College Liquid biopsy

Question 1

Wat zijn beperkingen van diagnostiek op primair tumorweefsel?

Answer 1

Patiënten overlijden tgv uitzaaiingen, meta verschilt van primair tumor (genetisch en epigenetisch)

Question 2

Waarom biopteren we niet op meta’s?

Answer 2

Invasief, moeilijk toegankelijk, meta’s zijn heterogeen, herhaaldelijk biopteren is lastig

Question 3

Wat zijn bronnen voor vloeibare biopten?

Answer 3

Bloed, urine, speeksel, liquor, nipple fluid, seminal fluis

Question 4

Wat zijn analyten voor vloeibare biopten?

Answer 4

CTC/circulerende tumorcellen, cfDNA/circulerend celvrij DNA, exosomen, circulerende metabolieten/eiwitten

Question 5

Wat zijn voor en nadelen van vloeibare biopten?

Answer 5

+ weinig invasief, real time, herhaaldelijk afnemen kan, meer representatief dan enkel biopt
- biomoleculen van interesse zijn zeldaam, zeer gevoelige meetmethoden nodig, verrijking noodzakelijk

Question 6

Wat zijn verschillen tussen CTCs en cfDNA? + assays

Answer 6

intacte tumorcellen en celvrij in circulatie
DNA/RNA/eiwit en nucleinezuren/histonen
activiteitsmetingen en gefragmenteerd
beperkte gevoeligheid en minder beperkt
lastig te verkrijgen en makkelijk te verkrijgen
enuration, mRNA profiel, single cell genomics, organoids en dPCR, UMI NGS, MeD-seq, NPT/Fastseq

Question 7

Waar worden vloeibare biopten voor gebruikt?

Answer 7

Predictieve/prognostische biomarkers, detectie ziekte/resistente klonen en inzage tumorheterogeniteit

Question 8

Wat doe je met vloeibare biopten?

Answer 8

Oorsprong primair tumor bepalen
Prognose
Therapie respons voorspellen
Met DLA CTC opbrengst verhogen
Singel CTC profilering en dus onderzoek naar heterogeniteit
Respons op therapie monitoren
Optreden resistentie monitoren
Universeel ziekte monitoren
CancerSeek lijkt methode voor screening