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Microbiologie > Chapitre 8 : Les virus, les viroïdes et les prions > Flashcards

Chapitre 8 : Les virus, les viroïdes et les prions Flashcards

1
Q

Quelles sont les définitions du virus ?

A
  • Parasite cellulaire obligatoire.
  • Dépendance métabolique envers une cellule hôte.
  • Pirate cellulaire qui détourne le métabolisme et est essentiellement composé de protéines et d’acides nucléiques (1 seul type à la fois : ARN ou ADN.)
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2
Q

Pourquoi y a-t-il une absence de taxinomie basée sur la phylogénétique ?

A

Pas d’origine commune concernant le domaine, le règne, l’embranchement et la classe.

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3
Q

Comment classe-t-on les virus ?

A

On utilise un système de classification artificiel.

  • Ordre : -ales, établi selon le type d’acide nucléique.
  • Famille : - viridae, établi (souvent) selon la forme des virus (capside).
  • Genre : - virus
  • Espèce, sous-espèce (sérotype)
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4
Q

Quelle est la nomenclature des virus selon leur hôte ?

A

Si l’hôte est… : alors le virus s’appelle.

  • Une bactérie : bactériophage.
  • Eucaryote
  • Cordés : pas de nom précis.
  • Anthropode : baculovirus.
  • Plantes : phytovirus.
  • Mycètes : mycovirus.
  • Virus : virophage.
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5
Q

Qu’est-ce que le spectre d’hôte ?

A
  • Représente l’éventail des types cellulaires permissifs à l’infection.
  • Niche écologique.
  • > Large : Lyssavirus (rage), infecte plusieurs mammifères.
  • > Étroit (Poliovirus) : poliomyélite, cellules humaines -> épithéliales du tube digestif et du tube nerveux.
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6
Q

Par quoi est déterminé le spectre d’hôte ?

A
  1. La présence de site de fixation sur la cellule hôte, habituellement des glycoprotéines de surface.
    Ex: VIH - GP120 (liaison) CD4 - Lymphocyte T
  2. Machinerie cellulaire nécessaire adaptée à la réplication virale.
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7
Q

Structure des virions. Que peut-on dire sur l’acide nucléique ?

A
  1. Acide nucléique (un seul type à la fois)
    - ADN ou ARN.
    Mono- ou bi-caténaire (brin)
    Circulaire ou linéaire
    - Génome viral de 10-400 gènes.
    Types de gènes:
    * Réplication génome.
    * Synthèse d’enzymes.
    * Protéines pirates (détournement du métabolisme de la cellule hôte.)
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8
Q

Structure des virions. Que peut-on dire sur la capside ?

A

La capside est une coquille protéique autour de l’acide nucléique.

  • Formée de sous-unités appelées capsomères.
  • Nombreuses architectures -> critère de classification désignant la famille.
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9
Q

Structure des virions. Que peut-on dire de l’enveloppe ?

A

Absente -> virus nu.
Présente -> virus enveloppé.
- Bicouche de phosphoglycérolipides provenant d’un bourgeonnement de la membrane plasmique, ou parfois du réticulum endoplasmique lisse de la cellule hôte.

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10
Q

Quels sont les facteurs de virulence ?

A
  1. Camouflage des antigènes de la capside (éviter le système immunitaire.)
  2. Pénétration par fusion de l’enveloppe et la membrane plasmique.
    MAIS fragilise le virus envers l’environnement (virus enveloppé se transmet par contact direct.)
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11
Q

Qu’est-ce qu’un spicule ? Quelles sont les fonctions des spicules ?

A

L’enveloppe est parfois couverte de glycoprotéines, nommées spicules.

Fonctions des spicules :

  • Facilite et permet l’attachement et la pénétration du virus dans la cellule hôte.
  • Constitue un antigène (permet l’identification)
  • Constitue un facteur de virulence.

Ex: Influenza (espèce) H1N1 (sous-espèce)
Hémagglutimine type 1 [H1 à H6]
- Fonction d’antigène qui permet de trouver la source (identification)
- Facteur de virulence : provoque l’agglutination érythrocytaire (des globules rouges.)
N = neuraminidase type 1 [N1 à N9]
- antigène permettant l’identification
- permet la libération du virus en dégradant des portions de la membrane cellulaire.

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12
Q

Quelles sont les cibles thérapeutiques pour les antiviraux ?

A

Elles sont rares, car les virus sont des parasites : si on veut s’en débarrasser, il faut tuer nos cellules en même temps (virus utilise la machinerie cellulaire.)

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13
Q

Qu’est-ce que la phase d’éclipse ?

A

Le virus est à l’intérieur de la cellule.

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14
Q

Que sont les cycles de réplication des virus ?

A
  • Afin de se reproduire à l’intérieur d’une cellule, un virus passe par un cycle de réplication.
    1. Cycle lytique.
    2. Cycle lysogénique (latence) -> virus animaux.
  • Implique des modifications cellulaires importantes : génétique, métabolisme / énergie, structurelle.
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15
Q

Que faut-il pour faire une culture in vitro de virus ?

