Cours 11 Flashcards
Interactions cation-pi
entre les noyaux aromatiques de Phe, Tyr ou Trp et les charges positives de Lys ou Arg
Interactions anion-pi
entre les noyaux aromatiques de Phe, Tyr ou Trp et les charges négatives de Asp ou Glu
Interactions souffre-pi
entre les noyaux aromatiques de Phe, Tyr ou Trp et les groupes soufre de Cys ou Met
Interactions amine-pi
entre les noyaux aromatiques de Phe, Tyr ou Trp et les groupes amines de Gln ou Asn
Forces électrostatiques
- Interactions ioniques
- Interactions dipôle-dipôle
- Interactions cation-π, anion-π soufre-π et amine-π
Les forces qui déterminent les interactions
- Forces électrostatiques
- Forces de liaison hydrogène
- Forces hydrophobes
Distance pour interactions ioniques
Leur distance est de 3-4 Å ou moins dans les structures de complexes protéine-protéine
Comment varie l’énergie d’une paire d’ions typique est égale à ~1,4 kCal/mol dans l’eau?
avec la distance entre les deux charges (1/r2)
Acides aminés avec charge positive à pH physiologique
Lysine, Arginine (parfois histidine)
Acides aminés avec charge négative à pH physiologique
Acide glutamique et acide aspartique
Acides aminés qui peuvent être acétylés
Lysine
Acides aminés qui peuvent être phosphorylés
Sérine, Thréonine, Tyrosine
