Cours 2 - Examen 2 Flashcards
Qu’est-ce que le génome?
l’ensemble de l’information moléculaire qui code les instructions nécessaires à la fabrication d’un organisme
Que comprend un nucléotïdes?
- sucre à 5 carbones (ribose ou désoxyribose)
- base azotée (U, T, C, A, G)
- Groupe phosphoryle
Qu’est-ce qu’un nucléoside?
Un sucre et une base azotée (nucléotide sans le phosphate)
Quelle est la différence entre un groupe ribote et désoxyribose?
R: peut subir des attaques
D: ADN plus stable
Quels sont les purines?
- Adénosine
- Guanine
Quels sont les pyrimidines?
- Cytosine
- Uracile
- Thymine
Savoir dessiner un nucléotide de base
Sacoir dessiner les 5 bases azotée
Quelle est la structure de l’ADN?
- 2 chaîne anti-parallèle
- forme d’hélice
- écrit l’ADN de 5’ à 3’ parce que c’est le sens de polymérisation
- lien de phosphodiester entre le carbone 3’ et 5’ (condensation)
Quelle est la règle de Chargaff?
- Les quantités d’adénosine et de thymine ainsi que celles de guanine et de cytosine sont identiques (ce n’est pas la même quantité d’un organisme à l’autre, mais la quantité ne varie pas dans le même organisme)
- La composition de base de l’ADN est caractéristique d’un organisme et non des tissus de cet organisme. Elle est indépendante de l’âge, du sexe, de l’état nutritionnel et des facteurs environnementaux.
Pourquoi chargaff a fait cette règle?
Parce que deux bases azotées peuvent s’assembler grâce à des liaisons hydrogènes. Alors, c’est sur que si il y a un lien entre 2 bases azotée, il y a la même quantité de bases azotée (appariement)
Combien y at-il de liaison hydrogène entre T et A et que sont T et A?
2 liaisons
- Adénine
- Thymine
Combien y a-t-il de raisons hydrogènes entre G et C et que sont G et C?
3 liaisons
- Guanine
- Cytosine
Apprendre tableau différences ADN
De quoi dépend la conformation de l’ADN bicaténaire?
- son degré d’hydratation
- sa séquence
- son taux de surenroulement
- des modifications chimiques des bases qui le composent
- de la nature
- de la concentration des ions métalliques en solution
Quelles forces stabilisent l’ADN?
- Forces hydrophobes (Van Der Waals) qui résultent de l’empilement des bases au centre de l’hélice
- Liaisons hydrogène entre les bases complémentaires
- Intercations électrostatiques entre les groupements phosphate et Mg2+ ou des protéines cationiques
Quelles sont les forces qui déstabilisent l’ADN?
Répulsion électrostatique directement lié à la présence de charges négatives tout le long de chaque molécules (phosphate)
Est-ce l’ADN bicaténaire ou monocaténaire la plus stable?
bicaténaire
Qu’est-ce que la dénaturation de l’ADN?
Les deux brins complémentaires sont séparés
Quel est le résultat de la dénaturation?
- In vivo: lors de la réplication ou la transcription
- In vitro: augmentation de la température, ruptures des ponts H et désapparieront des bases
- In vitro: Agents chaotropes (urée et chlorure de guanidium)
Qu’est-ce que l’effet hyperchrome?
L’ADN monocaténaire possède une absorbance à 260nm plus élevé que l’ADN bicaténaire. Alors, l’ADN monocaténaire présente une plus grande accessibilité des bases
Pourquoi dit-on que la fusion de l’ADN double brin est coopérative?
La dénaturation des extrémités et des régions interne riche en liaisons A-T déstabilise les régions adjacente de l’hélice et conduit à une désorganisation progressive et concertée de toute structure
Apprendre tableau stabilisation ADN
Quelle est la formule de la dénaturation thermique (fusion) de l’ADN double brin
Tm = T˚où [ADNdb] = [ADNsb]
Qu’est-ce que l’hybridation (renaturation)?
L’inversion de la dénaturation thermique de l’ADN par le refroidissement de la solution
En ce qui concerne l’hybridation, qu’est-ce qu’un refroidissement lent?
