Cours 2 - Génome, cromatine et nucléosome Flashcards
Comment se nomme le 1er niveau (ou étape) de compaction de l’ADN
Nucléosome
Les chromosomes ont un ratio 50:50 de sa masse avec 2 types de molécules, lesquelles ?
Protéine et ADN
L’empaquetage de l’ADN participe à 4 fonctions principales, lesquels ?
- Donne une forme compacte à l’ADN
- Protège de certaines altérations
- Transmis de façon efficace aux 2 filles quand la cellule se divise
- Confère une organisation générale particulière à chaque molécule d’ADN
Pourquoi il est important d’avoir des régions décompactés ?
Pour exprimer les gènes
C’est quoi la différence entre un chromosome, une chromatine et un chromatide ?
Chromosome: Chromatine mais en division cellulaire (condensé)
Chromatide: moitié d’un chromosome (chromatide soeur)
Chromatine: Complexe ADN + protéine (forme normale)
c’est quoi un histone ?
protéine responsable 1er niveau de compaction de l’ADN
Les cellules humaines contiennent combien de pb ?
si étendu, les chromosomes mesure combien en metre ?
C’est quoi l’espace moyen entre les pb?
6x10^9 (3x10^9 par jeu haploide)
2m (1m par jeu haploide)
0,34 nm
C’est quelle formation qui est la PLUS importante dans la compaction de l’ADN ( sans ça = ne marche pas)
Nucléosome
Le nucléosome réduit jusquà combien de fois l’ADN
10 000
Vrai ou faux: Sans nucléosome, l’ADN peut quand même se compacter
FAUX
à quoi sert le remaniement local de certains nucléosomes ?
Lire les informations à des endroits précis par les protéines
c’est quoi qui modifient et remodèlent les nucléosomes?
des enzymes
Vrai ou faux, le nombre de chromosome varie selon l’espece ?
Vrai
Vrai ou faux:
Eucaryote = circulaire
Procaryote = linéaire
Faux.
Eucaryote = linéaire
Procaryote = circulaire, mais peut être linéaire.
Il y a combien de chromosomes chez l’humain en tout
46 (23 paires)
C’est quoi un nucléoide chez les procaryotes ?
Zone non fermé mais délimité ou se trouve l’ADN et l’ARN
c’est quoi des plasmides ?
Petit ADN circulaire non essentiel mais porteur de gène aux caractères utiles (résistance antibio)
Les procaryotes et les eucaryotes sont haploide ou diploide ?
Procaryote: haploide (une copie)
Eucaryote : Diploide
Les deux chromosomes chez les eucaryotes sont hetérologue ou homologue ? pourquoi?
Homologue: dérive chacun des 2 parents
Qu’est-ce qui différencie les megacaryocyte des autres cellules eucaryotes ?
Ils ont plusieurs (28) copie de chromosomes (polyploide), donc maintient un haut niveau énergétique nécessaire à la production massive de plaquette
Vrai ou faux: Les plaquettes sont la division du cytoplasme et d’un jeu de chromosome du megacaryocytes
Faux
Seulement cytoplasme, mais aucun chromosome
Comment se nomme la fragmentation du cytoplasme des megacyocyte
thrombopoïèse
Quelle information nous informes de la compléxité d’un organisme ?
Plus la densité génique est faible (gène/Million paire de base)
Corrélation taille du génome et
complexité de l’organisme ?
Non parce que blé a un génome beaucoup plus élevé que l’humain
corrélation nombre de gènes et complexité de l’organisme ?
Non parce que riz en a deux fois plus que l’humain
Comment se nomme un site d’initiation de la transcription utilisé pour contrôler expression plusieurs gènes ?
Un opéron
Vrai ou faux: Un opéron est retrouve seulement chez les procaryote ?
Vrai
Vrai ou faux: La densité génique des procaryotes est plus variable que les eucaryotes
Faux,
c’est l’inverse
Pourquoi la densité génique est plus faible chez l’humain (eucaryote)? (2)
- augmentation taille des gènes
- Augmentation séquences d’ADN entre les gènes : les régions intergéniques
C’est quoi les régions intergéniques ?
séquence d’ADN entre les genes
Vrai ou faux: Les gènes ne sont qu’une petite partie de l’ADN du chromosome eucaryote
Vrai
Les gènes sont fragmenté par quoi?
Des introns
Comment se nomme le processus pour éliminer les introns de l’ARN après la transcription?
Épissage de l’ARN
Vrai ou faux: On épisse l’ADN pour éliminer les introns.
Faux : l’ARN
Quelle est la ‘‘conséquence’’ des introns ?
une région codante de l’ADN passe de 1,3kb à 27 kb
(pas important les chiffres, mais important de comprendre le principe)
sur 100%, combien de % des regions du gènes est codante vs introns ?
5% codante et 95% introns
C’Est quoi la différence entre une région intergénique et un introns ?
Intergenique: entre les gène
Intron: fragmente les gènes ( fait parti du gène)
Vrai ou faux: Les champignons ont plus d’intron en moyenne que les eucaryotes
Faux
Vrai ou faux: Régions intergénique (qui ne codent ni des gènes ni des ARN non-codants) = 60% génome humain
Vrai
Vrai ou faux: Les gènes c’est 1,5% du génomes humain
Vrai
Vrai ou faux: Les introns font parties des ARNm mais pas les région intergénique
Vrai
C’est quoi un pseudogène?
