Cours 2 Flashcards
L’angle Phi se situe entre quels atomes de l’acide aminé?
entre le carbone alpha et l’azote
L’angle Psi se situe entre quels atomes de l’acide aminé?
entre le carbone alpha et le carbone qui tient le groupement carbonyle
3 raisons pourquoi certaines valeurs de Phi et Psi ne sont pas permise
- Différences d’énergies entre conformation décalées et éclipsées
- Encombrement stérique des atomes du squelette
- Interactions non covalentes impliquant les chaînes latérales
Un tour d’hélice alpha
3,6 résidus d’acides aminés
Dans l’hélice alpha, où sont les liaisons hydrogène
entre le groupe C=O du résidu n et le groupe N-H du résidu n+4
Condition sur Phi et Psi pour hélice alpha
phi = -60° et ψ (psi) = -45° à -50˚
Le pas de l’hélice alpha
0,54 nm (5,4 Å) = 3,6 (nombre de résidus) * 0,15 nm (largeur des résidus)
Dans l’hélice 3;10, où sont les liaisons hydrogène?
entre le C=O du résidu n et le N-H du résidu n + 3
Pas de l’hélice 3;10
6,0 Å (0,60 nm), donc cette hélice est plus étroite que
l’hélice a
Angle Phi et Psi pour l’hélice 3;10
Phi = -50° et ψ= -30°
Acides aminés qui aident à la formation de l’hélice alpha
Ala, Glu, Leu, et Met
Acides aminés qui n’aident pas à la formation de l’hélice alpha
Pro, Gly, Tyr, et Ser
