Cours 4 - Transcription Flashcards
(174 cards)
1
Q
En quoi la transcription est très semblable à la réplication ADN
A
Nécessitent enzymes synthétisent nouveau brin d’acides nucléiques
complémentaires au brin ‘matrice’
2
Q
C’est quoi les 4 différences entre la transcription et la réplication ?
A
- Dans transcription: brin constitué de ribonucléotides (ARN)
- ARN polymérase: ne requiert pas d’amorce
- L’ARN ne reste pas apparié au brin matrice d’ADN : l’enzyme déplace la chaîne naissante
- Transcription: moins fidèle que la réplication: 1 erreur/ 10 000 nucléotides
3
Q
Pourquoi la transcription se permet de faire plus d’erreur que la réplication?
A
Réplication doit assurer transmission fidèle du matériel génétique aux cellules filles et toute erreur devient permanente dans génome peut avoir conséquences désastreuses
4
Q
V/F: ARN pol en a autant chez eucaryote que procaryote
c’est quoi leur différence ?
A
Faux
Procaryote en ont un
Eucarytote en ont 3
5
Q
Pol I fait quoi
A
Transcrit précurseur ARNr
6
Q
Pol II fait quoi
A
Code plupart des gènes (tous gènes codant des protéines)
7
Q
Pol III fait quoi?
A
code ARNt et ARNr 5S
8
Q
Vrai ou faux: Les polymérases eucaryotes et procaryote sont très similaire (sous-unité)
A
Vrai
9
Q
C’est quoi un promoteur ?
A
Séquence ADN en amont du gène voulu qui fixe l’ARN polymérase et les facteurs d’initiation requis
10
Q
C’est quoi les 3 étapes de l’initiation de la transcription
A
- Formation complexe fermé (ADN = double-brin)
2: Formation complexe ouvert (ADN = simple-brin)
3: Polymérase démarre transcription: détachement du promoteur
11
Q
V/F: La transcription initial est efficace.
pourquoi vrai ou pourquoi faux ?
A
Faux.
Elle n’est pas efficace.
Font des petites séquences (10nucléotide)
Synthèse abortive (Qui ne parvient pas au terme de son développement.)
12
Q
La ARN pol a besoin de quel cofacteur
A
Magnésium
13
Q
c’est quelle phase si ARN pol fait + 10 nucléotide ?
A
Élongation
14
Q
Rôle ARN pol ? (4)
A
- Déroule ADN devant elle
- Réassocie brins derrière complexe
- Dissocie chaine ARN de la matrice durant progression
- Corrige erreurs potentielles
15
Q
L’ARN polymérase minimale, ça veut dire quoi ?
A
chez bactérie, minimum 5 sous-unité (2 alpha, 2 beta, 1 omega) (peut initier transcription n’importe où sur l’ADN in vitro)
16
Q
V/f: L’ARN polymérase minimale peut initier transcription partout sur l’ADN (pas promoteur spécifique)
A
Vrai in vitro mais pas in vivo
17
Q
Comment pouvons-nous rendre l’ARN pol minimale spécifique aux promoteurs ?
A
En ajoutant 6e facteur d’initiation: σ
18
Q
c’est quoi holoenzyme de l’ARN polymérase chez les bactéries
A
ARN pol minimale (2 alpha, 2 beta, 1 omega) + σ
19
Q
Chez E. coli c’est quoi lefacteur σ prédominant
A
σ70
20
Q
Quel séquence consensus est reconnu par σ70
A
-10 et -35
21
Q
Pourquoi dit-on que -10 et -35 est une séquence consensus ?
A
Parce que σ70 reconnait plusieurs séquence différente, mais -10 et -35 est la plus fréquente. De ce fait, c’est la séquence consensus.
22
Q
C’est quoi les promoteurs forts (initiation transcription + élevé)?
A
Les séquences qui sont les plus proche du consensus
23
Q
c’est quoi exactement la séquence consensus?
