cours 6

Question 1

Comment la membrane doit être et c’est quoi la perméabilité sélective

Answer 1

La membrane est un FLUIDE bidimensionnel et doit être juste assez fluide

PERMAIBILITÉ SÉLECTIVE: memebrane CONTROLE ENTRÉE ET SORTIE des materiaux(permet maintenir milieu intracell mieux organisé)
permaibilité est sélective SI LA FLUIDITÉ DE MEMBRANE EST BIEN BALANCÉE(assez fluide)
la fluidité depend de la COMPOSITION DE MEMBRANE ET TEMPERATURE ENVIRONNEMENT

Question 2

Parle moi de composition de membrane et l’effet des température

Answer 2

FROID= MOINS FLUDIE CAR CRISTALLISÉ.
1.IL FAUT UNE AUGMENTATION DE FLUIDITÉ DONC CHOLESTEROL FAIT DES TROU
2.AJUSTER COMPOSITION LIPIDE ON A CONFORMATION CIS DONC MOINS D’INTERACTION ENTRE LIPIDE + FLUIDE

CHAUD= PLUS FLUIDE PLUS DE TROI, PRESQUE N’IMPORTE QUOI PEUX PASSER
1. CHOLESTÉROL BOUCHE LES TROU CE QUI AUGMENTE FLUIDITÉ MEMBRANE
2. AJUSTEMENT COMPOSITION DES LIPIDE, FORMATION TRANS + INTERACTION EN LIPIDE DONC+ DE STABILITÉ

Question 3

Parle moi de la microscopie à fluoresence et il sert a quoi, de la florensence et comment faire pour suivre molécule à la trace

Answer 3

Fluoresence=EMISSION D’UNE LUMIÈRE D’UNE CERTAINE COULEUR SUITE A EXCITATION D’UNE MOLÉCULE FLUORESCENTE par une lumière d’une
autre longueur d’onde.
molécule émet flurescence à longeur d’onde précise, possible de l’obserer à l’aide d’un MICROSCOPE À FLUORENSECE.
Microscope émet lumière onde précise, celle qui excitera la molécule fluorescente, une fois excité emet lumière a longeur onde différente.LE MICROSCPE EST MUNI DE FILTRE QUI PERMET DE N’ONSERVER LA LUMIÈRE QU’À CETTE LONGEUR D’ONDE PRÉCISE.

Pour suivre molécule trace: possible, par génie génétique, de produire la PROTÉINE D’INTERET FUSIONNÉE A UNE PROTÉINE FLUORESCENTE. cela peut se faire bactérie, mais aussi ds cellule végétale ou cellule animale

Question 4

C’est quoi l’experience qui a été faite et qui permet de voir que les protéine de la membrane se déplace

C’EST QUOI LA THECNIQUE FRAP et sert a quoi utilisé dans quel condition?

Answer 4

2 cellule ont été fusionné, cellule souris avc prot marquée rouge et humain vert.
Juste après fusion: un côté rouge et un vert. 40 MINUTE PLUS TRAD PROTEINE MARQUE VERT ET ROUGE PARTOUT

Thecnique frap= QUANTIFIER LA FLUIDITÉ( a un endroit on détruit fluoresence facon permanante donc la on voit rien apres on attend et on a une recuperation de la fluoresence cela prouve que phospholipide se déplace.

pls exp FRAP peuvent être effectué afin de quantifier fluidité membrane ds conditions précise(exemple chaud vs froid)). Temps nécessaire pour recupérrer la moitié de la fluorescnce est noté t1sur2.
Ds membrane, temp peut provoquer transition de phase(fluide à solide). Lorsqu’il fait chaud récuperation se fait plus rapidement car membrane fluide.

Les acide gras cis permettent plus grande fluidité à temp basses. Vice versaa trans saturé
chaque cellule ajuste compsition mebrane pour que soit JUSTE ASSEZ FLUIDE, p trop

Question 5

Les protéine membranaire se déplace ou pas a l’intérieur de la mebrane? Cela dépend de quoi

