cours 12: relation entre l'ADN et le phénotype La sélection naturelle

Question 1

Qu’est-ce que la dérive

Answer 1

La dérive génétique désigne la variation stochastique des fréquences alléliques dans une population en l’absence de sélection naturelle

Question 2

Que doit-on additionner au réservoir d’allèles constitué de la génération précédente afin de donnner l’ensemble des allèles d’une génération ?

Answer 2

Échantillonnage aléatoire + Taille efficace Ne

Question 3

Quelle est la probabilité de fixation d’une mutation qui apparait dans une population humaine diploïde? Quelle est l’espérance du temps de la fixation de cette mutation?

Answer 3

1/2Ne
temps de fixation: 4Ne générations

Question 4

Quels sont les impacts de la dérive génétique?

Answer 4

influence les fréquences alléliques et provoque une diminution de la div gen.

Question 5

Selon le modèle de la dérive génétique et la taille de la population, qu’est-ce qui a un impact direct sur sa diversité génétique?

Answer 5

Selon ce modèle, les changements de taille d’une population ou histoire démographique vont avoir un impact direct sur sa diversité génétique

Question 6

Selon le modèle de la dérive génétique et la taille de la population, les changements de taille d’une population ou histoire démographique vont avoir un impact direct sur sa diversité génétique.

Ainsi,
Quelle est la relation entre l’augmentation/diminution et la dérive génétique (ainsi que la diversité)

Answer 6

Augmentation de la taille de la population (expansion)
 Une dérive génétique plus faible et une augmentation de la diversité génétique de la population,

Réduction de la taille de la population ou goulot d’étranglement :
 Une dérive génétique forte, avec la disparition ou la fixation d’un certain nombre d’allèles et une diminution de
la diversité génétique.
 L’effet fondateur : un petit groupe d’individus se sépare d’une population mère pour fonder une nouvelle
population, est un cas de forte dérive génétique avec une diminution importante de la diversité génétique

Question 7

Qu’est-ce que l’isolement ? Quels sont ses impacts?

Answer 7

L’isolement ≡ désigne l’absence d’interfécondité entre deux populations.
o L’isolement crée de la différenciation soit par isolement géographique (distance, présence de barrière
géographique), soit par isolement reproductif (pour des raisons culturelles, par exemple).
o Différenciation génétique entre les populations, avec l’apparition de mutations spécifiques à l’une ou
l’autre des populations.

Question 8

Qu’est-ce que la migration? Quels sont ses impacts sur la fréquence allélique et la diversité génétique?

Answer 8

La migration ≡ déplacement d’un individu ou d’un groupe d’individus d’une population vers une autre.
o Pas d’impact sur la fréquence allélique au niveau de l’espèce (contrairement à la dérive génétique) o Augmentation de la diversité génétique de la population receveuse si les migrants participent à la
diversité génétique de la génération suivante : On parle alors de flux génique

Question 9

Quand peut-on parler de flux génique?

Answer 9

Augmentation de la diversité génétique de la population receveuse si les migrants participent à la
diversité génétique de la génération suivante : On parle alors de flux génique

Question 10

Décrit brièvement l’histoire des populations humaines africaines, européennes et asiatiques.

Answer 10

Séparation entre populations africaines et non africaines il y a 50 000 à 75 000 ans.
o Les populations africaines ont ensuite traversé un épisode d’expansion modérée
o La sortie d’Afrique s’est accompagnée d’un ou plusieurs goulots d’étranglement.
o Les populations asiatiques et européennes se sont séparées il y environ 20 000 ans, avant de connaître une expansion forte

Question 11

Quels sont les 3 grands principes de la sélection naturelle?

Answer 11

Trois grands principes :
o Existence, dans une population, d’un trait variable selon les individus, o Héritabilité de ce trait
o Corrélation entre variation du trait et succès reproductif des individus.

Question 12

Qu’est-ce qui guide l’évolution des espèces et favorise leur survie et leur reproduction en permettant leur adaptation à l’environnement?

Answer 12

la sélection naturelle

Question 13

La théorie darwinienne de l’évolution ne propose pas de mécanisme expliquant la transmission des traits au cours des générations, quelle théorie permet d’expliquer cette transmission?

Answer 13

La Théorie ontologique et synthétique de l’évolution

Question 14

Quels sont les deux grands principes de la théorie ontologique et synthétique de l’évolution, qui complète la théorie darwinienne?