Laisse sufissament de temps aux brins d’ADN complémentaire pour se retrouver (la solution présente la même absorbance qu’à l’origine, car l’ADN retrouve sa forme complètement bicaténaire
En ce qui concerne l’hybridation, qu’est-ce qu’un refroidissement rapide?
Permet la formation de régions locales d’ADN bicaténaire (la diminution dans l’absorbante à 260 nm est donc plus petite)
Pourquoi c’est la mère qui transmet l’ADN mitochondriale?
Parce qu’il n’y a pas de mitochondries dans les spermatozoïde
Comment est l’ADN mitochondriale?
- Circulaire
- Bicaténaire
- Aucun introns
- Aucune séquence répétée
- Plus résistante à la dégradation d’ADN n
- Fort polymorphisme (mute rapidement)
Pourquoi dit-on que l’ADN mitochondriale est en quantité non négligeable?
cellules = 2000 mitochondries = 2-4 molécules d’ADN = 4000 molécules ADN par cellule
Pour quoi code l’ADN mitochondriale?
- 22 ARNt
- 2 ARNr
- 13 protéines membranaires
Comment est l’ADN chloroplaste?
- 50 à 100 copies par chloroplaste
- code pour une centaine de gènes
Qu’est-ce que l’ARN?
Un brin monocaténaire où la base azotée thymine est remplacée par l’uracile et le sucre est le ribose
Qu’est ce que le ribose provoque dans l’ARN?
Comme le ribose peut subir des attaques, il rend l’ARN plus instable chimiquement que ADN
Quelle est cette structure secondaire d’ARN?
Structure en tige (suite consécutive de bas appariées)
Quelle est cette structure secondaire d’ARN?
Structure en boucle interne (boucle entourée par 2 tiges)
Quelle est cette structure secondaire d’ARN?
Structure en bulge (renflement) (base non appariées que d’un côté d’une tige)
Quelle est cette structure secondaire d’ARN?
Structure en tige-boucle ou en épingle à cheveux (boucle à l’extrémité d’une tige)
Quelle est cette structure secondaire d’ARN?
Boucle multiple
Quelle est cette structure secondaire d’ARN?
Empilements
Grâce à quoi sont possible les structures secondaire d’ARN?
l’existence de régions contenant des séquences répétées inversées, qui peuvent s’apparier pour former localement une structure en double hélice (appariement de manière anti-parallèle)
Quels sont les forme des structures de l’ARN?
secondaire: trèfle
tertiaire: L
Comment les formes secondaires peuvent devenir des formes tertiaires?
Les structures interagissent entre elles et peuvent entrainer un repliement de la molécule dans l’espace ce qui forme la structure tertiaire. Ces structures sont essentiels à la fonction
Apprendre tableau des type d’ARN
Qu’est-ce que des histones?
- Protéines riches en Lys et Arg qui neutralisent les charges négatives de l’ADN
- Leur séquence en aa est très bien concentrée
- 5 types: H1, H2A, H2B, H3, H4
De quoi est constitué le coeur du nucléosomes?
Complexe ADN (146 paires de bases) x histones (octamère)
Quelle est l’étape 1 de la compression de l’ADN?
Collier de perles: les histones se combinent à l’ADN pour constituer les nucléosomes
Quelles est l’étape 2 de l compression de l’ADN?
Solénoïde: forme encore plus compresser où l’histone H1 vient se positionner sur le double tour d’ADN et stabilise la strucutre du nucléosome. Une fois le nucléosome stabilise ils peuvent s’empiler pour former la fibre de 30 nm (solénoïde)
Quelle est l’étape 3 de la compression de l’ADN?
La fibre de 30 nm forme des boucles qui se fixent à leur base sur un squelette nucléaire pour donner la forme la plus compacte: le chromosome métaphysique
Quelles sont les formes de chromatine?
- Euchromatine
- Hétérochromatine
Qu’est-ce que l’euchromatine?
forme décondensée où la fibre de 30 nm est accessible aux enzymes de réplication ou de transcription
Qu’est-ce que l’hétérochromatine?
forme condensée qui n’est plus accessible aux enzymes de réplication ou de transcription