C’est un gène fonctionnel qui a une transcription inverseé par un retrovirus
(copie ADN en ARNm puis en ADN double brin)
+ se réintègre au génome de l’hote mais ne peux plus être exprimé, car manque les séquences régulatrice initiatrice à la transcription.
quel sont les éléments qui peut être dans les régions intergénique à séquence unique ?
gènes et séquence associés (introns, pseudogènes, fragment de gène)
L’ADN intergénique à séquence répétés a 2 grandes classes et une moins importantes. Lesquelles ?
- ADN microsatellite
- ADN répété dispersé
- ADN minisatellite ( moins important)
c’est quoi les caractéristiques des microsatellites
répétition de C et A
Proviennent de difficultés rencontrées par polymérase lors de duplication ADN
(environs 3-5% génomes)
c’est quoi les caractéristiques des ADN répété dispersées
Plus grand que les micro et minisateliite,
(environs 45% génomes humain)
Proviennent toutes d’éléments transposables (se déplace d’une place à un autre)
ADN minisatellite (G-C répétées en tandem) a un taux de mutation élevé ou faible?
Taux mutation élevé (donc très instable)
C’est quoi un transposon ?
on a passé beaucoup de temps sur ça
Séquences copie se déplace qui peuvent sauter d’un emplacement à un autre du génome
Laisse copie initiale, la copie va ailleurs.
Emplacement pris au hasard = + diversité génétique
Mécanisme très peu fréquent et fait sur des longues périodes d’évolution
Vrai ou faux: Phénomène de transposons sont rare dans les cellules humaine
Vrai
C’est quoi des parasite génétique
Transposons défavorable
C’est quoi le lien entre les transposons et l’évolution
Au cours de l’évolution, certain gène c’est propager pour former 45% du génome humain. (plupart inutile)
Maintenant, les expériences penchent en faveur d’un rôle prédominant dans l’évolution des espèces sont en cours. Quelles sont les expériences en cours ? (2)
- Création de nouveau gènes
- source d’amortissement des mutations dues à l’environnement (UV)
Vrai ou faux: Séquences intergéniques sont exclusive aux génomes humains
Faux
Séquences intergéniques sont inutile
Avant on le pensait,
-> mais leurs conservation sur des centaines de génération pourrait conférer avantage sélectif à l’organisme qui le contient
C’est quoi un origine de réplication
dirigent réplication ADN chromosomique
Sites où la machinerie de réplication de l’ADN va s’assembler pour débuter la réplication
eucaryote: plusieurs/chromosome
procaryote: 1 par chromosome
C’est quoi Centromères
Nécessaires à la ségrégation correcte des chromosomes après réplication ADN
(orientent ségrégation et fixe microtubule )
c’est quoi Télomères
protègent + répliquent extrémités chromosomes linéaires
(Situés aux 2 extrémités d’un chromosome linéaire)
Vrai ou faux: Chaque centromère porte un kinétochore
Vrai
Vrai ou faux: Chaque kinetochore intéragit avec 20-30 microtubules
Vrai
C’est quoi le role des kinétochore
important, à savoir
Pont entre ADN et microtubules
aide la séparation chromatide soeur pendant l’anaphase
Vrai ou faux: kinétochore sont des structures complexes ?
Oui. les plus simples ont + de 45 prot.
C’est quoi les (3) rôles des nombreuses protéines dans les kinétochores
- Certaines servent à s’attacher aux microtubules mitotique
- Certaines (dynéine, kinésine) sont des protéines moteurs (déplace avec force les chromosomes lors mitose à chaque pole)
- attache et fait tension chromosomes soeurs (MAD2)
Les protéines des kinétochores MAD2 attachent et créer de la tension sur les chromosomes soeurs, mais ont une autre utilité. Laquelle ?
Active contrôle tubulaire (empêche anaphase tant que tous chromosomes ne sont pas attachés aux microtubules)
C’est quoi les deux régions des kinétochores
Région interne: étroitement associé à ADN
-Région externe: interagit avec microtubules
Que se passe-t-il s’il n’y a pas de centromère
chromosomes répliqués se répartissent de manière aléatoire = mort cellulaire
Que se passe-t-il s’il y a plusieurs centromère
= cassure = pas viable
Plus les eucaryotes sont complexe, plus les centromères seront
grand
Les télomères sont des sites de recrutement pour un grand nombre de protéines qui vont assurer 2 fonctions importantes, lesquelles ?
- protéger pour rendre extrémité ADN résistante recombinaison et dégradation
- possèdent origines de réplication spécialisées pour répliquer les extrémités en recrutant une ADN polymérase particulière (télomérases)
Portion télomère est double ou simple brin et riche en quel nucléotide ?
Simple brin riche en T et G
V/f: Les télomères se dégrade plus qu’on vieillis
Vrai, maintenir la longueur des télomères augmenterais la vie cellulaire
Chez l’hommes, cest quoi la séquence répété des télomères ? EXAM 2022
5’-TTAGGG-3’
C’est quoi les 4 phases du cycles cellulaire mitotique ?
- Transition 1 (G1)
- Synthese (S)
- Transition 2 (G2)
- Mitose (M)
Que se passe-t-il lors de la transition 1 (G1) de la mitose
préparation réplication cellulaire (s’assure qu’il y a tout les nutriments)
Que se passe-t-il lors de la phase synthese (S) de la mitose
Réplication ADN