cours 4 chromatine Flashcards
Qu’est ce qu’un nucléosome
C’est l’unité de base de la chromatine
Qu’est ce que l’hétérochromatine
C’est des régions condensées de chromosomes transcriptionnellement inactives, car les protéines on moins d’accès à l’ADN.
Qu’est ce que l’euchromatine
C’est la chromosomes décondensée, pas toutes la chromatine décondensée sont transcrits.
C’est quoi l’hétérochromatine constitutive
C’est de la chromatine qui existe dans tous types de cellules avec peu ou pas d’expression génique. Ils ont une densité de gènes faible
C’est quoi l’hétérochromatine facultative
C’est de la chromatine qui est présente dans certains types de cellules ou durant certains stade du développement. Elle permet d’inactiver la transcription de blocs de chromosomes. Ils peuvent redevenir permissives à la transcription
Quelle est la forme de l’ADN des régions actives
De la chromatine décondensée
Qu’est ce que qui arrive quand l’ADN est sous forme de chromatine décondensée
Les protéines de transcription on accès aux gènes. La chromatine est plus facilement digérée par la DNAse I. Une nucléase dans les régions chromosomiques où un gène est transcrit confirme que l’ADN est sous forme décondensée
Que sont les sites hypersensibles
Ce sont des régions de chromatine ou il y a absence de nucléosomes, ou des régions avec des nucléosomes déstabilisés. Ce qui fait que les machinerie transcriptionnelle et les facteurs de transcription ont ainsi accès au promoteur d’un gène qui contient es site
Est ce que les gènes actifs ont des sites hypersensibles
Oui les gènes actifs ont généralement un ou plusieurs de ces sites dans la région de leur promoteur qui permet la liaison de facteurs de transcription
Quelle est la différence entre des sites hypersensibles et l’essai global
Les sites hypersensibles sont des régions ponctuelles sensibilité et l’Essaie global révèle la sensibilité d’un locus en entier.
Qu’elle est le lien entre les sites hypersensibles à la DNAse I et la liaison de facteurs de transcription
Les facteurs de transcription protègent l’ADN dans une région qui est flanquée des sites coupés par la DNAse
Comment est ce qu’on identifie les régions d’ADN associées à une protéine donnée par chromatin-immunoprecipitation (ChIP)
a) Il y a pontage au formaldéhyde, puis les protéines liées à leur région d’ADN sont purifiées par immunologies-précipitation
b) une résine couplée à un anticorps d’intérêt es incubée Ave la chromatine pontée
c) on isole les protéines et on purifie l’ADN associé
d) L’ADN est analysés par PCR quanti ou par micropsie/séquencage à haut débit
Est ce que les sites hypersensibles peut représenté des enchanter distaux
Oui les sites hypersensibles peut représenté des enchancer distaux qui doivent être liés par des protéines. L’accès à l’ADN par ces protéines est favorisé par une chromatine ouverte/décondensée
Que sont les sites appelés Locus control régions (LCR)
Ces des sites dans des gènes contenant la B-globine qui influencent l’expression de tous les gènes du locus. ils forment des boucles avec les promoteurs des gènes individuels
Qu’elle est l’effet global de la chromatine et des nucléosomes sur la transcription
Ils ont un effets global inhibiteur sur la transcription
Que doit faire les facteurs de transcription pour accéder à l’information encodée dans l’ADN
Ils doivent surmonter l’inhibition intrinsèque d’accessibilité causé par la chromatine
Qu’est ce que les complexes protéiques remodeleur de la chromatine utilisent pour rendre l’ADN accessible
Ils utilisent l’énergie de l’hydrolyse de l’ATP.
Qu’est ce qui régule le recrutement des complexes de remodelage à l’ADN
Il est régulé par des facteurs de liaisons à l’ADN ou des modifications d’histones
Pourquoi les complexes de remodelage de la chromatine font souvent partie de complexes protéiques
Ils ont des propriétés communes
Que sont les propriétés communes entre les complexes de remodelage et les complexes protéiques
Ils on une affinité pour les nucléosomes et les histones
Domaines protéique qui reconnait les histones modifiées comme le bromodomaine et le chromodomaine
Domaine ATPase qui module les contacts histone-ASN
Domaines qui interagissent avec des facteurs de transcription
Qu’est ce que les complexes de remodelage font
Ils peuvent déplacer les nucléosomes le long d’une molécule d’ADN
Qu’est ce que le glissement des nucléotides permet
Il permets d’accéder à des séquences auparavant cachées/ accès facilité pour les facteurs de transcriptions
Est ce que les complexes remodeler sont toujours activateurs
Non ils ne sont pas toujours activateurs car le déplacement d’un nucléosome peut causer une réduction de l’accessibilité à un site de liaison en cachant une séquence dans un nucléosome
Qu’est ce que les complexes de remodelage SWI/SNF et ISWI font
Ils peuvent éjecter des dimeres d’histones qui fait que l’octomère peut se dissocier et ce qui peut mener à l’éviction du nucléosome et les sites sans nucléosome sont hypersensibles à la DNAse I
