cours 4 (acides nucléiques) Flashcards
nuclétotide définition
monomère des acides nucléiques
nucléotides parties (3)
- base azotée liée à un
- pentose (sucre à 5 atomes de C) lié à un
- groupe phosphate
nucléotide: base azotée
- composé cyclique azoté
- deux familles selon que la base ait 1 ou 2 cycles
- les bases se distinguent par les groupements fonctionnels qui y sont liés
nucléotide: base azotée: 2 familles
- pyrimidine
- purine
nucléotide: base azotée: pyrimidine
- 1 cycle comprenant 4C et 2N
= Cytosine C: C(4)H(5)N(3)O
= Thymine T: C(5)H(6)N(2)O(2)
= Uracile U: C(4)H(4)N(2)O(2)
nucléotide: base azotée: purine
- 2 cycles comprenant 5C et 4N
= Adénine A: C(5)H(5)N(5)
= Guanine G: C(5)H(5)N(5)O
nucléotide: pentose (4)
- une ribose sous forme cyclique
- par convention:
= C dans pentose: C1’, C2’
= C dans base: C1, C2 - OH de C1’ au dessus du plan du cycle
= B-ribose - type de sucre va déterminer le nom de l’acide nucléique
= 2 types de pentoses => 2 types d’acides nucléiques
= ribose dans l’ARN: OH lié à C2’
= désoxyribose dans l’ADN: H lié à C2’
nucléotide: groupement phosphate
- groupement PO(4)
- vient de l’acide phosphorique H(3)PO(4)
- 5 électrons de valence
nucléotide: lien entre base azotée et pentose
- base azotée se lie au C1’ du pentose
= nucléoside - par liaison N-glycosidique
= OH du C1’ (pentose) et H de NH (base) forme H(2)0 = condensation
= C1’ (pentose) et N (base) établissent une liaison covalente (forte)
nucléotide: lien entre pentose et groupement phosphate
- par liaison phosphoester
- H(3)PO(4) se lie au C5’ (pentose) du nucléoside
= nucléotide - OH du C5’ (pentose) et un H du H(3)PO(4) forme H(2)O = condensation
- C5’ du pentose et un O de H(2)PO(4) forment une liaison covalente (forte)
nucléoside vs nucléotide: nucléoside (3)
- base azotée + pentose
- ribonucléoside si pentose est le ribose (dans l’ARN)
- désoxyribonucléoside si pentose est le désoxyribose (dans l’ADN)
nucléoside vs nucléotide: nucléotide (3)
- nucléoside + groupement phosphate
- ribonucléotide si le pentose est le ribose (dans l’ARN)
- désoxyribonucléotide si le pentose est le désoxyribose (dans l’ADN)
polymérisation des nucléotides
- polymériser pour former les chaînes ADN et ARN
- le C3’ d’un monomère se lie au groupement phosphate du monomère voisin par condensation et liaison covalente
- et ainsi de suite tout le long de la chaîne
extrémités de la chaîne polynucléotidique
tête: extrémité 5’
queue: extrémité 3’
- reflètent le sens de polymérisation
liaison phosphodiester
un groupement phosphate se retrouve impliqué dans deux liaisons phosphoesters:
1. celle qui le relie au C5’ de son nucléotide
2. celle qui le relie au C3’ du nucléotide précédent
diversité des acides nucléiques
réside dans la séquence et le nombre des nucléotides
- eux-mêmes caractérisés par la nature des bases azotées
= pyrimidine: C, T, U
= purine: A, G
autres nucléotides: autres fonctions (3)
- transport d’énergie chimique
- messagers cellulaires spécifiques
- constituants d’enzymes
ADN nom complet
acide désoxyribonucléique
ADN: définition
- polymère linéaire de désoxyribonucléotides
- généralement bicaténaire: 2 chaînes = 2 brins
ADN: niveaux de structure
- primaire
- secondaire
- tertiaire
ADN: structure primaire
- composition de deux brins: nature, nombre et séquence de désoxyribonucléotides reliés par liaison phosphoesters covalente
- en résulte une polarité: extrémité 5’ (tête) et l’autre extrémité 3’ (queue) de chaque chaîne
ADN: structure secondaire
- les 2 brins sont anti paralèlles et complémentaires
- les liaisons H permettent sa forme hélocoïdale