Answer 5

Oui, prot BOUGE et cela dépend de PLUSIEURS FACTEURS.
1. AGREGATS( COMPLEXES) PROTÉIQUE: prot membranaire souvent sous forme de gros complexe, pour que fonctionne chacune des prot bon endroits. COMPLEXE PEUT BOUGER DANS SON ENSEMBLE, MAIS PAS PROT ETAT INDIVIDUELLE
2. Radaux lipidique: certains liide possèdent longue chaine acide gras saturé. CES LIPIDES ET CHOLESTÉROL ONT TENDANCE À S’ASSOCIER ENSEMBLE, à bouger ensemble et permettent ancrage de certains prot membranaire
IL SONT VISIBLE EN MFA CAR AUGMENTENT ÉPAISSEUR DE MEMBRANE
3. LES JONCTIONS CELLULAIRES ÉTANCHES DES ÉPITHÉLIUMS: les cellules épithéliales sont unies entre-elles par des jontions étanches formées de protéines membranaires. Ces protéies ont des domaines extracellulaire auto complémetaires(SE LIENT FORTEMENT aux domaines extracellulaires des protéines de la cellule voisine). PAS OU TRÈS PEU DE MOUVEMENT POSSIBLE
4. ASSOCIATION AVEC CYTOSQUELETTE: les protéines transmembranaires peuvent interagir avc cytosquelette. Le cytosquelette du globule rouge possèdent filament protéique spéciaux: spectrine. Filaments de spectrine s’assemblent en résaux juste sous membrane plasmique, ds cytoplasme. Ils sonnent la forme caractéristique au globule rouge. Liée au resaux de spectrine peuvent pas bouger, pas liée peuvent bouger

Question 6

C’est quoi le microscope à force atomique et il sert a quoi

Answer 6

il sert VISUALISER LA TOPOGRAPHIE surface echantillon.
une pointe monter sur un microlevier, balaie surface dd’un echantillon, alors que rayon laser permet de détecter changement ds hauteur(mouvement) de la pointe

Question 7

Parle moi des radaux lipidique et la bactériorhodopsine

Answer 7

Une archée, Halobacterium, possède des taches de couleur sur sa membrane plasmique. il s’agit d’un pigement, le RÉTINAL, qui est attaché à une prot.ine membranaire, la BACTÉRIORHODOPSINE. cette dernière SE REGROUPE SUR LES RADEAUX LIPIDIQUES, ce qui cause formation des taches

Question 8

Parle moi de la composition des protéines transmembranaires

Answer 8

Port traans doivent posséder COURTES RÉGIONS NON POLAIRES(pr traverser membrane hydrophobe)
Hélice a HYDROPHOBES: hélice a de 15-20 aa peut traverser membrane. Faut plusieurs acides aminés non polaires consécutifs pour garder le domaine membranaire ds la membrane

FEUILLETS B AMPHIPHILES: dans les tonneaux B, chaine latérales non polaires sont orientées vers extérieur( en contact avec membrane). 1 hydrophobe, 1 hydrophile

Question 9

C’est quoi la perméabilité selective

Answer 9

Membrane plasmique permet de MAINTENIR DES CONCENTRATIONS DIFFÉRENTES de solutés entre cytoplasme et milieu extracellulaire. la perméabilité équilibrée est une PROPRIÉTÉ ESSENTIEL A LA VIE

Question 10

C’est quoi la diffusion et osmose

Answer 10

DIFFUSION= MOUVEMENT molécule D’UNE RÉGION PLUS CONCENTRÉE VERS UNE RÉGION MOINS CONCENTRÉE. le taux de diffusion est proportionnel au gradient de concentration de part et d’autre de la membrane plasmique

OSMOSE: Diffusion d’un solvant d’une SOLUTION HYPOTONIQUE VERS UNE SOLUTION HYPERTONIQUE afin d’atteindre l’équilibre

Molécule hydrophobe= passage facile a travers membrane

Petites molécules polaires non chargée et grosse non chargé plus ou moins
ions non ne passe pas

Question 11

Parle moi des transporteur membranaires pourquoi ils existent et les types?

Answer 11

Ils exitent pour 2 raison:
FACILITER LA DIFFUSION des molécules ayant de la difficulté à diffuser par membrane plasmique.
Trasnporter molécules dans LE SENS CONTRAIRE DE LA DIFFUSION( création d’un gradiant concentration)

Existe 2 grands type transporteurs:
Ceux qui font TRANSPORT PASSIF(canaux protéines porteuse
Ceux qui font TRANSPORT ACTIF(besoin energie)

Question 12

Parle moi des canaux et les protéines porteuses

Answer 12

un CANAL forme un PORE(comme tuyau) qui transporte des MOLÉCULES SPÉCIFIQUES. Les interactions entre pore et les molécules transportées sont faibles, IL NE PEUT PAS ETRE SATURÉ

une protéine porteuse LIE UN SUBSTRAT SPÉCIFIQUE sur son site de liaison, puis change de conformation et laisse passer vers le cytoplasme. eLLE PEUT ETRE SATURÉE( au début plus rpaide mais elle a une limite peut etre saturé)

Question 13

Parle moi de la permaibilite selective mais plus precisement des transporteur d’ions.

