Cours 3

Question 1

A quoi correspond une représentation de Lineweaver-Burk ?

Answer 1

En gros on essaye de représenter MM sous forme de fonction affine, en utilisant un passage à l’inverse : Du coup on a 1/V0 = 1/Vmax + Km/Vmax * 1/S

Question 2

Qu’est-ce que une représentation de Eadie Hofstee ?

Answer 2

V0 = Vmax -Km (V0/S)

La pente est de -km.

Question 3

Qu’est-ce que une représentation de Eadie Scatchard ?

Answer 3

V0/S = Vmax/Km - V0/Km

La pente est de -1/Km

Question 4

Quelle est la fonction la plus utilisée, mais quel inconvénient ?

Answer 4

Lineweaver est la plus utilisée mais donne trop de poids aux valeurs faibles de V0.

Question 5

Quel pb avec les fonction Eadie ? Quelle fonction surtout utilisée pour les interactions ligands prots ?

Answer 5

La vitesse est en abcisse et ordonnées, amplifiant les erreurs. Mais Scatchar utilisée bcp pour ligand prot.

Question 6

Qu’est-ce que le Katal ?

Answer 6

1 katal est la quantité d’enzyme qui transforme une mole de substrat par seconde.

Question 7

Quel problème pour l’utilisation du katal ?

Answer 7

L’unité est d’un ordre de grandeur beaucoup trop grand pour l’utiliser dans la pratique.

Question 8

A quoi correspond une U d’enzyme ?

Answer 8

C’est la quantité d’enzyme transformant une micromole d’enzyme par minute.

Question 9

Quelle différence entre activité enzymatique et activité spécifique ?

Answer 9

L’activité enzymatique se base uniquement par rapport aux enzymes présentes tandis que l’activité spécifique s’exprime en fonction de la totalité de protéines.

Question 10

Qu’est-ce que l’enrichissement ?

Answer 10

Il s’agit de la proportion de contaminants par rapport à l’enzyme.

Question 11

Qu’est-ce que le rendement ?

Answer 11

Il s’agit de la proportion d’enzyme perdue lors de l’enrichissement.

Question 12

Comment calcule-t-on le rendement ?

Answer 12

Il s’agit du nombre d’unités enzymatiques ans l’échantillon final par rapport au nombre d’unités enymatiques dans l’échantillon initial.

Question 13

Comment calcule-t-on l’enrichissement ?

Answer 13

Activité spécifique Finale / activité spécifique initiale.

Question 14

Dans le cas d’une réaction enzymatique avec deux substrats limitants comment se passe la fixation des substrat en réactions séquencielles ?

Answer 14

Tous les substrats se fixent à l’enzyme avant que le produit soit libéré, formant un complexe ternaire. Les substrat peuvent se fixer indépendamment l’un de l’autre ou dans un ordre défini.

Question 15

Dans le cas d’une réaction enzymatique avec deux substrats limitants comment se passe la fixation des substrat en réactions à double déplacement ?

Answer 15

Un ou plusieurs produits sont libérés AVANT que tous les substrats soient fixés à l’enzyme.

Question 16

Quels sont les deux facteurs affectant la vitesse initiale d’une réaction ?

Answer 16

La température et le pH.
Si on augmente la température, plus d’energie fournie –> accélération de la réaction..
pH : augmente jusqu’au pH optimum puis diminue.

Question 17

Comment le pH affecte la vitesse d’une réaction ?

Answer 17

Modifient l’enzyme en ionisant, modifiant la structure 3d ou changer les caracs du site actif.
Modifie le substrat en modifiant son degré d’ionisation.

Question 18

Dans l’exemple de la RNase A, quels sont les trois aa constituant son site actif ?

Answer 18

His12, Lys41, His119.

Question 19

Comment fonctionne l’inhibition irréversible ?

Answer 19

L’inhibiteur se fixe très fortement à son enzyme et se dissocie très lentement.

Question 20

Donner un exemple d’inhibiteur irréversible.

Answer 20

La péniciline : inhibe la croissance bactérienne de manière irréversible en inhibant la transpeptidase, intervenant dans la formation de certaines des liaisons peptidiques.

Question 21

Comment contrer les bactéries résistantes à la péniciline exprimant des beta lactamases ?

Answer 21

On développe des composés dits inhibiteurs suicides (inhibent la protéine de résistance), associés à l’antibiotique.

Question 22

Comment fonctionne l’inhibition réversible ?

Answer 22

Peut être compétitive, non compet ou incompétitive: se dissocie rapidement.

Question 23

Qu’est-ce qu’un inhibiteur compétitif ?

Answer 23

L’enzyme peut se fixer au substrat ou à cet inhibiteur, mais pas les deux en même temps : site de fixation est le même.

Question 24

Donner deux exemples d’inhibiteur compétitif.

Answer 24

Méthotrexate, inhibnt la DHFR et ibuprofène.

Question 25

Comment est-ce que les inhibiteurs compétitifs influent la cinétique?

Answer 25

Réduit le nombre de molécules E pouvant fixer les substrats : par conséquent, la vitesse de réaction est affectée.

Question 26

Qu’est-ce que Ki ?

Answer 26

C’est la constante de dissociation de l’inhibiteur, et Ki= [E][I]/[EI]

Question 27

Qu’est-ce qu’un inhibiteur noncompétitif ?

Answer 27

Ne se fixe pas au même enroit que le substrat mais sa fixation engendre un changement de conformation dusite actif.

Question 28

Exemple d’inhibiteur non compétitif.

Answer 28

Cyanure dans la respiration.

Question 29

Qu’est-ce qui est conservé entre pas d’inhibiteur et inhibiteur non compétitif ?

Answer 29

-1/Km (intersection abcisse)

Question 30

Qu’est-ce qu’un inhibiteur incompétitif ?

Answer 30

Se lie uniquement au complexe ES.

Question 31

exemple d’un inhibiteur incompétitif ?

Answer 31

Herbicide Glyphosphate.

Question 32

Quels paramètres sont affectés par un inhibiteur incompétitif ?

Answer 32

Km et Vmax, mais la pente ne change pas.

Question 33

Qu’est-ce qu’un agoniste ?

Answer 33

Il s’agit d’une molécule qui a les mêmes propriétés que le ligand donc déclenche en plus ou moins fort la même réaction que le substrat normal.

Question 34

Qu’est-ce qu’un antagoniste ?

Answer 34

Molécule dont l’action s’oppose aux effets du ligand similaire à l’inhibiteur compétitif d’une enzyme.