Cours 5 Flashcards
Qu’est-ce que la différence entre un plasmide autotransférable et mobilisable?
- autotransférable: a toute l’info nécessaire pour conjugaison
- mobilisable: besoin des fx d’un plasmide autotransférable
Séquences nécessaires (2) pour la conjugaison:
- gènes Tra (clivage, hélicase, synthèse pili, régulation…)
- OriT (origine de transfert)
Régulation de la conjugaison chez certaines bactéries (TraJ/FinP/O):
TraJ est un activateur de transcription de l’opéron Tra et est lui même régulé par l’ARN antisens finP (+finO pour protéger interaction ARN-ADN dégradation de ARN) FinP)
Les gènes Tra codent pour des protéines ayant comme composantes de (2):
- DTR = pour transfert + réplication ADN
2. MPF = pour générer le pilus + communique avec DTR pour synchroniser le transfert lors d’un contact
Les 2 étapes du processus de conjugaison et les protéines impliquées (4):
- formation mating pair (raccourcissement pili)
- transfert + réplication (à cercle roulant)
- prot. couplante
- relaxase (clive ADN au OriT et reste liée au 5’ de façon cov.)
- hélicase ouvre brin (3’OH)
- primase (synthétise courte amorce)
Qu’est-ce que le complexe tra dans la conjugaison?
forme un pore pour laisser passer l’ARN (syst. sécrétion type IV)
Qu’est-ce qui est nécessaire pour la mobilisation (2)?
- OriT
2. gènes mob (sur plasmide mobilisable) pour cliver à l’OriT
Utilisation des plasmides mobilisables: qu’est-ce que la conjugaison tri-parentales et quand est-ce que c’est utilisé?
- 2 conjugaisons pour transférer 1 plasmide mobilisable de la souche 2 à une souche 3
- utilisé lorsque le plasmide est difficilement transformable ou que le plasmides est dur à extraire
Qu’est-ce qu’une souche Hfr?
souche bactérienne ayant intégré un plasmide F dans son chromosome
Comment se fait la conjugaison Hfr (5 étapes)?
- le plasmide F s’intègre dans le chromosome (HR)
- les cellules entrent en contact par le pilus (fait par le plasmide)
- une partie du plasmide est transférée ainsi qu’avec une partie du chromosome
- la cellule receveuse synthétise le brin complémentaire
- l’ADN entrant et l’ADN chromosomique de la cellule receveuse peuvent recombiner (cellule receveuse reste F-, car elle n’a pas assez d’info pour regénérer le plasmide)
À quoi servent les séquences IS pour un plasmide F (2)?
- intégration
2. excision
Qu’est-ce qu’un plasmide F’ et comment se forme-t-il?
- plasmide F+ avec séquences chromosomiques de l’hôte en plus = F’
- se forme lorsqu’un plasmide F intégré s’excise de façon aberrante (erreur; une partie du chromosome bactérien est excisé)
Différences entre la conjugaison
Hfr et la conjugaison F’:
Hfr: cellule receveuse reste F-, transfert + HR
F’: cellule receveuse devient F+, pas de HR nécessaire
Les interactions entres les bactéries et les plantes: les
bactéries peuvent transférer de l’ADN aussi à des
cellules eucaryotes = 4 étapes pour infection:
- attachement
- ancrage
- transfert ADN
- formation tumeur (plasmide Ti)
Qu’est-ce qui est produit par la plante pour nourrir la bactérie?
opines sont produites (les gènes Noc et Acc codent pour des enzymes nécessaires au catabolisme des opines)
Les rôles de la recombinaison (4):
- Réparation de l’ADN
- Génère la diversité
- Ségrégation des chromosomes
- Réarrangements d’ADN
3 types de recombinaison?
- générale (homologue)
- site spécifique
- transposition
Quels sont les 2 types de système qui assurent la stabilité des plasmides?
- Actifs : protéines qui interagissent avec plasmide
2. Passifs: multicopies, monomérisation
Quels sont les 3 systèmes utilisés par les plasmides pour assurer leur stabilité?
- partition (F, P1, R1)
- système tueurs (colE1, F, R1)
- monomérisation (colE1, F, P1, R1)
VRAI OU FAUX: Seul les donneurs F+ peuvent donner leur plasmides.
vrai
Concernant le plasmide F, quel facteur stabilise l’interaction ARN-ADN et protège l’ARN antisense finP contre la dégradation ?
finO
Lorsque FinO et finP interagissent ensemble qu’arrive-t-il à l’expression de traJ?
l’expression de TraJ sera inhibé et l’opéron Tra aussi
Une fois que la relaxase a effectuer une coupure de l’ADN à oriT, elle se lie de façon covalente à quelle extrémité?
