Cours 1 - Structure ADN ARN Flashcards

1
Q

Qui a commencer avec la pengénèse et c’Est quoi?

A

Les Grecs: Mini particule de fragment corporel sont transmis lors de la reproduction et forment l’embryon

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Q

Il a découvert quoi Mendel ?

A

Notion de dominance et de résistivité

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3
Q

Est-ce que Mendel à découvert les gênes

A

Non, il a découvert leurs caractères

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4
Q

Le mot gène est une dérivé de quoi?

A

Pengène (organite intracellulaire présente dans toute les cellules)

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5
Q

Darwin à découvert quoi?

A

La sélection naturelle
avantages sélectifs seront + transmis
dépend capacité de reproduction espèce

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6
Q

Darwin à publié quel ouvrage ?

A

L’origine des espèces

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7
Q

Les victoriens paniquaient. Pourquoi?

A

Vertus et vice viennent de famille, les classes inférieurs se reproduisaient + vite, donc les humains allaient devenir de + en + dépravés. = humain condamné à sa perte.

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8
Q

Galton, concierge scientifique, à fait quoi?

A

créé mouvement eugenisme (de bonne naissance -> aller vers un idéal)
Produire une race supérieur comme animaux

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9
Q

Davenport, il a fait quoi?

A

créé centre d’étude eugénisme USA
Recueille donnée de l’épilepsie à la criminalité

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10
Q

Grant, il a fait quoi?

A

Milite en faveur de l’eugénisme raciste.
Il publie: le déclin de la grande race.

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11
Q

Quel ouvrage Hitler utilisait comme bible

A

« Le déclin de la grande race » de Grant

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12
Q

Hitler publie quoi?

A

Mon combat.

Gens ayant maladie héréditaire devait être stérilisé

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13
Q

C’est quoi l’apogée de l’eugénisme

A

Holocauste

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14
Q

Watson. il a découvert quoi ?

A
  • établie que ADN = 4 bases
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15
Q

Quel ouvrage a inspiré Watson ?

A

’’ Qu’est-ce que la vie’’
la vie = stockage + transmission d’info génétique

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16
Q

Avant, les scientifiques pensaient que l’info génétique était fait d’ARN

A

Faux, les protéines.

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17
Q

Wilkins, il. a fait quoi?

A

Analyse cristaux par rayon X
Analyse ADN par diffraction rayon X
pensait 3 brins
après avoir voler Franklin, conclu que 2 brins
A-T et C-G

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18
Q

Crick, il a fait quoi?

A

Modelisateur de l’ADN

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19
Q

Quelle erreur Crick et Watson ont fait à la base ?

A

Pensaient que les bases azotées étaient à l’extérieur.
Pensaient 3 brins
Pensaient que la Forme A était la ‘‘normal’’

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20
Q

Franklin elle a fait quoi?

A
  • Base azoté sont à l’intérieur
  • à trouvé la forme B
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21
Q

l’ADN est constitué de chaine…

A

polynucléotidique

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22
Q

Le petit et grand sillon font combien de nm ?

A

petit: 1.2 nm
Grand: 2.2 nm

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23
Q

C’est quoi les sorte de bases ?

A

Adénine
Thymine
Guanine
Cytosine

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24
Q

C’est quoi un nucléoside ?

A

Base + sucre (H si ADN)
Base + sucre (OH si ARN)

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25
Q

C’est quoi la différence entre un nucléoside et un nucléotide?

A

nucléosine: base +sucre
Nucléotide: base + sucre + phosphate

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26
Q

c’est quoi le nom complet d’un nucléotide d’anénine ?

A

2’-désoxyadénosine-5’phosphate

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27
Q

Pour former les nucléotides, comment se nomme la réaction de liaison?

A

La condensation

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28
Q

Comment se nomme le lien entre le sucre et la base ?

A

Lien glycosyle

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29
Q

Comment se nomme le lien entre le sucre et le phosphate ?

A

Lien phosphoester

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30
Q

Il y a combien de réaction de condensation ?

A

2 réactions de condensation

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31
Q

Que libère les 2 condensations ?

