Chemotaxis

Question 1

Welche Arten von Taxis gibt es?

Answer 1

Chemotaxis, Thermotaxis, Osmotaxis, Phototaxis, Hydrotaxis

Question 2

Wie sind Chemorezeptoren aufgebaut?

Answer 2

• an Zellpolen in Membran
• oben bindin/sensing domain: Aufnahme u. Weiterleiten des Signals
• Output/signaling domain
• methylation sites: Glutamatreste, die methyliert werden können
• fkt. Einheit: Homodimer

Question 3

Wie sind Chemorezeptoren organisiert?

Answer 3

• Trimer aus Dimeren
• oben versch. –> messen untersch. Signale
• unten Output-Domäne m. CheW u. CheA
• CheA-Proteine verbinden Trimere (SK)
• CheW ist Adapter

Question 4

Was gibt es für chemotaxische Signale?

Answer 4

• PTS (Glucose, mannitol, Fructose etc,)
• AER (Elektronenrezeptor: misst Elektronenfluss, [O2], Fumarat)
• MCP detektiert Hemmstoffe/Repellent (FS, Ionen, Alk, Temp. etc.), periplasmat. Bindeproteine (Dipeptide, nicht-PTS wie Maltose, Ribose, Galaktose)

Question 5

Was gibt es für Chemorezeptoren in E. coli?

Answer 5

Tsr: Ser (häufig)

Tar: Maltose, Asp (häufig)

Tap: Dipeptide

Trg: Galaktose, Ribose

Aer: O2

Question 6

Wie verläuft das Signaling bei E. coli?

Answer 6

• Signal v. MCPs aufgenommen –> MCPs methyliert (Methylase CheR) –> CheW –> CheA-P
  sofort: CheY-P über CheZ (Dephosphatase)–> bindet an FliM –> Richtungsänderung

3 sec: CheB-P (Demethylase v. MCPs)

Question 7

Was passsiert, wenn der Lockstoff da ist, aber die MCPs methyliert sind?

Answer 7

Kinase aktiv, weil Rezeptoren dr. Methylierung weniger sensitiv gegenüber Lockstoff werden

Question 8

Wie funktioniert ein Kapillarassay?

Answer 8

• Puffer o. Lockstoff m. Bakerien
  . Kapillare m. Lockstoff wird reigehalten
• Bakt. wandern in Kapillare
• Diagramm: Anzahl Zellen in Kapillare gegen Zeit: bei Lockstoff hoher Anstieg, bei Hemmstoff geringste Zahl