Cours 5

Question 1

Pour que les cellules compétitionnent adquatement, quelles sont les deux choix?

Answer 1

1. choisir le composé carboné avec le meilleur rendement énergétique
2. économie d’énergie à l’intérieur de la cellule

Question 2

Quel serait une bonne manière d’économiser l’énergie cellulaire, pourquoi?

Answer 2

• Régulation de la synthèse des arnt et des ribosomes

- Car la moitié des arn synthétisés sont des arnr et arnt

Question 3

Quels sont les gènes codant pour la 30S et la 50S?

Answer 3

rps et rpl

Question 4

Quelle est la protéine associée à la protéine ribosomale 50 S qu’on a vu en classe et par quoi est elle codée?

Answer 4

L11, codée par rpl K

Question 5

Comment as t on pu cartographier les gènes des ribosomes (2)?

Answer 5

phage p1 et avec la résistance aux antibiotiques

Question 6

Quels sont les deux grands groupes d’opérons des gènes des ribosomes?

Answer 6

73 et 90 min

Question 7

Pourquoi regrouper des gènes?

Answer 7

1. Plusieurs sont regroupés autour de l’oriC: dosage génique

2. Plus facile à réguler

Question 8

Vrai ou Faux. La synthèse et l’assemblage du ribosome ne se font pas au même endroit ce qui provoque des excès de protéines ribosomales.

Answer 8

Faux. le taux de synthèse des protéines ribosomales est ajustée au taux de synthèse des arnr

Question 9

Que veut dire couplage (les gènes codants pour les protéines sont couplées)?

Answer 9

Que la traduction du 1e gène permet la traduction des suivants. Parce que le TIR du 2e gène est dans la structure secondaire qui est défaite lorsque le ribosome arrive au codon de terminaison du 1e gène.

Question 10

Que se passe t’il avec L1 s’il n’y a pas d’arnr dans la cellule?

Answer 10

Se lie à rplk et bloque sa transcription ainsi que la transcription de rpla (tir dans une structure secondaire défaite uniquement par la traduction de rplk)

Question 11

Que veut on dire avec: les ribosomes sont autorégulés?

Answer 11

Le niveau d’expression est toujours le même peut importe le nombre de copie de gène ou d’opéron

Question 12

L’autorégulation des ribosomes est au niveau de:
A) Transcription
B) Traduction

Answer 12

B) Traduction

Question 13

Au sujet des opérons des ribosomes,
A) leurs noms
B) Combien d’opérons?

Answer 13

A) rrn

B) 7

Question 14

Les opérons des ribosomes sont près de quelles autre séquence dans le chromosome, que cela veut dire?

Answer 14

• Près de oriC

- Dosage génique

Question 15

Que contient la région du promoteur chez les opérons des ribosomes?

Answer 15

• Fis
• UP
• -35 -10

Question 16

Vrai ou faux. L’opéron 5 des ribosomes débute avec un GTP.

Answer 16

Faux. Les 6 premiers utilisent de l’atp et le 7e un gtp

Question 17

Que faut il pour que la polymérase passe au complexe ouvert et qui est important pour la synthèse des ribo?

Answer 17

présence d’un nuclétoide dans le canal secondaire, car polymérase instable, peut rapidement retourner au complexe fermé.

Question 18

Qu’st ce qui est important indicateur d’un milieu riche?

Answer 18

Présence d’ATP/GTP

Question 19

Les arnr et ls arnt sont régulés en fonction de quoi (2)?

Answer 19

1. Régulation en fonction du taux de croissance

2. Réponse stringente

Question 20

Quel est le médiateur de la réponse stringente?

Answer 20

le ppGpp

Question 21

Qu’est ce que la réponse stringente?

Answer 21

Arrêt de la synthèse de ribosomes lorsqu’il y a une pénurie de nutriment essentiels

Question 22

Que se passe t il lorsqu’il y a un aa manquant dans le milieu (étape de production de ppGpp)?

Answer 22

1. l’arnt associé non-chargé va aller s’associer au site A du ribosome (arreté)
2. Stimulation de la protéine relA (association transitoire au ribosome)
3. Synthèse de pppGpp (ou ppGppp)
4. Transformation en ppGpp

Question 23

Quelles sont les deux protéines qui régulent ppGpp chez e.coli?