A

2 H20

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32
Q

Entre base complémentaire, c’est quoi leur lien ?

A

Pont H

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33
Q

Entre phosphate de 2 nucléotides différents, c’est quoi le lien ?

A

phosphodiester

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34
Q

C’est quoi les deux purines ? Bicyclique ou monocyclique ?

A

Adénine, Guanine
Bicyclique

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35
Q

C’est quoi les deux pyrimidines ? bicyclique ou monocyclique ?

A

Thymine et cytosine
Monocyclique

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36
Q

Qui est en conformation Amino et ils ont combien d’accepteur vs donneur?

A

Adénine et cytosine
2 accepteurs et 1 donneurs

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37
Q

Quoi est en conformation Céto et ils ont combien d’accepteur/donneur ?

A

Guanine et thymine
2 donneur et 1 accepteur

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38
Q

Pk une cytosine peut pas être avec une adénine ?

A

Parce que 2 accepteur et 1 donneur les 2 = pas stable
Donner vis a vis = se repousse

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39
Q

Parmis les bases complémentaire, lesquels ont un lien plus fort et est plus stable et pk?

A

G-C et parce que 3 pont H

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40
Q

Appariement de bases entre elles impose quoi? orientation antiparalle ou parallele

A

orientation antiparalle

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41
Q

C’est quoi les 3 mécanismes stabilisateurs de l’ADN

A
  1. L’entropie (H20 si séparé)
  2. Empilement de base (Van Der Waals -> aimant)
  3. influences hydrophile/phobe (basephobe) = pression
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42
Q

Les pont H assurent quoi? (2)

A
  • Stabilité thermodynamique hélice
  • spécificité d’appariement
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43
Q

c’est quoi le pivotement des bases ?

A

Protéine (enzyme) retourne base une à une pour faire des réactions

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44
Q

Une base retourné devient le ligand des enzyme. Pour faire quoi ?

A
  1. Methylation des bases
  2. Recombinaison homologue
  3. Réparer l’ADN
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45
Q

Que fait l’enzyme de restriction Haelll ?

A

Methyltransférase

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46
Q

L’ADN normal est à gauche ou a droite

A

Droite (sens horaire)

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47
Q

Quelle est l’angle du petit et grand sillon
des bases ?

A

120 degré petit sillon
240 degré grand sillon

48
Q

Pourquoi les bases ont des petit et grand sillon

A

Du orientation de sucre

49
Q

Les protéines reconnaissent les paires de base de quelle facon ?

A

Par le code de paire de base électrochimique (grand sillon)

50
Q

Vrai ou faux: Protéine ne reconnait pas les pb dans les petits sillons, mais grand sillon oui

A

Vrai

51
Q

Quelle forme ADN a 11pb/tour et est condensé ?

A

Forme A

52
Q

Quelle forme ADN a 12 pb/tour et est lousse

A

Forme Z

53
Q

Forme ADN avec beaucoup trop de sel ?

A

Frome A

54
Q

forme A de l’ADN possible physiologiquement?

A

Non. In vitro

55
Q

Quelle est une condition qui fait en sorte que forme Z?

A

répétition d’une suite purine-pyrimidine

56
Q

Comment appel t-on le profil typique montré par Franklin

A

Croix de Malte

57
Q

c’est quoi la périodicité de l’ADN normal ?

A

3,4 nm (1.2+2.2)

58
Q

Vrai ou faux: l’ADN est statique ?

A

Faux. flexible.

59
Q

c’est quoi un arrangement en hélice d’avion ?

A

-Modifier localement nb pb/tour
-Grands et petits sillons de largeurs différentes

-> vrillage d’une région

60
Q

condition pour que l’ADN ait un pas à gauche ?