A

Cela requiert une lignée cellulaire* permissive (*opposition à une culture cellulaire primaire) -> selon le spectre d’hôte.

Lignée cellulaire:
Cellules immortelles provenant de cancers.

Forme des plages de lyse cellulaire.

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16
Q

Quelles sont les étapes du cycle lytique ?

A
  1. Cycle lytique (bactériophage) [virus animaux]
    - Attachement [absorption]. Liaison spécifique entre les protéines virales de surface (clé) aux protéines (glyco ou lipo) de surface de la bactérie (serrure.)
    - Pénétration. Injection de l’acide nucléique du bactériophage dans la bactérie. [Virus animal: fusion enveloppe virale et membrane plasmique, endocytose (spécifique), translocation (non spécifique)] Spécifique, car implique protéine qui va former vésicule.
    + [décapsidation = sortie de l’acide nucléique de la capside à l’intérieur de la cellule hôte.)
    - Biosynthèse. Réplication de l’acide nucléique viral et synthèse des protéines virales.
    => Provoque l’arrêt du métabolisme de la cellule hôte, car il est détourné au profit du virus.
    - Maturation. Assemblage des particules virales et l’acide nucléique viral en virus entier (sauf s’il est enveloppé.)
    - Libération. Lyse de la bactérie [ou de la cellule] provoquée par la sortie des [virus] bactériophages.
    Aussi, [bourgeonnement] pour les virus enveloppés.
    Aussi, [apoptose] lorsque le métabolisme ne fonctionne plus.
17
Q

Quelle est l’utilité des bactériophages ?

A

Phagothérapie : utilisation de bactériophages antibactériens.

18
Q

Quelles sont les étapes du cycle lysogénique ?

A

Cycle lysogénique [latence] : ce ne sont pas tous les virus qui sont lysogéniques.

Étape 1 & 2 : identiques au cycle lytique.
Étape 3: Intégration. Acide nucléique viral (prophage), [provirus] dans le génome de la bactérie [cellule] hôte.
-> Protéines virales serviront à inhiber la transcription des gènes viraux. Le prophage est silencieux.
Étape 4 : Réplication passive du prophage [provirus] lors de la réplication cellulaire.
Étape 5: Excision [réactivation] du prophage [provirus] et retour dans le cycle lytique.
-> Les causes de la réactivation sont souvent incomprises : immunité, âge, ??

19
Q

Quelles sont les conséquences du cycle lysogénique chez les bactéries ?

A
  1. Immunité à la réinfection.
  2. Immunité au cycle lytique de bactériophages apparentés
    -> En raison de l’inhibition de la transcription par des protéines virales lors de l’intégration (étape #3)
  3. Conversion phagique.
    Certains gènes de virulence font partie du prophage. Suite à l’infection et au cycle lysogénique, la bactérie infectée possède de nouvelles caractéristiques.
    Ex: Clostridium botulinum : toxine botulinique.
    Bacillus anthracis : formation d’un biofilm.
  4. Transduction localisée.
    Transfert d’une portion du génome d’une bactérie à un autre par l’entremise d’un bactériophage lysogénique (fig. 8.13)
20
Q

Quelles sont les conséquences du cycle lysogénique chez les animaux ? [latence]

A
  1. Cancer (environ 20% des cancers sont causés par des virus).
    Ces virus transmettent des gènes qui transforment le phénotype cellulaire et qui augmentent la prolifération cellulaire. Cela aura pour conséquence d’augmenter l’occurrence d’anomalies cellulaires. C’est de cette manière qu’ils peuvent causer des cancers.

Les gènes portent les nom d’oncogènes.
-> Oncovirus.

21
Q

Comment les virus ayant un ADN simple brin peuvent-ils détourner le bagage génétique à leur avantage ?

A
  • Le virus entre dans le noyau.
  • Enlève la capside.
  • Simple brin devient double brin à cause du promoteur.
  • Double brin transcrit en ARNm, qui sort du noyau.
  • ARNm est traduit en protéine.
  • La protéine est utilisée pour reformer le virus, avec des copies exactes de l’ADN simple brin venant du noyau.
22
Q

Comment les virus ayant un ARN double brin peuvent-ils détourner le bagage génétique à leur avantage ?

A

L’ARN double brin n’est pas toléré dans le cytoplasme.

  • Le virus a une protéine virale lui permettant de séparer ses brins d’ARN.
  • Le brin + d’ARN est utilisé pour former une protéine, qui servira à reformer le virus.
  • Une protéine virale fait une copie +.
  • Les copies sont utilisées pour reformer le virus.

Toutes les étapes se font dans le cytoplasme.

23
Q

Comment les virus ayant un ARN simple brin peuvent-ils détourner le bagage génétique à leur avantage ?

A
  • Le virus rentre dans le cytoplasme.
  • La transcriptase inverse permet de faire ADN à partir de ARN.
  • Le virus rentre dans le noyau.
  • L’ADN simple brin libéré va se faire répliquer et transcrire en ARNm.
  • L’ARN + sort du noyau pour former des protéines qui pourront reformer le virus.

Si le brin d’ARN était négatif au départ, des protéines virales auraient été nécessaires pour le transformer en ARN +.

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