Cours 5 - Examen 2 Flashcards
Quels sont les types d’ARN polymérase?
ARN polymérase I: ARNr
ARN polymérase II: ARNm (peut pas être directement traduit)
ARN polymérase III: ARNt
Quels sont les types de promoteurs?
- Minimal
- Proximal
- Distal
Qu’est-ce que le promoteur minimal?
Il ne peut pas transcrire seul de manière efficace. Il en existe 2 types: qui contiennent une région initiatrice positionnée entre -2 et +6
1. ceux qui contiennent les boîtes TATA entourée de régions riches en GC
2. Ceux qui contiennent un élément en aval
Qu’est-ce que le promoteur proximal?
- Boîte CAAT recconue par des facteurs de transcription activateur (CTF/NFI)
- Boîte GC (entre boite TATA et CAAT) reconnue par le facteur SpI
Qu’est-ce que le promoteur basal?
Une association du promoteur proximal et minimal qui permet une expression de base du gène
Qu’est-ce que le promoteur distal?
- modulateurs
- situé loin du gène (aval ou amont du site initiateur de la transcription)
- fixent des facteurs de transcription qui en recrutent d’autre par des interactions protéines-protéines (impliquent repliement de l’ADN)
- mécanisme de régulation: permet ajuster le taux de transcription aux besoins cellulaires
Que possèdent les facteurs de terminaisons?
- Domaine de fixation d’ADN (hélice alpha permet d’interagir avec l’ADN)
- Domaine d’inhibition/activation (interaction avec d’autres protéines pour réguler l’expression génétique)
- Domaine de saison à un ligand (permet de reconnaître le ligand donné et activer des gènes cibles du récepteurs nucléaire)
Quel est le rôle de la pré-initiation?
Faire un pont entre les activateurs de la transcription & Pol II
Quels sont les étapes de la pré-initiation?
- TFIID reconnaît la boîte TATA
- TFIIA et TFIIB stabilisent le groupe
- Recrutement de l’ARN pol II associé à TFIIF
- Recrutement de TFIIE et TFIIH pour former le complexe fermé de pré-initiation
Quels sont les facteurs de transcription généraux et leur rôle?
TFIID, TFIIB, TFIIA: positionne comme il faut la pol II au site d’initiation
Quelles sont les étapes de l’initiation?
- Ouverture du brin avec de l’ATP par l’hélicase TFIIH (préalablement recruté par TFIIE) pour former bulle de transcription
- Ajout du premier nucléotïde (avant 4 peut arrêter, mais après 4 c’est parti pour la gloire)
- TFIIH phosphore des séries dans le domaine C-terminal de pol II ce qui permet l’échappement de l’enzyme de son promoteur
- Dissociation des facteurs tFIID/A/E/B/H et du médiateur de l’An poly A
Qu’arrive t-il lorsqu’un complexe de pause est recruté?
- arrêt de la transcription (après 20-25 nucléotïdes)
- Mise en place de la coiffe 5’ sinon l’ARN se ferait dégrader dans le cytosol avant d’arriver au site de traducteur
Quelles sont les étapes de l’élongation?
- phosphatase déphosporyle une partie de CTD-Ser5P
- Facteurs d’élongation remplace les facteurs d’initiation (P-TEF6 & TFIIS)
- P-TEF6 phosphore CTD-Ser2P/NELF/DSIF
- NELF et DSIF sont relargué et activé et deviennent des facteurs d’élongation
- TFIIS stimule poly en pause à reprendre la transcription
- Domaine CTD-Ser2P recrute machinerie d’épisssage de pollyadénylation
Comme se fait la terminaison?
En aval, par un signal de polyadénylation par clivage d’ARN
Quels sont les 3 types de maturation?
- Ajout d’une coiffe 5’ (protège l’ARN)
- Ajout d’une queue poly-A 3’ (après la terminaison, CTD recrute un complexe qui catalyse la transcription)
- Épissage (pendant la traduction, éliminer les introns et recoller les exons par les ribonucléoprotéines > splicesomes)