A
  1. ADN contenant des résidus purines et pyrimidines répétés -> permet 2 config (gauche ou droite)
  2. lien glycosyle en configuration anti pour les résidus pyrimidiques (T/C)
  3. en configuration syn pour les résidus puriques (A/G)
    Alternance anti-syn-anti-syn
  4. Beaucoup d’ion positif
61
Q

ADN forme B et A est anti ou syn

A

lien glycosyle toujours anti

62
Q

c’est quoi la configuration Anti ou Syn

A

Configuration lien glycosyle entre la base et le sucre

63
Q

Comment l’ADN aurait un pas à gauche en solution ?

A

bcp d’ion positif (+) se lie au phosphate négatif

64
Q

Comment s’appel la réaction lorsque l’ADN se sépare et se recolle ?

A

Dénaturation et hybdridation

65
Q

Comment appel t-on un segment non apparié après l’hybridation d’un ADN dénaturé ?

A

Segment ‘a’

66
Q

Comment pouvons-nous dénaturer un ADN

A

augmenter la température et le pH

67
Q

Vrai ou faux: l’ADN absorbe plus de UV en double brin

A

Faux, en simple brin.

68
Q

Comment appel t-on le processus que l’absorbance UV augmente avec la température ?

A

Hyperchromicité

69
Q

La température de fusion (Tm) correspond à quoi?

A

Dénaturation de l’ADN (double -> simple)

70
Q

Le Tm est caractéristique à chaque ADN, pourquoi?

A
  • dépend longueur
  • dépend quantité de G-C
  • dépend force ionique en solution
71
Q

Pourquoi la force ionique fait augmenter le Tm?

A

Parce que les ions (+) vont se coller sur les phosphates négatif de l’ADN (-) donc, rend neutre = dure à séparer
Sans ions, le phosphate se repousse lui-meme

72
Q

Par quel lien l’ADN peut se refermer par lui même pour former ADNccc

A

Covalent

73
Q

Vrai ou faux: Les chromosomes humains sont linéaire, mais surrenroulé ?

A

vrai

74
Q

C’est quoi LK ?

A

Le nombre d’enlacement (nombre de fois qu’un brin passe dans l’autre)
Lk= Tw + Wr

75
Q

c’est quoi Tw?

A

Nombre de torsion : nombre de tour d’hélice autour de l’autre

76
Q

C’est quoi Wr ?

A

Nombre de supertours nombre de fois que l’hélice s’entrecroise sur lui-même

77
Q

c’est quoi les deux formes de supertours dans l’ADN ?

A

Plectonémique
Toroidaux

78
Q

c’est quoi la forme supertours plectonémique ?

A

Brin ADN s’enroule sur lui-même

79
Q

C’Est quoi forme supertours toroidaux

A

ADN s’enroule autour d’un tube imaginaire

80
Q

c’est quoi Lk° ?

A

nombre de supertours en état relâcher = nombre de paire de base = 11

81
Q

Si ADN déserré = surenroulement négatif ou positif

A

Surenroulement négatif

82
Q

Vrai ou faux: ADN relaxé est rare

A

vrai

83
Q

Que fait le Dnasel en condition douce?

A

Relaxe l’ADN en cassant 1 brin (POINT PIVOT)

84
Q

quel surenroulement demande plus d’énergie ?

A

Surenroulement positif (serrer)

85
Q

Vrai ou faux: Il est plus difficile de séparer ADN surenroulement négatif

A

FAUX (facile à défaire)

86
Q

L’ADN physiologique est surenroulé de quelle facon et son surenroulement est de quel coté ?

A

négativement et gauche (nucléosome)

87
Q

c’est quoi un nucléosome

A

ADN enroulé 2x (146 pb) autour d’un histone

88
Q

Topoisomérase fait quoi?

A

Relaxe l’ADN

89
Q

Topoisomérase est utile pour de nombreux processus biologique, lesquels?

A
  1. Réplication
  2. Transcription
  3. séparation chromosomes (chromatides soeurs) en anaphase
  4. détend les noeud
90
Q

Topoisomérase 1 fait quoi
** à savoir

A

change surenroulement de facteur 1, elle peut juste couper et passer brin intact dans la fente
UTILISE PAS ATP

91
Q

Topoisomérase 2 fait quoi
**à savoir
ATP ou non?