A
TTGACA (-35) et TATAAT (-10)
24
Q
Quel élément de plus ont les prometteurs puissants
A
élément UP
25
c'est quoi un élément UP ?
augmente la liaison polymérase et permet interaction spécifique supplémentaire Enzyme/ADN (ARNr)
26
Que ce passes-t-il si certains promoteurs σ70: pas élément -35
ils ont un élément -10 + long (ex.galactose)
27
L'Élément discriminateur est placer ou?
en avant de -10
28
σ70 est divisé en combien de région?
4 régions
29
Les régions 2 et 4 de σ70 font quoi?
Reconnaissent -10 et -35
30
La région 4 de σ70 fait quoi?
porte 2 hélices formant motif hélice-coude-hélice (domaine liaison ADN)
31
Dans la région 4 de σ70, il y a 2 hélices. Elles font quoi?
1ère hélice: grand sillon ADN élément -35
2ème hélice: située en travers au dessus du sillon:
établit contacts avec squelette ADN
32
Élément -10 est reconnu par quel région de σ70 ?
région 2
33
La region 3 de σ70, elle fait quoi?
Reconnait élément -10 allongé lorsque présente
34
Élément ‘discriminateur’ (lorsque présent) est reconnu par quoi dans σ70?
région 1.2
35
l'Élément UP est reconnu par quoi?
Pas reconnu par une hélice σ mais par domaine C-terminal de sous-unité α de polymérase ( αCTD)
36
c'est quoi le pont flexible (pont protéique flexible) ?
Pont qui relie αCTD relié à αNTD
37
La transition en complexe ouvert implique des modifications de quel type ?
structurales dans l’ARN polymérase et le promoteur
(isomérique)
38
Le complexe fermé est-il réversible ?
Oui
39
Le passage du complexe fermer à ouvert est-il réversible ?
Non
40
Le passage du complexe fermer à ouvert nécessite quoi?
1.modification structurale de l’enzyme 2. séparation brins ADN
41
La séparation de l'ADN par le complexe expose le brin matrice et un brin sens. À quoi sert le brin sens ?
Rien
42
Quand c'es écrit -11 ou +11, les - ou + servent à quoi
Dire si avant ou après le gène
43
La modification structurale de la polymérase + σ70 de fermer à ouvert implique quel type de modification
Isomérisation (pas ATP utilisé)
44
ADN polymérase comporte combien de canaux ? et qu'est-ce qu'il font ?
1 Canal d’entrée des NTPs au centre actif
1 Canal de sortie de l’ARN
3 autres canaux permettent l’entrée et sortie de l’ADN
45
C'est quoi les deux changements structuraux saisissants observés dans l'ADN polymérase chez la bactérie
1. fermeture machoire (double hélice maintenue fermement)
2. Déplacement région N-terminale σ
- Dans complexe fermé: σ1.1 dans foyer catalytique
- Dans complexe ouvert: lorsque sépare ADN σ1.1 est expulsé (déplacé)
46
Dans les canaux de l'ADN polymérase, que ce passe-t-il avec le Brin sens
quitte le centre actif par le canal NT
47
Dans les canaux de l'ADN polymérase, que ce passe-t-il avec le Brin matrice ?
suit parcours passant par centre catalytique puis canal brin matrice (T)
48
ADN se sépare en quelle position et se referme en laquelle?
+3 et -11
49
V/f: ARN polymérase a besoin d'une amorce
Faux
50
c'est quoi le mécanisme d'action de la transcription?
1er ribonucléotide amené au site actif + maintenu stable sur la matrice
2e NTP présenté pour permettre à la polymérisation de se dérouler
51
après la synthèse abortive, c'est quoi les modes de déplacement (3) du site actif de l'enzyme sur matrice ADN?
Pas certain, mais 3 modèles expliquerait
1. excursion transitoire
2. Chenille
3. Compression *
52
c'est quoi le modèle d’ « excursion transitoire » :
Cycles translocation ARN polymérase avant/arrière
53
c'est quoi le modèle de compression
ADN en avant tiré et replié à l’intérieur de l’enzyme
ADN s’y accumule (boucles simple brin)
54
c'est quoi le modèle « inchworming »
Existerait élément flexible qui
Permet au module (site actif) de se déplacer vers l’avant en synthétisant un court transcrit avant de se
rétracter dans le corps de l’enzyme (promoteur)
55
Parmis les modèles du déplacement de la Pol sur l'ADN, laquelle est retenue?