Answer 14

deux grands principes :
o le hasard de l’évolution des fréquences des mutations dans une population (dérive génétique), o l’interaction entre génome et pressions environnementales (sélection naturelle).

Question 15

Quels sont les trois régimes sélectifs principaux de la sélection naturelle?

Answer 15

: la sélection positive, la sélection négative et la sélection balancée.

Question 16

Qu’est-ce que la sélection positive ? Quels sont ses effets?

Answer 16

Mutation apparue par hasard confère un avantage sélectif à l’individu :
o Augmenter de sa fréquence dans la population sous l’effet de la sélection positive plus rapidement que ne le ferait une mutation neutre sous l’effet du hasard.

Question 17

comment mesure-t-on l’efficacité de la sélection dans une population?

Answer 17

L’efficacité de la sélection dans une population, notée g, est exprimée par la formule g = 2Nes, où s désigne le coefficient de sélection, qui correspond à l’avantage relatif procuré par l’allèle sélectionné par rapport à l’autre allèle, et Ne la taille efficace de la population.

Question 18

Le temps de fixation de la mutation dépend de quels facteurs?

Answer 18

Le temps de fixation de la mutation dans la population dépend de:
o l’efficacité de la sélection
o du mode de transmission de l’allèle sélectionné (dominant, co-dominant ou récessif). une mutation dominante
avec un coefficient de sélection élevé dans une population de grande taille se fixera plus rapidement qu’une mutation récessive avec un faible coefficient de sélection dans une petite population.

Question 19

quelle est la différence entre selective sweep, classical sweep et ongoing sweep?

Answer 19

La sélection positive cible une mutation dès son apparition, on parle alors de balayage sélectif (selective sweep)

o complet si l’allèle est fixé dans les populations (classical sweep),

o incomplet si l’augmentation en fréquence de l’allèle est toujours en cours (ongoing sweep).

Question 20

Quel est le type de sélection qui touche la région régulatrice du gène LCT? Qu’est-ce que ça permet concernant la lactase?

Answer 20

Sélection (positive) convergente, plusieurs mutations de la région régulatrice du gène LCT qui permettent la persistance de la production de lactase à l’âge adulte ayant en effet été la cible de la sélection positive dans différentes populations
 Persistance chez certaines populations d’Afrique, Europe et Moyen-Orient chez plus de 80% des individus

Question 21

Quels sont les deux types de sélection positive ? explique les

Answer 21

sélection positive sur variant existant et adaptation/sélection polygénique

Nouvelle mutation commence à évoluer en fréquence dans la population sous neutralité ou sous sélection négative faible avant de devenir avantageuse suite à un changement environnemental.
 Sélection sur variant pré-existant
L’ avantage sélectif conféré par un ensemble de mutations à plusieurs loci
 Augmentation de la fréquence de plusieurs
mutations à différents loci, et on parle de sélection polygénique

Question 22

explique l’influence de la sélection positive concernant la taille des individus en Europe

Answer 22

o La taille d’un individu est un phénotype multi-génique, un certain nombre d’allèles favorisant une plus grande taille présentent des fréquences plus élevées dans les populations du nord que dans celles du sud de l’Europe : une sélection faible mais ciblant plusieurs mutations favorisant une grande stature dans les populations nordique

Question 23

Qu’est-ce que la sélection negative et de quels paramètres le temps de disparition dépend-il?

Answer 23

Mutation apparue par hasard confère un désavantage pour la survie ou la reproduction :
o Diminution de la fréquence sous l’effet de la sélection négative jusqu’à disparaître.

Le temps de disparition de la population dépend des mêmes paramètres que pour la sélection positive
 le coefficient de sélection, qui correspond cette fois-ci au désavantage relatif procuré par l’allèle sous sélection
négative par rapport à l’autre allèle,
 la taille efficace de la population
 le mode de transmission de l’allèle sélectionné : un allèle récessif mettra plus de temps à disparaître d’une population qu’un allèle dominant

Question 24

Quels sont les deux types de sélection négative forte ? explique les.

Answer 24

Deux types de sélection négative :
o Sélection négative est forte, la mutation très délétère sera purgée rapidement de la population : sélection
purificatrice.
o Sélection plus mesurée ou sélection négative faible, la mutation moins délétère peut se maintenir à basse fréquence dans la population.

Question 25

Donne des exemples de gènes sous sélection négative

Answer 25

Parmi les gènes sous sélection négative:
o Les gènes impliqués dans les fonctions liées au cytosquelette et à la matrice extra-cellulaire o Les gènes liés à l’immunité : un certain nombre d’exemples de fortes contraintes évolutives.

