ARNt et amoniacylation Flashcards
Il y a combien de nucléotide
Il y a 4 nucléotide A, G, C, U/T
Combien y a-t-il de code possible
1 lettre 4 aa
2 lettres 16 aa
3 lettres 64 aa
Combien y a t’il de aa
Il y a 20 aa ce qui suggère que le code génétique est dégénéré
combien y a-t-il de codon associée
il y a 61 codons associés avec des tas
1 codon d’initiation (AUG)
3 codon stop (UAA, UAG, UGA0
Que correspond à un codon de l’ARNm
Chaque triplet de nucléotides sur l’ADN
Que correspond à l’anti-codon spécifique de l’ARNt
Chaque codon de l’ARNm
Que correspond à un acide aminé spécifique
Chaque anti-codon
Que correspond à un aa
Chaque triplet de nucléotides sur l’ADN
Qu’est ce que l’ARNt fait
Il joue rôle dans la reconnaissance et le déchiffrage des codons de l’ARNm.
1. reconnait un codon de 3-base sur l’ARNm
2. Transporte au aa spécifique pour ce codon
Que sont les rôle dans la traduction
ARNt : adaptateur
anticodon : ARNt isoaccepteurs
aminoacyl synthétase : décodage
Transfert du peptide et ribosome
Qu’est ce qui arrive durant l’initiation de la traduction
Il ya liaison de deux ARNt grâce à leur anticodon complémentaire au codon. Le brin d’ADN s’attache au ribosome.
Formation d’une liaison covalence entre les 2 aas
site a: aa
site p: peptide
Qu’est ce qui arrive durant l’élongation de la traduction
Le premier ARNt quitte le ribosome. Le ribosome avance de trois nucléotide. Un nouvel ARNt se positionne dans le site libre du ribosome
Qu’est ce qui arrive durant l’élongation et la terminaison de la traduction
formation de liaison peptidique entre le peptidyl-ARNt au site P et l’aminoacyl ARNt au site A par une enzyme peptidyl-transférase. La synthèse s’arrête au niveau d’un codon stop et polypeptide est libéré. Pour les eucaryote 15-20 aa/sec rapide
Que son les structures de l’ARNt
la structure primaire, secondaire et tertiaire
Que sont les composant de la structure tertiaire des ARNt
42 bases appariées dans tiges, 9 liens entre bases éloignées et 71 bases empilées
Que sert à la stabilisation de la structure tertiaire des ARNt
9 liens hydrogènes sont formées entre des bases éloignées et contribuent à stabiliser la structure tertiaire.
Qu’est ce qui explique que la structure tertiaire soit conservée entre les espèces
C’est que la plupart de ces nucléotides sont invariants ou semi-invariants
Pourquoi seulement les bouts sont accessibles pour la structure de l’ARNt
Puisque tous les interactions font que la structure de l’ARNt soit très compacte
Pour les i6A (N6-isopentenyl adénosine) retrouvé en 3’ de l’Anticodon qu’est ce qui fait qu’on augmente sa fidélité de lecture
Sa faible polarité augmente la force d’interaction avec le codon ce qui augmente la fidélité de lecture
C’est quoi le rôle des aminoacyl-ARNt synthétases
C’est de coupler un aa spécifique à l’extrémité CCA des ARNt par estérification
reconnait un aa. il y en a une pour chaque des 20 aa
reconnait ARNt non chargé correspondant
Comment les acides aminés libres du cytoplasme participe à la synthèse des protéines
Ils doivent être activé par les aminoacyl-ARNt synthétases
Comment est ce que les aa sont activé
L’aminoacyl-ARNt synthétase hydrolyse un ATP en AMP puis active l’aa en liant sa fonction acide avec la fonction acide du phosphate alpha de l’AMP. Ensuite l’aa est transféré avec sa liaison riche en énergie sur un des alcool secondaires du ribose de l’amp 3’ terminal de l’ARNt. L’ARNt chargé se lie ensuite au ribosome pour la synthèse de la protéine
C’est quoi l’abréviation de aminoacyl-ARNt synthétases
aaRS
Que sont les classes de aaRS
Classe I: doivent souvent reconnaitre l’anticodon
amincoacylent le 2’OH
Chargent des aa plus gros et plus hydrophobiques que celle de classe 2
Classe II: rare reconnaissance de l’anticodon
aminoacylent le 3’oh
Pendant la synthèse protéique qU’est ce qui détermine l’ARNt choisi
L’interaction codon-anticodon. L’aa au bout de l’ARNt n’intervient pas
C’est quoi la quantité de code génétique
Il y a 61 codons, mais pas 61 ARNt, donc les anticodons peut s’apparier à plus d’un codon
Que sont les bases qui s’apparie avec Watson-crick normal
C’est les 2 premières paires de base codon-anticodon qui s’apparie
Que peut se produire au 3e nucléotide
Ils peut avoir un appariements non-watson-Crick à la 3è position
Que font les bases wobble
Ils permettent de palier en partie la disparité entre le nombre de codons et le nombre d’acides aminés, en utilisant des appariements bancal ou wobble à la première position de l’anticodon de l’ARN de transfert ce qui permet à un ARNt de reconnaître plusieurs codons synonymes
C’est quoi le rôle de la sélénocystéine
c’est le 21e aa qui est utilisé par certains organismes dans des protéines impliquées dans des réactions d’oxyde-réduction
C’est quoi la sélénocystéine (SeCys)
C’est un analogue à la cystéine. contient un sélénium (Se) à l’emplacement du soufre dans la cystéine
La sélénocystéine est codée par quoi
Elle est codée par le codon UGA, qui est aussi un signal d’arrêt
Comment est inséré la sélénocystéine dans les ARNm
L’élément de la séquence d’insertion de SeCys (SECIS)