= meilleure stabilité
ADN: structure secondaire: 2 brins complémentaires
- les bases azotés sont positionnées face à face selon un appariement strict
- les bases sont reliées par des liaisons hydrogène
- la pyrimidine d’un brin fait face à la purine d’un autre brin
= T-A: lié par 2 liaisons H
= G-C: lié par 3 liaisons H
ADN: structure tertiaire: 2 molécules
- molécule circulaire
- molécule linéaire enroulé autour de protéines nommées histone
ADN: structure tertiaire: molécule circulaire
- ADN des bactéries (procaryotes, cellules sans noyau)
- ADN des mitochondries (dans toutes les cellules eucaryotes, avec noyau)
- ADN des chloroplaste (dans les cellules végétales)
ADN: structure tertiare: molécule linéaire mais entourée autour de protéines nommées histone
- ADN du noyeau des cellules eucaryotes
= les histones compactent et protègent l’ADN
= se lie à l’ADN par des liaisons ioniques et H
ADN pour hérédité
matériel héréditaire des organismes vivants
ADN: hérédité et reproduction
- molécule très stable, produite une fois et dure toute la vie d’une cellule
- seule molécule possédant la capacité à produire une copie d’elle-même, propriété essentielle à la continuité du vivant
= reproduction à l’échelle moléculaire - code toutes les fonctions de la cellule mais ne les exécute pas elle-même
ARN: nom complet
acide ribonnnucléique
ARN: définition
- polymère linéaire de ribonucléotide
- monocaténaire: 1 chaîne
- complémentaire avec un segment d’un brin d’une molécule d’ADN
= beaucoup plus court que l’ADN
= très instable - 3 niveaux de structure:
1. primaire (tous les types)
2. secondaire (certains)
3. tertiaire (certains types)
ARN: structure primaire
sa composition: nombre, nature et séquence de rubonucléotide relié par liaison phosphoester covalente
- 2 pyrimidines: C et U
- 2 purines: A et G
ARN: structure secondaire
le transcrit d’ARN peut se replier
- ARNm et ARNr sont surtout linéaires, mais peuvent se replier
- ARNt forme des épingles à cheveux où
= appariement de U-A et de C-G par des liaisons H doubles ou triples le long des tiges
= au bout, boucle sans appariements de bases
ARN: structure tertiaire
- ARNt: la molécule se replie sur elle-même en forme de L
- ARNr: certains ont une activité catalytique et acquièrent une structure 3D, comparable à celle des protéines
ARN: classification (différents types d’ARN)
- ARNm: ARN messager
- ARNt: ARN de transport
- ARNr: ARN ribosomal
ARN messager
- l’ARNm est transcrit à partir d’un gène codant une protéine
- le seul type d’ARN qui est traduit en protéine
ARN de transfert
- petite molécule d’environ 80 ribonucléotides
- transcrit à partir d’une partie d’un gène mais pas traduit en protéine
= sert d’adaptateur entre l’ARNm et les acides aminés lors de la synthèse protéique - structure secondaire en forme de trèfle à 5 tiges
ARN de transfert: structure secondaire en forme de trèfle à 5 tiges
- le long des tiges: les bases azotées qui se font face établissent des liaisons H
- dans les boucles: les bases ne forment pas de liaisons H (elles sont trop éloignées)
ARN ribosomal
- transcrit par une partie de gène, mais pas traduit en protéine
- retrouvé dans les ribosomes
- ARN la plus abondante dans les cellules
ribosome
- composante cytoplasmique comprenant:
= ARN ribosomal (60% de sa masse)
= protéines ribosomales (40% de sa masse)
ribosome et sous-unités
- ribosome a des sous unités, une petite et une grosse
= elles sont utilisées séparémment, jusqu’à ce qu’elles soient utilisées ensemble pour la synthèse protéique - les ribosomes et sous-unités se décrivent par leur taux de sédimentation