Question 26

Indique comment ces types de sélection affecte la cellule afin de faire sa sélection correspondante.

Forte sélection purificatrice
Sélection plus faible ou neutre
Sélection positive ou balancée

Answer 26

Forte sélection purificatrice : Fonctions essentielles des gènes ciblés

o Sélection plus faible ou neutre : Fonctions plus ou moins redondantes dans la signalisation immunitaire.

o Sélection positive ou balancée : Gènes impliqués dans des mécanismes où la variation génétique a conféré un avantage sélectif à la population.

Question 27

Quelle proportion de la population du génome humain est sous contrainte de sélection négative?

Answer 27

Évaluation à environ 7 à 9% la proportion du génome humain sous contrainte, dont un peu plus de la moitié est conservée au sein des mammifères

Question 28

Qu’est-ce que la sélection balancée ? donne trois exemples de cas de sélection balancée

Answer 28

La sélection balancée agit sur plusieurs allèles à un même site, en favorisant la coexistence de plusieurs allèles

Plusieurs cas de sélection balancée:
o L’état hétérozygote est plus avantageux que les deux états homozygotes : superdominance

o L’avantage d’un phénotype dépend de sa fréquence relative par rapport aux autres phénotypes : sélection dépendante de la fréquence, peut être positive ou négative

o L’ oscillation du génotype le plus avantageux dans le temps (au cours de la vie de l’individu) ou dans l’espace (en fonction de l’environnement) :sélection variant dans le temps ou l’espace.

Question 29

Sélection balancée: explique en quoi la drépanocytose correspond à cette sélection tout en expliquant cette maladie.

Answer 29

La drépanocytose, aussi appelée anémie falciforme :
o à l’état homozygote l’allèle de l’hémoglobine S (HbS) est responsable de la drépanocytose, une maladie qui affecte le transport de l’oxygène dans le sang.

 Malgré ses conséquences très délétères, cet allèle est présent à forte fréquence dans certaines régions où le paludisme est endémique (apparue en Afrique et en Inde )

o à l’état hétérozygote, meilleure résistance à l’infection par Plasmodium falciparum, parasite responsable du paludisme, sans avoir beaucoup d’effet sur le transport d’oxygène.

    **L’état hétérozygote est plus avantageux que les deux états homozygotes**

Question 30

Sélection balancée: explique le système HLA et en quoi celui-ci est sous l’influence d’une sélection balancée

Answer 30

Le système HLA (human leucocyte antigène ou antigènes des leucocytes humains) est une famille de gènes qui permettent de reconnaitre les marqueurs du “soi” et de présenter les antigènes provenant de pathogènes ou de cellules modifiées (par exemple cancéreuses) aux lymphocytes T pour déclencher la réponse immunitaire

Évolution sous sélection dépendante de la fréquence négative, c’est-à-dire que c’est la rareté de l’allèle qui donne le caractère avantageux

L’avantage d’un phénotype dépend de sa fréquence relative par rapport aux autres phénotypes

Question 31

Sélection balancée: explique le système ABO et en quoi évolue en sélection balancée.

Answer 31

Le gène ABO dont les fréquences des trois allèles A, B et O varient beaucoup selon les populations humaines, évolue sous l’un ou l’autre de ces modèles potentiellement dans le cadre d’une co-évolution avec les pathogènes présents dans l’intestin

 **Variation du génotype le plus avantageux dans le temps (au cours de la vie de l’individu) ou dans l’espace (en fonction de l’environnement)**

Question 32

Qu’est-ce que la sélection balancée à long terme ? Nomme un exemple et un contre-exemple.

Answer 32

 Sélection balancée « à long terme » (longterm balancing selection) caractérisée par la présence d’allèles
trans-espèces (allèles présents dans plusieurs espèces) bien plus longtemps après leur divergence qu’attendu
sous neutralité.

 Cas du système HLA, dont certains allèles sont apparus il y a plus de 40 millions d’années et des allèles A et B
du gènes ABO, apparus il y a environ 20 millions d’années chez les primates.

 Il existe aussi des événements de sélection balancée plus récents comme pour HbS spécifiques de l’humain.

Question 33

Qu’est-ce que la sélection balancée maintient ? pendant combien de temps?

Answer 33

le polymorphisme allélique, durant une période très longue.

