Cours 21 Flashcards

1
Q

2150

Qu’est-ce qu’un immunoglubuline?

A

C’est un anticorps produit par le système immunitaire

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Q

Une immunoglobuline contient

A

Une chaine lourde et légère
Un domaine Fab et Fc
Des domaines constantes et variables

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3
Q

Quels sont les noms des boucles hypervariables

A

CDR L1-L3 (light 1-3)

CDR H1-H3 (heavy 1-3)

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4
Q

Comment gp120-gp41 (Env) permet l’entrée de virus dans la cellule hote

A

Monomère de trimère gp120 intéragit avec CD4
Changement de conformation de gp120
gp120 intéragit avec corécepteur
gp41 expose son peptide fusion pour laisser l’entrée du virion en canal

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5
Q

Quels sont les facons de faire un vaccin contre le VIH1

A

Bloquer coopérativité du trimère après chg. de conformation
Bloquer intéraction CD4 gp120
Empeche entrée en arretant jonction gp41 et gp120

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6
Q

Pourquoi SOSIP64 est plus cristallisable que Env?

A

RRR à gp120 pour un clivage de gp120-fp41 (par site de furine) plus facile.
gp120-41 attachés par liaison disulfure
I559P pour stabiliser la protéine
Ne possède pas sont gp41 c-terminal

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7
Q

Qu’est-ce qui est caractéristqie à Env?

A

C’est 50% glycosylés (de sa masse)

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8
Q

Dans l’article, on s’intéresse à:

A

La liaison de gp120 et l’anticorps VRCPG05 qui s’attache au silent face très glycosylée de gp120

Comment le virus du patient a mutée

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9
Q

Quel est le but de cytométrie de flux?

A

Trouver les cellules de l’hote avec des anticorps qui veulent s’attacher de facon non-spécifique et spécifique au site de liaison de CD4 de Env

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10
Q

Quels sondes de cytométie de flux sont utilisés?

A

Rsc3 (non-spécifique)

deltaRsc3 (spécifique)

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11
Q

Le cytométrie de flux a permet d’isoler quels anticorps?

A

VRCPGO4 et VRCPG05

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12
Q

Quel est le but d’un test de compétition ELISA? Que veut dire la fluorescence?

A

C’est pour voir comment bien le VRCPG05 se lie au site de laision de CD4 de gp120 à comparaison à d’autres anticorps qui lient au gp120.

Grand DO veut dire PAS de liaison.

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13
Q

What does the competition ELisa results mean?

A

Aucun anticorps a été capable de délooger VRCPG05

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14
Q

Qu’a donnée les tests de neutralisation de plusieurs souches de Env?

A

L’anticorps a une spécificité difféerente des autres anticorps connues (epitope différente) donc elle vient d’une lignée différente.

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15
Q

Qu’a donné le TEM de Env-anticorps-CD4?

A

Les sites de liaison de l’anticorps et CD4 sur gp120 sont opposés l’un de l’autre

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16
Q

Quels changements de Env étaient nécessaires pour faire la crystallisation en rayon X?

A

Des coeurs de gp120 sont faites avec des souches sensbles à VRCPG05 dans des cellules HEK293S GNTI-
Ils sont soumis à un endoglucosidae pour cliver les glycanes qui rendent la crystallisation impossible
On l’a complexé au fragment Fab de VRCPg05

17
Q

La crystallisation a montré que la surface d’intéraction

A

se compose 85% de glycanes

18
Q

Quels sont les glycanes principales dans l’intéraction

A

N262, 295 et 448

19
Q

Quels sont les parties protéiques (de Env) de l’interaction?

Par quels boucles?

A

ELS (E293, L446 et S447)

Par les CDRL1 et H3 qui s’inserent dans une pochette

20
Q

Quels sont les intéractions que font N262 (REQ), N295 et N448

A

N262 avec H1 et H3 (REQ)
N295 avec L2 et H3 (liaisons hydrogènes)
N448 avec L1, H2 et H3 (empilements, H et hydrophobes)
W fait un empilement pi

21
Q

Qu’a donné l’expérience de Surface Plasma Resonance?

A

Le VC PG05 interagit uniquement avec le gp120 GLYCOSYLÉ

22
Q

Qu’est-ce que se passe si on enle;eve les N262 et N248 de Env? analyse par test ELISA

A

Il n’y a pas d’intéraction avec l’anticorps

23
Q

Est-ce que l’épitope (les glycans) sont uniques au VRCPGO5

A

Non, sauf pour l’intéraction avec N262. C’est l’épitope le 2e plus glycolysé connu pour le VIH1.

24
Q

Est-ce que l’épitope (les glycans) sont uniques au VRCPGO5

A

Non, sauf pour l’intéraction avec N262. C’est l’épitope le 2e plus glycolysé connu pour le VIH1.

25
Q

Qu’est-ce que le modèle anticorps CD4 - gp120 CLOSE et OPEN nous montre?

A

En conformation close, l’anticorps peut s’attacher au trimère
En conformation open, il y a des empechements stériques avec le CD4

Cela EMPECHE l’infection

26
Q

Quels mutations a VRCPg05 eu pour reconnaitre les glycanes?

A

Allongement de bouvles, mutations dans les boucles
Mutations qui ajoutent à la surface de liaison
Y enlevé comme il cause des encombrements stériques

27
Q

Pourquoi le E293 est importante

A

Elle intéragit avec anticorps (partie protéique)

Elle lie 3 molécules d’eau et des boucles qui font des liaisons avec les glycans

28
Q

Quels sont les changements Env a subit contre le VRCPgo5

A

E293A ou G pour enlever la liaison avec les anticorps

N448 à 446 pour enlever la surface d’intéraction