Cours 6 Flashcards
Pourquoi la recombinaison site-spécifique est-elle conservative?
aucune création d’une nouvelle molécule d’ADN (slm réarrangement)
Résultats possibles de la recombinaison spécifiques (3)?
- inversion (séquence dont l’orientation est pareil)
- intégration
- excision/résolution (séquence dont l’orientation est inversée)
Quelle recombinase permet la recombinaison entre 2 molécules d’ADN distinctes?
intégrase
Quelles recombinases permet la recombinaison entre régions de la même molécule?
résolvases et invertases
Quels sont les 2 type de recombinases sites-spécifique?
- Sérine-recombinase
2. Tyrosine-recombinase
Caractéristiques d’une sérine recombinases (4):
- résidu sérine
- distance de 2 pb entre coupures
- 3’OH libre
- 2 brins clivés
Caractéristiques d’une tyrosine recombinases (4):
- résidu tyrosine
- distance de 6-8 pb entre coupures
- 5’OH libre
- 1 brin clivé
L’intégrase du phage lambda fait partie de quel type de recombinase?
tyrosine-recombinase
La protéine Gin, une invertase (sérine recombinase) chez le phage Mu, reconnait les régions de l’ADN sites-spécifiques:
GixL et R (left and right)
Qu’est-ce que permet le Phage Host Range?
permet d’infecter plusieurs espèces bactériennes différentes grâce à l’expression de différentes protéines lors de l’inversion de séquence
Qu’est-ce qu’un shufflon
- c’est un système de recombinaison qui permet de produire différents types de pili de conjugaison permettant de faire la conjugaison avec d’autre type de bactéries
- il contient la séquence codante de la recombinase qui intervient dans le réarrangement
VRAI OU FAUX: FimBE (tyrosine recombinases) contrôlent l’expression du gène fimA.
vrai
Expression des fimbriae (expression de FimA) si FimB ou FimE:
FimB: inversion dans les 2 sens (on ou off)
FimE: inversion dans 1 sens (favorise off)
Par quel moyen, la résistance d’un antibiotique sur un plasmide, pourrait être gardé chez une bactérie, même après avoir perdu se plasmide?
par transposition (expérience avec atb)
Définition de transposons:
- Éléments génétiques mobiles
- recombinaison indépendante du système RecA
- intégration aléatoire, aucune homologie entre les séquences
2 types de transposons:
- élément IS
- transposons composés (2 IS avec gènes de résistances au milieu)
* toujours s.répétées, inversées aux extrémités
2 mécanismes de transpositions:
- cut&paste (Tn5 + Tn10) = conservatif
2. réplicative (Tn3 + phage Mu)
VRAI OU FAUX: le transposon exprime seulement la transposase
vrai
Transposition réplicative (Tn3, phage Mu), Un enzyme resolvase reconnait une séquence:
res (S pour réSOlvaSe)
Différence de la coupure entre cut&paste et réplicative:
cut&paste = coupure double brin réplicative = clive 1 brin
Le transposons Tn7 code pour 1 transposase seulement, VRAI OU FAUX:
il code pour 2 transposases qui génère des coupures décalées sur les deux brins
Pour transposer le Tn7 à un site aléatoire, quelles sont les protéines?
TnsABC-E
Pour transposer le Tn7 à un site préféré, quelles sont les protéines?
TnsABC-D
À partir de quelle matrice, le mécanisme de rétrotransposition se sert comme substrat pour la transposition?
ADNc (ARNm converti en ADN par transcriptase inverse)
Qu’est-ce que les ICE?
transposons transférés par conjugaison
Qu’est-ce que les intégrons?
éléments géniques mobiles qui contiennent cassettes d’expression
Est-il vrai que les ICE sont sans origine de réplication mais avec origine de transfert?
oui c’est vrai
VRAI OU FAUX: les intégrons sont impliqués dans le gain et la perte des gènes de résistance et pathogénicité.
vrai
Qu’est-ce qu’une cassette?
gènes de résistances sans promoteur
Deux types de réactions: excision et intégration des cassettes =
- Excisions se font via recombinaison attC x attC
- Intégrations se font via recombinaison attI x attC
Structure des cassettes:
- sans promoteur
- 1 seul ORF
- site attC (cible de l’intégrase)
- ICS toujours complémentaire au CS (alors très conservées)
