Cours 6 Flashcards

1
Q

Pourquoi la recombinaison site-spécifique est-elle conservative?

A

aucune création d’une nouvelle molécule d’ADN (slm réarrangement)

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Q

Résultats possibles de la recombinaison spécifiques (3)?

A
  1. inversion (séquence dont l’orientation est pareil)
  2. intégration
  3. excision/résolution (séquence dont l’orientation est inversée)
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3
Q

Quelle recombinase permet la recombinaison entre 2 molécules d’ADN distinctes?

A

intégrase

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4
Q

Quelles recombinases permet la recombinaison entre régions de la même molécule?

A

résolvases et invertases

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5
Q

Quels sont les 2 type de recombinases sites-spécifique?

A
  1. Sérine-recombinase

2. Tyrosine-recombinase

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6
Q

Caractéristiques d’une sérine recombinases (4):

A
  1. résidu sérine
  2. distance de 2 pb entre coupures
  3. 3’OH libre
  4. 2 brins clivés
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7
Q

Caractéristiques d’une tyrosine recombinases (4):

A
  1. résidu tyrosine
  2. distance de 6-8 pb entre coupures
  3. 5’OH libre
  4. 1 brin clivé
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8
Q

L’intégrase du phage lambda fait partie de quel type de recombinase?

A

tyrosine-recombinase

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9
Q

La protéine Gin, une invertase (sérine recombinase) chez le phage Mu, reconnait les régions de l’ADN sites-spécifiques:

A

GixL et R (left and right)

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10
Q

Qu’est-ce que permet le Phage Host Range?

A

permet d’infecter plusieurs espèces bactériennes différentes grâce à l’expression de différentes protéines lors de l’inversion de séquence

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11
Q

Qu’est-ce qu’un shufflon

A
  • c’est un système de recombinaison qui permet de produire différents types de pili de conjugaison permettant de faire la conjugaison avec d’autre type de bactéries
  • il contient la séquence codante de la recombinase qui intervient dans le réarrangement
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12
Q

VRAI OU FAUX: FimBE (tyrosine recombinases) contrôlent l’expression du gène fimA.

A

vrai

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13
Q

Expression des fimbriae (expression de FimA) si FimB ou FimE:

A

FimB: inversion dans les 2 sens (on ou off)
FimE: inversion dans 1 sens (favorise off)

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14
Q

Par quel moyen, la résistance d’un antibiotique sur un plasmide, pourrait être gardé chez une bactérie, même après avoir perdu se plasmide?

A

par transposition (expérience avec atb)

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15
Q

Définition de transposons:

A
  • Éléments génétiques mobiles
  • recombinaison indépendante du système RecA
  • intégration aléatoire, aucune homologie entre les séquences
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16
Q

2 types de transposons:

A
  1. élément IS
  2. transposons composés (2 IS avec gènes de résistances au milieu)
    * toujours s.répétées, inversées aux extrémités
17
Q

2 mécanismes de transpositions:

A
  1. cut&paste (Tn5 + Tn10) = conservatif

2. réplicative (Tn3 + phage Mu)

18
Q

VRAI OU FAUX: le transposon exprime seulement la transposase

A

vrai

19
Q

Transposition réplicative (Tn3, phage Mu), Un enzyme resolvase reconnait une séquence:

A

res (S pour réSOlvaSe)

20
Q

Différence de la coupure entre cut&paste et réplicative:

A
cut&paste = coupure double brin
réplicative = clive 1 brin
21
Q

Le transposons Tn7 code pour 1 transposase seulement, VRAI OU FAUX:

A

il code pour 2 transposases qui génère des coupures décalées sur les deux brins

22
Q

Pour transposer le Tn7 à un site aléatoire, quelles sont les protéines?

A

TnsABC-E

23
Q

Pour transposer le Tn7 à un site préféré, quelles sont les protéines?

A

TnsABC-D

24
Q

À partir de quelle matrice, le mécanisme de rétrotransposition se sert comme substrat pour la transposition?

A

ADNc (ARNm converti en ADN par transcriptase inverse)

25
Q

Qu’est-ce que les ICE?

A

transposons transférés par conjugaison

26
Q

Qu’est-ce que les intégrons?

A

éléments géniques mobiles qui contiennent cassettes d’expression

27
Q

Est-il vrai que les ICE sont sans origine de réplication mais avec origine de transfert?

A

oui c’est vrai

28
Q

VRAI OU FAUX: les intégrons sont impliqués dans le gain et la perte des gènes de résistance et pathogénicité.

A

vrai

29
Q

Qu’est-ce qu’une cassette?

A

gènes de résistances sans promoteur

30
Q

Deux types de réactions: excision et intégration des cassettes =

A
  • Excisions se font via recombinaison attC x attC

- Intégrations se font via recombinaison attI x attC

31
Q

Structure des cassettes:

A
  • sans promoteur
  • 1 seul ORF
  • site attC (cible de l’intégrase)
  • ICS toujours complémentaire au CS (alors très conservées)