cours 3 microbio / pathogène et virulence Flashcards
Qu’est ce qu’un processus infectuex?
ensemble des étapes par lesquelles un microbe en arrive à induire une maladie
- pénétrer dans l’organisme
- adhérer aux cellules de l’hôte
- faire compétition à la flore normale
- résister aux défenses immunitaires
- envahir les tissus cibles
- induire des dysfonctions physiologiques
Quels sont les réservoirs d’agents pathogènes?
réservoirs humains: porteur sains (n’est pas affecté par le microbe, mais peut le transmettre), porteur latent (microbe est en état de latence), gens malades
animaux (zoonoses)
environnement (réservoir inanimé): sol (mycètes, spores bactériennes), eau (choléra), aliments (gastroentérites) ou objects d’usage commun
Quels sont les modes de transmission des microbes?
- contact étroit (généralement entre humains, direct, indirect ou par gouttelettes)
- vecteur vivant (surtout les arthropodes comme moustiques, acariens, tiques, etc)
- véhicule inanimé (exposition à un object souillé dans la nature comme clou, couteau qui sert à dépecer un animal)
Qu’est ce que la pathogénicité?
capacité pour un microbe d’induire une infection (attribut qualitatif)
(pathogène primaire rend un hôte sain malade)
Qu’est ce que la virulence?
attribut quantitatif, réflète le degré de pathogénicité d’une souche envers un hôte (c’est-à-dire sa capacité d’induire une infection d’une plus ou moins grande sévérité)
peut être mesuré par le taux de morbidité que la souche induit, taux de mortalité et la dose léthale 50 (quantité de microbes ou de toxines nécessaires pour tuer 50% de la population infectée)
la virulence n’est pas un facteur constant pour une souche, car elle peut varier en fonction de divers critères
Quels sont les facteurs de risque qui prédisposent l’hôte à contracter des facteurs spécifiques?
- génétique (anatomie féminine, déficience immunitaire de nature génétique)
- reliées à l’âge (enfant < 2 ans et personnes âgées)
- habitudes de vie (malnutrition, mesures sanitaires inadéquates, pratiques sexuelles, injection de drogues)
- maladie chroniques sous-jacentes (SIDA, fibrose kystique, diabète, cancer, etc)
- prise de médicaments (antibiotiques, agents immunosuppresseurs, chimiothérapie)
- environnement (ex élevage d’animaux, région avec des moustiques, système d’air dans les bâtiments)
Quelles sont les portes d’entrées des microbes?
-muqueuses (infections respiratoires, gastro-intestinales, urogénitales) ou peau (follicules pileux, glandes sudoripares, plaies)
voie parentéale si l’infection n’emprunte pas la voie orale-digestive
Quels sont les obstacles à l’implantation des germes à la surface des tissus en contact avec l’extérieur?
- acide gras (sébum)
- lysozyme (dans les larmes)
- HCl
- enzymes de sucs digestifs
- bile
- anticorps IgA
- desquamation des cellules épithéliales
- mouvements péristaltiques du tube digestif
- réflexes des voies respiratoires (toux, éternuements)
Qu’est ce que l’adhésine?
composantes macromoléculaires sur la surface d’un microbe qui permet l’attachement aux cellules de l’hôte, peut être des pili/fimbriae, éléments de la capsule, polymères agglutinants faisant partie du glycocalyx
sont en général des glycoprotéines ou lipoprotéines
Qu’est ce que les récepteurs?
généralement des hydrates de carbone (sucres tel le mannose) ou des protéines localisées à la surface des cellules épithéliales de l’hôte)
Qu’est ce que le microbiote?
flore normale / ensemble des microorganisme rencontrés chez un individu, fait de souches endogènes (retrouvée habituellement à la surface/intérieur de certains sites corporels, permantens ou transitoires) et exogènes (venant de l’environnement mais peuvent être rencontrés chez un individu sain)
Qu’est ce que le microbiome?
les microbes en lien avec leur environnement
Quelle est la différence entre la génomique la métagénomique?
génomique: science qui étudie le génome
métagénomique: étudie l’ensemble des gènes présents dans un environnement complexe (toutes espèces confondues)
Quels sont les rôles de la flore normale?
- rôle protecteur (occupent le terrain, assimilent les nutriment disponibles, sécrètent des éléments toxiques envers les autres bactéries indésirables)
- rôle métabolique (favorise la digestion et transformation des aliments ingérés + produit des vitamines)
- stimulation du système immunitaire (production d’anticorps IgA, présence de leucocytes phagocytaires)
- source d’infections (peuvent causer des infections opportunistes au niveau des sites anatomiques inhabituels ou blessés)
Quels tissus sont stériles de microbe?
sang, liquide céphalorachidien, tissus profonds, muscles, cerveau
Qu’est ce que la flore de la peau?
pas un milieu favorable à la croissance microbienne (à cause du dessèchement périodique), flore microbienne aux endroits plus humides
flore résidente capable de survivre au acide gras + forte odeur + sueur salée et une flore transitoire
staphylocoques, corynébactéries, propionibacterium acnes, entérobactéries, levures
Qu’est ce que les staphylocoques?