Modèle de compression
56
La phase d'élongation commence quand ?
Lorsque Polymérase va se libérer du promoteur
57
Polymérase va se libérer du promoteur à parti de quand ?
lorsque polymérase fait plus de 10 nucléotide
58
Que ce passes-t-il avec l'ARN naissant ?
ne peut pas rester contenu dans région où il s’hybride à l’ADN donc commence à s’insérer dans le canal de sortie ARN
59
La libération du promoteur implique de briser quoi?
des interactions polymérase-promoteur et noyau de la polymérase-σ
60
Que fait le linker3/4 ?
mime ARN chargé négativement occupe le canal de sortie en attendant la phase d'élongation. après: sort.
Relie la région 3 et la région 4
61
À quoi sert σ dans la pol
Reconnaissance
62
éjection de la région 3/4: fait quoi?
Baisse force de liaison de σ à l’enzyme = σ se décroche complexe d'élongation
63
Quel processus fournit énergie requise pour la polymérase de: i) rompre interactions polymérase-promoteur et ii) libérer noyau de l’enzyme du facteur σ
L’empilement de l’ADN dans l’enzyme est inversé lors de la libération du promoteur = ADN est donc ré-enroulé
64
V/f: Les ARN polymérases bactériennes et eucaryotes sont très semblables
Vrai
65
V/f: Un cycle de transcription comprend 3 phases distinctes: initiation, élongation et
terminaison.
Vrai
66
V/f: Chez les eucaryotes, le complexe d’initiation de la transcription est constitué de plusieurs protéines (polymérases + FGTs)
Vrai
67
V/f: La queue CTD de la polymérase permet de transporter des protéines requises
à toutes les étapes de la transcription d’un gène
Vrai
68
V/f: Les polymérases Pol I et Pol III fonctionnent de manière similaire à Pol II mais transcrivent dès gènes qui leurs sont propres
Vrai
69
Coté énergie, la méthode compression permet de quoi?
entrepose+mobilise énergie durant l’initiation transcription
70
la Libération énergie permet de faire quoi sur l'ADN pol?
permet polymérase détacher du promoteur + séparer σ de l’enzyme (qui devient inutle à ce moment)
71
En phase d'élongation, la matrice et le transcrit sont à l'interieur ou à l'extérieur de l'ADN pol
intérieur
72
La taille de la bulle ( quantité ADN associés dans l'ADN pol ) est toujours la même pendant la phase d'élongation
Vrai
73
c'est quoi les deux fonctions correctrices de l'ARN pol pendant la phase d'élongation?
1. pyrophospholytique
-> catalyse le retrait d'un ribonucléotide incorrect lors de l'incorporation (PPi) d'un autre nucléotide
(ne ralentit pas)
2. hydrolytique
-> Enzyme recule un ou plusieurs nucléotides et clive ARN
(rallonge)
74
Si l'ARN pol est bloqué, que faut-il faire ?
Il faut l'enlever de la matrice car ça peut être catastrophique
75
pourquoi l'arret de l'ARN pol peut être catastrophique ?
bloque les autres polymérase de faire la transcription des gènes
76
À quoi sert le TRCF ?
1. Lie ADN double brin en amont (derrière) polymérase et pousse l'ARN pol vers l'avant
2. permet la réparation des dommages: recrute enzymes de réparation
77
Lorsque la TRCF entre en collision avec l'ARN pol, que peut-il arriver ?
1. sois reprend élongation ou
2. se dissocie complexe ternaire
(ARN pol/ADN matrice/ARN transcrit)
78
c'est quoi une séquence ''terminateur'' ?
séquence conduisent polymérase en élongation à se dissocier ADN et à libérer l’ARN
comme une lettre disant d'arreter
79
Les bactéries ont 2 types de terminateur, lesquels ?
1er : Rho-dépendant : nécessite protéine Rho pour provoquer terminaison
2ème : Rho-indépendant : provoque terminaison sans autres facteurs
80
C'est quoi les caractéristique de l'anneau RHO :
1. se fixe à quoi? (séquence cible)
2. se fixe ou?
