cours 5 (traduction + fin) Flashcards
traduction intro
- de l’ARNm vers acides aminés que composent les protéines
- traduction implique changement de langage
= de riboNUCLÉOTIDES à acides aminés - effectué sur un ribosome
- seul l’ARNm est traduit
combien de nucléotides pour coder combien d’acides aminés protéiques
besoin de 3 nucléotides pour coder un minimum de 20 acides aminés protéiques
- mais, avec 3 nucléotides, on code 64 acides aminés protéiques, ce qui est plus que nécessaire
= on calcule en faisant: 4^1= 4 (pas assez), 4^2=16 (pas assez), 4^3=64 (assez)
nombre de ribonucléotides qui jouent un rôle pour coder les acides aminés
sur les 64 possible, 61 sont utilisés pour coder les acides aminés. les trois autres ont d’autres fonctions
1. génon
2. codon
anticodon
codon
séquence de 3 ribonucléotides consécutifs d’une molécule d’ARNm
génon
séquence de 3 désoxyribonucléotides consécutifs du gène (soit, du brin anticodant de l’ADN) transcrit en codon d’ARNm
- les génons de l’ADN sont complémentaires aux codon de l’ARNm
anticodon
séquence de 3 ribonucléotides consécutifs au bout du bras II (à 6h) de l’ARNt
- complémentaire au codon de l’ARNm
codons d’initiation
- 3 codons permettent le début de la lecture de l’ARNm
1. AUG: code la méthionine chez les cellules eucaryotes
2. GUG: code la valine
3. UUG: code la leucine
= chez les cellules eucaryotes, presque juste le AUG utile
= chez les cellules procaryotes, les 3 servent
codons de terminaisons
- 3 codons de terminaisons qui signalent la fin de la lecture de l’ARNm et ne codent aucun acides aminés
1. UAG: ambre
2. UAA: ocre
3. UGA: opale
codons: redondance
puisque qu’il y a 61 codons qui codent 20 acides aminés
- un acide aminé peuvent être codés par plusieurs codons
= redondance
- les codons synonymes (qui codent les mêmes acides aminés) ne diffèrent souvent que par le 3e nucléotide de l’ARNm
codons: ambiguité
un codon ne code qu’un seul acide aminé
= le code génétique n’est pas ambigue
code génétique est universel
un codon donné va TOUJOURS coder le même acide aminé, pour des bactéries jusqu’aux animaux
- les exceptions sont très rares
= les gènes peuvent être transplanté d’une espèce à l’autre et fonctionner normalement
acteurs de la traduction (3)
- ARNm: vedette
- ARNt: le jeune premier
- ribosome: l’acteur de soutien
acteurs de la traduction: ARNm
vedette: l’ARNm
- transcrit du gène codant une protéine
- dans les cellules eucaryotes, l’ARNm
= subit des modifications post-transcriptionnelles
== épissage: excision des introns
== ajout de la m7G à la tête et de poly-A à la queue
= passe au noyau du ribosome au cytoplasme
- est traduit par codons triplets en acide aminé
acteurs de la traduction: ARNm: codons: cadre de lecture
les codons sont lus un à la suite de l’autre, sans chevauchement
acteurs de la traduction: ARNt (3)
(1) - transcrit à tout moment à partir de courts gène d’ADN
= dans l’ARNt, la séquence se termine toujours à CCA, à la queue 3’
= dans les cellules eucaryotes, les ARNt passent du noyau au cytoplasme
(2) - sa branche acceptrice perd sa queue poly-A et se lie à un acide aminé spécifique
(3) - l’acide aminé est sélectionné selon l’anticodon
= la spécifité entre l’acide aminé et l’ARNt est assuré par l’enzyme AAS
acteurs de la traduction: ARNt: liaison entre quoi et quoi et son nom
liaison entre ARNt et acide aminé
liaison aminoacyl-ARNt
acteurs de la traduction: ARNt: liaison aminoacyl-ARNt
- condensation (libération de H2O)
- l’acide aminé perd le OH de son groupement hydroxyle (COOH) par le groupement carboxyle (R-COOH), ce qui donne le nom acyl (perte d’hydroxyle par carboxyle)
- le C3’ du ribose du dernier nucléotide de l’ARNt perd le H de son OH
= H2O - liaison covalente
- C du CO restant du groupement hydroxyle COOH ayant perdu son OH lors de la condensation
- O du C3’ du ribose du nucléotide A de l’ARNt
= liaison covalente de CO
acteurs de la traductiono: ARNt: acides aminés, codon, liaisons
un ARNt veut se lier à un acide aminé. mais, l’acide aminé doit être approprié à l’anticodon de cet ARNt. comment s’y assurer?
- SPÉCIFICITÉ assurée par un enzyme AAS
enzyme AAS
enzyme aminoacyl-ARNt-synthétase
- résultat de la liaison aminoacyl-ARNt: condensation et liaison covalente
étapes de la spécificité et enzyme aminoacyl-ARNt-synthétase
- le site actif de l’AAS se lie à un acide aminé spécifique et à de l’ATP
- l’AAS hydrolyse l’ATP en AMP + 2P et l’AMP va se lier à l’acide aminé spécifique
- l’ARNt approprié déplace l’AMP du site actif de l’AAS et s’y lie par le bras I.
