Cours 4 Flashcards
1
Q
Ce que dit l’expérience d’Anfisen avec l’ARNase A
A
Les protéines peuvent être dénaturées et retrouver leur conformation native (active)
2
Q
Calcul de Levinthal
A
- Pour une protéine avec 2n angles de torsion, il existe 10n conformations possibles (n= résidus dans la protéine)
- Il n’est pas possible pour la protéine d’explorer toutes les possibilités (~ 1013 conformations par second)
t = 10n /1013
pour une protéine de 100 acides aminés:
t= 1087sec
3
Q
L’état de la globule fondue
A
- La taille du polypeptide est plus petite que celle d’une « pelote statistique » (random coil) et marginalement plus grande que celle du polypeptide natif
- Le contenu global en structure secondaire (mesurée par spectroscopie
de dicrhoïsme circulaire (DC)), est identiques à ceux de l’état natif - Les enzymes dans l’état globule fondu sont sans activité
- Au contraire dans l’état complètement replié, les chaînes se trouvent
dans des environnements différents et asymétriques à l’intérieur de l’état replié
4
Q
Quel type de conformation migre le plus rapidement sur gel?
A
conformation native (plus compacte)
5
Q
Méthodes de dénaturation
A
- Température
- pH
- agents chaotropiques
6
Q
Techniques pour la détermination de repliement in vitro
A
- Spectroscopie de dichroïsme circulaire (DC)
- RMN
7
Q
Avantages de la spectroscopie DC pour l’étude de la structure des protéines
A
- Elle permet de déterminer la composition en structures secondaires de façon qualitative ou semi-quantitative
- Utile pour observer des changements de structures secondaires
- Seulement de petites quantités d’échantillon sont nécessaire et l’échantillon n’est pas détruit par la prise de données
8
Q
Limites de la spectroscopie DC pour l’étude de la structure des protéines
A
- Pas d’information précise sur un site en particulier dans la protéine
- Conformation native donne les mêmes spectres que conformation du globule fondu.
- Ne permet pas d’évaluer si la protéine peut adopter plus d’une conformation
- Les analyses sont basées sur les valeurs expérimentales de systèmes modèles. Il n’existe pas de modèle théorique très précis
9
Q
Longueur et largeur du canal de sortie de la grosse sous-unité ribosomale
A
Largeur : 15 Å (largeur d’hélice)
Longueur : 100 Å (polypeptide de 30 acides aminés)
