  2. régulateur transcriptionnel cytoplasmique peut-être phosphorylé à un résidus aspartate
20
Q

Dans le système à deux composantes, que produisent les stimulis?

A

Ds signaux cellulaires, soit des protéines senseurs à résidus histidine qui s’auto-phosphorylent.

21
Q

Quelles sont les sourcs d’azote de la majorité des bactéries?

A

NH3, NO3-, molécules organiques avec azote, N2

22
Q

Quelle la réaction principale lorsque la cellule est en A) manque de NH3?
B) surplus de NH3?

A

A) conversion de glutamate en glutamine par la glutamine synthétase
B) a-acetoglutarate + NH3 -> glutamate (par la glutamate DH)

23
Q

l’opéron glnA-ntrB-ntrC est présent chez les
A) gram -
B) gram +
C) toutes les bactéries
D) tous les organismes vivants de la terre, naturels, surnaturels, des planètes et des galaxies, même gallifrey!

A

A) gram -

24
Q

Comment est mesurée la quantité d’azote dans la cellule?

A

Avec la quantité de glutamine

25
Q

Que sont les composantes du système à 2 composantes du système Ntr?

A

NtrB: senser membranaire (histidine kin)

NtrC régul transcriptionnel cytoplamique (résidus aspartate phosphorylable)

26
Q

Avec le système Ntr, que se passe t il lorsque la quantité d’azote est élevée?

A
  • l’enzyme GlnD convertit le PII-UMP en PII
  • PII intéragit avec NtrB et empêche son activité histidine kinase
  • NtrC: pas de phosphate au niveau de l’aspartate
  • pas d’ativation de l’opéron glnA-ntrB-ntrC
27
Q

Quel est l’action sur a-cetoglutarate sur PII

A

Il empêche intéraction avec NtrB

28
Q

Système Ntr

Quels sont les 3 promoteurs et avec quels facteurs sigma sont ils associés

A

P1: s70
P3: s70
P2: s54 (sN)

29
Q

Système Ntr

Quel promoteur s’assure que la quantité de glutamine synthétase minimale est présente?

A

P1

30
Q

Système Ntr

Lequel est le plus fort des promoteur?

A

P2

31
Q

Système Ntr

Que fait le domaine central de NtrC

A

activité atpase qui fait passer le complexe fermé au complexe ouvert

32
Q

Système Ntr

Que fait le domaine Cterm de NtrC?

A

NtrC phosphorylé se lie à UAS en amont de P2. Une courbure se crée dans l’adn et il peut y avoir transcription

33
Q

Que cause une mutation du gène glnB?

A

Change le site d’attachement du UMP sur PII, donc ntrB toujours déphosphorylé, l’opéron est pas activé

34
Q

Que cause une mutation du gène glnL?

A

Prévient le lien entre PII et NtrB, qui peut donc toujours être phosphorylé avec ou sans PII-UMP