Cours 12 - La Synthèse Protéique Flashcards
Cadre de lecture ouvert
- La partie d’un cadre de lecture avec le potentiel d’encoder une protéine
- C’est une serie de codons sans codon de terminaison
Quelles sont les 4 types de mutation
1) Silencieuse
- Change pas l’AA
2) Faux-sens
- Change l’AA
3) Non-sens
- Change l’AA pour un codon STOP
4) Continuation
- Change le codon STOP pour un AA
Rôle des ARNt
Elles sont les médiatrices-clés entre la séquence nucléotidique de l’ARNm et la séquence d’acides aminés polypeptidique
Quelles sont les 5 parties de l’ARNt
1) Tige acceptrice
2) Lobe tψc
3) Lobe anticodon
4) Lobe D
Comment les ARNt reconnaissent les molécules d’ARNm
Grâce à l’appariement des anticodons avec les codons.
Wobble
- La position 5’ de l’anticodon possède une flexibilité de conformation souvent appelé position de flottement
Quelle nucléotide peut donner une inosine
L’adénine en position 5’ de l’anticodon peut être désaminée pour donner une inosine
ARNt isoaccepteurs
Les diverses molécules d’ARNt qui portent toutes le même acide aminé sont appelées ARNt isoaccepteurs.
Type de liaison entre un AA et l’ARNt et le nom du produit
- Liaison covalente
=> Aminoacyl-ARNt ou ARNt activées (car riche en énergie)
Enzyme qui catalyse la liaison entre un AA et l’ARNt
Aminoacyl-ARNt synthétases
Réaction de synthèse d’un aminoacyl-ARNT
Acide aminé + ARNt + ATP —> Aminoacyl-ARNt +AMP +PPi
2 étapes:
1) La formation d’un intermédiaire réactionnel 2) Le transfert du groupe aminoacyle de l’intermédiaire à l’ARNt
Composition des ribosomes
Composition (ribonucléoprotéines)
- 2/3 d’ARNr - 1/3 de protéines
Que signifie S
Unités Svedberg
Site P
Aka: - Site peptidyle
Rôle: - Contient une molécule d’aminoacyl-ARNt qui porte la chaîne polypeptidique naissante
Site A
Aka: - Site aminoacyle
Rôle: - Contient l’autre molécule d’aminoacyl-ARNt
Étapes de la synthèse protéique (3)
1) L’initiation
2) L’allogement ou élongation
3) La terminaison
Quelle est la matrice de la synthèse protéique
L’ARNm
Étape d’initiation
- L’assemblage d’un complexe d’initiation au BON CODON départ du BON CADRE de lecture
ARNt initiateur
Procaryote: - fMet-ARNt (formyl transférase)
Eucaryote: - Met-ARNt
Rôle: - Reconnait seulement AUG
Initiation chez les procaryotes
1) Dissociation des sous-unités ribosomales
2- Assemblage du complexe d’initiation 30S au site d’initiation
- Petite sous-unité - ARNm - Complexe ternaire fMet- ARNtfMet -IF-2-GTP
3- La sous-unité 50S s’associe (Complexe 70S)
=> Le ribosome est prêt à se fixer à un 2e AA-ARNt
Facteurs d’initiation
Eucaryotes (12):
1) eIF2 (Protéine de liaisonm au GTP qui facilite la fixation du codon initiateur à la petite sous-unité) 2) eIF4F: F=AGE (Aide à fixer la petite sous-unité à l’ARNm)
Procaryotes:
1) IF-1 (S’attache à 30S et dissocie les 2 sous-unités) 2) IF-2 (Une protéine de liaison au GTP qui facilite la liaison du f-MetARNt à la petite sous-unité) 3) IF-3 (Fixe l’ARNm sur le ribosome)
Séquence Shine-Dalgarno
- Séquence consensus riche en purines placée en amont du codon initiateur de l’ARNm
- Complémentaire au segment riche en pyrimidine du bout 3’ de l’ARNr 16S de la petite sous-unité 30S
- Différentie le codon start d’un codon interne de méthionine
Séquence Kozak
Séquence consensus autour du codon start eucaryote
Initiation de la traduction chez les eucaryotes
1) Dissociation
2) Assemblage du complexe ternaire avec 40S
3) Recrutement de 40S et balayage (scanning)
4) Association 60S-40S
Étapes de l’élongation (3)
1) La MISE EN PLACE correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome.
1. 1) Placement du prochain aminoacyl-ARNt au site A
* * Catalysé par EF-Tu (Bactérie) ou EF1A (Eucaryote) **
1. 2) Hydrolyse du GTP
* * Aidé par EF-Ts (Bactérie) ou EF1B (Eucaryote) **
2) La formation de la LIAISON peptidique
- Peptidyl transférase de la grande sous-unité
3) La TRANSLOCATION
- Catalysé par EF-G
EF-Tu
- Un facteur d’élongation
- Muni d’un site de fixation pour le GTP
Rôle: - Reconnaît des propriétés communes à la structure tertiaire des molécules d’ARNt et se fixe à celle-ci (Excepté fMet-ARNt)
Bilan pour une liaison peptidique *****
4 ATP/liaison:
1) Activation des ARNt (1 ATP) 2) Liaison (2 GTP) 3) Translocation (1 GTP)
Rôle de l’hydrolyse du GTP pendant l’élongation
Assure l’irréversibilité des réactions
Codon de terminaison (3)
1) UAG
2) UAA
3) UGA
** Pas reconnu par un ARNt mais par un des facteurs de relargage **
Terminaison de la traduction
Hydrolyse de la liaison ester du peptidyl-ARNt
- 2 facteurs chez les eucaryotes (eRF1 et eRF3)
- 3 facteurs chez les procaryotes (RF-1, RF-2 et RF-3)
Vrai ou Faux
Moins de 2% du génome humaincodent pour des protéines
Vrai
Séquencé en 2001 (20’310 gènes)
% du gènome
> 2% = Protéines
50% = ADN répété
Méthode de Sanger
Technique de séquençage
- ddNTP qui bloque l’élongation - À partir d’une amorce connu
Exemples d’OGM
- Principaux vecteurs sont dérivés de la bactérie: Agrobacterium tumefaciens
- Pomme OGM: ARNi
=> Bloque l’enzyme menant au pigment brun - Les plants de coton résistants aux insectes
- Hormone de croissance
- Glo Fish
=> Peut contribuer au développement de résistance aux antibiotiques
Methode de transfert de gène
1) Dans les gamètes et les embryons
- Le site d’intégration et le nombre de copies du transgène sont aléatoires
2) Via cellules ES
- Recombinaison homologue
=> Embryons chimère
Protéines recombinantes
1) Choisir l’organisme hôte
=> Pour préserver l’activité de la protéine
- Levures, cellules d’insectes, cellules de mammifères
