Cours 3: Caractéristiques de développement bactérien Flashcards
Croissance des microorganismes
se poursuit jusqu’à division
Courbe de croissance système fermé
4 phases:
- latence
- exponentielle (croissance)
- stationnaire
- mortalité
Latence
pas de division
varie en fonction de:
- âge des bactéries
- milieu
Exponentielle (croissance)
Accélération de la croissance et division
Développement maximal
Uniforme
Relation entre concentration nutriments et croissance
Stationnaire
Nb microorganismes viable reste constant
équilibre division/mort (environ 10^9 cell/mL)
Causes:
- Limitation des nutriments
- Accumulation des déchets toxiques
- Acidité
Mortalité
Arrêt division
Causes:
- Dommages irréparables
- Réponse génétique programmée
- Formations de VNC (viable non cultivable)
Mesure de la croissance (Méthodes directes)
A- Comptage
- Compteur de cellules Coulter et Cytomètre de flux
- Chambre de comptage sous microscope (Hémocytomètre et Cellule de Petroff-Hausser)
Avantages:
- Facile
- Rapide
- Information sur taille et morpho des bactéries
Inconvénients:
- petits volumes
- Décompte vivants et morts
B- Comptage des unités vivantes
- Méthode de dilution en milieu liquide puis étalement sur gélose
Avantage:
- Colonies proviennent de cellules vivantes et viable
Inconvénient:
- Amas = 1 colonie
- Méthode des filtres de cellulose
Mesure de croissance (Méthodes indirectes)
A- Mesure de l’activité
- Mesure consommation substrats
- Mesure concentration constituants cellulaires
- Mesure concentration excrétions
B- Mesure masse cellulaire
- poids sec
- Turbidité par DO
nécessite concentration 10^6mL < < 10^8mL
DO proportionnelle à concentration cellulaire
Expression mathématiques de la croissance
Temps de génération
g=t/n
t: temps
n: nombre de génération
Taux de croissance (k)
k=n/t
t et n idem
Nombre de générations
n=(logNt-logNo)/log2
Nt: nombre de cellules au temps t
No: nombre initial de cellules
Culture en système ouvert
- Apport en nutriment + élimination des déchets
- maintient de la période de croissance sur une longue durée
2 types:
Chémostat: équilibre apport/élimination du milieu
Turbidostat: vitesse de dilution déterminée par DO
Types de milieu
Solide/Liquide
Synthétique ou défini/Empiriques ou complexe
Base ou propagation/sélectif/différentiel
Classification des microorganismes
Source de carbone:
- Autotrophe: co2 seule source
- Hétérotrophe: molécules organiques préformées
Source énergie:
- Phototrophe: lumière
-Chimiotrophe: oxydation des composés organiques
Source e-:
- Lithotrophe: molécules inorganiques réduites (H2S, NH4+…)
- Organotrophe: molécules organiques réduites (glucose)
Exigences nutritionnelles C
inorganique -> autotrophes
organique/hydrocarburé -> hétérotrophe
EN N
Inorganique:
Natm -> N2 -> organite nitrogénase
Ammoniaque -> NH3 -> nitrosation
Nitrite -> NO2 -> nitration
nitrosation+nitration=nitrification
Organique:
Composés azotés: phospholipides, acides aminés
EN P
absorbé forme inorganique -> PO4^-2
EN S
absorbé forme inorganique -> sulfate SO4^-2
absorbé organique -> cystéine
EN facteurs de croissance
composés organiques essentiels que la bactérie ne peut pas synthétiser elle même
Acides aminés
Vitamines
Bases azotées
2 types:
Prototrophe: type sauvage, autonome pov nutritionnel
Auxotrophe: perte capacité synthèse métabolites essentiels
EN Eau
Indispensable
2 états:
- Libre: propriété physico-chimiques normales, libre de ses mouvements
- Liée: liée aux macromolécules, ions ou toute autre surface
seule eau libre est dispo pour les microorganismes
EN O
Accepteur final e- -> Aérobiques
Toxique -> Anaérobiques
Procaryotes: nécessaire, toléré ou toxique
Eucaryotes: presque toujours essentiel
5 groupes selon leur réponse à l’égard de O2
- Aérobies stricts: exigent obligatoirement O2
- Microaérophiles: ne se développent qu’en présence O2% < 21%
- Anaérobies stricts: ne peuvent se développer qu’en absence de O2
- Anaérobie facultatif (aéro-anaérobie): capable de se développer en présence ou en absence de O2
- Anaérobie aérotolérants: anérobie mais O2 ne les tue pas, mais croissance plus faible
O2 toxique car produit radicaux libres très oxydants:
- O2- -> anion super oxydant
- H2O2 -> peroxyde d’hydrogène
- OH- -> radical hydroxyle
Processus de réduction accéléré par enzymes:
O2-+H+->SOD->H2O2+O2
H2O2->Catalase->H2O
Croissance bactéries anaérobiques
- Bouillon thioglycolate
- Système GasPack
- Chamre de travail anaérobie O2->N2
Facteurs influents la croissance
Température:
- Psychrophile: <10°C
- Psychrotrophe: 20-30°C
- Mésophile: 20-45°C
- Thermophile: 55-65°C
- Hyperthermophile: 80-133°C
Pasteurisation 67°C
pH:
- Acidophile: 0-5.5
- Neutrophile: 5.5-8
- Alcalophile: 8.5-11.5
Physiologie fasse à la pression osmotique
Pression osmotique:
- Osmotolérant: tolère PO élevée
- Osmophile: Nécessite PO élevée
- Halophile: Nécessite [Na+]+[Cl-] > 0.2M