3. ATPase ou non ATPase ?
1. ’ARN simple-brin dès qu’il sort de ARNpol
2. près de fin gène (site rut)
3. ATPase
81
qu'est-ce qu’il y a de spéciale avec RHO et sa liaison à l'ARN
Rho induit terminaison uniquement des transcrits en cours de transcription à la fin d’un gène
82
ARN pol est plus ou moins rapide que RHO?
+ vite
l'ARN pol fait des pauses pour permettre à RHO de le rattraper
83
C'est quoi les hypothèses du mode d'action de RHO ?
1. RHO pousse ARN pol vers l'avant
2. RHO arracherais ARN de la pol (sépare ARN de l'ADN)
3. RHO induirait un changement de conformation
de la polymérase
84
Synonyme de terminateur Rho-indépendant
Terminateurs intrinsèques
85
c'est quoi les deux éléments de séquence du terminateur RHO-indépendant ?
**TRÈS IMPORTANT À SAVOIR**
RHO-indépendant fonctionne sur quoi?
1.Courte séquence répétée inversée
2. paires de bases A-T
-> fonctionne sur ARN( pas ADN)
86
La courte séquence répétée inversé du termianteur RHO-indépendant sert à quoi?
Structure tige-boucle
87
La forme Tige-boucle du RHO-indépendant se passe ou?
Comment ça termine la transcription?
dans ARN pol
-> désorganise le complexe d'élongation par changement de conformation = terminaison
88
La forme épingle à cheveux du RHO indépendant fonctionne efficacement uniquement si quoi?
uniquement si elle est suivie
par une série de bases T (U dans l’ARN)
(parce que pare de base A-T )
89
C'est quoi la différence entre polymérase bactérienne et eucaryote ?
bactérie : une seule polymérase et besoin d'un seul facteur initiateur (sigma)
eucaryote: en a 3 (pol I, II, III) et besoin plusieurs facteurs initiateur (facteur généraux de transcription (FGT))
90
FGT sert à quoi? (3)
1. Accomplissent les mêmes fonctions que σ dans transcription bactérienne
2. Aident Pol II à se fixer au promoteur + séparer brins ADN
3. Aident Pol II détacher promoteur et engager élongation
91
Les FGT ont besoin de 3 facteurs supplémentaires. C'est quoi?
i) Protéines régulatrices liant ADN (facteurs de transcription/régulateurs) TRÈS IMP.
ii) Complexe « Médiateur » (grappe raisin)
iii) Enzymes modification de la chromatine
92
Quelle Pol est la plus importante ?
Pol II
93
c'est quoi un promoteur minimal
plus petit ensemble d’éléments de séquence nécessaire pour assurer l’initiation de la transcription par la machinerie de Pol II IN VITRO
94
c'est quoi le promoteur minimal pour POL II ? (in vitro)
1. Élément reconnu par TFIIB (BRE)
2. Élément TATA (similaire tige boucle bactérie)
3. initiateur Inr
4. Élément après le promoteur (DCE, DPE, MTE )
95
Avant le promoteur, il y a d'autre séquence requise pour la transcription IN VIVO. c'est quoi?
BRE, TATA, Inr, DCE, DPE, MTE + séquence régulatrice
96
Quelles sont les séquences régulatrices du promoteur minimal Pol II
1. élément proximaux du promoteur (très proche)
2. séquence activatrice en avant (UAS) -> peut être très loin
3. Les « enhancers » ou amplificateurs (avant ou après)
4. D’autres éléments (« silencers », éléments frontière et isolateurs) -> bloque la transcription
97
Quelles sont les deux étapes pour libérer le promoteur qui est absent chez les bactéries ?
1. Hydrolyse d’ATP
(en + de hydrolyse ATP pour fusion ADN par TFIIH)
2. Phosphorylation de la Pol II
98
C'est quoi le complexe de préinitiation (PIC) ?
ensemble des FGT + pol II lié au promoteur.
Ils sont formé dans un ordre très précis
99
Quelle est l'ordre de la formation de PIC ?