- l’ARNt approprié se lie à l’acide aminé spécifique par le A du bras V
- l’AAS libère l’aminoacyl-ARNt
- un seul acide aminé et un seul ARNt peuvent se fixer à une AAS donnée
pourquoi pas besoin de 61 ARNt différents
pas besoin de 61 ARNt différents, même s’il existe 61 codons codants pour les acides aminés
- chaque codon de l’ARNm est une suite de 3 lettres (nucléotides) qui code pour un acide aminé
- un ARNt spécifique reconnaît chaque codon grâce à son anticodon complémentaire
= 61 codons qui codent pour des acides aminés
= 45 ARNt chez les humains, ce qui est assez
PARCE QUE la cellule réutilise certains ARNt grâce à un phénomène appelé OSCILLATION DE LA 3E BASE
oscillation de 3e base
habituellement, codon et anticodon doivent être complémentaires.
ex: codon GGG dans ARNm doit être lu par anticodon CCC de ARNt
mais, oscillation de 3e base permet de la flexibilité au niveau de la complémentarité. la 3e lettre peut être différente dans certains cas
ex: anticodon GGA de l’ARNt peut s’attacher normalement à un codon UCC de l’ARNm
mais, grâce à oscillation de 3e base, peut aussi s’attacher à UCU, même si la 3e lettre est différente (U au lieu de C)
- règle (juste pour la 3e lettre):
G peut s’apparier avec C ou U
U peut s’apparier avec A ou G
I peut s’apparier avec A, G ou C
acteur de la traduction: ribosome: qu’est ce que le ribosome
- particule dans le cytoplasme
= 60% ARNr: transcrit de segments d’un brin d’ADN
= 40% protéines ribosomales - 2 sous unités chacun ayant la même proportion (60:40) ARNr protéine
= petite sous unité
= grosse sous unité
== ne s’assemblent que pour la synthèse des protéines
étau ribosome
- petite et grosse sous unité forment un étau qui maintient l’ARNm et l’ARNt
acteur de la traduction: ribosome: 4 sites de liaison
Sur la petite sous-unité
1. site de l’ARNm
Sur la grosse sous-unité
2. site A: acétyl accepteur
- son ARNr se lie au bras IV de l’ARNt qui apporte un nouvel acide aminé au ribosome
3. site P: peptidyle
- son ARNr se lie au bras IV de l’ARNt qui porte la chaîne d’acides aminés en élongation
4. site E: exit
- sortie
traduction: 3 grandes étapes
- initiation
- élongationo
- terminaison
traduction: initiation: étapes
- séries de réactions chimiques qui précèdent la formation d’une liaison peptidique entre deux acides aminés qui formeront une protéine
- débute souvent avec le codon initiateur AUG qui code le Met
- 3 sous étapes
traduction: initiation: 3 sous étapes
- liaison de l’acide aminé Met à l’ARNt médiée par l’AAS
- formation du complexe d’initiation ARNr-ARNm
- fixation du Met-ARNt, puis que la grosse sous-unité ribosomale sur le complexe d’initiation
traduction: initiation: sous étapes: liaison de l’acide aminé Met à l’ARNt médiée par l’AAS
- l’acide aminé Met se lie à l’AAS en présence d’ATP.
= devient AMP+2P - AAS déplace l’AMP du site actif et se lie à l’acide aminé spécifique, le Met
= par condensation et liaison covalente, revoir diapo pour détails - résultat: Met-ARNt se libère de l’AAS
traduction: initiation: sous étapes: formation du complexe d’initiation ARNr-ARNm
- ARNs de la petite sous unité d’un ribosome reconnaît une séquence spécifique, de l’extrémité 5’, de l’ARNm avec coiffe m7G, chez les cellules eucaryotes
= cette reconnaissance est le complexe d’initiation
traduction: initiation: sous étapes: fixation du Met-ARNt puis de la grosse sous-unité ribosomale sur le complexe d’initiation
- le Met-ARNt se lie au complexe d’initiation par association spécifique de l’anticodon ARNt au codon complémentaire de l’ARNm par des liaisons H
- la grosse sous-unité ribosomale se lie au complexe d’initiation
= le Met-ARNt se trouve au site P (peptidyle) du ribosome
traduction: élongation
- addition d’acides aminés pour former un polypeptide
- dure environ 60 ms
traduction: élongation de la chaîne polypeptidique: sous étapes
- fixation d’un 2e aminoacyl-ARNt
- l’acide aminé Met se détache de l’ARNt du site P par hydrolyse
- translocation
traduction: élongation de la chaîne polypeptidique: fixation d’un deuxième aminoacyl-ARNt
- l’ARNt va se lier à un acide aminé spécifique: l’aminoacyl-ARNt
= l’aminoacyl-ARNt est choisi selon si sont anticodon est complémentaire au 2e codon de l’ARNm - l’aminoacyl-ARNt chemine vers le site A du ribosome
traduction: élongation de la chaîne polypeptidique: l’acide aminé Met se détache de l’ARNt du site P par hydrolyse
- l’acide aminé Met se détache de l’ARNt du site P par hydrolyse
- il se lie au nouvel acide aminé de l’aminoacyl-ARNt du site A par liaison peptidique
= l’ARNt du site P n’attache plus d’acide aminé
traduction: élongation de la chaîne polypeptidique: translocation
le ribosome se déplace le long de l’ARNm, un codon à la fois, dans le sens 5’–>3’
traduction: terminaison
séries d’étapes nécessaires à la libération de la chapine polypeptidique située au site P du ribosome
- codons STOP
- seul un facteur de libération se lie au codon STOP
- le ribosome se sépare en petite et grosse sous-unités qui pourront servir encore