Answer 13

Ce sont les CANAUX IONIQUES(transport passif) ou des pompes ATP DEPENDANTES( actif). 2 type protegent charge ions. Le canal à K+ est entouré de charges négatives, ce qui repousse les
molécules chargées négativement qui voudraient s’enrichir de l’ion K+
.
Un filtre de sélection étroit fait de carbonyles distingue les K+ des Na+ : Les
C=O lient parfaitement les K+, alors qu’ils ne lient les Na+ que partiellement…
(le ΔG avec le K+ est donc plus faible).

Question 14

L’energie du transport actif. Parle moi des types d’energie

Answer 14

ATP(enrgie chimique) source très importante energie. Il existe autre type energie utilisable par cellule. PHOTONS , UN GRADIENT DE CONCENTRATION D’UN AUTRE IONS.
Rappel : une
réaction
couplée marie
une réaction au
ΔG négatif avec
une autre au
ΔG positif.

Question 15

Perméabilité sélective
Parle moi du transport symport et antiport

Answer 15

Symport: transport dans le même sens que le gradient de concentration(libère energie)

Antiport: transport contre le gradient de concentration( nécessite de l’énergie

Question 16

Perméabilité sélective
Parle moi des pompes ATP- dépendantes de type P.

La liaison du P à la protéine provoque
un changement de conformation. Par
quelle méthode peut-on visualiser ce
phénomène ?

Answer 16

Pompes type P ont besoin d’un cycle PHOSPHORYLATION- DÉPHOSPHORYLATION pour fonctionner

Elles permetetnt de maintenir le GRADIENT DES PRINCIPAUX IONS CELLULAIRES(Na+ etc.)

Disons na+ veut etre pomper cytosol vers exterieur on a un p qui vien se lier a la prot changement de conformation k+ rentre enleve le phosphate changeement de confoation rentre.
L’hydrolyse de l’ATP et l’ajout du Pi(phosphorylation) donnent l’éenergie nécessaire au changement de conformation de la pompe

Très utile maintien gradient na+ et k+
acidité estomac avc pompe h+ k+
Permet retirer ca2+ du cytoplasme(pompe ca2+ et h+)

On peux visualiser cela avec la cristallographie aux rayon X

Question 17

Parle moi des pompes ATP-dépendantes de type ABC

Answer 17

Transporteurs de types ABC(ATP BINDING CASETTE) sont utilisés pr transporter generelement de facon UNIDIRECTIONELLE, des ions inorganiques + molécule

Dimère: deux prot se lie ensemble.

La liaison du ligand au transporteur permet sa DIMÉRISATION. Du côté cytoplasmique, de l’ATP se lie au domaine ATPase du transporteur, puis il est hydrolysé. L’hydrolyse d’ATP en ADP permet le RELACHEMENT DU LIGAND DE L’AUTRE CÔTÉ DE LA MEMBRANE.

Question 18

Explique moi le rapport entre les transporteur de type ABC et la fibrose kystique

Answer 18

La prot CFTR est un transporteur de type ABC pour LE CL- et elle se retrouve ds membrane plasmique des cellule épithéliales des voies respiratoires. LA SORTIE DU CL- PERMET LE MOUVEMENT DE L’EAU VERS L’EXTÉRIEUR, ce qui HYDRATE LE MUCUS

La fibrose kystique est due à une MUTATION DU GÈNE CODANT POUR LA PROTÉINE CFTR, produisant un transporteur non fonctionnel. Le CL- RESTE DS CELLULES ET MUCUS N’EST PLUS HYDRATÉ, ce qui entraine un BLOCAGE DES VOIES RESPIRATOIRES

Question 19

pARLE MOI DES atpASES ET LES ATP synthases et à quel processus biologiques chaqun des types sert

Answer 19

Forment des gros complexes protéiques, qui, par LE MOUVEMENT DE CERTAINES SOUS-UNITÉS, permettent le passage des ions H+

TYPE V: retrouvé ds membrane des VVVVacuoles(plantes) lysosomes et permet de garder le pH acide. UTILISE DE LATP (pHOSPHORYLATION OXYDATIVE(RESPIRATION CELLULAIRE))

TYPE F: retrouvé ds membrane interne des MITOCHONDRIES, celle des THYLAKOIDES et la MEMBRANE PLASMIQUES DES BACTÉRIES. FABRIQUE LATP(acidifer le milieu