1. TBP reconnait boîte TATA
2. ajout TFIID
3. ajout TFIIA
4. ajout TFIIB
5. ajout TFIIF-polymérase (presque imp. des séparer)
6. ajout TFIIE
7. AJout TFIIH
100
c'est quoi qui compose TFIID ?
Complexe de sous-unités comprenant:
TBP (‘TATA binding protein’) + TAFs (‘TBP Associated Factors’)
101
Que fait le complexe TBP-TATA?
fournit plateforme pour attirer sur
le promoteur d’autres FGTs + pol II
102
Quelle TFII_ qui hydrolyse l'ATP ?
TFIIH
(activité hélicase qui stimule déroulement ADN)
103
qu'est-ce qui est phosphorylé dans la pol II pour libéré le promoteur ? à quoi sert la phosphorylation?
- La queue c-terminal ( CTD)
- aide la pol II à se défaire de la plupart des FGT
104
V/f: CTD est très court
Faux. très longue répétition de séquence
Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser
105
V/f: Promoteur peut posséder la boite TATA et un élément DPE
Faux. un ou l'autre.
106
Pourquoi dit-on que TBP a un comportement inhabituel ?
utilise une large région constitué d'un feuillet beta pour reconnaitre le ptit sillon de la boite TATA
Inhabituel parce que habituellement protéine utilise hélice a et grand sillon
107
Pourquoi c'est inhabituel pour la TBP de reconnaitre le petit sillon?
petit sillon = moins riche en information
108
Comment fonctionne TBP sur la boite TATA vu qu'il reconnait le petit sillon?
Il déforme localement l'ADN = élargit le sillon le rendent avec une configuration plane + pli ADN 80 degré
109
Comment TBP est-il spécifique ?
dépend chaines latérales de 2 résidus phénylalanine = s’intercalent entre les paires de bases aux extrémités TATA
Va préférée les séquences A-T, car plus facile à déformer (moins de pont H)
110
C'est quoi TAF ?
un FGT
111
TBP se lie à combien de TAF ?
10
112
Que fait les TAF ?
se lien à l'ADN un peu comme les histones
113
ou se retrouvent les TAF ?
dans le complexe TFIID
+
associé à des enzymes de modification d'histone (complexe SAGA dans les levures)
114
Quelle TAF se lient au promoteur
TAF42 et TAF62
115
c'est quoi TFIID ?
association TBP + environs 10 TAF
116
TFIIA interagit avec quoi? il fait quoi?
Complexe TBP-TFIID (il le stabilise)
117
c'est quoi les fonctions de TFIIA ?
- élimine interaction de répresseurs avec TBP qui empêchent formation du complexe d’initiation (PIC)
- Agit comme co-activateur pour certains
activateurs
118
V/f: TFIIA interagit avec l'ADN
Faux.
avec TBP
incapable de lier l'ADN
119
TFIIB interagit avec quoi?
Complexe TBP-TFIID-TFIIA
120
TFIIA ou TFIIB qui est capable de lier l'ADN ?
TFIIB
(contact avec l'ADN et TBP)
121
TFIIB peut être en contacte avec quoi?
TBP
ADN
en amont BRE
en aval TATA
POL II (en complexe preinitiation)
122
À quoi sert TFIIB ?
Fait le lien entre la boite TATA et la Pol II
123
ou est TFIIB?
canal de sortie ARN et gorge site actif de polymérase
124
TBP fait partie quelle complexe initiation
de la transcription ?
TFIID
125
TFIIF fait quoi?
1. La liaison de POL II-TFIIF stabilise le complexe ADN-TBP-TFIIB
=nécessaire avant l'arrivé de TFIIE et TFIIH
2. contribuerait maintenir enroulement serré ADN autour complexe preinitiation
126
Dans quelle ordre arrive les TFII dans le complexe d initiation de la transcription?
1. TFIID (TBP-TAFs)
2. TFIIA
3.TFIIB
4. TFIIF+polymérase
5. TFIIE
6.TFIIH
127
À quoi sert TFIIE ?
recrute et régule TFIIH
128
À quoi sert TFIIH ?
