Cours 3 Biochimie et enzymologie Flashcards
Quelle biomolécule est amphotères? Ça veut dire quoi?
- AA
- C’est une molécule qui peut donner ou accepter des H+ (comportement basique ou acide)
Comment le lien peptidique se forme? Qu’est-ce qui est produit?
- Le lien CO de l’acide carbo se colle à deux liens NH de l’amide
- De l’eau est formée
Différence entre peptide et protéine?
Peptide c’est une chaîne d’a.a, alors que la protéine c’est plusieurs chaînes peptidiques. basically peptide c’est plus petit que protéine.
Qu’y a-t-il aux deux extrémités d’ **
À quoi servent les ponts disulfure?
- Stabiliser la structure des protéines
Comment un pont disulfure est formé? Qu’est-ce qui est produit?
- Rx entre 2 groupements thiol
- De l’eau (déshydratation)
V ou F: tous les AA ont une activité optique.
Faux, ce n’est pas le cas pour la glycine. La glycine n’a pas de forme énantiomérique.
V ou F: tous les acides aminés possèdent une configuration L.
Faux, on parle uniquement des AA dérivés de protéines.
Comment identifier les formes L ou D?
Grâce à la projection de Fisher.
Qu’est ce qu’un mélange racémique?
Mélange composé de quantité égale de 2 isomères.
Quels sont les deux types de protéines? Ex?
- Protéine de fonction: catalyser, transporter, réguler, protection etc..
- Protéine de structure: actine, collagène, kératine
Qu’est ce qui établie la fonction d’une protéine?
Sa structure.
Quelles sont les deux extrémités de la structure primaire des protéines?
- Groupement aminé NH2
- Groupement carboxylique COOH
Les mutations dans le génome sont attribuées à une modification dans quel niveau protéique?
Structure primaire.
À quoi ressemble la structure primaire des protéines?
Collier de perle de AA.
V ou F : tous les liens peptidiques ont une conformation cis (Z).
Faux, la majorité des liens ont une conformation trans (E).
Quelle liaison forme le lien peptidique?
C-N
Qu’est-ce qui permet à la structure des protéines d’être rigide et plane?
Le caractère double liaison partielle (quand la résonance permet la délocalisation des électrons pour former une double liaison).
V ou F: le squelette peptidique est composé de la chaîne principale et latérale, qui contiennent les atomes participant aux liens peptidiques.
Faux, la chaîne latérale n’est pas inclue. Elle ne contient pas les atomes participant aux liens peptidiques.
Qu’est-ce qui limite les angles de torsion?
Encombrement stérique des résidus des AA.
Que font les forces de torsion?
Influencent la structure tridimensionnelle de la protéine.
V ou F: la chaîne peptidique n’est pas statique.
V
Quelles sont les 2 structures secondaire?
Hélice alpha et bêta.
Qu’est-ce qui stabilise les hélices alpha?
Les ponts hydrogène.
Quelle est la forme de l’hélice alpha?
Spirale.
Combien d’AA par hélice? **
En ce qui concerne les liaisons entre AA, quelle est la différence entre les hélices alpha et feuillets bêta?
- Alpha: les AA sont liés par des pont H et sont rapprochés.
- Bêta: les AA sont liés par des liaisons hydrogènes entre AA distants.
Quelles sont les 2 configurations possible pour les feuillets bêta?
- Parallèle
- Antiparallèle
Qu’est-ce qu’un motif? Dans quelle catégorie on la place?
- C’est une combinaison de structures secondaires, comme une signature
- Structure supersecondaire
Qu’est-ce qu’une structure tertiaire?
- Repliement global de toutes les structures secondaires et superstructures
Qu’est-ce qui stabilise les structures tertiaire?
- Liaison hydrophobes
- Forces électrostatiques
- Ponts disulfures
- Liaisons peptidiques
Les protéines de plus de __ AA forment des structures appelées ___.
- 200
- Domaines
Qu’est-ce qui forme un domaine? **
Structure tertiaire.
Quelles sont les fonctions d’un domaine protéique?
- Activité enzymatique
- Pore membranaire
- Interaction moléculaire
Qu’est-ce qu’une structure quaternaire?
Assemblage de plusieurs chaînes de polypeptides.
polypeptide vs peptide vs structure primaire de protéine??