Question 20

Parle moi du rapport entre ATP synthase et production d’ATP ds mitochonderie

Answer 20

La CHAINE DE TRANSPORT D’ÉLECTRONS(CTE) accumule les H+ ds espace intermembranaires. Les H+ cherchent à retourner ds matrice pour RETABLIR L’ÉQUILOBRE. Les h+ cherchent à retourner ds matrice pour RÉTABLIR L’ÉQUILIBRE(DELTA G) La seul facon de revenir vers la matrice est de passer par la SOUS UNITÉ F0 DE L’ATP SYNTHASE(ATPase, réaction inverse). leur passage génère un MOUVEMENT DS LA SOUS UNITÉ(elle tourne) et cela CHANGE LA CONFORMATION DE LA SOUS UNITÉ F1 –> PRODUCTION D’ATP EN UTILISANT ADP ET Pi

Question 21

Explique moi en détails le fonctionnement de L’ATP synthase au niveau des sous unités

Answer 21

La rotation de la F0 :
Les H+ ENTRENT DANS LE C-RING qui est composé de plusieurs compartiments dont chacun possède une aa ASP OU GLU
Le mouvement des H+ d’un compartiment à l’autre permet la ROTATION DE LA F0

Le c-ring est attaché à la SOUS UNITÉ A(statique), cette dernière possèdent un AA ARG à la même hauteur que l’ASP(ou Glu) du c-ring

Lorsque les H+ arrivent à la sous-unité a, ils sont PROPULSÉS VERS LA MATRICE

La F0 est attachée à la sous-unité y au centre de la pompe. LORSQUE F0 TOURNE, LA Y TOURNE ELLE- AUSSI. La y est égalenebt insérée au milieu de la sous-unité F1 et SA ROTATION MODIFIE LES TROIS SITES CATALYTIQUES SITUÉS SUR LA F1. chaque site catalytique est formé d’une SOUS UNITÉ a ET UNE AUTRE B qui lient l’adp et le Pi

ON A 3 CONFORMATIONS DES SITES CATALYTIQUES:
O(ouverte): ADP ET Pi entrent
L(lOUSSE): ADP ET Pi SE RAPPROCHENT
T(Tight): Formation de l’ATP

CE SONT LES SITES CATALYTIQUES QUI TOURNENT: O,L,T, LES SOUS INITÉS ab NE BOUGENT PAS.

L’ADP et le Pi qui entrent en ab près du 1 demeurent à cet endroit, c’est le 1 qui change de place, et le site 2 viendera remplacer le 1. Meme chose pour les sites 2 et 3

Question 22

Parle moi des séquences répétées mobiles: les transposons e t. de leur mouvement

Answer 22

Les TRANSPOSONS sont des séquences d’ADN CAPABLES DE SE DÉPLACER DE MANIÈRE AUTONOME(OU PRESQUE) dans le génome

Il en existe TROIS GRANDES CLASSES: 1) TRANSPOSONS D’ADN; 2) RÉTROTRANSPOSONS VIRAUX ET 3) RÉTROTRANSPOSONS NON-VIRAUX(LINEs SINEs)

leurs principes de mouvement

Ils codent pour des ENZYMES NÉCESSAIRES À LEUR MOUVEMENT(rétro, ADN et line) ou ils utilisent celles qui sont présentes chez d’autre transposons(SINE)

la séquence du transposon est bien DÉLIMITÉE: chaque extremité est bien reconnue par les enzymes de transposition

LES TRANSPOSONS D’ADN BOUGENT GENERALEMENT SELON UN COUPER COLLER ET LES RÉTROTRANSPOSONS LAISSENT UNE COPIE DERRIÈRE EUX( COPIER COLLER) avec une étape d’ARN(rétro)

Question 23

Parle moi des transposons et de leur deplacement

Answer 23

La région ou les gènes de l’hemoglobine sont codés dans le génome de l’humain et la souris est parsemée de transposons

Les séquences codantes(régions jaune)présentent un pourcentage d’identité élevée, alors que les transposons ne sont absolument pas les mêmes( et n’ont pas colonisé les mêmes endroits)

Question 24

Définit moi les transposon d’ADN

Rétrotransposon

Answer 24

transposon d’adn: Code pour une transposase. Elle coupe le transposon, puis l’insèere ailleurs dans le génome.

Rétrotransposon: Il est transcrit complètement(ARN). Certains codent pour transcriptase inverse, endonuclése et intégrase. Rétrotranscription en ADN, puis insertion ailleurs dans le génome

Question 25

À quoi servent les transposons

Serait ce de l’ADN DÉCHET OU UN MECANISME D’ÉVOLUTION ACCÉLÉRÉE

Answer 25

Les transposons peuvent s’inserer dans les séquences codantes ou régulatrices de gènes existants, provoquant des mutations, modifiant un promoteur ou permettant le brassage des exons. Il peuvent donc créer de nouveau gènes, nouveaux patrons d’expression,inactiver des gènes