bactéries sphériques à Gram positif qui s’assemblent en grappes
2 groupes: coagulase positive et coagulase négative (enzyme qui provoque la formation de caillots de fibrine dans le sang)
sont pathogènes lorsque la barrière cutanée est rompue ou perforée donc d’importants pathogènes nosocomiaux (acquis en milieu hospitalier)
S. epidermidis (coagulase négative) prévale dans la flore normale
S. aureus (coagulase positive) est plus pathogène
devient facilement résistant aux antibiotiques (péniciline et méticiline)
se propage des voies nasales jusqu’à contaminer la base des follicules pileux pour donner des folliculites (avec boutons et inflammation) (orgelet pour le cil de l’oeil) (furoncle est une sorte d’abcès) (impérigo du nouveau-né)
Comment se forme l’acnée?
occlusion du conduit des glandes pilo-cébacées qui permettent normalement au sébum de se rendre à la surface de la peau, s’ensuit la formaation de petites papules à tête blanche… si la matière accumulée perce la peau, il se produit des lésions appelées comédons (points noirs). les bactéries propionibacterium acnes métablisent le glycérol présent dans le sébum en sécrétant des acides gras libres qui causent une réaction inflammatoire, par le recrutement de neutrophiles, ce qui produit des papilles et des pustules
Qu’est ce que l’érythème?
rougeur
Qu’est ce que le prurit?
démangeaison
Qu’est ce que le squame?
peau qui pèle, desquamation
Qu’est ce qu’une macule?
tache rougeâtre plane sans aucun relief
Qu’est ce qu’une papule?
lésion surélevée de moins de 1 cm de diamètre, sans pus
Qu’est ce qu’une plaque?
lésion surélevée de plus de 1 cm de diamètre
Qu’est ce qu’une vésicule?
cloque d’eau de moins de 1 cm (contenant un liquide séreux clair)
Qu’est ce qu’une bulle?
cloque d’eau de plus de 1 cm (contenant un liquide séreux clair)
Qu’est ce qu’une pustule?
ampoule de l’épiderme contenant un liquide purulent (pus)
Qu’est ce qu’une croûte?
zone de sérosité, de sang et de pus séché
Qu’est ce qu’un ulcère?
petite cavité dans la peau résultant d’une perte de la couche épidermique
De quoi est composé la flore buccale?
flore de la muqueuse buccale et celle des dents
Qu’est ce que la flore de la muqueuse buccale?
streptocoques qui adhèrent aux cellules de l’épithelium (streptococcus salivarius), bacteroides, fusobacterium, beaucoup de bactéries dans ;a salive, levures comme candida albicans (Rx immumosuppresseurs, antibio, hormonothérapie)
Qu’est ce que la flore des dents et de la plaque dentaire?
plaque dentaire = film bactérien adhérant à l’émail des dents, constituée de nombreuses bactéries insérées dans une matrice organique, composée de glycoprotéines provenant de la salive ainsi que de polymères bactériens
la plaque peut se calcifier pour donner le tartre ou se compliquer de carie dentaire
les bactéries de la plaque dentaire sont des streoptocoques (le principal est Streptococcus mutans)
Qu’est ce que la flore de l’estomac?
pH très acide = barrière à la pénétration dans l’intestin des bactéries apportées par les aliments, paroi de l’estomac peuvent être colonisées par des bactéries acido-tolérantes comme Helicobacter pilori (ulcères gastriques)
Qu’est ce que la flore de l’intestin grêle?
flore microbienne ressemble à celle de l’estomac
du duodénum à l’iléon, le pH devient graduellement alcalin et la densité bactérienne augmente (bactéries vont se mélanger avec le contenu intestinal dans la partie distale de l’iléon)
Qu’est ce que la flore du colon?
plus forte concentration microbienne de tout l’organisme, 30% du contenu du colon
bactéries anaérobies sont nettement prédominantes (bacteroides, fusobacterium, clostridium)
celles en aérobie sont entérobactéries, entérocoques, lactobacilles, staphylocoques, levures
cette flore protège l’hôte contre les bactéries pathogènes et synthétise les vitamines B1, B2, B6, B12 et K
peut être perturbée par des antibiotiques, mais restaurée par des probiotiques
Qu’est ce que la flore du système respiratoire?
nez: staphylocoques, streptocoques, haemophilus
gorge/nasopharynx (ressemble à celle de la salive): streptocoques, staphylocoques, corynébactéries, Neisseria, Moraxella, Haemophilus + Staphylococcus aureus, streptococcus pneumoniae, streptococcus pyogenes, corynebacterium diphteriae, Neisseria meningtidis (pathogènes chez les gens en bonne santé)
trachée/bronches/poumons: normalement stériles (bactéries éliminés par cellules ciliées des bronches)
Qu’est ce que la flore du système génito-urinaire?
reins/vessie: stériles
urètre: staphylocoques, streptocoques, corynébactéries, entérobactéeis, bacilles Gram négatif anaérobies (retrouvées dans l’urine du premier jet ou dans le sperme)
vagin: varie avec le cycle menstruel, lactobacilles ferment le glycogène et produisent de l’acide lactique (pH vaginal acide, seulement en âge de procréer), aérobies (streptocoques, staphylocoques, corynébactéries)
anaérobies (peptococcus, peptostreptococcus, clostridium, bacteroides), levures (candida)
Comment est-ce que les microbes parviennent à résister aux défenses immunitaires?