Question 34

Quels sont les trois postulats pour retracer l’histoire évolutive d’une région génomique ou d’une mutation?

Answer 34

Un taux de mutation constant : horloge moléculaire

Une taille de population constante

Équilibre entre mutation et dérive (nombre d’allèles perdus par dérive génétique étant compensé par le
nombre d’allèles créés par mutation, considération du contexte génomique)

Question 35

Quels sont les deux grands types de tests pour détecter la sélection positive ? ils sont tous basés sur quoi?

Answer 35

Deux grands types de tests permettant de détecter la sélection positive : o Les tests inter-spécifiques
o Les tests intra-spécifiques
 Tous basés sur l’étude des SNP, et permettant de détecter des événements de sélection plus ou moins récents en fonction des signatures moléculaires étudiées

Question 36

Les tests inter-spécifiques se concentrent sur la comparaisons de quels facteurs (3) ?

Answer 36

1. régions codantes : comparaison du nombre de mutations fonctionnelles (non synonymes) et non-fonctionnelles (synonymes) = ration dN/dS
2. Nombre total de divergences et de polymorphisme synonymes (ne changeant pas la séquence d’a.a) et non synonymes (test Mk et ses variants)
3. Nombre de divergence par rapport au nombre de polymorphisme(HKA): excès de polymoprhisme et de divergence à un locus donné par rapport à d’autres régions peut indique une sélection positive.

Question 37

Qu’est-ce qui modifie le spectre de fréquences alléliques ?

Answer 37

 La sélection positive modifie le spectre de fréquences alléliques, avec notamment un enrichissement
en mutations à très faibles ou très fortes fréquences.

Question 38

Quels sont les tests qui permettent de déterminer si le spectre de fréquence allélique observé correspond à celui attendu sous neutralité?

Answer 38

des comparaisons des estimateurs de θ, le taux de mutation de la population
 Théoriquement, θ= 4Neμ, où μ est le taux de mutation par génération.
Ce taux ne peut être calculé directement à partir de données de polymorphisme d’un échantillon, mais il peut être estimé en utilisant différentes méthodes, qui donnent toutes des valeurs comparables si l’hypothèse de neutralité est respectée.
le D de Tajima (Tajima1989), le D et le F de Fu et Li (FuandLi1993), le H de Fay et Wu (FayandWu2000) et le E de Zeng

Question 39

Qu’est-ce qui augmente la différenciation entre les population?

Quel indice permet de mesurer cette différenciation entre les populations?

Answer 39

La fréquence d’une mutation avantageuse (sélection positive) augmente rapidement dans la population mais continue d’évoluer sous neutralité dans les autres populations
 une augmentation de la différenciation entre populations à cette mutation.
 Le FST (indice de fixation ) permet de mesurer la différenciation entre populations.
Sous neutralité FST est déterminé par la dérive génétique
 Événement de sélection positive locale : FST de la mutation sélectionnée augmente

Question 40

Quel est l’avantage du FST? quel est son désavantage et les tests pouvant l’aider par rapport à ce désavantage?

Answer 40

L’avantage du FST est de détecter directement le variant sous sélection
mais ne permet pas de déterminer dans quelle population la sélection positive a agi

Tests plus récents : PBS (population branch statistics),LSBL (locus-specific branch lengths ) et LRT (likelihood ratio test).
 utilisent le FST pour générer des arbres de distance génétique entre au moins deux populations à une mutation donnée, permettant ensuite l’identification de la population dans laquelle l’événement de sélection a eu lieu par comparaison de la longueur des branches.

Question 41

Explique comment les variations locales de la longueur des haplotypes permet de détecter la sélection positive. Quels types de sélection positive peut-il détecter?

Answer 41

Pour un site situé à la position d0 ayant deux allèles, l’allèle ancestral aA et l’allèle d’intérêt aD: , l’EHH pour l’allèle d’intérêt à une distance x de ce site noté EHH(x;aD) correspond à la probabilité que deux chromosomes choisis par hasard dans un échantillon présentent le même haplotype sur l’ensemble de la région allant de d0 à d0+x, et est compris entre 0 et 1.

 L’EHH d’un allèle dérivé sous sélection positive diminuera plus lentement que celui de l’allèle ancestral correspondant

EHH (extended haplotype homozygosity), mesure la diminution de l’homozygotie moyenne entre haplotypes en se déplaçant latéralement depuis la mutation d’intérêt.

 permettent de détecter uniquement des événements de sélection positive très récents (<30 000 ans)

Question 42

En quoi la variabilité génétique des populations africaines sont différentes des populations européennes et asiatiques?