Answer 23

Rela et Spot (synthèse et dégradation)

Question 24

Quelles sont les protéines qui régulent ppGpp chez B. subtilis?

Answer 24

Famille de protéines Rsh

Question 25

Que fait le ppGpp (4)?

Answer 25

1. Inhibe les activateurs des promoteurs rrn (exploitent leur faiblesse a/n des complexes ouverts)
2. ppGpp diminue la stabilité des complexes ouverts de moitié
3. Alarmone: “avise” que des changements majeurs, nécessitant l’expression de certains gènes en phase stationnaire
4. Augmente l’activité des facteurs sigma de stress (sH et sE)

Question 26

Que fait un mutant double de rela et spot?

Answer 26

Auxotrophe pour 9 acides aminés

Question 27

Que fait un mutant dska (3-4)?

Answer 27

Similaire aux mutants double spot et rela

• auxotrophie pour des aa
• augmentation du taux de synthèse pour arnr et arnt
• promoteur rrn: pas de réponse stringente, pas de régultation du taux de croissance

Question 28

Que fait dksa?

Answer 28

• Augmente les effets négatifs de ppGpp sur les promoteurs rrn
• augmente les effets positifs du ppGpp sur les promoteurs de biosynthèse des aa

Question 29

Quelles sont les protéines en acton lors qu’un choc thermique? (toutes, genre le nom de la familles et les 4 noms)

Answer 29

Hpsps:

GroEl, GrpE, DnaK, DnaJ

Question 30

À quoi correspond un choc thermique (2)?

Answer 30

Hausse de température (lol)

Éthanol

Question 31

Que font les protéines du choc thermique?

Answer 31

Toutes: repliement des protéines nouvellement synthétisées

DnaK et DnaJ: assemblage des protéines de réplication de l’adn des phages lambda

Question 32

Pourquoi dit on que le choc thermique est transitoire?

Answer 32

Parce que les protéines non adéquates (non repliables) pour une telle température sont dégradées. Une fois la situation rétablie, la réponse heat shock n’est plus nécessaire

Question 33

Que font les protéins Clp et Lon?

Answer 33

Dégradent les protéines irréparables du heat shock

Question 34

Quel est le promoteur du heat shock?

Answer 34

sH ou s32

Question 35

Ou se fait la régulation de sH et celle de sS

Answer 35

Les 2: Post-transcriptionelle, augmentation du taux de traduction et augmentation de la stabilité

Question 36

Que peut on dire sur les arnm du heat shock?

Answer 36

Ce sont des arn thermosenseurs, lorsque la température est masquée, le TIR est masqué

Question 37

Que fait Dnak lorsque la température est normale par rapport à sH?

Answer 37

1. Augmentation de la sensibilité de sH à la protéase FtsH

2. Se lie à sH (non utilisable)

Question 38

Que fait sE (2)

Answer 38

1. Contrôle la transcription de certains gènes dont sH (température élevée)
2. Contrôle la réponse au tress (affecte la membrane externe)

Question 39

Que fait le gène rpoS?

Answer 39

- activé par plusieurs types de stress:
pénurie de nutriments, 
dommage oxydatifs
conditions acides
- gène du facteur sS

Question 40

Quelle est la similarité entre le facteur sS et s70?

Answer 40

Promoteurs semblables, -10 plus étendue pour sS

Question 41

Que comprend les gènes régulés par sS (2)?

Answer 41

Métabolisme central

Génes transporteurs

Question 42

sS est un régulateur principal chez:
A) les gram -
B) les gram +

Answer 42

A) les gram -

Question 43

Qu’est ce qu’est dsra?

Answer 43

petit arn régulateur de sS

Question 44

Comment agit dsra?

Par qui est il aidé

Answer 44

• il empêche la formation de la structure secondaire qui contient le TIR de sS
• Aidé par Hfq

Question 45

Que fait le srna 6S?

Answer 45

S’accumule en phase stationnaire, séquestre s70 -> libère la polymérase -> intéragit avec sS -> finalement activation de la transcription (réponse générale au stress)