**Il est important **
- contrôle transition complexe préinitiation (fermé) au complexe ouvert (dépendant de l’ATP)
- fusion du promoteur et dans le détachement de PolII du promoteur
- réparation ADN
- activité hélicase
129
Quel FGT est le plus gros et le plus complexe ?
TFIIH
130
c'est quoi l'activité de la TFIIH ?
activité ATPase et activité protéine kinase
131
Le médiateur est en contact ou pas avec la polymérase ?
En contact
132
La régulation de la transcription est régulé par quoi?
* Protéines régulatrices
* Complexe Médiateur
* Enzyme de modification des nucléosomes
133
Le médiateur facilite l'initiation en régulant quoi?
activité CTD kinase de TFIIH
134
Pourquoi il existe différentes formes de Médiateurs ?
Pour la régulation de différents groupes de gènes
135
V/f: Médiateur a plusieurs sous-unité
Vrai (environs 20)
136
Que ce passes-t-il lorsque Pol II libérée promoteur et initie transcription
passe en mode élongation
137
Lorsque c'est la phase élongation, il se passe quoi avec les FGT et le médiateur ?
Se débarrasse de la plupart et les remplaces par des facteurs d'élongation (comme TFIIS et hSPT5)
138
qu'est-ce qui est nécessaire pour la maturation de l'ADN. ?
enzyme recruté sur la CTD de la Pol II
139
les enzymes impliqué à la maturation de l'ADN Préfèrent la forme phosphorylée ou non phosphorylée de CTD
phosphorylée
140
CTD de pol II est ou et est courte ou longue ?
Canal de sortie et très longue
141
Pourquoi la CTD de pol II est longue ?
Permet CTD de lier plusieurs composants
machinerie élongation + maturation: les
met en contact avec ARN
142
Kinase P-TEFb, elle fait quoi?
avec la pol II elle est Important dans stimulation l’élongation
-> Phosphoryle résidu Ser 2 répétitions CTD
-> recrute, phosphoryle + active autre protéine : TAT-SF1 (autre facteur d'élongation)
143
c'est quoi ''la famille ELL'' ?
Une classe de facteur d'élongation
144
Que font les facteurs ELL ?
Suppriment arrêts temporaires de l’enzyme = Améliore processivité de Pol II
145
TFIIS fait quoi?
rôle dans la stimulation de l’élongation: facteur d'élongation
- diminue le temps de pause de Pol II sur séquences qui ralentissent sa progression
- vérification des nucléotides si ok (élimine base incorrect par hydrolyse)
- Stimule activité RNase de la Pol II ( capable de revenir en arrière pour vérifier)
(comparable à la correction hydrolytique GRE chez bactéries)
146
ARN eucaryote subit modifications quand ?
avant exportation du noyau + traduction
147
Le facteur FACT c'est quoi?
Hétérodimère de 2 protéines très conservées : Spt16 et SSRP1
148
Le facteur FACT il fait quoi? c'est quoi son mode d'action?
Il démantele les nucléosomes en enlevant un dimère H2A/H2B mais aussi les réassemblee en réinsérant dimère après
-> Spt16: lie à H2A/H2B
-> SSRP1 lie tétramère H3/H4
-> FACT extrait 1 dimère H2A/H2B
= Permet à Pol II passer ce nucléosome
FACT: possède aussi activité chaperon d’histone
Devant Pol II en transcription :
-> Permet réinsérer H2A/H2B dans héxamère d’histones derrière Pol II
149
Que voulons-nous dire quand on dit que FACT possède une activité chaperon d'histone ?
lui permet de réinsérer H2A/H2B dans héxamère d’histones derrière Pol II
150
Une fois transcrit, ARN eucaryote doit subir différentes modifications avant d’être exporté du
noyau pour être traduit, lesquelles ?
1. Formation de la coiffe à l’extrémité 5’
2. Épissage de l’ARN
3. Polyadénylation à l’extrémité 3’ (ajout)
151
c'est quoi la formation de la coiffe 5 ' ?
