Cours 4 - Examen 2 (procaryotes)

Question 1

Combien les procaryotes ont de gènes à comparé des eucaryotes?

Answer 1

Procaryotes: 2 000
Eucaryotes: 30 000

Question 2

Quels sont les différents types de gènes?

Answer 2

• Gènes d”entretien (ils sont toujours en fonction et sont obligatoirement dans toutes les cellules. Ils sont nécessaire au maintien de la fonction, code pour ARNt, ARNr, etc)
• Gènes qui ne s’expriment que dans des circonstances particulières (embryogenèse, division cellulaire)
• Gènes exprimés dans certaines cellules (insuline)

Question 3

Quels sont les étapes de la trsnacription et par quelle enzymes est-elle assurée?

Answer 3

Par l’ARN polymérase :
- initiation
- élongation
- terminaison

Question 4

Par quoi est défini l’unité de transcription?

Answer 4

• promoteur (zone d’ADN reconnu par la polymérase pour débuter la transcription)
• terminateur (zone où il y a dissociation de l’ARN nouvellement formé et de l’ADN matrice)

Question 5

Qu’est-ce qu’un ARN monocistronique ou polycistronique?

Answer 5

• Mono: infos pour 1 protéines avec 1 promoteur par gènes (eucaryote)
• Poly: infos pour plusieurs protéines avec 1 promoteur pour plusieurs gènes (procaryote)

Question 6

Qu’est-ce que la transcriptase (procaryote)?

Answer 6

• l’ARN polymérase qui catalyse la synthèse de tous les ARNs
• synthétise l’ARN dans le sens 5’ vers 3’, mais se déplace de 3’ à 5’

Question 7

De quoi est composé l’ARN polymérase?

Answer 7

de différentes sous-unités qui forme le noyau holoenzymatique
- alpha: assemblage de l’enzyme et interaction non-spécifique avec le promoteur
- beta: site actif de l’enzyme pour la synthèse de l’ARN
- omega: stabilisation de l’enzyme et participe à l’assemblage des sous-unités
- omicron: facteur protéique nécessaire pour fixer spécifiquement sur le promoteur

Question 8

(bactéries) Quelles sont les deux étapes de l’Initiation?

Answer 8

1. Fixation de l’ARN polymérase au promoteur
2. Enzyme sépare les 2 brins d’ADN

Question 9

(bactéries) Comment se fait la fixation de l’ARN polymérase au promoteur?

Answer 9

1. omicron se fixe au noyau enzymatique pour former l’holoenzyme
2. le promoteur est donc reconnu et et l’enzyme est stabilisé sur ce dernier

Question 10

(bactéries) Comment s’exprime l’intensité de la transcription?

Answer 10

En rapport avec l’affinité de la liaison entre l’ADN et la polymérase:
- Promoteur puissant: séquences consensus beaucoup conservées = augmentation du taux de transcription
- Promoteur faible: séquence consensus dégénées = diminution du taux de transcription

Question 11

(bactéries) Qu’est-ce qu’une séquence consensus?

Answer 11

Une séquence hautement conservée au cours de l’évolution qui peut être identifié dans le promoteur (boite TATAAT

Question 12

(bactéries) Comment l’enzyme sépare les deux brins d’ADN?

Answer 12

• Dans une région riche en AT
• Demande beaucoup d’énergie (étape limitante)
• Formation d’une bulle de transcription
• Le facteur omicron se détache

Question 13

(bactéries) Comment se fait l’élongation de la transcription?

Answer 13

• La libération du facteur omicron permet à l’ARN polymérase de se déplacer sur l’ADN matrice de 3’ à 5’ et fait de l’ARN 3’ vers 5’
• Quand la polymérase avance, elle défait les brins devant la bulle et les refait derrière elle
• ARN reste sur ADN envrion pendant 8 nucléotide

Question 14

(bactéries) Quelle est la différence entre le brin codant et le brin matrice?

Answer 14

• brin codant: code pour l’ARN (même chose que le brin matrice, mais avec T au lieu de U)
• brin matrice: fait l’ARN (polymérase se déplace sur le lien matrice)

Question 15

(bactéries) Quand est-ce que l’étape de terminaison commence?

Answer 15

Jusqu’à la rencontre du site de terminaison

Question 16

Quels sont les types de site de terminaison?

Answer 16

1. Terminateurs rho-indépendants (pas de protéines externes et séquences de terminaison intrinsèques)
2. Terminateurs rho-dépendants (protéine rho requise)

Question 17

Qu’est-ce qu’un site palindromique?

Answer 17

Un site qui se lie pareil dans les deux sens (comme Laval) et qui sont riches en CG. C’est le brin matrice qui forme un brin codant en remplaçant les T par des U

Question 18

Qu’est-ce que la structure en épingle à cheveux?

Answer 18

C’est la laision de site palindromiques complémentaires et d’une queue poly U qui entraîne l’arrêt de la polymérase et qui favorise la dissociation du complexe et la libération de l’ARN

Question 19

(bactéries) Qu’est-ce que la terminaison rho-dépendante?

Answer 19

• Protéine rho (hexamère) qui possède activité hélicase et ATPase
  1. Recconnait une région riche en C avant le site de terminaison et se fixe à l’ARN
  2. Utilise l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP pour atteindre l’ARN polymérase
  3. Se dissocie du complexe et provoque la terminaison de la transcription grâce à son activité hélicase