Cours 12 - La Synthèse Protéique

Question 1

Cadre de lecture ouvert

Answer 1

• La partie d’un cadre de lecture avec le potentiel d’encoder une protéine
• C’est une serie de codons sans codon de terminaison

Question 2

Quelles sont les 4 types de mutation

Answer 2

1) Silencieuse
- Change pas l’AA
2) Faux-sens
- Change l’AA
3) Non-sens
- Change l’AA pour un codon STOP
4) Continuation
- Change le codon STOP pour un AA

Question 3

Rôle des ARNt

Answer 3

Elles sont les médiatrices-clés entre la séquence nucléotidique de l’ARNm et la séquence d’acides aminés polypeptidique

Question 4

Quelles sont les 5 parties de l’ARNt

Answer 4

1) Tige acceptrice
2) Lobe tψc
3) Lobe anticodon
4) Lobe D

Question 5

Comment les ARNt reconnaissent les molécules d’ARNm

Answer 5

Grâce à l’appariement des anticodons avec les codons.

Question 6

Wobble

Answer 6

• La position 5’ de l’anticodon possède une flexibilité de conformation souvent appelé position de flottement

Question 7

Quelle nucléotide peut donner une inosine

Answer 7

L’adénine en position 5’ de l’anticodon peut être désaminée pour donner une inosine

Question 8

ARNt isoaccepteurs

Answer 8

Les diverses molécules d’ARNt qui portent toutes le même acide aminé sont appelées ARNt isoaccepteurs.

Question 9

Type de liaison entre un AA et l’ARNt et le nom du produit

Answer 9

• Liaison covalente

=> Aminoacyl-ARNt ou ARNt activées (car riche en énergie)

Question 10

Enzyme qui catalyse la liaison entre un AA et l’ARNt

Answer 10

Aminoacyl-ARNt synthétases

Question 11

Réaction de synthèse d’un aminoacyl-ARNT

Answer 11

Acide aminé + ARNt + ATP —> Aminoacyl-ARNt +AMP +PPi

2 étapes:

1) La formation d’un intermédiaire réactionnel
2) Le transfert du groupe aminoacyle de l’intermédiaire à l’ARNt

Question 12

Composition des ribosomes

Answer 12

Composition (ribonucléoprotéines)

- 2/3 d’ARNr
- 1/3 de protéines

Question 13

Que signifie S

Answer 13

Unités Svedberg

Question 14

Site P

Answer 14

Aka: - Site peptidyle

Rôle: - Contient une molécule d’aminoacyl-ARNt qui porte la chaîne polypeptidique naissante

Question 15

Site A

Answer 15

Aka: - Site aminoacyle

Rôle: - Contient l’autre molécule d’aminoacyl-ARNt

Question 16

Étapes de la synthèse protéique (3)

Answer 16

1) L’initiation
2) L’allogement ou élongation
3) La terminaison

Question 17

Quelle est la matrice de la synthèse protéique

Answer 17

L’ARNm

Question 18

Étape d’initiation

Answer 18

• L’assemblage d’un complexe d’initiation au BON CODON départ du BON CADRE de lecture

Question 19

ARNt initiateur

Answer 19

Procaryote: - fMet-ARNt (formyl transférase)

Eucaryote: - Met-ARNt

Rôle: - Reconnait seulement AUG

Question 20

Initiation chez les procaryotes

Answer 20

1) Dissociation des sous-unités ribosomales

2- Assemblage du complexe d’initiation 30S au site d’initiation

- Petite sous-unité
- ARNm
- Complexe ternaire fMet- ARNtfMet -IF-2-GTP

3- La sous-unité 50S s’associe (Complexe 70S)
=> Le ribosome est prêt à se fixer à un 2e AA-ARNt

Question 21

Facteurs d’initiation

Answer 21

Eucaryotes (12):

1) eIF2 (Protéine de liaisonm au GTP qui facilite la fixation du codon initiateur à la petite sous-unité)
2) eIF4F: F=AGE (Aide à fixer la petite sous-unité à l’ARNm)