- masquer leurs composantes vulnérables: virus enveloppés, bactéries encapsulées
- se protéger contre la phagocytose: bactérie encapsulées
- survivre à l’intérieur des leucocytes: VIH, certains parasites et bactéries
- sécréter des enzymes détruisant les leucocytes: leucocidines bactériennes
- interférer avec les anticorps et le complément: enzymes, changements structurels
Qu’est ce que les cytolysines?
enzymes qui brisent des composantes cellulaires ou extra-cellulaires comme le collagène (protéine humaine très abondante qui confère une résistance à l’étirement et contribue à la cicatrisation) ou les phospholipides (composantes des membranes cellulaires)
Qu’est ce que les hémolysines?
exotoxines qui affectent les globules rouges et sont produites par des streptocoques, staphylocoques et des mycètes
Comment est-ce que les streptocoques sont classifiés?
classifiés selon leurs propriétés hémolytiques
- alpha-hémolytiques: oxydent le fer de l’hémoglobine (couleur verte autour des colonies sur gélose sang)
- beta-hémolytiques: causent une rupture franche des membranes érythrocytaires (zone transparente autour des colonies), classification plus détaillée de “Lancefield” donc groupes A, B, C, D, F, G, H
- gamma-hémolytiques; ne produisent pas d’hémolyse (rouge autour des colonies)
infections de la gorge = strep beta-hémolytique de groupe B
Qu’est ce que les coagulases et fibrinolysines?
coagulases transforment la fibrinogène en fibrine, ce qui provoque la formation de caillots (sert à identifier les staphylocoques)
fibrinolysines hydrolysent la fibrine, entravant la coagulation
Qu’est ce que les leucocidines?
créent des pores dans les membranes des leucocytes et les détruisent et contribuent à la formation de pus (staphylococcus aureus résistants à la méticiline)
Qu’est ce que les endotoxines?
lipopolysaccharides qui constituent la paroi cellulaire des bactéries à Gram négatif, sont libérés lors de la mort de la bactérie, produisent de fortes fièvres et même un choc septique
Qu’est ce qu’un choc septique?
fièvre, frissons, troubles vasculaires, chute TA
médié par les cytokines inflammatoires (TNF, IL-1) et des lipides vasoactifs (prostaglandine) qui dilatent et perméabilisent les capillaires sanguins, laissant diffuser le plasma hors des vaisseaux
aussi appelé choc endotoxique, les microbes le plus souvent associés à cet état sont les bacilles à Gram négatif (ex: E. coli)
Qu’est ce que les exotoxines?
macro-molécules de nature protéique sécrétées par les microbes, surtout les bactéries à Gram positif
certains sont toxiques (très)
ex: certaines causent choléra, diphtérie, tétanos, botulisme (plus empoisonnement que infections)
perdent leur toxicité si on les chauffe = anatoxine
Quelles sont les catégories des exotoxines?
- cytotoxines (tuent les cellules hôtes ou altèrent leur fonctionnement)
- neurotoxines (perturbent la transmission des influx nerveux)
- entérotoxines (s’attaquent aux cellules tapissant le tube digestif)
Qu’est ce que la diphtérie?
exotoxines de corynebacterium diphteriae ont un effet nécrosant sur le muscle cardiaque et le système nerveux
Qu’est ce que le tétanos?
exotoxines de clostridium tetani ont un effet neurotoxique, moelle épinière, contraction convulsive des muscles
Qu’est ce que le botulisme?
exotoxines de clostridium botulinum sont neurotoxique et causent une paralysie progressive de la bouche, du pharynx et du diaphragme
Qu’est ce que le gangrène?
exotoxines de clostridium perfringens sont des cytolysines à action nécrosante sur les tissus musculaires
Qu’est ce qui peut causer la fièvre?
exotoxines de bordetella pertussis causent infections pyogènes détruisant les érythrocytes et les leucocytes
Qu’est ce qui peut causer une intoxication alimentaire?
exotoxines de staphylococcus aureus sont les cytolysines s’attaquant aux entérocytes
Qu’est ce que la gastroentérite?
exotoxines de E. choli sont entérotoxines causant des diarrhées avec perte d’électrons
Qu’est ce que le choléra?
exotoxines de vibrio cholerae sont entérotoxines causant des diarrhées, fuite de liquides et déshydratation
Qu’est ce que la dysenterie?
exotoxines de shigella dysenteriae sont entérotoxines inhibant l’absorption intestinale des sucres et protéines
Qu’est ce que la fascite nécrosante?
exotoxines de streptococcus pyogenes = bactérie mangeuse de chair