Ajout guanine (G) méthylée à extrémité 5’ ARN des qu'il sort du canal de sortie
152
Quelles sont les 3 étapes enzymatiques lors de la formation e la coiffe
1ère étape : groupe phosphate est retiré de l'extrémité 5’ ARN
2ème étape : ajout nucléotide GMP
3ème étape : méthylation du GMP
153
Que ce passe-t-il Après ajout de la coiffe
Déphosphorylation Ser5 du CTD: dissociation machinerie assemblage coiffe
+
Phosphorylation Ser2 du CTD: assemblage de machinerie épissage
154
Rôles de la coiffe ?
-Stabilise ARNm (protège ribonucléases) = + imp,
-Export ARNm dans cytoplasme
-Recrutement ribosome
155
à quoi sert polyadénylation 3' ?
1. Clivage de ARNm
2. Ajout grand nb de résidus adénine à son extrémité 3’
3. Dégradation de l’ARN encore associé à l’ARN Pol II
4. Terminaison de la transcription
156
Comment fonctionne la polyadénylation 3' ?
Stimule transfert enzymes de polyadénylation du CTD à l’ARN lorsque la Pol II atteint la fin d’un gène et rencontre séquence spécifique (AATAAA)
157
Quel signaux stimulent transfert CPSF et CstF à ARN
Signaux Poly-A
158
Lorsque l'ARN est clivé, c'est CPSF ou CstF qui reste sur l'ARN ?
CPSF
159
CPSF fait quoi après le clivage?
1. CPSF: recrute Poly-A-polymérase
2. Ajoute ≈200 A au extrémité 3’ ARN clivé
3. Recrutement des PABP
4. Export ARNm mature au cytoplasme
(Poly-A-polymérae a abesoin ATP)
159
V/f: Pol II s'arrete direct après clivage de l'ARN
Faux.
on pense qu'Il se déplace sur matrice produisant 2ème molécule ARN
160
c'est quoi le modèle de terminaison de la torpille
Extrémité libre 2ème ARN est dépourvue d’une coiffe et elle est reconnu par RNase (Rat1/Xrn2)
= très processive et dégrade rapidement ARN 5’/3' donc rattrape la Pol II en transcription
-> pousserait Pol II vers avant et/ou arracherait transcrit naissant
161
c'est quoi le Modèle de la terminaison: allostérique
dépendrait modification structurale Pol II = Réduit caractère processif Pol II = terminaison spontanée
-> Provoquée par transfert enzymes modifiant ARN (CPSF et CstF) de queue CTD Pol II à ARN
162
L’initiation de la transcription se déroule à un endroit bien précis des gènes, ou ?
promoteur
163
V/f: Les polymérases Pol I et Pol III fonctionnent de manière similaire à Pol II mais transcrivent dès gènes qui leurs sont propres
vrai
164
La queue CTD de la polymérase permet de quoi?
transporter des protéines requises
à toutes les étapes de la transcription d’un gène
165
V/f: Pol I codent des ARN spécialisés et non des protéines
vrai
166
V/f: TBP est seulement dans la pol II
Faux. pol I, pol II et pol III
167
Pol I code quoi?
précurseur des ARNr
168
Promoteur ARNr constitué de 2 parties, lesquelles ?
Promoteur central + Élément de contrôle amont (UCE)
169
C'est quoi les deux autres facteurs requis pour initiation de pol I
SL1 : comprend TBP + 3 TAFs spécifiques
(fixe promoteur central, mais requiert UBF pour liaison)
UBF : lie UCE qui recrute SL1 = stimule transcription en recrutant Pol I
170
Promoteurs Pol III existent sous différentes formes, lesquelles ?
- Certains contiennent boîte A et boîte B séparées par court élément
- D’autres portent boîte A et boîte C
- D’autres portent boîte TATA seulement
171
Vrai ou faux -> Transcription par Pol III nécessite des FTGs
Vrai.
172
Quelle est le mode d'action de la Pol III
TFIIIB et TFIIIC (gènes ARNt)
TFIIIB, TFIIIC et TFIIIA (gène ARNr 5S)
TFIIIC se lie dans région du promoteur
Attire TFIIIB sur! ADN juste en amont du site d’initiation
Recrute ensuite Pol III au site d’initiation
Pol III utilise TBP inclus dans TFIIIB
173
est-ce que le modèle torpille et allostérique peut co-exister ?
Vrai