Procaryotes:

1) IF-1 (S’attache à 30S et dissocie les 2 sous-unités)
2) IF-2 (Une protéine de liaison au GTP qui facilite la liaison du f-MetARNt à la petite sous-unité)
3) IF-3 (Fixe l’ARNm sur le ribosome)

Question 22

Séquence Shine-Dalgarno

Answer 22

• Séquence consensus riche en purines placée en amont du codon initiateur de l’ARNm
• Complémentaire au segment riche en pyrimidine du bout 3’ de l’ARNr 16S de la petite sous-unité 30S
• Différentie le codon start d’un codon interne de méthionine

Question 23

Séquence Kozak

Answer 23

Séquence consensus autour du codon start eucaryote

Question 24

Initiation de la traduction chez les eucaryotes

Answer 24

1) Dissociation
2) Assemblage du complexe ternaire avec 40S
3) Recrutement de 40S et balayage (scanning)
4) Association 60S-40S

Question 25

Étapes de l’élongation (3)

Answer 25

1) La MISE EN PLACE correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome.
1. 1) Placement du prochain aminoacyl-ARNt au site A
* * Catalysé par EF-Tu (Bactérie) ou EF1A (Eucaryote) **
1. 2) Hydrolyse du GTP
* * Aidé par EF-Ts (Bactérie) ou EF1B (Eucaryote) **

2) La formation de la LIAISON peptidique
- Peptidyl transférase de la grande sous-unité

3) La TRANSLOCATION
- Catalysé par EF-G

Question 26

EF-Tu

Answer 26

• Un facteur d’élongation
• Muni d’un site de fixation pour le GTP

Rôle: - Reconnaît des propriétés communes à la structure tertiaire des molécules d’ARNt et se fixe à celle-ci (Excepté fMet-ARNt)

Question 27

Bilan pour une liaison peptidique *****

Answer 27

4 ATP/liaison:

1) Activation des ARNt (1 ATP)
2) Liaison (2 GTP)
3) Translocation (1 GTP)

Question 28

Rôle de l’hydrolyse du GTP pendant l’élongation

Answer 28

Assure l’irréversibilité des réactions

Question 29

Codon de terminaison (3)

Answer 29

1) UAG
2) UAA
3) UGA

** Pas reconnu par un ARNt mais par un des facteurs de relargage **

Question 30

Terminaison de la traduction

Answer 30

Hydrolyse de la liaison ester du peptidyl-ARNt

• • 2 facteurs chez les eucaryotes (eRF1 et eRF3)
• • 3 facteurs chez les procaryotes (RF-1, RF-2 et RF-3)

Question 31

Vrai ou Faux

Moins de 2% du génome humaincodent pour des protéines

Answer 31

Vrai

Séquencé en 2001 (20’310 gènes)

Question 32

% du gènome

Answer 32

> 2% = Protéines

50% = ADN répété

Question 33

Méthode de Sanger

Answer 33

Technique de séquençage

- ddNTP qui bloque l’élongation
- À partir d’une amorce connu

Question 34

Exemples d’OGM

Answer 34

• Principaux vecteurs sont dérivés de la bactérie: Agrobacterium tumefaciens
• Pomme OGM: ARNi
  => Bloque l’enzyme menant au pigment brun
• Les plants de coton résistants aux insectes
• Hormone de croissance
• Glo Fish

=> Peut contribuer au développement de résistance aux antibiotiques

Question 35

Methode de transfert de gène

Answer 35

1) Dans les gamètes et les embryons
- Le site d’intégration et le nombre de copies du transgène sont aléatoires

2) Via cellules ES
- Recombinaison homologue
=> Embryons chimère

Question 36

Protéines recombinantes

Answer 36

1) Choisir l’organisme hôte
=> Pour préserver l’activité de la protéine
- Levures, cellules d’insectes, cellules de mammifères