Answer 42

Les populations humaines ne sont pas de taille constante:
o Les populations africaines montrant une variabilité génétique compatible avec une expansion modérée, o Les populations européennes et asiatiques ont une variabilité génétique compatible avec un ou plusieurs
goulots d’étranglement suivis d’une expansion importante.

Distinction des effets de l’histoire démographique et de la sélection naturelle:
 La première affecte l’ensemble du génome, alors que la seconde n’affecte que localement la diversité génétique
autour de la mutation sélectionnée.

Question 43

Adaptation au climat: explique l’adaptation la plus connue – l’ensoleillement et l’exposition aux UV–

Answer 43

o Gènes sous sélection en Europe et en Asie, associés à une pigmentation plus claire de la peau, des cheveux et des yeux : SLC24A5, MATP, KITLG, TYR, HERC2, OCA2, TPCN2 et ASIP.
 avantage dans le cadre d’une faible exposition aux UV
o En Afrique, le gène MC1R, impliqué dans la production de mélanine, est sous forte sélection purificatrice
 la mélanine est indispensable à la protection contre les dommages provoqués par l’exposition aux rayons UV sur l’ADN et la lyse du folate

Question 44

Nomme des exemples d’adaptation humaine au climat

Answer 44

 Latitude, température, le taux de précipitations et l’humidité. Il est important de noter que ces paramètres climatiques sont très corrélés entre eux.

Question 45

voir diapo 30 pour explications

Answer 45

voir diapo 30

Question 46

Adaptation au climat: explique l’adaptation à l’hypoxie causée par la haute altitude des populations vivant en altitude (nomme aussi les 3 régions dans lesquelles ils vivent)

Answer 46

o Les allèles de EGLN1, EPAS1 et PPARA entraînant une diminution de la concentration en hémoglobine sont
sous balayage sélectif dans des populations vivant en altitude au Tibet
o Des mutations dans quatre autres gènes (CBARA1, VAV3, ARNT2 and THRB) ainsi qu’un SNP intergénique, rs10803083, associés au même phénotype, sont également sous sélection positive dans les populations vivant sur les hauts plateaux éthiopiens.

o Deux autres gènes NOS2A et PRKAA1, impliqués dans des voies métaboliques associées à la vasodilatation et à la détection de l’hypoxie, respectivement sont sous sélection convergente en Amérique du Sud.

Géographie de l’adaptation humaine aux hautes altitudes.
o l’Altiplano andin en Amérique du Sud
o le plateau tibétain en Asie centrale
o le plateau de Semien en Éthiopie.

Question 47

L’accumulation de données génomiques issues de populations vivant dans des conditions climatiques particulières avec une forte résolution géographique va permettre de détecter …

Answer 47

L’accumulation de données génomiques issues de populations vivant dans des conditions climatiques particulières avec une forte résolution géographique va permettre de détecter les mutations fortement différenciées entre populations et dont la fréquence est corrélée à des facteurs climatiques, et ainsi d’en apprendre plus sur les pressions exercées par le climat sur la diversité humaine.

Question 48

Plusieurs SNP associés au diabète de type 2, à l’obésité et à l’augmentation de l’IMC sont sous sélection positive chez l’humain. Pourtant, une mutation dans le gène TCF7L2, associée à une diminution de l’incidence du diabète de type et à une réduction de l’indice de masse corporelle est sous sélection positive en Europe et en Asie. Pourquoi?

Answer 48

La datation de l’événement d’adaptation suggère qu’il est contemporain du développement de l’agriculture en Europe et doit donc conférer un avantage dans cet environnement

Question 49

Le risque de développer le diabète est causé par quoi?

Answer 49

Rôle important du régime alimentaire sur la diversité phénotypique humaine. Les humains ont notamment dû s’adapter à des modes de vie où les sources de nourriture sont incertaines.
 Le risque de développer un diabète serait donc une conséquence secondaire de l’adaptation à la variation de
la disponibilité des ressources alimentaires

Question 50

voir diapo 34

Answer 50

voir diapo 34

Question 51

la persistance de la lactase à l’âge adulte est un exemple de…

Answer 51

pression de sélection depuis l’invention de l’agriculture qui ont notamment mené à des adaptations locales.

Question 52

Quelle sélection et quelles population cette mutation touche, et pourquoi?