A

Change facteur 2 surenroulement
coupe 2 brin et referme lien phosphodiester
utilise ATP

92
Q

c’est quoi la caténation?

A

Accrocher 2 ADNccc ensemble

93
Q

c’est quoi la décaténation?

A

Déccrocher 2 anneaux pris ensemble ( ADNccc)

94
Q

Comment fonctionne la topoisomérase

A

prend une branche dans les deux mains, la casse, l’écarte, change de place les brins et le recolle

95
Q

Vrai ou faux: Les ADNccc migre + vite dans l’electroporese

A

faux

96
Q

Quelle est la liste des type ADN qui migre du - au + vite dans l’electroporese ?

A
  1. ADNccc
  2. Linéaire
  3. surenroulement Wr= 2
  4. surenroulement Wr= 3
97
Q

l’ion éthidium, il fait quoi? et c’est quoi son caractère unique ?

A
  1. Diminue l’enroulement de l’ADN (déroule)
    et relâche les ADNccc
  2. Fluo aux UV
98
Q

c’est quoi le mécanisme d’action de l’ion étidium?

A

détord localement de 26 degrés
passe rotation de 36 degré à 10
= devient 36 pb /helice

-> Linéaire: il déroule
-> ADNccc : le relâche ( enlacement ne change pas)

99
Q

ARN est différent de l’ADN de 3 facons:

A
  1. Ribose
  2. Uracile au lieu de thymine
  3. monocaténaire (mais peut se replier pour faire double ou triple brin)
100
Q

c’est quoi les différents types d’ARN

A

ARNm
ARNt
ARNr
Micro-ARN (super régulateur important)
ARN enzymatique

101
Q

c’est quoi une structure secondaire de l’ARN?
comment se nomment les structure secondaire de l’ARN (3)

A

Repliement de l’ARN
- tige boucle (tete d’épingle)
- hernie
- simple boucle

102
Q

La séquence UUCG est stable et permet de faire une tétra-boucle, par quelle type d’intéraction?

A

interraction empilement (comme empilement de base)

103
Q

c’est quoi l’auto-appariement

A

Capacité ARN de relié U et G parce que sont correspondant = se replie sur lui même

104
Q

c’est quoi un pseudo noeud ?

A

capacité former triplet
tige-bouge entre 2 séquence proche
+ triplet hélice avec séquence plus loin

105
Q

Les ribozymes ont 3 critères qui sont spécifique aux enzymes, lesquels ?

A
  • site actif
  • site fixation substrat
  • site fixation cofacteur
106
Q

c’est quoi le 1er ribozyme ARN découvert ?

A

Rnase P

107
Q

c’est quoi les 3 structure dans un ribozyme

A
  1. proteine (non réactif, facilite association neutralise - phosphate)
  2. ARN (Catalyseur)
  3. précurseur ARNt
108
Q

c’est quoi un viroide ?

ca se retrouve ou?

A

Agent subviral qui existe dans les cellules en tant que particules d’ARN uniquement qui s’auto-clive (pas de capside ni enveloppe)

CHEZ LES PLANTES

109
Q

Comment fonctionne le viroide ?

A

c’est une longue copie ARN qui fait une longue copie répété de lui meme et s’autoclive sous l’action de ribozyme (tête de marteau)

chaque copie viruoide mature possède une séquence ribozyme à tête de marteau et lui coupe les copies

= tue énergétiquement la cellule, car passe trop de temps à couper

110
Q

Pourquoi l’ADN Z a une forme de zigzag ?

A

Alternance anti et syn donne allure en zigzag au squelette d’ADN

111
Q

Adénine et cytosine son imino ou amino?

A

Amino

112
Q

Guanine et thymine sont céto ou énol?

A

Céto

113
Q

c’est quoi qui retourne les base dans l’ADN?

A

Protéine / enzyme

114
Q

Il y a plus d’information dans le grand ou petit sillon ?

A

Plus riche dans le grand sillon
parce que dans le petit sillon, ne distingue pas si A

115
Q

la présence de sel dans l’ADN change quoi?

A

La thermostabilité de l’ADN