5’ car 3’ pour réplication
La réplication des 2 plasmides est…
A. Continu chez le donneur et discontinu chez le receveur
B. Discontinu chez le donneur et continu chez le receveur
C. Continu dans les 2 cellules
D. Discontinu dans les 2 cellules
A. continu chez le donneur et discontinu chez le receveur (fragments d’okazaki)
Le pore du complexe Tra (pilus) est formé entre autre de quel protéine?
piline
Le complexe Tra est un système de sécrétion de quel type?
IV (4)
VRAI OU FAUX: Les bactéries peuvent simplement se transférer du matériels génétiques entre elles.
FAUX, aussi aux cellules eucaryotes
Une plante peut être infectée jusqu’à combien de temps après sa blessure?
30h
Quel composé sécrété par la plante induit les gènes de virulence chez Agrobacterium ?
A. Acide polygalacturonique
B. Acetylsyringone
C. Acetylcholine
B. acetylsyringone (composés phénoliques)
VRAI OU FAUX: produits des gènes chvAB et pscA sont impliqués dans le synthèse et
transport des sucres.
vrai
Quel phénomène fait en sorte que les bactéries se fixent à la plante? (Agrobacterium)
la synthèse de cellulose qui forme un réseau de fibre
Quel région du plasmide Ti est transféré à la plante pendant l’infection?
ADN-T
Quels facteurs se retrouvant sur l’ADN-T permet la formation de tumeur (2)?
- auxines (tumeurs dans les racines)
2. cytokinines (tumeurs dans les tiges)
VRAI OU FAUX: L’ADN-T transféré aux plantes est sous forme bicaténaire linéaire et est intégré dans le génome de la plante par recombinaison homologue.
FAUX, non sous forme monocaténaire
VRAI OU FAUX: Les opines sont synthétisés par la plante et métabolisés par les bactéries (par le plasmide Ti).
vrai
Quelle protéine est nécessaire pour guider l’ADN-T dans le noyau de la cellule végétale ? VirA VirB VirC VirD VirE VirG
VirD (guiDer)
VRAI OU FAUX: Seulement les bactéries qui possèdent un plasmide Ti peuvent cataboliser les opines.
vrai
Quelle est la fx de virA?
- ce sont des récepteurs aux signaux libérés lorsque la plante est blessée
- lorsqu’activé, s’auto-P + active virG
Quelle est la fx de virB?
formation pore de conjugaison
Quelle est la fx de virC?
hélicase
Quelle est la fx de virE?
stabilise le simple brin de l’ADN-T transféré (SSB)
Quelle est la fx de virG?
une fois activé par virA, contrôle la transcription de l’opéron vir
Qu’est ce qui est nécessaire pour faire la recombinaison
homologue (4)?
- homologie
- appariement
- enzymes de recombinaisons
- formation hétéroduplex
VRAI OU FAUX: Dans tous les modèle l’invasion
du brin est permise par la protéine RecA.
vrai
Différence entre le modèle de Holliday, modèle de Meselson et Radding et le odèle de Szostak:
Holliday: invasion des 2 brins
Meselson/Radding: invasion 1 brin
Szostak: répare casses bicat. avec invasion d’1 brin
Fx sytème RecBCD:
prépare l’ADN pour liaison de RecA (presynapsis)
Fx système RecA:
échange des brins pour former JH (synapsis)
Fx système RuvABC:
migration de branche et résolution
de la JH (postsynapsis)
RecBCD répare les cassures monocaténaires: VRAI OU FAUX
Faux, RecBCD répare les cassures bicaténaires (ceux qui réparent les cassures monocaténaires sont RecFOR)
Particularités (4) de l’enzyme RecBCD:
- exonucléase ATP dépendante sur l ’ADN bicatenaire
- activité d’hélicase sur l ’ADN linéaire bicatenaire
- endo et exonucléase sur l ’ADN monocatenaire
- activité ATPase ADN dépendante
Qu’est ce que la séquence CHI?
Séquence reconnu par la sous-unité RecC qui permet la modification de l’activité de RecBCD: activité exonucléase change de 3’-5’ à 5’-3’
VRAI OU FAUX: RecFOR aide la protéine RecA à interagir avec le simple brin et déplacer les protéines SSB.
vrai
Quelle protéine est requise pour la recombinaison homologue?
RecA!!!
VRAI OU FAUX: RecA:
- Fixe de l’ADN monocaténaire,
- Forme boucle D,
- 38 000 Daltons,
- Forme des hétéroduplexes,
- ATP dépendante
vrai
Les mutant RecA- ont (4):
- croissance réduite
- viabilité réduite
- augmentation sensibilité UV + agents endommageants l’ADN
- fréquence recombinaison homologue réduite