“Mutation rs1229984 du gène ADH1B qui altère la capacité à digérer l’alcool et protège probablement contre l’alcoolisme”

Answer 52

Signatures de balayage sélectif en Asie de l’Est et en Europe, et son augmentation en fréquence dans les populations suit l’expansion de la culture du riz à l’est de l’Asie

Question 53

Des mutations impliquées dans le goût et l’olfaction, deux sens importants dans l’alimentation, portent également des signatures de sélection positive. Donne un exemple.

Answer 53

 Mutation faux sens dans TAS2R16 provoquant une plus grande sensibilité à certains glycosides est sous sélection dans l’espèce humaine.
=Sélection chez les ancêtres chasseurs-cueilleurs des populations humaines car il confère une protection contre les toxines cyanogènes présentes dans certaines plantes

 Quatre haplotypes : HAP-A(N172/H222) et HAP-B (N172/R222) caractérisés par le site faux sens K172N; HAP-C (K172/H222) et HAP-D (K172/H222) caractérisés par une substitution synonyme L154L

Question 54

Nombreux gènes sous sélection sont des gènes impliqués dans le métabolisme des glucides, des graisses et de l’alcool, la perception du goût et l’olfaction, ce qui indique que?

Answer 54

Nombreux gènes sous sélection sont des gènes impliqués dans le métabolisme des glucides, des graisses et de l’alcool, la perception du goût et l’olfaction, ce qui indique que de nombreux événements d’adaptation pourraient être liés au régime alimentaire.

Question 55

Nomme des exemples de pathogènes qui ont joué un rôle dans l’évolution des populations humaines

Answer 55

Plasmodium falciparum, les bactéries responsables de la lèpre, de la tuberculose, du choléra, et de nombreux virus.

Question 56

les gènes de l’immunité sont seulement victime de sélection négative. V ou F

Answer 56

F, environ 200 gènes liés à l’immunité montrent également des signatures de sélection positive

Question 57

Explique en quoi des gènes impliqueés dans la résistance au paludisume sont sous forte sélection positive dans les zones où le parasite est endémique?

Answer 57

Des mutations dans des gènes impliqués dans la résistance au paludisme sont par exemple sous forte sélection positive dans les zones où le parasite est endémique (FY, aussi connu sous le nom de DARC et CR1 en Afrique sub-saharienne et G6PD en Asie du Sud-Est )

L’allèle FY*O qui confère une résistance au paludisme à P. vivax, est répandu et même fixé dans de nombreuses populations africaines, mais pratiquement absent en dehors de l’Afrique

La déficience en glucose-6-phosphate déshydrogénase (G6PD) est associée à un ictère néonatal et une anémie hémolytique.

Les allèles déficients en G6PD semblent avoir un effet protecteur contre le paludisme : Le variant commun en Asie du Sud-Est : G6PD-Mahidol487A serait lié à la survie humaine au paludisme à vivax

Forte et récente sélection positive a ciblé le variant au cours des 1500 dernières années. Le variant de G6PD-Mahidol487A réduit la densité parasitaire à vivax

Question 58

Explique comment une mutation de LARGE permet de diminuer la sensibilité des cellules à l’infection par le virus de la fièvre de Lassa est sous sélection positive en Afrique de l’Ouest.

Answer 58

Le génome du LASV se compose de deux segments d’ARN qui codent pour quatre protéines en utilisant une stratégie ambisens.

 Le segment S code pour la nucléoprotéine NP, ainsi que le précurseur de la glycoprotéine GPC qui est clivé en glycoprotéines GP1 et GP2.

 Le segment LARGE contient la protéine de liaison au zinc Z et la polymérase ARN-dépendante de l’ARN viral L.

Le LASV appartient à la famille des arénavirus hautement divergente : arénavirus « du Vieux Monde » : principalement en Afrique
arénavirus « du Nouveau Monde » principalement en Amérique du Sud.

Les segments S complets représentatifs de tous les arénavirus connus ont été alignés et un arbre phylogénétique bootstrapé (1000 répétitions) a été construit en utilisant la méthode du neighbour-joining.

Question 59

Pourquoi des gènes de la famille TLR tels que TLR5 et le cluster TLR1-6-10 ont été la cible de la sélection positive?

Answer 59

probablement à cause de leur rôle de reconnaissance de bactéries à la surface des cellules, ce qui nécessite de s’adapter à de multiples pathogènes pouvant évoluer rapidement